52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_1891 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_0948  site-specific integrase/resolvase  98.65 
 
 		 209 aa  150  7e-36  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.531266  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1891  transposase OrfA  100 
 
 		 74 aa  149  1e-35  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1564  hypothetical protein  98.65 
 
 		 215 aa  149  1e-35  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.20655  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0658  hypothetical protein  98.65 
 
 		 215 aa  149  1e-35  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2258  resolvase domain-containing protein  94.59 
 
 		 74 aa  141  2e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.216039  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3324  resolvase domain-containing protein  83.78 
 
 		 197 aa  129  2.0000000000000002e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.296266  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3670  DNA binding domain-containing protein  59.7 
 
 		 201 aa  92  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.635315  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0465  resolvase-like protein  51.43 
 
 		 219 aa  80.5  0.000000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.123984  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1219  DNA binding domain protein, excisionase family  54.55 
 
 		 201 aa  76.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3893  DNA binding domain protein, excisionase family  54.84 
 
 		 203 aa  70.5  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3943  DNA binding domain protein, excisionase family  54.84 
 
 		 203 aa  70.5  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000130893  normal  0.0337021 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1220  DNA binding domain protein, excisionase family  49.18 
 
 		 201 aa  63.9  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0818  DNA binding domain protein, excisionase family  42.03 
 
 		 216 aa  57.4  0.00000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2574  DNA binding domain protein, excisionase family  38.46 
 
 		 194 aa  56.2  0.0000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.235149  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1190  DNA binding domain protein, excisionase family  40.58 
 
 		 216 aa  55.1  0.0000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0122  DNA binding domain protein, excisionase family  40.58 
 
 		 216 aa  55.1  0.0000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0131  DNA binding domain protein, excisionase family  40.58 
 
 		 216 aa  55.1  0.0000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000948008  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0390  DNA binding domain protein, excisionase family  40.58 
 
 		 216 aa  55.1  0.0000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0112175  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0484  DNA binding domain protein, excisionase family  39.13 
 
 		 216 aa  54.7  0.0000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.114276  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0522  DNA binding domain protein, excisionase family  40.58 
 
 		 244 aa  53.9  0.0000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0170413  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2443  DNA binding domain protein, excisionase family  40.98 
 
 		 193 aa  53.9  0.0000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.453884  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0272  Resolvase domain protein  37.68 
 
 		 229 aa  53.5  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000593088  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1118  Resolvase domain protein  37.68 
 
 		 229 aa  53.1  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000220769  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1717  regulatory protein MerR  40.98 
 
 		 201 aa  53.1  0.000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.212526  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2645  DNA binding domain protein, excisionase family  41.54 
 
 		 192 aa  52  0.000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0911  DNA binding domain protein, excisionase family  40.98 
 
 		 192 aa  51.6  0.000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  unclonable  0.00000302589  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0895  DNA binding domain protein, excisionase family  42.62 
 
 		 192 aa  50.8  0.000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2150  DNA binding domain protein, excisionase family  40.98 
 
 		 195 aa  49.7  0.00001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0744  Resolvase domain protein  34.78 
 
 		 229 aa  49.7  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000000124642  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1710  resolvase domain-containing protein  30.56 
 
 		 222 aa  48.5  0.00003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1224  putative site-specific integrase-resolvase  35.29 
 
 		 197 aa  48.1  0.00004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.997311  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1174  DNA binding domain protein, excisionase family  32.88 
 
 		 219 aa  48.1  0.00004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.122691  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1304  transposon resolvase  37.29 
 
 		 209 aa  47.8  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0311544  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2194  Resolvase domain protein  30.56 
 
 		 208 aa  47.8  0.00005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.72008  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0236  Resolvase domain protein  37.29 
 
 		 195 aa  47.8  0.00005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000223632  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1105  transposon resolvase  33.9 
 
 		 196 aa  47.4  0.00007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.600674  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1808  DNA binding domain protein, excisionase family  34.25 
 
 		 219 aa  47.4  0.00007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2513  Resolvase domain protein  35.59 
 
 		 195 aa  47.4  0.00007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12805  resolvase  38.6 
 
 		 193 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00189559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10616  resolvase  39.29 
 
 		 202 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000496522  normal  0.221326 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1913  Resolvase domain protein  30.56 
 
 		 208 aa  46.2  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0947  Resolvase domain protein  37.29 
 
 		 195 aa  45.1  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000151254  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1070  resolvase domain-containing protein  37.93 
 
 		 197 aa  45.1  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.709621  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1911  DNA binding domain-containing protein  30.99 
 
 		 216 aa  45.4  0.0003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2683  resolvase-like protein  41.07 
 
 		 190 aa  45.1  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.300522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10939  resolvase  34.43 
 
 		 193 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2048  Resolvase domain protein  36.07 
 
 		 193 aa  43.9  0.0007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0322526  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0785  Resolvase domain protein  36.67 
 
 		 202 aa  43.9  0.0007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00525149  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1449  Resolvase domain protein  37.5 
 
 		 207 aa  42.4  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0392946  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12994  resolvase  35.09 
 
 		 194 aa  41.6  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000478883  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1426  site-specific integrase-resolvase-like protein  35.85 
 
 		 81 aa  41.6  0.004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.765769  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3431  resolvase-like protein  41.18 
 
 		 197 aa  40.4  0.008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>