50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_1191 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011726  PCC8801_1191  Resolvase domain protein  100 
 
 
205 aa  424  1e-118  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1218  resolvase domain protein  98.05 
 
 
205 aa  418  1e-116  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3893  DNA binding domain protein, excisionase family  41.58 
 
 
203 aa  183  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3943  DNA binding domain protein, excisionase family  41.58 
 
 
203 aa  183  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000130893  normal  0.0337021 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1220  DNA binding domain protein, excisionase family  43 
 
 
201 aa  182  4.0000000000000006e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1219  DNA binding domain protein, excisionase family  44.22 
 
 
201 aa  181  5.0000000000000004e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3670  DNA binding domain-containing protein  36.18 
 
 
201 aa  129  2.0000000000000002e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.635315  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1564  hypothetical protein  31.82 
 
 
215 aa  120  9.999999999999999e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.20655  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0658  hypothetical protein  31.82 
 
 
215 aa  120  9.999999999999999e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3324  resolvase domain-containing protein  32.98 
 
 
197 aa  119  3e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.296266  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0465  resolvase-like protein  32.12 
 
 
219 aa  110  1.0000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.123984  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0948  site-specific integrase/resolvase  31.46 
 
 
209 aa  109  2.0000000000000002e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.531266  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2002  regulatory protein, MerR  33.55 
 
 
148 aa  89  5e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0947  Resolvase domain protein  25.41 
 
 
195 aa  87  2e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000151254  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1449  Resolvase domain protein  24.74 
 
 
207 aa  86.3  3e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0392946  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0236  Resolvase domain protein  24.86 
 
 
195 aa  85.9  4e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000223632  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0785  Resolvase domain protein  27.47 
 
 
202 aa  84  0.000000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00525149  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1717  regulatory protein MerR  26.52 
 
 
201 aa  82.8  0.000000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.212526  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1710  resolvase domain-containing protein  25.98 
 
 
222 aa  80.9  0.00000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0272  Resolvase domain protein  26.5 
 
 
229 aa  79.7  0.00000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000593088  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1118  Resolvase domain protein  26.63 
 
 
229 aa  79.3  0.00000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000220769  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1070  resolvase domain-containing protein  26.37 
 
 
197 aa  78.6  0.00000000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.709621  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0744  Resolvase domain protein  26.5 
 
 
229 aa  77.8  0.00000000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000000124642  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2716  DNA binding domain protein, excisionase family  26.26 
 
 
213 aa  75.1  0.0000000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.00788025  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1513  DNA binding domain protein, excisionase family  26.26 
 
 
213 aa  75.1  0.0000000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1111  DNA binding domain-containing protein  25.89 
 
 
215 aa  74.3  0.000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.385151  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0941  resolvase domain-containing protein  26.98 
 
 
208 aa  72.4  0.000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0143335  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0818  DNA binding domain protein, excisionase family  24.64 
 
 
216 aa  70.9  0.00000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0484  DNA binding domain protein, excisionase family  24.17 
 
 
216 aa  70.1  0.00000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.114276  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1304  transposon resolvase  25 
 
 
209 aa  69.3  0.00000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0311544  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1190  DNA binding domain protein, excisionase family  23.61 
 
 
216 aa  68.6  0.00000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0122  DNA binding domain protein, excisionase family  23.44 
 
 
216 aa  67.8  0.0000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0131  DNA binding domain protein, excisionase family  23.44 
 
 
216 aa  67.8  0.0000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000948008  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0390  DNA binding domain protein, excisionase family  22.49 
 
 
216 aa  67.4  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0112175  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1270  Resolvase domain protein  24.86 
 
 
195 aa  63.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2150  DNA binding domain protein, excisionase family  25.6 
 
 
195 aa  63.2  0.000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0522  DNA binding domain protein, excisionase family  22.75 
 
 
244 aa  62  0.000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0170413  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2574  DNA binding domain protein, excisionase family  24.37 
 
 
194 aa  62  0.000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.235149  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1911  DNA binding domain-containing protein  22.44 
 
 
216 aa  61.6  0.000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2645  DNA binding domain protein, excisionase family  24 
 
 
192 aa  60.8  0.00000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1808  DNA binding domain protein, excisionase family  22.82 
 
 
219 aa  59.3  0.00000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0911  DNA binding domain protein, excisionase family  24 
 
 
192 aa  58.2  0.00000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  unclonable  0.00000302589  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1174  DNA binding domain protein, excisionase family  23.19 
 
 
219 aa  57.4  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.122691  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0895  DNA binding domain protein, excisionase family  23.43 
 
 
192 aa  57.4  0.0000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0754  Resolvase domain protein  26.49 
 
 
207 aa  55.1  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1241  Resolvase domain protein  28.42 
 
 
222 aa  52.8  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0456632  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2000  DNA binding domain protein, excisionase family  25.67 
 
 
212 aa  46.2  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.27976  normal  0.357405 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1033  transposon resolvase  25.32 
 
 
204 aa  44.7  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.412274  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2513  Resolvase domain protein  23.31 
 
 
195 aa  43.1  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5986  resolvase domain-containing protein  23.33 
 
 
162 aa  42.7  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00224994  normal  0.0280728 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>