109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_1033 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_1033  transposon resolvase  100 
 
 		 204 aa  419  1e-116  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.412274  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2513  Resolvase domain protein  43.39 
 
 		 195 aa  153  1e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1105  transposon resolvase  41.62 
 
 		 196 aa  145  4.0000000000000006e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.600674  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1513  DNA binding domain protein, excisionase family  41.24 
 
 		 213 aa  128  5.0000000000000004e-29  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2716  DNA binding domain protein, excisionase family  41.24 
 
 		 213 aa  128  5.0000000000000004e-29  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.00788025  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1111  DNA binding domain-containing protein  37.29 
 
 		 215 aa  121  7e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.385151  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1224  putative site-specific integrase-resolvase  36.22 
 
 		 197 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.997311  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2683  resolvase-like protein  36.42 
 
 		 190 aa  112  5e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.300522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0684  resolvase domain-containing protein  38.37 
 
 		 190 aa  111  6e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.245344 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5676  resolvase domain-containing protein  38.37 
 
 		 190 aa  111  6e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3431  resolvase-like protein  37.43 
 
 		 197 aa  108  8.000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12805  resolvase  35.75 
 
 		 193 aa  107  1e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00189559  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1241  Resolvase domain protein  41.45 
 
 		 222 aa  107  1e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0456632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12994  resolvase  34.39 
 
 		 194 aa  107  2e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000478883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0941  resolvase domain-containing protein  39.13 
 
 		 208 aa  105  3e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0143335  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0754  Resolvase domain protein  31.91 
 
 		 207 aa  104  7e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10939  resolvase  34.62 
 
 		 193 aa  103  2e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0272  Resolvase domain protein  36.54 
 
 		 229 aa  103  2e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000593088  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1449  Resolvase domain protein  39.71 
 
 		 207 aa  102  3e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0392946  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2781  Resolvase domain protein  39.47 
 
 		 222 aa  102  3e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.912906 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0851  regulatory protein MerR  38.82 
 
 		 222 aa  102  5e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1118  Resolvase domain protein  35.9 
 
 		 229 aa  101  6e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000220769  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0236  Resolvase domain protein  39.55 
 
 		 195 aa  101  7e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000223632  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0744  Resolvase domain protein  37.82 
 
 		 229 aa  101  7e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000000124642  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0947  Resolvase domain protein  40.3 
 
 		 195 aa  101  7e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000151254  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10616  resolvase  34.64 
 
 		 202 aa  100  2e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000496522  normal  0.221326 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13862  resolvase  34.24 
 
 		 203 aa  99.8  2e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1070  resolvase domain-containing protein  39.58 
 
 		 197 aa  100  2e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.709621  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1710  resolvase domain-containing protein  38.06 
 
 		 222 aa  100  2e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0785  Resolvase domain protein  37.76 
 
 		 202 aa  100  2e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00525149  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0751  Resolvase domain protein  40.56 
 
 		 209 aa  99.4  3e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1808  DNA binding domain protein, excisionase family  38.18 
 
 		 219 aa  94.7  9e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1911  DNA binding domain-containing protein  42.54 
 
 		 216 aa  94.7  9e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1913  Resolvase domain protein  38.3 
 
 		 208 aa  93.2  2e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1614  resolvase domain-containing protein  34.97 
 
 		 182 aa  92.4  4e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00182311  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1304  transposon resolvase  37.12 
 
 		 209 aa  91.7  6e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0311544  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0465  resolvase-like protein  33.89 
 
 		 219 aa  90.9  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.123984  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0658  hypothetical protein  41.04 
 
 		 215 aa  90.9  1e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1564  hypothetical protein  41.04 
 
 		 215 aa  90.9  1e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.20655  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0948  site-specific integrase/resolvase  41.04 
 
 		 209 aa  90.1  2e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.531266  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5986  resolvase domain-containing protein  35.29 
 
 		 162 aa  89.4  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00224994  normal  0.0280728 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1174  DNA binding domain protein, excisionase family  37.95 
 
 		 219 aa  89.7  3e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.122691  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2194  Resolvase domain protein  36.17 
 
 		 208 aa  86.7  2e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.72008  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0842  resolvase domain-containing protein  32.73 
 
 		 196 aa  85.5  5e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.419  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2645  DNA binding domain protein, excisionase family  35.21 
 
 		 192 aa  84.3  0.000000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3670  DNA binding domain-containing protein  39.1 
 
 		 201 aa  84.3  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.635315  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2000  DNA binding domain protein, excisionase family  33.11 
 
 		 212 aa  84.3  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.27976  normal  0.357405 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3324  resolvase domain-containing protein  38.06 
 
 		 197 aa  83.6  0.000000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.296266  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1270  Resolvase domain protein  30.43 
 
 		 195 aa  83.6  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1219  DNA binding domain protein, excisionase family  34.59 
 
 		 201 aa  81.6  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1000  Resolvase domain protein  33.82 
 
 		 206 aa  81.3  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0589477 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2935  Resolvase domain protein  33.82 
 
 		 206 aa  81.3  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0895  DNA binding domain protein, excisionase family  36.55 
 
 		 192 aa  80.9  0.00000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0484  DNA binding domain protein, excisionase family  35.38 
 
 		 216 aa  79.7  0.00000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.114276  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2048  Resolvase domain protein  30.81 
 
 		 193 aa  79.7  0.00000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0322526  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2574  DNA binding domain protein, excisionase family  32.89 
 
 		 194 aa  78.2  0.00000000000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.235149  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0390  DNA binding domain protein, excisionase family  33.85 
 
 		 216 aa  77  0.0000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0112175  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0522  DNA binding domain protein, excisionase family  35.38 
 
 		 244 aa  77  0.0000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0170413  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2443  DNA binding domain protein, excisionase family  35.62 
 
 		 193 aa  75.1  0.0000000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.453884  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0911  DNA binding domain protein, excisionase family  33.8 
 
 		 192 aa  75.1  0.0000000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  unclonable  0.00000302589  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1717  regulatory protein MerR  33.58 
 
 		 201 aa  73.9  0.000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.212526  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0818  DNA binding domain protein, excisionase family  33.59 
 
 		 216 aa  73.9  0.000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1190  DNA binding domain protein, excisionase family  30.77 
 
 		 216 aa  73.2  0.000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0122  DNA binding domain protein, excisionase family  30.18 
 
 		 216 aa  72.8  0.000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0131  DNA binding domain protein, excisionase family  30.18 
 
 		 216 aa  72.8  0.000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000948008  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2150  DNA binding domain protein, excisionase family  32.39 
 
 		 195 aa  70.9  0.00000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2776  putative resolvase  41.3 
 
 		 116 aa  68.6  0.00000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.481265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2002  regulatory protein, MerR  36.45 
 
 		 148 aa  68.2  0.00000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3893  DNA binding domain protein, excisionase family  28.28 
 
 		 203 aa  63.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3943  DNA binding domain protein, excisionase family  28.28 
 
 		 203 aa  63.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000130893  normal  0.0337021 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12900  resolvase  30.64 
 
 		 295 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0601752  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2393  DNA binding domain protein, excisionase family  33.1 
 
 		 191 aa  59.7  0.00000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1425  putative resolvase  33.61 
 
 		 126 aa  59.7  0.00000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0072  transposase  54.17 
 
 		 50 aa  55.8  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.905697  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1220  DNA binding domain protein, excisionase family  24.64 
 
 		 201 aa  51.6  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0196  putative site-specific integrase-resolvase, degenerate  41.27 
 
 		 63 aa  51.2  0.00001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000193839  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1960  site-specific integrase-resolvase-like  35.62 
 
 		 147 aa  49.7  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.4652  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1942  Resolvase domain protein  28.79 
 
 		 561 aa  50.1  0.00003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0571  resolvase domain-containing protein  36.17 
 
 		 210 aa  47  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0873  Resolvase domain protein  37.84 
 
 		 206 aa  47.4  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0568  recombinase  25.95 
 
 		 547 aa  46.6  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.816013  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0592  Resolvase domain protein  35.37 
 
 		 462 aa  45.8  0.0004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0119  transposon resolvase  30.37 
 
 		 186 aa  46.2  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.336282 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001518  resolvase  30.11 
 
 		 204 aa  45.8  0.0004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000153211  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0149  transposon resolvase  29.63 
 
 		 186 aa  45.8  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000015767 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4193  Resolvase domain  23.61 
 
 		 555 aa  45.4  0.0006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.384127 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2559  resolvase-like protein  30.43 
 
 		 222 aa  45.1  0.0007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.22678 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3979  resolvase domain-containing protein  35.11 
 
 		 208 aa  44.7  0.0008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3963  recombinase  34.29 
 
 		 493 aa  44.3  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.636106  normal  0.385317 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3649  resolvase domain-containing protein  36.26 
 
 		 380 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.340945 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1191  Resolvase domain protein  25.32 
 
 		 205 aa  44.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0155  resolvase x  31.03 
 
 		 193 aa  43.5  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4161  Resolvase domain  31.15 
 
 		 206 aa  43.9  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1238  Resolvase domain protein  26.67 
 
 		 217 aa  43.9  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000100955  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0068  resolvase  32.32 
 
 		 181 aa  43.1  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0902003  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4253  resolvase-like protein  27.18 
 
 		 201 aa  42.7  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.35703  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4263  resolvase-like protein  27.18 
 
 		 201 aa  42.7  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3805  resolvase-like protein  25.56 
 
 		 526 aa  43.1  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.296715  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1426  site-specific integrase-resolvase-like protein  32.31 
 
 		 81 aa  42.7  0.004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.765769  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2971  resolvase domain-containing protein  34.74 
 
 		 474 aa  42.4  0.005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0952966  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>