More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_4161 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_4161  Resolvase domain  100 
 
 		 206 aa  415  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1306  resolvase domain-containing protein  65.66 
 
 		 205 aa  242  3e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.92579  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3278  resolvase domain-containing protein  64.65 
 
 		 208 aa  241  5e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.312644  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4533  resolvase domain-containing protein  60.95 
 
 		 214 aa  236  1e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6887  resolvase domain-containing protein  61.19 
 
 		 210 aa  226  2e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4343  Resolvase domain protein  56.41 
 
 		 202 aa  223  2e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000112202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4408  resolvase domain-containing protein  56.41 
 
 		 202 aa  223  2e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000545957  normal  0.0701498 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4666  resolvase domain-containing protein  56.41 
 
 		 202 aa  223  2e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000148612  normal  0.936039 
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0078  TnpR  51.52 
 
 		 220 aa  214  9e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.569126 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0950  resolvase domain-containing protein  52.63 
 
 		 207 aa  205  5e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_44  putative resolvase  50.98 
 
 		 211 aa  204  1e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0377389  n/a   
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_03  resolvase  52.74 
 
 		 209 aa  202  3e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0298  resolvase, putative  50.75 
 
 		 205 aa  202  3e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4266  resolvase domain-containing protein  52.43 
 
 		 231 aa  198  6e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000000000120246  unclonable  5.20349e-19 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0021  resolvase, putative  50.25 
 
 		 221 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00853796  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0077  resolvase family site-specific recombinase  51.52 
 
 		 211 aa  195  4.0000000000000005e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.349046  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0024  resolvase, putative  49.75 
 
 		 206 aa  194  6e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000663819  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4246  Resolvase domain protein  50.75 
 
 		 205 aa  193  2e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01413  resolvase, putative  48.02 
 
 		 207 aa  189  2.9999999999999997e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0873  Resolvase domain protein  48.5 
 
 		 206 aa  188  5e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0123  putative resolvase  50.75 
 
 		 206 aa  187  7e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  6.922970000000001e-26 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4355  Resolvase domain protein  46.97 
 
 		 200 aa  187  9e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4460  Resolvase domain protein  46.46 
 
 		 209 aa  187  1e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4455  resolvase domain-containing protein  46.46 
 
 		 203 aa  187  1e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4562  resolvase domain-containing protein  46.46 
 
 		 209 aa  186  2e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.338072  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0571  resolvase domain-containing protein  48.06 
 
 		 210 aa  186  2e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4386  resolvase domain-containing protein  45.96 
 
 		 209 aa  184  6e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2180  resolvase domain-containing protein  46.46 
 
 		 212 aa  184  6e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.52939  n/a   
 
 
-
 
NC_009516  PsycPRwf_2397  resolvase domain-containing protein  46.77 
 
 		 210 aa  184  8e-46  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3590  resolvase domain protein  46.46 
 
 		 208 aa  182  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000308956 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3979  resolvase domain-containing protein  50.25 
 
 		 208 aa  175  4e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0054  resolvase domain-containing protein  45.32 
 
 		 213 aa  174  7e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4402  resolvase domain-containing protein  45.81 
 
 		 213 aa  172  3.9999999999999995e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001518  resolvase  45.08 
 
 		 204 aa  156  2e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000153211  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1801  resolvase domain-containing protein  42.29 
 
 		 228 aa  144  9e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.118365 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2559  resolvase-like protein  39.71 
 
 		 222 aa  135  3.0000000000000003e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.22678 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0719  resolvase domain-containing protein  38.12 
 
 		 197 aa  126  3e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000179161 
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2477  resolvase-like protein  38.28 
 
 		 198 aa  124  8.000000000000001e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.131622  normal  0.782919 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1355  resolvase-like protein  36.6 
 
 		 190 aa  114  1.0000000000000001e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.141663 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6519  resolvase  36.22 
 
 		 283 aa  112  4.0000000000000004e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0037  resolvase  36.14 
 
 		 245 aa  110  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.489197  normal  0.472165 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3355  resolvase domain-containing protein  37.13 
 
 		 301 aa  109  3e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0978291  normal  0.274195 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0094  resolvase  35.5 
 
 		 245 aa  108  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.86084  normal  1 
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2479  hypothetical protein  37.6 
 
 		 138 aa  85.5  5e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.802993 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20410  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  31.55 
 
 		 194 aa  76.6  0.0000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0661103 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0026  resolvase family site-specific recombinase  41 
 
 		 102 aa  76.3  0.0000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  decreased coverage  0.000122476  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1467  resolvase-like protein  32.98 
 
 		 196 aa  74.7  0.0000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0019  Resolvase domain protein  33.16 
 
 		 195 aa  72.8  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1006  Resolvase domain protein  29.95 
 
 		 189 aa  72.8  0.000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2019  resolvase family site-specific recombinase  46.75 
 
 		 91 aa  72.4  0.000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3678  Resolvase domain  28.06 
 
 		 190 aa  70.5  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134045  n/a   
 
 
-
 
NC_010715  Nther_2949  Resolvase domain  28.08 
 
 		 202 aa  70.5  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.587528  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0260  resolvase family site-specific recombinase  28.87 
 
 		 205 aa  69.7  0.00000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1082  resolvase family site-specific recombinase  28.87 
 
 		 205 aa  69.7  0.00000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.271311  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3124  resolvase domain-containing protein  31.03 
 
 		 194 aa  69.7  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0904767  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0039  resolvase  27.04 
 
 		 181 aa  69.3  0.00000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0293678  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4357  resolvase-like protein  34.68 
 
 		 309 aa  68.2  0.00000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4598  Resolvase domain protein  32.65 
 
 		 188 aa  67.4  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4473  serine-based site-specific recombinase activity TnpR  28.21 
 
 		 186 aa  67  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0992302  decreased coverage  0.00348712 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4599  serine-based site-specific recombinase activity TnpR  28.21 
 
 		 186 aa  67  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000321893  hitchhiker  0.00456228 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15430  putative resolvase, essential for transposition  28.21 
 
 		 186 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  7.34084e-16  unclonable  6.55355e-22 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1206  Resolvase domain protein  28.21 
 
 		 186 aa  67  0.0000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1490  resolvase domain-containing protein  29.5 
 
 		 183 aa  66.6  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.832501  hitchhiker  0.00333462 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5553  resolvase domain protein  30.54 
 
 		 515 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.919369999999999e-21 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1711  integrative genetic element Gsu5, resolvase  26.6 
 
 		 190 aa  65.9  0.0000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0316952  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0053  transposon Tn21 resolvase  27.18 
 
 		 186 aa  65.9  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.509225 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4319  resolvase domain-containing protein  27.18 
 
 		 186 aa  65.9  0.0000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0687  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  32.04 
 
 		 200 aa  64.7  0.0000000009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.731539  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1807  resolvase domain-containing protein  27.23 
 
 		 201 aa  64.3  0.000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.261116  unclonable  0.00000000603181 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0043  hypothetical protein  28.95 
 
 		 188 aa  64.3  0.000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0041  resolvase domain-containing protein  28.5 
 
 		 184 aa  64.3  0.000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.0000573211 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4253  resolvase-like protein  28.64 
 
 		 201 aa  64.3  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.35703  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4263  resolvase-like protein  28.64 
 
 		 201 aa  64.3  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3464  resolvase domain-containing protein  29.08 
 
 		 185 aa  63.9  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5396  resolvase domain-containing protein  27.55 
 
 		 180 aa  62.8  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.859533  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1326  resolvase domain-containing protein  29.44 
 
 		 180 aa  63.2  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0166  Resolvase domain protein  31.28 
 
 		 188 aa  63.2  0.000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3075  resolvase domain protein  31.66 
 
 		 191 aa  63.2  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1125  resolvase domain-containing protein  27.18 
 
 		 184 aa  62.8  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.577602  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0204  transposon resolvase  28.22 
 
 		 191 aa  62.4  0.000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000159954 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0068  resolvase  28.87 
 
 		 181 aa  62.8  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0902003  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2033  resolvase domain-containing protein  29.29 
 
 		 192 aa  62.4  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.188765  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0088  resolvase domain-containing protein  27.14 
 
 		 199 aa  62.4  0.000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.223955  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1811  Resolvase domain protein  27.46 
 
 		 183 aa  62.4  0.000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0297206  hitchhiker  0.00833685 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1494  resolvase-like protein  29.74 
 
 		 186 aa  61.6  0.000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.493325 
 
 
-
 
NC_010504  Mrad2831_6517  resolvase domain-containing protein  30.81 
 
 		 185 aa  61.6  0.000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0037  transposon Tn21 resolvase  27.18 
 
 		 205 aa  61.2  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.335597 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0222  transposon resolvase  28.71 
 
 		 199 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000952158 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1762  resolvase-like protein  31.66 
 
 		 192 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2374  resolvase domain-containing protein  31.66 
 
 		 192 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0014  resolvase domain-containing protein  27 
 
 		 184 aa  61.2  0.00000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.125158  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1183  resolvase domain-containing protein  26.53 
 
 		 200 aa  60.1  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.132915  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0105  resolvase, N-terminal:resolvase helix-turn-helix region  32.32 
 
 		 192 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002227  resolvase  32.56 
 
 		 128 aa  60.5  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0466  Resolvase domain  30.37 
 
 		 205 aa  59.7  0.00000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.418385  normal  0.0169839 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3112  Resolvase domain protein  31.9 
 
 		 184 aa  59.7  0.00000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6405  resolvase domain-containing protein  30.05 
 
 		 185 aa  59.7  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3670  resolvase domain-containing protein  27.55 
 
 		 185 aa  59.7  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2582  resolvase domain-containing protein  27.22 
 
 		 185 aa  59.7  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6810  Resolvase domain protein  30.93 
 
 		 185 aa  59.7  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.67902  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>