More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_1355 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007969  Pcryo_1355  resolvase-like protein  100 
 
 
190 aa  383  1e-106  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.141663 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0719  resolvase domain-containing protein  93.09 
 
 
197 aa  356  9e-98  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000179161 
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2477  resolvase-like protein  86.24 
 
 
198 aa  328  2e-89  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.131622  normal  0.782919 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0873  Resolvase domain protein  46.43 
 
 
206 aa  157  1e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0078  TnpR  41.29 
 
 
220 aa  143  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.569126 
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_44  putative resolvase  40.61 
 
 
211 aa  132  3e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0377389  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0298  resolvase, putative  42.35 
 
 
205 aa  130  9e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01413  resolvase, putative  39.09 
 
 
207 aa  130  1.0000000000000001e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_03  resolvase  39.29 
 
 
209 aa  128  5.0000000000000004e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3590  resolvase domain protein  42.19 
 
 
208 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000308956 
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0054  resolvase domain-containing protein  39.09 
 
 
213 aa  125  3e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4402  resolvase domain-containing protein  38.58 
 
 
213 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0024  resolvase, putative  39.29 
 
 
206 aa  123  1e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000663819  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0021  resolvase, putative  39.29 
 
 
221 aa  123  1e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00853796  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4266  resolvase domain-containing protein  39 
 
 
231 aa  118  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000000000120246  unclonable  5.20349e-19 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4246  Resolvase domain protein  40.83 
 
 
205 aa  117  7.999999999999999e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1801  resolvase domain-containing protein  38.07 
 
 
228 aa  115  3e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.118365 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0123  putative resolvase  38.07 
 
 
206 aa  116  3e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  6.922970000000001e-26 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4161  Resolvase domain  36.6 
 
 
206 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0571  resolvase domain-containing protein  39.05 
 
 
210 aa  113  2.0000000000000002e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009516  PsycPRwf_2397  resolvase domain-containing protein  41.77 
 
 
210 aa  112  4.0000000000000004e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0077  resolvase family site-specific recombinase  35.18 
 
 
211 aa  109  3e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.349046  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0950  resolvase domain-containing protein  35.2 
 
 
207 aa  108  7.000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3278  resolvase domain-containing protein  37.95 
 
 
208 aa  107  8.000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.312644  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3979  resolvase domain-containing protein  39.05 
 
 
208 aa  107  1e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6887  resolvase domain-containing protein  37.24 
 
 
210 aa  107  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4386  resolvase domain-containing protein  39.76 
 
 
209 aa  105  3e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4533  resolvase domain-containing protein  35.47 
 
 
214 aa  105  3e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2180  resolvase domain-containing protein  38.55 
 
 
212 aa  103  1e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.52939  n/a   
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4355  Resolvase domain protein  35.57 
 
 
200 aa  103  1e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1306  resolvase domain-containing protein  37.06 
 
 
205 aa  103  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.92579  n/a   
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4562  resolvase domain-containing protein  39.16 
 
 
209 aa  103  2e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.338072  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001518  resolvase  36.92 
 
 
204 aa  103  2e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000153211  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4455  resolvase domain-containing protein  39.16 
 
 
203 aa  102  3e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4460  Resolvase domain protein  39.16 
 
 
209 aa  102  3e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4343  Resolvase domain protein  38.32 
 
 
202 aa  102  3e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000112202  normal 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4666  resolvase domain-containing protein  38.32 
 
 
202 aa  102  3e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000148612  normal  0.936039 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4408  resolvase domain-containing protein  38.32 
 
 
202 aa  102  3e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000545957  normal  0.0701498 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2559  resolvase-like protein  34.3 
 
 
222 aa  102  5e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.22678 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6519  resolvase  34.54 
 
 
283 aa  84.7  7e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3355  resolvase domain-containing protein  30.41 
 
 
301 aa  70.9  0.00000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0978291  normal  0.274195 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0037  resolvase  28.06 
 
 
245 aa  68.2  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.489197  normal  0.472165 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3170  resolvase domain-containing protein  27.55 
 
 
200 aa  67  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00430122 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0466  Resolvase domain  30.69 
 
 
205 aa  65.9  0.0000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.418385  normal  0.0169839 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3876  resolvase domain-containing protein  28.65 
 
 
199 aa  65.9  0.0000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.3792 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3680  resolvase domain-containing protein  28.65 
 
 
199 aa  65.9  0.0000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4081  resolvase domain-containing protein  28.65 
 
 
199 aa  65.9  0.0000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0381075 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0088  resolvase domain-containing protein  27.41 
 
 
199 aa  65.5  0.0000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.223955  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0094  resolvase  27.55 
 
 
245 aa  65.5  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.86084  normal 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08245  resolvase  29.84 
 
 
179 aa  65.1  0.0000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4537  Resolvase domain protein  27.13 
 
 
198 aa  64.7  0.0000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.41321 
 
 
-
 
NC_010715  Nther_2949  Resolvase domain  24.74 
 
 
202 aa  64.7  0.0000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.587528  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1807  resolvase domain-containing protein  27.41 
 
 
201 aa  64.3  0.000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.261116  unclonable  0.00000000603181 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1052  Resolvase domain  29.53 
 
 
186 aa  64.3  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1711  integrative genetic element Gsu5, resolvase  27.23 
 
 
190 aa  62  0.000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0316952  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1397  Resolvase domain protein  30.41 
 
 
209 aa  62  0.000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.954133  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3112  Resolvase domain protein  30.37 
 
 
184 aa  61.6  0.000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7006  hypothetical protein  28.95 
 
 
183 aa  61.6  0.000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0438  putative resolvase  27.37 
 
 
318 aa  60.1  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6810  Resolvase domain protein  29.56 
 
 
185 aa  59.7  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.67902  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4084  resolvase domain-containing protein  27.32 
 
 
188 aa  60.1  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.236689  normal  0.0346573 
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2479  hypothetical protein  34.69 
 
 
138 aa  59.7  0.00000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.802993 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0471  resolvase  26.04 
 
 
197 aa  59.7  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2582  resolvase domain-containing protein  27.75 
 
 
185 aa  60.1  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0955  Resolvase domain protein  30.05 
 
 
194 aa  58.9  0.00000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0816  resolvase domain-containing protein  28.93 
 
 
185 aa  58.9  0.00000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1006  Resolvase domain protein  26.56 
 
 
189 aa  58.9  0.00000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_42  putative resolvase  29.01 
 
 
181 aa  58.9  0.00000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0684051  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4386  resolvase  31.12 
 
 
219 aa  58.9  0.00000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0039  resolvase  28.65 
 
 
181 aa  58.9  0.00000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0293678  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5397  Resolvase domain protein  29.02 
 
 
185 aa  58.5  0.00000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010374  M446_7059  hypothetical protein  29.79 
 
 
183 aa  58.5  0.00000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0466  resolvase  31.41 
 
 
193 aa  58.5  0.00000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.736746  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2095  Resolvase domain protein  29.71 
 
 
203 aa  58.2  0.00000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3678  Resolvase domain  29.7 
 
 
190 aa  57.8  0.00000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134045  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3992  resolvase domain-containing protein  30.59 
 
 
195 aa  57.4  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.378658  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2312  Resolvase domain  29.34 
 
 
201 aa  57.8  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0246  resolvase domain-containing protein  30.82 
 
 
179 aa  57.8  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.315323  normal 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0149  resolvase  28.35 
 
 
189 aa  57.4  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1325  resolvase domain-containing protein  27.8 
 
 
192 aa  57.4  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3670  resolvase domain-containing protein  27.27 
 
 
185 aa  56.6  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0172  recombinase  31.01 
 
 
545 aa  56.2  0.0000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6405  resolvase domain-containing protein  27.89 
 
 
185 aa  56.2  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4154  resolvase domain-containing protein  28.3 
 
 
199 aa  55.8  0.0000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3655  Resolvase domain protein  29.84 
 
 
212 aa  55.5  0.0000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0554731  normal  0.301287 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0235  resolvase domain-containing protein  29.09 
 
 
187 aa  55.1  0.0000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008263  CPR_A0002  resolvase  28.5 
 
 
190 aa  55.1  0.0000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141759  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29040  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  29.17 
 
 
197 aa  54.7  0.0000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.436309  normal 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0043  hypothetical protein  27.18 
 
 
188 aa  54.3  0.000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1494  resolvase-like protein  27.57 
 
 
186 aa  53.9  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.493325 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2494  resolvase domain-containing protein  28.87 
 
 
191 aa  54.3  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1284  transposon Tn2501 resolvase  29.76 
 
 
191 aa  53.5  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.1264  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0105  resolvase, N-terminal:resolvase helix-turn-helix region  27.98 
 
 
192 aa  53.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3572  Resolvase domain protein  29.32 
 
 
213 aa  53.1  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000252709  hitchhiker  0.00189094 
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0011  RlgA  28.95 
 
 
186 aa  53.1  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.928686  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2757  resolvase domain-containing protein  27.75 
 
 
188 aa  52.8  0.000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20410  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  28.5 
 
 
194 aa  52.8  0.000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0661103 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2427  resolvase domain-containing protein  28.8 
 
 
193 aa  52.8  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0929457  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2374  resolvase domain-containing protein  28.27 
 
 
192 aa  52.8  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0041  resolvase domain-containing protein  27.23 
 
 
184 aa  52.8  0.000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  decreased coverage  0.0000573211 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>