More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_0123 on replicon NC_010158
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010158  YpAngola_0123  putative resolvase  100 
 
 		 206 aa  420  1e-117  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  6.922970000000001e-26 
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_44  putative resolvase  60.1 
 
 		 211 aa  252  3e-66  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0377389  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0077  resolvase family site-specific recombinase  58.62 
 
 		 211 aa  250  9.000000000000001e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.349046  n/a   
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_03  resolvase  59.41 
 
 		 209 aa  247  1e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009516  PsycPRwf_2397  resolvase domain-containing protein  50.5 
 
 		 210 aa  212  2.9999999999999995e-54  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4666  resolvase domain-containing protein  52.5 
 
 		 202 aa  211  5.999999999999999e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000148612  normal  0.936039 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4343  Resolvase domain protein  52.5 
 
 		 202 aa  211  5.999999999999999e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000112202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4266  resolvase domain-containing protein  52.71 
 
 		 231 aa  211  5.999999999999999e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000000000120246  unclonable  5.20349e-19 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4408  resolvase domain-containing protein  52.5 
 
 		 202 aa  211  5.999999999999999e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000545957  normal  0.0701498 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4246  Resolvase domain protein  52.22 
 
 		 205 aa  206  1e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0571  resolvase domain-containing protein  51.23 
 
 		 210 aa  207  1e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0298  resolvase, putative  53 
 
 		 205 aa  204  1e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01413  resolvase, putative  49.5 
 
 		 207 aa  198  3.9999999999999996e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0021  resolvase, putative  49.5 
 
 		 221 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00853796  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0024  resolvase, putative  49 
 
 		 206 aa  196  3e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000663819  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4161  Resolvase domain  50.75 
 
 		 206 aa  187  7e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4533  resolvase domain-containing protein  46.67 
 
 		 214 aa  184  9e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0054  resolvase domain-containing protein  45.81 
 
 		 213 aa  183  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3979  resolvase domain-containing protein  49.5 
 
 		 208 aa  182  3e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4402  resolvase domain-containing protein  45.32 
 
 		 213 aa  180  2e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0950  resolvase domain-containing protein  50.24 
 
 		 207 aa  179  4e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6887  resolvase domain-containing protein  49.75 
 
 		 210 aa  176  2e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0873  Resolvase domain protein  45.5 
 
 		 206 aa  171  5e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3278  resolvase domain-containing protein  49.25 
 
 		 208 aa  171  6.999999999999999e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.312644  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1306  resolvase domain-containing protein  48.76 
 
 		 205 aa  170  2e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.92579  n/a   
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0078  TnpR  42.13 
 
 		 220 aa  164  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.569126 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001518  resolvase  41.5 
 
 		 204 aa  159  2e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000153211  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3590  resolvase domain protein  43.59 
 
 		 208 aa  159  2e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000308956 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1801  resolvase domain-containing protein  45.85 
 
 		 228 aa  157  1e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.118365 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2180  resolvase domain-containing protein  43.48 
 
 		 212 aa  155  5.0000000000000005e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.52939  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4455  resolvase domain-containing protein  43.48 
 
 		 203 aa  155  6e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4460  Resolvase domain protein  43 
 
 		 209 aa  151  5e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4562  resolvase domain-containing protein  42.51 
 
 		 209 aa  150  8.999999999999999e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.338072  normal  1 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4355  Resolvase domain protein  43.72 
 
 		 200 aa  150  2e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4386  resolvase domain-containing protein  42.03 
 
 		 209 aa  149  4e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2477  resolvase-like protein  39.71 
 
 		 198 aa  131  6.999999999999999e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.131622  normal  0.782919 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2559  resolvase-like protein  36.28 
 
 		 222 aa  125  4.0000000000000003e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.22678 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0719  resolvase domain-containing protein  38.61 
 
 		 197 aa  121  8e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000179161 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1355  resolvase-like protein  38.07 
 
 		 190 aa  116  3e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.141663 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6519  resolvase  34.98 
 
 		 283 aa  109  3e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0094  resolvase  35.32 
 
 		 245 aa  107  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.86084  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3355  resolvase domain-containing protein  36.95 
 
 		 301 aa  106  2e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0978291  normal  0.274195 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0037  resolvase  36.45 
 
 		 245 aa  105  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.489197  normal  0.472165 
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2479  hypothetical protein  45.28 
 
 		 138 aa  103  2e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.802993 
 
 
-
 
NC_010715  Nther_2949  Resolvase domain  28.64 
 
 		 202 aa  85.5  6e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.587528  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1811  Resolvase domain protein  30.46 
 
 		 183 aa  82  0.000000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0297206  hitchhiker  0.00833685 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1006  Resolvase domain protein  29.38 
 
 		 189 aa  72.8  0.000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1711  integrative genetic element Gsu5, resolvase  29.86 
 
 		 190 aa  71.2  0.000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0316952  n/a   
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0011  RlgA  32.54 
 
 		 186 aa  69.7  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.928686  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2582  resolvase domain-containing protein  32.75 
 
 		 185 aa  67.8  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0216  transposon resolvase  28.64 
 
 		 199 aa  67  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.159168 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2781  resolvase domain-containing protein  29.41 
 
 		 190 aa  67  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.183587  normal  0.43479 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3112  Resolvase domain protein  30.05 
 
 		 184 aa  67  0.0000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0127  resolvase family site-specific recombinase  48.68 
 
 		 87 aa  66.6  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.364122  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0466  Resolvase domain  28.28 
 
 		 205 aa  66.2  0.0000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.418385  normal  0.0169839 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0580  resolvase domain-containing protein  32.21 
 
 		 186 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0611  Resolvase domain protein  32.21 
 
 		 186 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0605  resolvase domain-containing protein  32.21 
 
 		 186 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.177837 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3135  resolvase TnpR  28.17 
 
 		 217 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3670  resolvase domain-containing protein  31.03 
 
 		 185 aa  65.9  0.0000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010373  M446_7006  hypothetical protein  31.73 
 
 		 183 aa  65.9  0.0000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0039  resolvase  29.27 
 
 		 181 aa  65.9  0.0000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0293678  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0222  transposon resolvase  28.64 
 
 		 199 aa  65.5  0.0000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000952158 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3170  resolvase domain-containing protein  30.65 
 
 		 200 aa  65.5  0.0000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00430122 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0043  hypothetical protein  29.23 
 
 		 188 aa  64.7  0.0000000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1445  Resolvase domain  30.82 
 
 		 188 aa  63.9  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0204  transposon resolvase  27.14 
 
 		 191 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000159954 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2355  Resolvase domain protein  28.92 
 
 		 186 aa  63.5  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.230305  normal  0.6636 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1125  resolvase domain-containing protein  29.29 
 
 		 184 aa  63.2  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.577602  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1325  resolvase domain-containing protein  26.32 
 
 		 192 aa  63.5  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0053  transposon Tn21 resolvase  29.59 
 
 		 186 aa  62.8  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.509225 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6405  resolvase domain-containing protein  31.25 
 
 		 185 aa  62.8  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4319  resolvase domain-containing protein  29.59 
 
 		 186 aa  62.8  0.000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1594  resolvase domain-containing protein  29.13 
 
 		 189 aa  62.4  0.000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.94865  normal  0.455677 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004307  resolvase N-terminal domain protein  30.95 
 
 		 190 aa  62.8  0.000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.179008  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2033  resolvase domain-containing protein  28.86 
 
 		 192 aa  62.4  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.188765  n/a   
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4352  Resolvase domain protein  28.43 
 
 		 186 aa  62  0.000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00813261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4489  Resolvase domain protein  28.43 
 
 		 186 aa  62  0.000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000146883  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4598  Resolvase domain protein  28.64 
 
 		 188 aa  62  0.000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3423  Resolvase domain protein  27.23 
 
 		 185 aa  61.6  0.000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3678  Resolvase domain  29.52 
 
 		 190 aa  61.6  0.000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134045  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2019  resolvase family site-specific recombinase  42.86 
 
 		 91 aa  61.2  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0026  resolvase family site-specific recombinase  42.53 
 
 		 102 aa  61.2  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  decreased coverage  0.000122476  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0816  resolvase domain-containing protein  30.95 
 
 		 185 aa  60.8  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6810  Resolvase domain protein  30.77 
 
 		 185 aa  60.8  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.67902  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2179  resolvase domain-containing protein  29.27 
 
 		 188 aa  60.1  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0190993  hitchhiker  0.0022624 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3847  resolvase-like protein  27.36 
 
 		 191 aa  60.5  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.388128  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2946  resolvase domain-containing protein  29.27 
 
 		 188 aa  60.1  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0986415  normal  0.227448 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2494  resolvase domain-containing protein  29.67 
 
 		 191 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010374  M446_7059  hypothetical protein  29.47 
 
 		 183 aa  59.7  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3928  resolvase domain-containing protein  31.12 
 
 		 191 aa  59.7  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.272515  hitchhiker  0.0000753359 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1807  resolvase domain-containing protein  26.54 
 
 		 201 aa  59.3  0.00000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.261116  unclonable  0.00000000603181 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0037  transposon Tn21 resolvase  27.96 
 
 		 205 aa  59.3  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.335597 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1132  Resolvase domain  30.54 
 
 		 184 aa  58.9  0.00000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003898  resolvase putative  30.2 
 
 		 202 aa  58.5  0.00000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3410  Resolvase domain protein  27.49 
 
 		 206 aa  58.5  0.00000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.260918 
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5396  resolvase domain-containing protein  27.36 
 
 		 180 aa  58.5  0.00000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.859533  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5792  resolvase TnpR  27 
 
 		 212 aa  58.2  0.00000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.923438  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3124  resolvase domain-containing protein  26.11 
 
 		 194 aa  58.2  0.00000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0904767  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1284  transposon Tn2501 resolvase  30.14 
 
 		 191 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.1264  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>