280 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_A0077 on replicon NC_004349
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004349  SO_A0077  resolvase family site-specific recombinase  100 
 
 		 211 aa  431  1e-120  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.349046  n/a   
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_44  putative resolvase  68.97 
 
 		 211 aa  293  2e-78  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0377389  n/a   
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_03  resolvase  66.83 
 
 		 209 aa  286  1e-76  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0123  putative resolvase  58.62 
 
 		 206 aa  250  9.000000000000001e-66  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  6.922970000000001e-26 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4666  resolvase domain-containing protein  52.45 
 
 		 202 aa  210  1e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000148612  normal  0.936039 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4343  Resolvase domain protein  52.45 
 
 		 202 aa  210  1e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000112202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4408  resolvase domain-containing protein  52.45 
 
 		 202 aa  210  1e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000545957  normal  0.0701498 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0298  resolvase, putative  51.5 
 
 		 205 aa  204  9e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0021  resolvase, putative  49.27 
 
 		 221 aa  201  5e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00853796  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4246  Resolvase domain protein  49.75 
 
 		 205 aa  201  6e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0024  resolvase, putative  48.78 
 
 		 206 aa  201  9e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000663819  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0054  resolvase domain-containing protein  49.75 
 
 		 213 aa  199  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4402  resolvase domain-containing protein  50.25 
 
 		 213 aa  199  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4266  resolvase domain-containing protein  50.96 
 
 		 231 aa  199  3e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000000000120246  unclonable  5.20349e-19 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01413  resolvase, putative  50 
 
 		 207 aa  198  5e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4533  resolvase domain-containing protein  50 
 
 		 214 aa  198  5e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0571  resolvase domain-containing protein  48.28 
 
 		 210 aa  196  2.0000000000000003e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4161  Resolvase domain  51.52 
 
 		 206 aa  195  4.0000000000000005e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009516  PsycPRwf_2397  resolvase domain-containing protein  49.01 
 
 		 210 aa  192  3e-48  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3979  resolvase domain-containing protein  49.02 
 
 		 208 aa  180  2e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0950  resolvase domain-containing protein  46.34 
 
 		 207 aa  174  7e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0078  TnpR  46.55 
 
 		 220 aa  173  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.569126 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3278  resolvase domain-containing protein  58.02 
 
 		 208 aa  172  2.9999999999999996e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.312644  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6887  resolvase domain-containing protein  45.5 
 
 		 210 aa  169  4e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1306  resolvase domain-containing protein  57.41 
 
 		 205 aa  168  5e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.92579  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0873  Resolvase domain protein  46.29 
 
 		 206 aa  167  9e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3590  resolvase domain protein  44 
 
 		 208 aa  157  1e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000308956 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4460  Resolvase domain protein  43.56 
 
 		 209 aa  153  2e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4455  resolvase domain-containing protein  43.07 
 
 		 203 aa  153  2e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4562  resolvase domain-containing protein  43.56 
 
 		 209 aa  152  5e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.338072  normal  1 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4355  Resolvase domain protein  43.56 
 
 		 200 aa  151  7e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2180  resolvase domain-containing protein  43.07 
 
 		 212 aa  150  1e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.52939  n/a   
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4386  resolvase domain-containing protein  43.07 
 
 		 209 aa  150  2e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2559  resolvase-like protein  43.32 
 
 		 222 aa  140  9.999999999999999e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.22678 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1801  resolvase domain-containing protein  40.69 
 
 		 228 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.118365 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001518  resolvase  40.44 
 
 		 204 aa  138  6e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000153211  n/a   
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2477  resolvase-like protein  38.73 
 
 		 198 aa  128  6e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.131622  normal  0.782919 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0719  resolvase domain-containing protein  35.64 
 
 		 197 aa  117  1.9999999999999998e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000179161 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6519  resolvase  35.78 
 
 		 283 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1355  resolvase-like protein  35.18 
 
 		 190 aa  109  3e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.141663 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3355  resolvase domain-containing protein  36.87 
 
 		 301 aa  105  6e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0978291  normal  0.274195 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0094  resolvase  34.67 
 
 		 245 aa  102  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.86084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0037  resolvase  34.8 
 
 		 245 aa  101  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.489197  normal  0.472165 
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2479  hypothetical protein  43.86 
 
 		 138 aa  99.4  4e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.802993 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3670  resolvase domain-containing protein  35.12 
 
 		 185 aa  77.8  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2582  resolvase domain-containing protein  32.39 
 
 		 185 aa  77.4  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3124  resolvase domain-containing protein  32.84 
 
 		 194 aa  76.6  0.0000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0904767  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3678  Resolvase domain  35.15 
 
 		 190 aa  75.9  0.0000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134045  n/a   
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0127  resolvase family site-specific recombinase  57.81 
 
 		 87 aa  72.8  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.364122  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6405  resolvase domain-containing protein  32.84 
 
 		 185 aa  72  0.000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1811  Resolvase domain protein  28.22 
 
 		 183 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0297206  hitchhiker  0.00833685 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1006  Resolvase domain protein  31.55 
 
 		 189 aa  70.5  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1132  Resolvase domain  32.14 
 
 		 184 aa  69.3  0.00000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1711  integrative genetic element Gsu5, resolvase  32.14 
 
 		 190 aa  68.9  0.00000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0316952  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0816  resolvase domain-containing protein  31.86 
 
 		 185 aa  68.9  0.00000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0260  resolvase family site-specific recombinase  32.74 
 
 		 205 aa  68.9  0.00000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1082  resolvase family site-specific recombinase  32.74 
 
 		 205 aa  68.9  0.00000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.271311  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6810  Resolvase domain protein  31.86 
 
 		 185 aa  68.6  0.00000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.67902  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0037  transposon Tn21 resolvase  31.21 
 
 		 205 aa  68.2  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.335597 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4473  serine-based site-specific recombinase activity TnpR  31.21 
 
 		 186 aa  67.8  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0992302  decreased coverage  0.00348712 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4599  serine-based site-specific recombinase activity TnpR  31.21 
 
 		 186 aa  67.8  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000321893  hitchhiker  0.00456228 
 
 
-
 
NC_010715  Nther_2949  Resolvase domain  29.38 
 
 		 202 aa  67.8  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.587528  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15430  putative resolvase, essential for transposition  31.21 
 
 		 186 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  7.34084e-16  unclonable  6.55355e-22 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4489  Resolvase domain protein  30 
 
 		 186 aa  67  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000146883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0039  resolvase  30.05 
 
 		 181 aa  67  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0293678  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2355  Resolvase domain protein  31.86 
 
 		 186 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.230305  normal  0.6636 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4352  Resolvase domain protein  30 
 
 		 186 aa  67  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00813261  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1445  Resolvase domain  29.38 
 
 		 188 aa  66.6  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2946  resolvase domain-containing protein  27.08 
 
 		 188 aa  65.5  0.0000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0986415  normal  0.227448 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2179  resolvase domain-containing protein  27.08 
 
 		 188 aa  65.5  0.0000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0190993  hitchhiker  0.0022624 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4319  resolvase domain-containing protein  30.64 
 
 		 186 aa  65.9  0.0000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0053  transposon Tn21 resolvase  30.64 
 
 		 186 aa  65.9  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.509225 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1494  resolvase-like protein  32.5 
 
 		 186 aa  64.7  0.0000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.493325 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3464  resolvase domain-containing protein  30.63 
 
 		 185 aa  64.7  0.0000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0011  RlgA  30.54 
 
 		 186 aa  64.3  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.928686  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2033  resolvase domain-containing protein  31.87 
 
 		 192 aa  64.3  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.188765  n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0043  hypothetical protein  29.81 
 
 		 188 aa  64.3  0.000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1807  resolvase domain-containing protein  28.1 
 
 		 201 aa  64.3  0.000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.261116  unclonable  0.00000000603181 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1206  Resolvase domain protein  31.79 
 
 		 186 aa  64.3  0.000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0088  resolvase domain-containing protein  28.57 
 
 		 199 aa  63.9  0.000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.223955  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5397  Resolvase domain protein  32.53 
 
 		 185 aa  63.9  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1256  resolvase domain-containing protein  29.48 
 
 		 185 aa  63.2  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.249423  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01209  bacteriocin production protein  31.61 
 
 		 198 aa  63.2  0.000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000702686  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2680  resolvase domain-containing protein  29.48 
 
 		 185 aa  63.2  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3829  resolvase domain-containing protein  29.48 
 
 		 185 aa  63.2  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3846  resolvase domain-containing protein  29.48 
 
 		 185 aa  63.2  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.40246  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1914  resolvase domain-containing protein  29.48 
 
 		 185 aa  63.2  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3112  Resolvase domain protein  29.27 
 
 		 184 aa  62.4  0.000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7006  hypothetical protein  31.61 
 
 		 183 aa  62.4  0.000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0466  Resolvase domain  31.18 
 
 		 205 aa  62  0.000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.418385  normal  0.0169839 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2019  resolvase family site-specific recombinase  45.56 
 
 		 91 aa  62  0.000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1326  resolvase domain-containing protein  28.26 
 
 		 180 aa  62  0.000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0049  recombinase  25.25 
 
 		 220 aa  61.6  0.000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00880033  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0246  resolvase domain-containing protein  29.52 
 
 		 179 aa  61.6  0.000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.315323  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0026  resolvase family site-specific recombinase  42.86 
 
 		 102 aa  61.6  0.000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  decreased coverage  0.000122476  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1183  resolvase domain-containing protein  25.12 
 
 		 200 aa  61.6  0.000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.132915  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3992  resolvase domain-containing protein  27.27 
 
 		 195 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.378658  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5093  resolvase domain-containing protein  28.29 
 
 		 201 aa  60.5  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.993134 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6187  resolvase-like protein  30 
 
 		 186 aa  59.7  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0984609  hitchhiker  0.0000107923 
 
 
-
 
NC_010374  M446_7059  hypothetical protein  29.85 
 
 		 183 aa  59.7  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>