237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_D6519 on replicon NC_007337
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007337  Reut_D6519  resolvase  100 
 
 		 283 aa  564  1e-160  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3355  resolvase domain-containing protein  77.94 
 
 		 301 aa  321  7e-87  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0978291  normal  0.274195 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0037  resolvase  76.96 
 
 		 245 aa  312  4.999999999999999e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.489197  normal  0.472165 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0094  resolvase  76.47 
 
 		 245 aa  310  2e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.86084  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0298  resolvase, putative  41.33 
 
 		 205 aa  132  6.999999999999999e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4386  resolvase domain-containing protein  38.14 
 
 		 209 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4455  resolvase domain-containing protein  37.63 
 
 		 203 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2180  resolvase domain-containing protein  37.63 
 
 		 212 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.52939  n/a   
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4355  Resolvase domain protein  37.24 
 
 		 200 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4460  Resolvase domain protein  37.63 
 
 		 209 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4562  resolvase domain-containing protein  37.63 
 
 		 209 aa  119  6e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.338072  normal  1 
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0078  TnpR  34.16 
 
 		 220 aa  119  7.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.569126 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0571  resolvase domain-containing protein  36.71 
 
 		 210 aa  112  5e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4161  Resolvase domain  36.22 
 
 		 206 aa  112  8.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4266  resolvase domain-containing protein  37.68 
 
 		 231 aa  112  9e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000000000120246  unclonable  5.20349e-19 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0077  resolvase family site-specific recombinase  35.78 
 
 		 211 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.349046  n/a   
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_03  resolvase  34.65 
 
 		 209 aa  110  2.0000000000000002e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0123  putative resolvase  34.98 
 
 		 206 aa  109  6e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  6.922970000000001e-26 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01413  resolvase, putative  34.85 
 
 		 207 aa  108  7.000000000000001e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001518  resolvase  35.11 
 
 		 204 aa  108  1e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000153211  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0021  resolvase, putative  36.68 
 
 		 221 aa  107  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00853796  n/a   
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4408  resolvase domain-containing protein  33.33 
 
 		 202 aa  107  2e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000545957  normal  0.0701498 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4666  resolvase domain-containing protein  33.33 
 
 		 202 aa  107  2e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000148612  normal  0.936039 
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0054  resolvase domain-containing protein  34.13 
 
 		 213 aa  107  2e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_44  putative resolvase  33.84 
 
 		 211 aa  107  2e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0377389  n/a   
 
 
-
 
NC_009516  PsycPRwf_2397  resolvase domain-containing protein  35.35 
 
 		 210 aa  107  2e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4343  Resolvase domain protein  33.33 
 
 		 202 aa  107  2e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000112202  normal  1 
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0024  resolvase, putative  36.18 
 
 		 206 aa  106  4e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000663819  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4402  resolvase domain-containing protein  34.3 
 
 		 213 aa  105  6e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4246  Resolvase domain protein  35.42 
 
 		 205 aa  103  3e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1801  resolvase domain-containing protein  32.26 
 
 		 228 aa  103  4e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.118365 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0873  Resolvase domain protein  37.14 
 
 		 206 aa  102  5e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1306  resolvase domain-containing protein  35.38 
 
 		 205 aa  101  1e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.92579  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3278  resolvase domain-containing protein  35.38 
 
 		 208 aa  100  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.312644  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3590  resolvase domain protein  32.49 
 
 		 208 aa  99.4  7e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000308956 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0950  resolvase domain-containing protein  33 
 
 		 207 aa  97.1  3e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4533  resolvase domain-containing protein  31.19 
 
 		 214 aa  95.5  9e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2477  resolvase-like protein  35.86 
 
 		 198 aa  92.8  6e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.131622  normal  0.782919 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0719  resolvase domain-containing protein  35.35 
 
 		 197 aa  92.4  7e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000179161 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2559  resolvase-like protein  33.49 
 
 		 222 aa  89  7e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.22678 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6887  resolvase domain-containing protein  35.68 
 
 		 210 aa  89  7e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3979  resolvase domain-containing protein  33.68 
 
 		 208 aa  88.6  1e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1355  resolvase-like protein  34.54 
 
 		 190 aa  84.7  0.000000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.141663 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1132  Resolvase domain  35.22 
 
 		 184 aa  76.6  0.0000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1711  integrative genetic element Gsu5, resolvase  33 
 
 		 190 aa  72.4  0.000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0316952  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2582  resolvase domain-containing protein  34.48 
 
 		 185 aa  72.4  0.000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4084  resolvase domain-containing protein  32.82 
 
 		 188 aa  71.6  0.00000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.236689  normal  0.0346573 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0687  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  31.19 
 
 		 200 aa  69.3  0.00000000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.731539  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3124  resolvase domain-containing protein  32.72 
 
 		 194 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0904767  n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08245  resolvase  29.69 
 
 		 179 aa  67  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20410  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  29.95 
 
 		 194 aa  67.4  0.0000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0661103 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0246  resolvase domain-containing protein  29.02 
 
 		 179 aa  67  0.0000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.315323  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01209  bacteriocin production protein  29.5 
 
 		 198 aa  64.7  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000702686  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3678  Resolvase domain  31.77 
 
 		 190 aa  63.9  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134045  n/a   
 
 
-
 
NC_010374  M446_7059  hypothetical protein  34.16 
 
 		 183 aa  63.5  0.000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0011  RlgA  34.15 
 
 		 186 aa  62.8  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.928686  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1052  Resolvase domain  29.74 
 
 		 186 aa  62.4  0.000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010373  M446_7006  hypothetical protein  33.66 
 
 		 183 aa  61.6  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0268  resolvase domain-containing protein  36.68 
 
 		 181 aa  62  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.268273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5093  resolvase domain-containing protein  32.51 
 
 		 201 aa  61.6  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.993134 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0026  resolvase family site-specific recombinase  41.86 
 
 		 102 aa  60.8  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  decreased coverage  0.000122476  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2019  resolvase family site-specific recombinase  41.46 
 
 		 91 aa  61.2  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3553  resolvase domain-containing protein  32.12 
 
 		 181 aa  60.8  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.467372  n/a   
 
 
-
 
NC_008264  CPR_B0006  resolvase  28.79 
 
 		 189 aa  60.5  0.00000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00548662  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1206  Resolvase domain protein  31.55 
 
 		 186 aa  60.1  0.00000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3982  resolvase domain-containing protein  32 
 
 		 201 aa  59.3  0.00000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.364011  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0631  resolvase domain-containing protein  32 
 
 		 201 aa  59.3  0.00000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0580  resolvase domain-containing protein  36.48 
 
 		 186 aa  59.7  0.00000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0611  Resolvase domain protein  36.48 
 
 		 186 aa  59.7  0.00000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0605  resolvase domain-containing protein  36.48 
 
 		 186 aa  59.7  0.00000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.177837 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4473  serine-based site-specific recombinase activity TnpR  30.48 
 
 		 186 aa  58.9  0.00000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0992302  decreased coverage  0.00348712 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4599  serine-based site-specific recombinase activity TnpR  30.48 
 
 		 186 aa  58.9  0.00000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000321893  hitchhiker  0.00456228 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15430  putative resolvase, essential for transposition  30.48 
 
 		 186 aa  58.9  0.00000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  7.34084e-16  unclonable  6.55355e-22 
 
 
-
 
NC_008263  CPR_A0002  resolvase  28.28 
 
 		 190 aa  58.5  0.0000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141759  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0216  transposon resolvase  32.05 
 
 		 199 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.159168 
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_42  putative resolvase  28.87 
 
 		 181 aa  58.9  0.0000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0684051  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0037  transposon Tn21 resolvase  30.48 
 
 		 205 aa  57.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.335597 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1494  resolvase-like protein  31.02 
 
 		 186 aa  57.8  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.493325 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0222  transposon resolvase  25.23 
 
 		 199 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000952158 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2680  resolvase domain-containing protein  29.95 
 
 		 185 aa  57  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3464  resolvase domain-containing protein  29.79 
 
 		 185 aa  57.4  0.0000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3829  resolvase domain-containing protein  29.95 
 
 		 185 aa  57  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3846  resolvase domain-containing protein  29.95 
 
 		 185 aa  57  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.40246  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1914  resolvase domain-containing protein  29.95 
 
 		 185 aa  57  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1256  resolvase domain-containing protein  29.95 
 
 		 185 aa  57  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.249423  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4319  resolvase domain-containing protein  31.02 
 
 		 186 aa  56.6  0.0000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0053  transposon Tn21 resolvase  31.02 
 
 		 186 aa  56.6  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.509225 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0204  transposon resolvase  24.64 
 
 		 191 aa  56.6  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000159954 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6187  resolvase-like protein  30.48 
 
 		 186 aa  56.6  0.0000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0984609  hitchhiker  0.0000107923 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1006  Resolvase domain protein  30.63 
 
 		 189 aa  56.6  0.0000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5459  resolvase domain-containing protein  28.92 
 
 		 190 aa  56.2  0.0000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.358499  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1811  Resolvase domain protein  28.72 
 
 		 183 aa  56.2  0.0000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0297206  hitchhiker  0.00833685 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0206  transposon resolvase  30.71 
 
 		 169 aa  55.8  0.0000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000314886 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3928  resolvase domain-containing protein  28.12 
 
 		 191 aa  55.5  0.0000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.272515  hitchhiker  0.0000753359 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1615  resolvase family site-specific recombinase  47.83 
 
 		 197 aa  55.1  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6405  resolvase domain-containing protein  31.86 
 
 		 185 aa  55.1  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5450  resolvase domain-containing protein  30.39 
 
 		 184 aa  55.1  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0816  resolvase domain-containing protein  31.86 
 
 		 185 aa  55.1  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2355  Resolvase domain protein  30.35 
 
 		 186 aa  55.5  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.230305  normal  0.6636 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2179  resolvase domain-containing protein  26.9 
 
 		 188 aa  54.7  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0190993  hitchhiker  0.0022624 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>