50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_A0026 on replicon NC_004349
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004349  SO_A0026  resolvase family site-specific recombinase  100 
 
 		 102 aa  209  7e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  decreased coverage  0.000122476  n/a   
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4460  Resolvase domain protein  98.04 
 
 		 209 aa  208  2e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4386  resolvase domain-containing protein  97.06 
 
 		 209 aa  206  7e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4562  resolvase domain-containing protein  97.06 
 
 		 209 aa  205  2e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.338072  normal  1 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4355  Resolvase domain protein  97.96 
 
 		 200 aa  200  6e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4455  resolvase domain-containing protein  95.05 
 
 		 203 aa  200  6e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2180  resolvase domain-containing protein  93 
 
 		 212 aa  193  7e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.52939  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2019  resolvase family site-specific recombinase  98.84 
 
 		 91 aa  175  1e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0571  resolvase domain-containing protein  54.22 
 
 		 210 aa  90.1  8e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0078  TnpR  46.39 
 
 		 220 aa  87.8  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.569126 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4666  resolvase domain-containing protein  45.36 
 
 		 202 aa  82.8  0.000000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000148612  normal  0.936039 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4343  Resolvase domain protein  45.36 
 
 		 202 aa  82.8  0.000000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000112202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4408  resolvase domain-containing protein  45.36 
 
 		 202 aa  82.8  0.000000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000545957  normal  0.0701498 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4246  Resolvase domain protein  49.4 
 
 		 205 aa  78.6  0.00000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1801  resolvase domain-containing protein  47.57 
 
 		 228 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.118365 
 
 
-
 
NC_009516  PsycPRwf_2397  resolvase domain-containing protein  43.96 
 
 		 210 aa  77.4  0.00000000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4161  Resolvase domain  41 
 
 		 206 aa  76.3  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001518  resolvase  44.9 
 
 		 204 aa  70.5  0.000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000153211  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0873  Resolvase domain protein  43.59 
 
 		 206 aa  68.6  0.00000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0021  resolvase, putative  45.45 
 
 		 221 aa  67.8  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00853796  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3590  resolvase domain protein  39.53 
 
 		 208 aa  67  0.00000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000308956 
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0024  resolvase, putative  44.32 
 
 		 206 aa  67  0.00000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000663819  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4533  resolvase domain-containing protein  38.1 
 
 		 214 aa  67  0.00000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3979  resolvase domain-containing protein  50.6 
 
 		 208 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0950  resolvase domain-containing protein  45.45 
 
 		 207 aa  64.7  0.0000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2559  resolvase-like protein  36.04 
 
 		 222 aa  63.2  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.22678 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0298  resolvase, putative  40 
 
 		 205 aa  62  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0077  resolvase family site-specific recombinase  42.86 
 
 		 211 aa  61.6  0.000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.349046  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0123  putative resolvase  42.53 
 
 		 206 aa  61.2  0.000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  6.922970000000001e-26 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3355  resolvase domain-containing protein  41.86 
 
 		 301 aa  60.8  0.000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0978291  normal  0.274195 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6519  resolvase  41.86 
 
 		 283 aa  60.8  0.000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_44  putative resolvase  39.02 
 
 		 211 aa  59.7  0.00000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0377389  n/a   
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_03  resolvase  38.64 
 
 		 209 aa  58.5  0.00000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4402  resolvase domain-containing protein  48.15 
 
 		 213 aa  57.8  0.00000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0054  resolvase domain-containing protein  46.3 
 
 		 213 aa  54.3  0.0000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3278  resolvase domain-containing protein  39.77 
 
 		 208 aa  54.7  0.0000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.312644  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6887  resolvase domain-containing protein  40.66 
 
 		 210 aa  53.9  0.0000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0094  resolvase  38.37 
 
 		 245 aa  53.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.86084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1306  resolvase domain-containing protein  39.77 
 
 		 205 aa  53.5  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.92579  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4266  resolvase domain-containing protein  37.21 
 
 		 231 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000000000120246  unclonable  5.20349e-19 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0037  resolvase  38.37 
 
 		 245 aa  53.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.489197  normal  0.472165 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0246  resolvase domain-containing protein  42.11 
 
 		 179 aa  48.1  0.00004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.315323  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01413  resolvase, putative  28.87 
 
 		 207 aa  47.4  0.00007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002227  resolvase  34.62 
 
 		 128 aa  47  0.00009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0466  Resolvase domain  30.86 
 
 		 205 aa  43.1  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.418385  normal  0.0169839 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3678  Resolvase domain  32.53 
 
 		 190 aa  41.2  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134045  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2095  Resolvase domain protein  47.5 
 
 		 203 aa  41.2  0.005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6388  resolvase domain-containing protein  31.58 
 
 		 191 aa  40.8  0.006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0260  resolvase family site-specific recombinase  35.44 
 
 		 205 aa  40.8  0.007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1082  resolvase family site-specific recombinase  35.44 
 
 		 205 aa  40.8  0.007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.271311  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>