More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_0687 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008528  OEOE_0687  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  100 
 
 
200 aa  404  1.0000000000000001e-112  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.731539  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3124  resolvase domain-containing protein  39.58 
 
 
194 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0904767  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5628  Resolvase domain  35.94 
 
 
198 aa  112  3e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.526216 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2351  resolvase-like protein  36.14 
 
 
235 aa  110  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.329475 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1206  Resolvase domain protein  35.42 
 
 
186 aa  107  8.000000000000001e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4764  resolvase domain-containing protein  36.6 
 
 
189 aa  107  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5519  Resolvase domain  34.38 
 
 
197 aa  107  1e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.176111  normal  0.515657 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4473  serine-based site-specific recombinase activity TnpR  35.42 
 
 
186 aa  107  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0992302  decreased coverage  0.00348712 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4599  serine-based site-specific recombinase activity TnpR  35.42 
 
 
186 aa  107  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000321893  hitchhiker  0.00456228 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15430  putative resolvase, essential for transposition  35.42 
 
 
186 aa  107  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  7.34084e-16  unclonable  6.55355e-22 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6417  resolvase domain-containing protein  35.94 
 
 
196 aa  106  3e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1494  resolvase-like protein  35.75 
 
 
186 aa  105  4e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.493325 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7006  hypothetical protein  35 
 
 
183 aa  104  9e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1445  Resolvase domain  35.08 
 
 
188 aa  103  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0204  transposon resolvase  37.5 
 
 
191 aa  102  3e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000159954 
 
 
-
 
NC_010715  Nther_2949  Resolvase domain  34 
 
 
202 aa  102  4e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.587528  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0747  resolvase domain-containing protein  36.73 
 
 
181 aa  102  5e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1125  resolvase domain-containing protein  37.5 
 
 
184 aa  102  5e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.577602  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0222  transposon resolvase  36.98 
 
 
199 aa  102  5e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000952158 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4489  Resolvase domain protein  35.23 
 
 
186 aa  101  6e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000146883  normal 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4352  Resolvase domain protein  35.23 
 
 
186 aa  101  6e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00813261  normal 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6187  resolvase-like protein  34.72 
 
 
186 aa  101  7e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0984609  hitchhiker  0.0000107923 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0216  transposon resolvase  43.15 
 
 
199 aa  101  8e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.159168 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3928  resolvase domain-containing protein  36.46 
 
 
191 aa  100  1e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.272515  hitchhiker  0.0000753359 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0053  transposon Tn21 resolvase  33.33 
 
 
186 aa  100  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.509225 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4885  resolvase domain-containing protein  36.79 
 
 
187 aa  100  1e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4319  resolvase domain-containing protein  33.33 
 
 
186 aa  100  1e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5122  resolvase domain-containing protein  34.9 
 
 
290 aa  99.8  3e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0155  resolvase x  40.79 
 
 
193 aa  98.6  6e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0268  resolvase domain-containing protein  36.22 
 
 
181 aa  98.6  6e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.268273  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0037  transposon Tn21 resolvase  32.99 
 
 
205 aa  98.6  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.335597 
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5396  resolvase domain-containing protein  36.27 
 
 
180 aa  98.2  7e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.859533  n/a   
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3553  resolvase domain-containing protein  36.41 
 
 
181 aa  98.2  7e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.467372  n/a   
 
 
-
 
NC_010374  M446_7059  hypothetical protein  33.85 
 
 
183 aa  98.2  7e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2322  resolvase domain-containing protein  34.38 
 
 
186 aa  97.4  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2680  resolvase domain-containing protein  33.84 
 
 
185 aa  97.4  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3829  resolvase domain-containing protein  33.84 
 
 
185 aa  97.4  1e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3846  resolvase domain-containing protein  33.84 
 
 
185 aa  97.4  1e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.40246  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1914  resolvase domain-containing protein  33.84 
 
 
185 aa  97.4  1e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3992  resolvase domain-containing protein  31.16 
 
 
195 aa  97.8  1e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.378658  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1256  resolvase domain-containing protein  33.84 
 
 
185 aa  97.4  1e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.249423  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0049  recombinase  35.12 
 
 
220 aa  96.7  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00880033  n/a   
 
 
-
 
NC_008264  CPR_B0006  resolvase  33.66 
 
 
189 aa  97.1  2e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00548662  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3982  resolvase domain-containing protein  33.68 
 
 
201 aa  97.1  2e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.364011  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0631  resolvase domain-containing protein  33.68 
 
 
201 aa  97.1  2e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008263  CPR_A0002  resolvase  33.17 
 
 
190 aa  95.9  3e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141759  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3464  resolvase domain-containing protein  33.5 
 
 
185 aa  95.9  3e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4084  resolvase domain-containing protein  34.85 
 
 
188 aa  96.3  3e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.236689  normal  0.0346573 
 
 
-
 
NC_013518  Sterm_4140  Resolvase domain protein  33.33 
 
 
217 aa  95.9  4e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00204948  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3678  Resolvase domain  32.83 
 
 
190 aa  95.5  4e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134045  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20410  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  32.31 
 
 
194 aa  94  1e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0661103 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0090  resolvase TnpR  36.55 
 
 
183 aa  94  1e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.707126  normal  0.345515 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4598  Resolvase domain protein  35.94 
 
 
188 aa  93.2  2e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1711  integrative genetic element Gsu5, resolvase  31.79 
 
 
190 aa  93.6  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0316952  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1132  Resolvase domain  32.29 
 
 
184 aa  93.2  2e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2033  resolvase domain-containing protein  33.33 
 
 
192 aa  93.2  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.188765  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0166  Resolvase domain protein  35.53 
 
 
188 aa  93.2  2e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2582  resolvase domain-containing protein  31.63 
 
 
185 aa  93.6  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5066  resolvase domain-containing protein  31.25 
 
 
313 aa  92.8  3e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.436238  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1326  resolvase domain-containing protein  32.99 
 
 
180 aa  92.8  3e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08245  resolvase  33.33 
 
 
179 aa  93.2  3e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1762  resolvase-like protein  33.5 
 
 
192 aa  92.8  3e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2374  resolvase domain-containing protein  33.5 
 
 
192 aa  92.8  3e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0043  hypothetical protein  36.27 
 
 
188 aa  92.4  4e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2312  Resolvase domain  33.83 
 
 
201 aa  92.4  4e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2757  resolvase domain-containing protein  36.08 
 
 
188 aa  92.4  4e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0246  resolvase domain-containing protein  34.36 
 
 
179 aa  92  6e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.315323  normal 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0039  resolvase  34.72 
 
 
181 aa  91.3  8e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0293678  n/a   
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2239  resolvase domain-containing protein  34.69 
 
 
187 aa  91.3  9e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2984  putative site-specific recombinases, DNA invertase Pin  37.11 
 
 
203 aa  90.9  1e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.200056  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0466  Resolvase domain  32.99 
 
 
205 aa  90.9  1e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.418385  normal  0.0169839 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0884  Resolvase domain protein  32.16 
 
 
187 aa  90.9  1e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000364698  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3670  resolvase domain-containing protein  31.12 
 
 
185 aa  91.3  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1325  resolvase domain-containing protein  36.27 
 
 
192 aa  90.9  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1006  Resolvase domain protein  31.25 
 
 
189 aa  89.7  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5450  resolvase domain-containing protein  34.87 
 
 
184 aa  89.7  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3662  Resolvase domain protein  33.67 
 
 
188 aa  89.7  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2264  resolvase-like protein  33.88 
 
 
183 aa  89.4  3e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0723164  hitchhiker  0.00531394 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1811  Resolvase domain protein  35.23 
 
 
183 aa  89.4  3e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0297206  hitchhiker  0.00833685 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3031  DNA-invertase  35.05 
 
 
197 aa  89.7  3e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00130363 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1579  transposon Tn3 resolvase  35.23 
 
 
185 aa  89  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.159821  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3112  Resolvase domain protein  32.64 
 
 
184 aa  89  4e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1183  resolvase domain-containing protein  34.33 
 
 
200 aa  88.6  5e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.132915  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4091  Resolvase domain  34.69 
 
 
186 aa  88.6  6e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5399  resolvase domain-containing protein  32.47 
 
 
186 aa  88.6  6e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00909416  normal 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0119  transposon resolvase  37.5 
 
 
186 aa  88.6  6e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.336282 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04260  hypothetical protein  35.47 
 
 
197 aa  88.2  7e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1104  Resolvase domain  33.16 
 
 
196 aa  88.2  7e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5037  resolvase domain-containing protein  29.9 
 
 
201 aa  88.2  7e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.931406  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1807  resolvase domain-containing protein  30.57 
 
 
201 aa  88.2  8e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.261116  unclonable  0.00000000603181 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0149  transposon resolvase  36.84 
 
 
186 aa  87.8  8e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000015767 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2494  resolvase domain-containing protein  32.49 
 
 
191 aa  88.2  8e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2245  resolvase domain-containing protein  35.05 
 
 
183 aa  87.8  9e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.0071186  normal  0.011182 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2381  Resolvase domain  33.16 
 
 
196 aa  87.8  1e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0011  resolvase, putative  33.68 
 
 
181 aa  87.4  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0216  site-specific recombinase  35.8 
 
 
208 aa  87.8  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal  0.613104 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2095  Resolvase domain protein  32.51 
 
 
203 aa  86.7  2e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0260  resolvase family site-specific recombinase  37.06 
 
 
205 aa  86.7  2e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21550  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  35.08 
 
 
218 aa  86.7  2e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.850113  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0105  resolvase, N-terminal:resolvase helix-turn-helix region  32.34 
 
 
192 aa  87  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>