More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_p320_03 on replicon NC_011314
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011314  VSAL_p320_03  resolvase  100 
 
 		 209 aa  427  1e-119  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_44  putative resolvase  88.41 
 
 		 211 aa  379  1e-104  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0377389  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0077  resolvase family site-specific recombinase  66.83 
 
 		 211 aa  286  1e-76  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.349046  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0123  putative resolvase  59.41 
 
 		 206 aa  247  1e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  6.922970000000001e-26 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4666  resolvase domain-containing protein  54.46 
 
 		 202 aa  219  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000148612  normal  0.936039 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4343  Resolvase domain protein  54.46 
 
 		 202 aa  219  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000112202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4408  resolvase domain-containing protein  54.46 
 
 		 202 aa  219  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000545957  normal  0.0701498 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0298  resolvase, putative  53.5 
 
 		 205 aa  216  2e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01413  resolvase, putative  51.98 
 
 		 207 aa  216  2e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0571  resolvase domain-containing protein  56 
 
 		 210 aa  207  1e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4246  Resolvase domain protein  50.5 
 
 		 205 aa  205  4e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009516  PsycPRwf_2397  resolvase domain-containing protein  56 
 
 		 210 aa  203  1e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4266  resolvase domain-containing protein  51.9 
 
 		 231 aa  203  2e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000000000120246  unclonable  5.20349e-19 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0021  resolvase, putative  48 
 
 		 221 aa  202  3e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00853796  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4161  Resolvase domain  52.74 
 
 		 206 aa  202  4e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0024  resolvase, putative  47.5 
 
 		 206 aa  201  7e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000663819  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4533  resolvase domain-containing protein  50 
 
 		 214 aa  194  7e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3979  resolvase domain-containing protein  58.29 
 
 		 208 aa  194  9e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0054  resolvase domain-containing protein  45.45 
 
 		 213 aa  193  2e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4402  resolvase domain-containing protein  45.93 
 
 		 213 aa  192  4e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1306  resolvase domain-containing protein  53.47 
 
 		 205 aa  190  1e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.92579  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3278  resolvase domain-containing protein  52.97 
 
 		 208 aa  190  1e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.312644  n/a   
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0078  TnpR  46.27 
 
 		 220 aa  190  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.569126 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6887  resolvase domain-containing protein  55.43 
 
 		 210 aa  176  2e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3590  resolvase domain protein  47.18 
 
 		 208 aa  175  4e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000308956 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0873  Resolvase domain protein  49.14 
 
 		 206 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001518  resolvase  44.79 
 
 		 204 aa  160  9e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000153211  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4455  resolvase domain-containing protein  41.38 
 
 		 203 aa  159  3e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0950  resolvase domain-containing protein  43.96 
 
 		 207 aa  159  4e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2180  resolvase domain-containing protein  41.15 
 
 		 212 aa  159  4e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.52939  n/a   
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4460  Resolvase domain protein  45.93 
 
 		 209 aa  157  7e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4355  Resolvase domain protein  45.35 
 
 		 200 aa  156  2e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4562  resolvase domain-containing protein  45.35 
 
 		 209 aa  156  2e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.338072  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2559  resolvase-like protein  42.72 
 
 		 222 aa  155  3e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.22678 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4386  resolvase domain-containing protein  44.77 
 
 		 209 aa  155  5.0000000000000005e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1801  resolvase domain-containing protein  42.16 
 
 		 228 aa  151  5.9999999999999996e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.118365 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0719  resolvase domain-containing protein  40 
 
 		 197 aa  139  3.9999999999999997e-32  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000179161 
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2477  resolvase-like protein  39.81 
 
 		 198 aa  136  2e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.131622  normal  0.782919 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1355  resolvase-like protein  39.29 
 
 		 190 aa  128  6e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.141663 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0094  resolvase  37.76 
 
 		 245 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.86084  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3355  resolvase domain-containing protein  37.76 
 
 		 301 aa  115  6e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0978291  normal  0.274195 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0037  resolvase  37.24 
 
 		 245 aa  114  8.999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.489197  normal  0.472165 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6519  resolvase  34.65 
 
 		 283 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2479  hypothetical protein  46.6 
 
 		 138 aa  103  2e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.802993 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2582  resolvase domain-containing protein  30.14 
 
 		 185 aa  74.3  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3678  Resolvase domain  30.39 
 
 		 190 aa  73.2  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134045  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1811  Resolvase domain protein  28.64 
 
 		 183 aa  72.8  0.000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0297206  hitchhiker  0.00833685 
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0011  RlgA  30 
 
 		 186 aa  72.8  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.928686  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1326  resolvase domain-containing protein  28.29 
 
 		 180 aa  72  0.000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0088  resolvase domain-containing protein  27.8 
 
 		 199 aa  72  0.000000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.223955  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0605  resolvase domain-containing protein  28.99 
 
 		 186 aa  71.6  0.000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.177837 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0611  Resolvase domain protein  28.99 
 
 		 186 aa  71.6  0.000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0580  resolvase domain-containing protein  28.99 
 
 		 186 aa  71.6  0.000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010715  Nther_2949  Resolvase domain  26.34 
 
 		 202 aa  71.6  0.000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.587528  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1807  resolvase domain-containing protein  27.32 
 
 		 201 aa  70.9  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.261116  unclonable  0.00000000603181 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6405  resolvase domain-containing protein  31.37 
 
 		 185 aa  70.5  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0816  resolvase domain-containing protein  30.88 
 
 		 185 aa  70.1  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3124  resolvase domain-containing protein  29.06 
 
 		 194 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0904767  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0687  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  32.23 
 
 		 200 aa  69.7  0.00000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.731539  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3928  resolvase domain-containing protein  32 
 
 		 191 aa  68.2  0.00000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.272515  hitchhiker  0.0000753359 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0043  hypothetical protein  28.14 
 
 		 188 aa  67.8  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3670  resolvase domain-containing protein  28.43 
 
 		 185 aa  67.4  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1711  integrative genetic element Gsu5, resolvase  30.3 
 
 		 190 aa  66.6  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0316952  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3112  Resolvase domain protein  29.27 
 
 		 184 aa  66.2  0.0000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6810  Resolvase domain protein  30.39 
 
 		 185 aa  66.2  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.67902  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01209  bacteriocin production protein  30.05 
 
 		 198 aa  65.9  0.0000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000702686  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0466  Resolvase domain  29.21 
 
 		 205 aa  66.2  0.0000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.418385  normal  0.0169839 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1006  Resolvase domain protein  29.88 
 
 		 189 aa  65.9  0.0000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3423  Resolvase domain protein  29.85 
 
 		 185 aa  65.1  0.0000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43160  Resolvase-like protein  30.41 
 
 		 189 aa  64.3  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0037  transposon Tn21 resolvase  28.89 
 
 		 205 aa  64.3  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.335597 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1206  Resolvase domain protein  28.49 
 
 		 186 aa  64.3  0.000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010504  Mrad2831_6517  resolvase domain-containing protein  27.59 
 
 		 185 aa  63.2  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0167  site-specific recombinase  25.56 
 
 		 214 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1445  Resolvase domain  29.52 
 
 		 188 aa  63.9  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1052  Resolvase domain  31.03 
 
 		 186 aa  63.9  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1325  resolvase domain-containing protein  27.09 
 
 		 192 aa  63.5  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1132  Resolvase domain  29.27 
 
 		 184 aa  63.2  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004307  resolvase N-terminal domain protein  30.39 
 
 		 190 aa  63.2  0.000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.179008  n/a   
 
 
-
 
NC_010374  M446_7059  hypothetical protein  28.71 
 
 		 183 aa  63.2  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4473  serine-based site-specific recombinase activity TnpR  26.5 
 
 		 186 aa  62.4  0.000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0992302  decreased coverage  0.00348712 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4599  serine-based site-specific recombinase activity TnpR  26.5 
 
 		 186 aa  62.4  0.000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000321893  hitchhiker  0.00456228 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4253  resolvase-like protein  29.5 
 
 		 201 aa  62.4  0.000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.35703  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4263  resolvase-like protein  29.5 
 
 		 201 aa  62.4  0.000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15430  putative resolvase, essential for transposition  26.5 
 
 		 186 aa  62.4  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  7.34084e-16  unclonable  6.55355e-22 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4084  resolvase domain-containing protein  26.87 
 
 		 188 aa  62.4  0.000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.236689  normal  0.0346573 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20410  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  28.64 
 
 		 194 aa  62  0.000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0661103 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0068  resolvase  27.23 
 
 		 181 aa  62.4  0.000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0902003  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5450  resolvase domain-containing protein  29.41 
 
 		 184 aa  62  0.000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2003  transposon Tn2501 resolvase  29.5 
 
 		 222 aa  61.6  0.000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00181715  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4319  resolvase domain-containing protein  27.33 
 
 		 186 aa  62  0.000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0053  transposon Tn21 resolvase  27.33 
 
 		 186 aa  62  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.509225 
 
 
-
 
NC_006578  pBT9727_0065  DNA recombinase  27.33 
 
 		 203 aa  61.2  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0049  recombinase  24.76 
 
 		 220 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00880033  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3135  resolvase TnpR  27.14 
 
 		 217 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3846  resolvase domain-containing protein  28.32 
 
 		 185 aa  60.8  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.40246  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1914  resolvase domain-containing protein  28.32 
 
 		 185 aa  60.8  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0246  resolvase domain-containing protein  28.79 
 
 		 179 aa  60.8  0.00000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.315323  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5792  resolvase TnpR  29.85 
 
 		 212 aa  61.2  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.923438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1256  resolvase domain-containing protein  28.32 
 
 		 185 aa  60.8  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.249423  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>