More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_3278 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009668  Oant_3278  resolvase domain-containing protein  100 
 
 
208 aa  418  1e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.312644  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1306  resolvase domain-containing protein  95.54 
 
 
205 aa  370  1e-102  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.92579  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4533  resolvase domain-containing protein  65.07 
 
 
214 aa  271  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4161  Resolvase domain  64.65 
 
 
206 aa  260  1e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6887  resolvase domain-containing protein  63.46 
 
 
210 aa  254  5e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4343  Resolvase domain protein  60 
 
 
202 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000112202  normal 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4666  resolvase domain-containing protein  60 
 
 
202 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000148612  normal  0.936039 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4408  resolvase domain-containing protein  60 
 
 
202 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000545957  normal  0.0701498 
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0078  TnpR  58.46 
 
 
220 aa  241  7.999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.569126 
 
 
-
 
NC_009516  PsycPRwf_2397  resolvase domain-containing protein  55.17 
 
 
210 aa  232  3e-60  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4246  Resolvase domain protein  52.71 
 
 
205 aa  229  2e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4266  resolvase domain-containing protein  57.56 
 
 
231 aa  224  1e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000000000120246  unclonable  5.20349e-19 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0571  resolvase domain-containing protein  50.99 
 
 
210 aa  216  2.9999999999999998e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_03  resolvase  52.97 
 
 
209 aa  213  1.9999999999999998e-54  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_44  putative resolvase  53.47 
 
 
211 aa  211  4.9999999999999996e-54  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0377389  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0298  resolvase, putative  53.69 
 
 
205 aa  211  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0021  resolvase, putative  52 
 
 
221 aa  202  2e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00853796  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0024  resolvase, putative  51.5 
 
 
206 aa  202  4e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000663819  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3979  resolvase domain-containing protein  50.99 
 
 
208 aa  201  5e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0950  resolvase domain-containing protein  53.69 
 
 
207 aa  200  9.999999999999999e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0123  putative resolvase  49.25 
 
 
206 aa  196  3e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  6.922970000000001e-26 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0077  resolvase family site-specific recombinase  58.02 
 
 
211 aa  195  4.0000000000000005e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.349046  n/a   
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4386  resolvase domain-containing protein  47.21 
 
 
209 aa  191  5e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01413  resolvase, putative  50.75 
 
 
207 aa  191  5e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4460  Resolvase domain protein  47.21 
 
 
209 aa  191  8e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4355  Resolvase domain protein  47.21 
 
 
200 aa  190  1e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4562  resolvase domain-containing protein  46.7 
 
 
209 aa  189  2e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.338072  normal 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4455  resolvase domain-containing protein  46.5 
 
 
203 aa  189  2e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2180  resolvase domain-containing protein  48.74 
 
 
212 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.52939  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0054  resolvase domain-containing protein  47.06 
 
 
213 aa  186  2e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4402  resolvase domain-containing protein  47.06 
 
 
213 aa  184  6e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3590  resolvase domain protein  44.12 
 
 
208 aa  184  8e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000308956 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0873  Resolvase domain protein  47.76 
 
 
206 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001518  resolvase  45.77 
 
 
204 aa  164  8e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000153211  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1801  resolvase domain-containing protein  43.9 
 
 
228 aa  157  1e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.118365 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2559  resolvase-like protein  39.91 
 
 
222 aa  145  3e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.22678 
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2477  resolvase-like protein  42.18 
 
 
198 aa  135  5e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.131622  normal  0.782919 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3355  resolvase domain-containing protein  38.89 
 
 
301 aa  133  1.9999999999999998e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0978291  normal  0.274195 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0719  resolvase domain-containing protein  40.8 
 
 
197 aa  132  3.9999999999999996e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000179161 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0037  resolvase  37.37 
 
 
245 aa  128  7.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.489197  normal  0.472165 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0094  resolvase  36.87 
 
 
245 aa  125  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.86084  normal 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6519  resolvase  35.38 
 
 
283 aa  121  8e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1355  resolvase-like protein  37.95 
 
 
190 aa  120  9.999999999999999e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.141663 
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2479  hypothetical protein  40.8 
 
 
138 aa  96.7  2e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.802993 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1811  Resolvase domain protein  27.78 
 
 
183 aa  79.3  0.00000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0297206  hitchhiker  0.00833685 
 
 
-
 
NC_004310  BR0260  resolvase family site-specific recombinase  30.65 
 
 
205 aa  77.4  0.0000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1082  resolvase family site-specific recombinase  30.65 
 
 
205 aa  77.4  0.0000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.271311  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0026  resolvase family site-specific recombinase  39.77 
 
 
102 aa  72.8  0.000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  decreased coverage  0.000122476  n/a   
 
 
-
 
NC_010715  Nther_2949  Resolvase domain  29.09 
 
 
202 aa  72  0.000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.587528  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20410  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  29.29 
 
 
194 aa  71.6  0.000000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0661103 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0019  Resolvase domain protein  31.09 
 
 
195 aa  70.5  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2019  resolvase family site-specific recombinase  39.29 
 
 
91 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0222  transposon resolvase  29.8 
 
 
199 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000952158 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1711  integrative genetic element Gsu5, resolvase  27.81 
 
 
190 aa  69.7  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0316952  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0204  transposon resolvase  28.5 
 
 
191 aa  69.7  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000159954 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0246  resolvase domain-containing protein  28.35 
 
 
179 aa  68.2  0.00000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.315323  normal 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0216  transposon resolvase  29.8 
 
 
199 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.159168 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1326  resolvase domain-containing protein  28.08 
 
 
180 aa  67.8  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3124  resolvase domain-containing protein  30.15 
 
 
194 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0904767  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0039  resolvase  29.17 
 
 
181 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0293678  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0088  resolvase domain-containing protein  29.29 
 
 
199 aa  67.4  0.0000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.223955  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3678  Resolvase domain  28.16 
 
 
190 aa  67  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134045  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1490  resolvase domain-containing protein  29.53 
 
 
183 aa  66.2  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.832501  hitchhiker  0.00333462 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0687  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  27.67 
 
 
200 aa  66.6  0.0000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.731539  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3670  resolvase domain-containing protein  28.22 
 
 
185 aa  66.2  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1445  Resolvase domain  29.95 
 
 
188 aa  66.2  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2033  resolvase domain-containing protein  27.46 
 
 
192 aa  65.9  0.0000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.188765  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0068  resolvase  28.5 
 
 
181 aa  65.5  0.0000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0902003  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1467  resolvase-like protein  31.05 
 
 
196 aa  65.1  0.0000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0536  resolvase domain-containing protein  29.15 
 
 
203 aa  64.7  0.0000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.201567  normal 
 
 
-
 
NC_008263  CPR_A0002  resolvase  27.36 
 
 
190 aa  65.1  0.0000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141759  n/a   
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2509  putative res  76.92 
 
 
41 aa  63.9  0.000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.963906 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0206  transposon resolvase  30.46 
 
 
169 aa  63.9  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000314886 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1006  Resolvase domain protein  25.38 
 
 
189 aa  63.9  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1807  resolvase domain-containing protein  28.79 
 
 
201 aa  63.5  0.000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.261116  unclonable  0.00000000603181 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0041  resolvase domain-containing protein  28.5 
 
 
184 aa  63.5  0.000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  decreased coverage  0.0000573211 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7006  hypothetical protein  33.33 
 
 
183 aa  63.5  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0167  site-specific recombinase  28.24 
 
 
214 aa  62.4  0.000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0014  resolvase domain-containing protein  27.98 
 
 
184 aa  62.4  0.000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.125158  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4473  serine-based site-specific recombinase activity TnpR  26.94 
 
 
186 aa  62.4  0.000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0992302  decreased coverage  0.00348712 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4599  serine-based site-specific recombinase activity TnpR  26.94 
 
 
186 aa  62.4  0.000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000321893  hitchhiker  0.00456228 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43160  Resolvase-like protein  31.52 
 
 
189 aa  62.4  0.000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15430  putative resolvase, essential for transposition  26.94 
 
 
186 aa  62.4  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  7.34084e-16  unclonable  6.55355e-22 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4319  resolvase domain-containing protein  26.8 
 
 
186 aa  62  0.000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1325  resolvase domain-containing protein  26.87 
 
 
192 aa  62  0.000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0053  transposon Tn21 resolvase  26.8 
 
 
186 aa  62  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.509225 
 
 
-
 
NC_008264  CPR_B0006  resolvase  29.06 
 
 
189 aa  62  0.000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00548662  n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0043  hypothetical protein  27.45 
 
 
188 aa  61.6  0.000000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6405  resolvase domain-containing protein  29.65 
 
 
185 aa  60.8  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08245  resolvase  24.74 
 
 
179 aa  61.2  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3170  resolvase domain-containing protein  28.06 
 
 
200 aa  61.2  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00430122 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2427  resolvase domain-containing protein  29.19 
 
 
193 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0929457  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0816  resolvase domain-containing protein  29.15 
 
 
185 aa  60.8  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2582  resolvase domain-containing protein  26.18 
 
 
185 aa  61.2  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6810  Resolvase domain protein  29.65 
 
 
185 aa  60.8  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.67902  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3928  resolvase domain-containing protein  25.77 
 
 
191 aa  61.2  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.272515  hitchhiker  0.0000753359 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0466  Resolvase domain  29.38 
 
 
205 aa  61.2  0.00000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.418385  normal  0.0169839 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01209  bacteriocin production protein  28.06 
 
 
198 aa  60.5  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000702686  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0202  resolvase  27.98 
 
 
183 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4137  resolvase domain-containing protein  28.08 
 
 
224 aa  60.1  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.130251  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>