More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_2180 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009052  Sbal_2180  resolvase domain-containing protein  100 
 
 		 212 aa  438  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.52939  n/a   
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4386  resolvase domain-containing protein  96.52 
 
 		 209 aa  400  1e-111  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4562  resolvase domain-containing protein  96.52 
 
 		 209 aa  400  1e-111  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.338072  normal  1 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4355  Resolvase domain protein  96.97 
 
 		 200 aa  397  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4460  Resolvase domain protein  94.03 
 
 		 209 aa  395  1e-109  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4455  resolvase domain-containing protein  93.03 
 
 		 203 aa  392  1e-108  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001518  resolvase  54.55 
 
 		 204 aa  202  3e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000153211  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0026  resolvase family site-specific recombinase  93 
 
 		 102 aa  193  2e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  decreased coverage  0.000122476  n/a   
 
 
-
 
NC_009516  PsycPRwf_2397  resolvase domain-containing protein  47.8 
 
 		 210 aa  192  2e-48  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1801  resolvase domain-containing protein  51.98 
 
 		 228 aa  191  6e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.118365 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0571  resolvase domain-containing protein  49.75 
 
 		 210 aa  188  5e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4161  Resolvase domain  46.46 
 
 		 206 aa  184  7e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4533  resolvase domain-containing protein  46.38 
 
 		 214 aa  182  3e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4666  resolvase domain-containing protein  46.23 
 
 		 202 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000148612  normal  0.936039 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4343  Resolvase domain protein  46.23 
 
 		 202 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000112202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4408  resolvase domain-containing protein  46.23 
 
 		 202 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000545957  normal  0.0701498 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0298  resolvase, putative  47.96 
 
 		 205 aa  178  5.999999999999999e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6887  resolvase domain-containing protein  49.5 
 
 		 210 aa  178  5.999999999999999e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0078  TnpR  46.19 
 
 		 220 aa  177  9e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.569126 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4246  Resolvase domain protein  47.76 
 
 		 205 aa  175  5e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1306  resolvase domain-containing protein  49.75 
 
 		 205 aa  174  9.999999999999999e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.92579  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3278  resolvase domain-containing protein  48.74 
 
 		 208 aa  171  5.999999999999999e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.312644  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0021  resolvase, putative  47.98 
 
 		 221 aa  169  2e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00853796  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0024  resolvase, putative  47.47 
 
 		 206 aa  168  5e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000663819  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2559  resolvase-like protein  44.34 
 
 		 222 aa  166  2.9999999999999998e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.22678 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3979  resolvase domain-containing protein  48.26 
 
 		 208 aa  164  6.9999999999999995e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0950  resolvase domain-containing protein  47.29 
 
 		 207 aa  164  1.0000000000000001e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2019  resolvase family site-specific recombinase  94.05 
 
 		 91 aa  162  3e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_03  resolvase  41.15 
 
 		 209 aa  159  4e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_44  putative resolvase  45.93 
 
 		 211 aa  155  3e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0377389  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0123  putative resolvase  43.48 
 
 		 206 aa  155  6e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  6.922970000000001e-26 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4402  resolvase domain-containing protein  45.88 
 
 		 213 aa  154  1e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01413  resolvase, putative  41.29 
 
 		 207 aa  151  8.999999999999999e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0077  resolvase family site-specific recombinase  43.07 
 
 		 211 aa  150  1e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.349046  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0054  resolvase domain-containing protein  46.47 
 
 		 213 aa  149  2e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3590  resolvase domain protein  43.3 
 
 		 208 aa  148  6e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000308956 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0873  Resolvase domain protein  41.03 
 
 		 206 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4266  resolvase domain-containing protein  39.9 
 
 		 231 aa  142  5e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000000000120246  unclonable  5.20349e-19 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3355  resolvase domain-containing protein  37.06 
 
 		 301 aa  125  3e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0978291  normal  0.274195 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6519  resolvase  37.63 
 
 		 283 aa  120  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0719  resolvase domain-containing protein  39.77 
 
 		 197 aa  116  3e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000179161 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0037  resolvase  35.61 
 
 		 245 aa  115  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.489197  normal  0.472165 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0094  resolvase  35.61 
 
 		 245 aa  115  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.86084  normal  1 
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2477  resolvase-like protein  42.18 
 
 		 198 aa  113  2.0000000000000002e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.131622  normal  0.782919 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1355  resolvase-like protein  38.55 
 
 		 190 aa  103  2e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.141663 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0246  resolvase domain-containing protein  30.89 
 
 		 179 aa  72.8  0.000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.315323  normal  1 
 
 
-
 
NC_010715  Nther_2949  Resolvase domain  26.37 
 
 		 202 aa  70.5  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.587528  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0019  Resolvase domain protein  28.95 
 
 		 195 aa  63.9  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01209  bacteriocin production protein  28.12 
 
 		 198 aa  63.5  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000702686  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3678  Resolvase domain  27.64 
 
 		 190 aa  63.2  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134045  n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08245  resolvase  26.18 
 
 		 179 aa  62.4  0.000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2479  hypothetical protein  36.27 
 
 		 138 aa  62  0.000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.802993 
 
 
-
 
NC_004310  BR0260  resolvase family site-specific recombinase  29.02 
 
 		 205 aa  61.2  0.00000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1082  resolvase family site-specific recombinase  29.02 
 
 		 205 aa  61.2  0.00000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.271311  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1326  resolvase domain-containing protein  25.79 
 
 		 180 aa  60.8  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5450  resolvase domain-containing protein  27.5 
 
 		 184 aa  61.2  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4084  resolvase domain-containing protein  27.84 
 
 		 188 aa  60.1  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.236689  normal  0.0346573 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0172  resolvase family site-specific recombinase  28.28 
 
 		 208 aa  60.1  0.00000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0049  recombinase  24.86 
 
 		 220 aa  59.3  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00880033  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1183  resolvase domain-containing protein  28.93 
 
 		 200 aa  59.3  0.00000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.132915  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1006  Resolvase domain protein  27.55 
 
 		 189 aa  59.3  0.00000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_42  putative resolvase  26.98 
 
 		 181 aa  58.9  0.00000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0684051  n/a   
 
 
-
 
NC_006578  pBT9727_0065  DNA recombinase  26.88 
 
 		 203 aa  58.9  0.00000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1284  transposon Tn2501 resolvase  30.65 
 
 		 191 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.1264  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0466  Resolvase domain  27.6 
 
 		 205 aa  58.2  0.00000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.418385  normal  0.0169839 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6810  Resolvase domain protein  27.27 
 
 		 185 aa  56.2  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.67902  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2355  Resolvase domain protein  29.09 
 
 		 186 aa  56.6  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.230305  normal  0.6636 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1445  Resolvase domain  26.53 
 
 		 188 aa  56.2  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010374  M446_7059  hypothetical protein  27.89 
 
 		 183 aa  55.8  0.0000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4731  Resolvase domain protein  27.37 
 
 		 187 aa  55.5  0.0000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0011  resolvase, putative  28.06 
 
 		 181 aa  55.5  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1467  resolvase-like protein  26.84 
 
 		 196 aa  55.5  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1494  resolvase-like protein  27.69 
 
 		 186 aa  55.5  0.0000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.493325 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1325  resolvase domain-containing protein  25.5 
 
 		 192 aa  55.5  0.0000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6405  resolvase domain-containing protein  27.27 
 
 		 185 aa  55.5  0.0000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0816  resolvase domain-containing protein  26.77 
 
 		 185 aa  55.1  0.0000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5397  Resolvase domain protein  25.49 
 
 		 185 aa  55.1  0.0000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0011  RlgA  25.98 
 
 		 186 aa  55.1  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.928686  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1807  resolvase domain-containing protein  26.37 
 
 		 201 aa  54.7  0.0000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.261116  unclonable  0.00000000603181 
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2509  putative res  61.54 
 
 		 41 aa  54.7  0.0000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.963906 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6187  resolvase-like protein  28.21 
 
 		 186 aa  55.1  0.0000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0984609  hitchhiker  0.0000107923 
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5424  Resolvase domain  28.85 
 
 		 194 aa  54.7  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5457  hypothetical protein  28.85 
 
 		 194 aa  54.7  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0088  resolvase domain-containing protein  26.87 
 
 		 199 aa  54.7  0.000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.223955  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3847  resolvase-like protein  25.74 
 
 		 191 aa  53.9  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.388128  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0053  transposon Tn21 resolvase  24.61 
 
 		 186 aa  53.1  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.509225 
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a031  site-specific recombinase/resolvase  29.75 
 
 		 211 aa  53.1  0.000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0141681  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3410  Resolvase domain protein  27.88 
 
 		 206 aa  53.1  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.260918 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2362  DNA-invertase  27.86 
 
 		 188 aa  53.1  0.000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4319  resolvase domain-containing protein  24.61 
 
 		 186 aa  53.1  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2582  resolvase domain-containing protein  26.83 
 
 		 185 aa  53.1  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2084  resolvase domain-containing protein  28.5 
 
 		 196 aa  52.8  0.000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0523  resolvase-like protein  30.12 
 
 		 198 aa  52.8  0.000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2327  Resolvase domain  28.43 
 
 		 217 aa  52.8  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2173  resolvase domain-containing protein  28.5 
 
 		 196 aa  52.8  0.000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3670  resolvase domain-containing protein  27.23 
 
 		 185 aa  52.8  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0108  hypothetical protein  27.1 
 
 		 309 aa  52.4  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4419  resolvase domain-containing protein  28.5 
 
 		 196 aa  52.8  0.000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00736052  normal  0.464308 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20410  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  25.39 
 
 		 194 aa  52.4  0.000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0661103 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1811  Resolvase domain protein  26.4 
 
 		 183 aa  52.4  0.000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0297206  hitchhiker  0.00833685 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>