More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene pE33L54_0049 on replicon NC_007105
Organism: Bacillus cereus E33L



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007105  pE33L54_0049  recombinase  100 
 
 
220 aa  453  1e-127  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00880033  n/a   
 
 
-
 
NC_006578  pBT9727_0065  DNA recombinase  71 
 
 
203 aa  298  5e-80  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1183  resolvase domain-containing protein  68.18 
 
 
200 aa  283  1.0000000000000001e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.132915  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0216  site-specific recombinase  49.51 
 
 
208 aa  190  1e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal  0.613104 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0167  site-specific recombinase  44.33 
 
 
214 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2438  Resolvase domain protein  42.71 
 
 
206 aa  168  6e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000895592 
 
 
-
 
NC_010715  Nther_2949  Resolvase domain  41.71 
 
 
202 aa  154  1e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.587528  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5624  resolvase domain-containing protein  35.15 
 
 
179 aa  123  2e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2322  DNA recombinase  51.46 
 
 
110 aa  106  3e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2324  resolvase-like protein  57.47 
 
 
95 aa  102  5e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0687  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  35.12 
 
 
200 aa  96.7  3e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.731539  n/a   
 
 
-
 
NC_013518  Sterm_4140  Resolvase domain protein  33.49 
 
 
217 aa  92.4  5e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00204948  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1445  Resolvase domain  30.57 
 
 
188 aa  92  7e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4352  Resolvase domain protein  31.98 
 
 
186 aa  89.7  3e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00813261  normal 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4489  Resolvase domain protein  31.98 
 
 
186 aa  89.7  3e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000146883  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0037  transposon Tn21 resolvase  35.71 
 
 
205 aa  89.7  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.335597 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3982  resolvase domain-containing protein  32.65 
 
 
201 aa  89  5e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.364011  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0631  resolvase domain-containing protein  32.65 
 
 
201 aa  89  5e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2322  resolvase domain-containing protein  33.51 
 
 
186 aa  88.6  6e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1206  Resolvase domain protein  33.54 
 
 
186 aa  88.6  7e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1125  resolvase domain-containing protein  35.98 
 
 
184 aa  88.6  7e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.577602  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0053  transposon Tn21 resolvase  33.33 
 
 
186 aa  88.2  8e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.509225 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4319  resolvase domain-containing protein  33.33 
 
 
186 aa  88.2  8e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2033  resolvase domain-containing protein  36.6 
 
 
192 aa  87.4  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.188765  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4473  serine-based site-specific recombinase activity TnpR  32.82 
 
 
186 aa  87.8  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0992302  decreased coverage  0.00348712 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4599  serine-based site-specific recombinase activity TnpR  32.82 
 
 
186 aa  87.8  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000321893  hitchhiker  0.00456228 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15430  putative resolvase, essential for transposition  32.82 
 
 
186 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  7.34084e-16  unclonable  6.55355e-22 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0039  resolvase  32.45 
 
 
181 aa  87  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0293678  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4598  Resolvase domain protein  36.48 
 
 
188 aa  87  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0166  Resolvase domain protein  35.85 
 
 
188 aa  86.7  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1256  resolvase domain-containing protein  30.96 
 
 
185 aa  87  2e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.249423  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2680  resolvase domain-containing protein  30.26 
 
 
185 aa  86.3  3e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3464  resolvase domain-containing protein  34.78 
 
 
185 aa  86.7  3e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3829  resolvase domain-containing protein  30.26 
 
 
185 aa  86.3  3e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3846  resolvase domain-containing protein  30.26 
 
 
185 aa  86.3  3e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.40246  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1914  resolvase domain-containing protein  30.26 
 
 
185 aa  86.3  3e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1494  resolvase-like protein  34.16 
 
 
186 aa  85.9  5e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.493325 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6187  resolvase-like protein  30 
 
 
186 aa  85.5  7e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0984609  hitchhiker  0.0000107923 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0043  hypothetical protein  36.81 
 
 
188 aa  84.3  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2803  putative resolvase  39.62 
 
 
188 aa  84.3  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.545302  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0884  Resolvase domain protein  33.96 
 
 
187 aa  83.6  0.000000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000364698  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3928  resolvase domain-containing protein  36.2 
 
 
191 aa  83.2  0.000000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.272515  hitchhiker  0.0000753359 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1735  putative resolvase  38.99 
 
 
188 aa  83.2  0.000000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2351  resolvase-like protein  34.81 
 
 
235 aa  82.8  0.000000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.329475 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2362  DNA-invertase  26.7 
 
 
188 aa  81.6  0.000000000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0204  transposon resolvase  32.46 
 
 
191 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000159954 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3662  Resolvase domain protein  31.38 
 
 
188 aa  79.7  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007617  Nmul_D2813  resolvase-like protein  31.09 
 
 
184 aa  80.1  0.00000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.493253  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3440  invertase/recombinase protein  30.77 
 
 
188 aa  79.7  0.00000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.115695  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4764  resolvase domain-containing protein  33.77 
 
 
189 aa  79.3  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3523  resolvase, N-terminal:resolvase helix-turn-helix region  38.85 
 
 
184 aa  78.2  0.00000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000257012  decreased coverage  0.00040401 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0090  resolvase TnpR  29.17 
 
 
183 aa  77.4  0.0000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.707126  normal  0.345515 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1202  resolvase domain-containing protein  30.77 
 
 
194 aa  77.8  0.0000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004307  resolvase N-terminal domain protein  32.72 
 
 
190 aa  77.8  0.0000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.179008  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0216  transposon resolvase  31.41 
 
 
199 aa  77  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.159168 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0011  resolvase, putative  30.73 
 
 
181 aa  76.6  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1312  resolvase, N-terminal:resolvase helix-turn-helix region  38.85 
 
 
187 aa  76.6  0.0000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.183881 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0014  resolvase domain-containing protein  33.33 
 
 
184 aa  75.5  0.0000000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.125158  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0096  resolvase domain-containing protein  29.84 
 
 
185 aa  75.5  0.0000000000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1645  resolvase-like protein  30.26 
 
 
213 aa  75.5  0.0000000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.27327  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1104  Resolvase domain  32.03 
 
 
196 aa  75.1  0.0000000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0955  Resolvase domain protein  29.76 
 
 
194 aa  75.1  0.0000000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5037  resolvase domain-containing protein  28.5 
 
 
201 aa  74.7  0.0000000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.931406  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0167  resolvase domain-containing protein  28.5 
 
 
196 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0041  resolvase domain-containing protein  34 
 
 
184 aa  74.7  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  decreased coverage  0.0000573211 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1397  invertase/recombinase like protein  34.19 
 
 
176 aa  74.3  0.000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.777573 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0545  hypothetical protein  28.8 
 
 
186 aa  74.7  0.000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0606652 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5431  Resolvase domain protein  30.77 
 
 
185 aa  73.9  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.318584  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5399  resolvase domain-containing protein  29.95 
 
 
186 aa  73.2  0.000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00909416  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5628  Resolvase domain  36.65 
 
 
198 aa  73.2  0.000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.526216 
 
 
-
 
NC_008263  CPR_A0002  resolvase  31.79 
 
 
190 aa  73.2  0.000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141759  n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6417  resolvase domain-containing protein  33.84 
 
 
196 aa  73.2  0.000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1490  resolvase domain-containing protein  30.32 
 
 
183 aa  72.4  0.000000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.832501  hitchhiker  0.00333462 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0222  transposon resolvase  30.37 
 
 
199 aa  72.4  0.000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000952158 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0854  invertase/recombinase like protein  33.55 
 
 
198 aa  72.4  0.000000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.160403  normal  0.816153 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1562  recombinase  29.95 
 
 
188 aa  72.4  0.000000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2781  resolvase domain-containing protein  31.45 
 
 
190 aa  72  0.000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.183587  normal  0.43479 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2154  Resolvase domain protein  30.69 
 
 
185 aa  72  0.000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.478214  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1403  resolvase domain-containing protein  30.69 
 
 
185 aa  72  0.000000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.749996  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1594  resolvase domain-containing protein  28.22 
 
 
189 aa  71.6  0.000000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.94865  normal  0.455677 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2363  resolvase-like protein  29.02 
 
 
228 aa  71.6  0.000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.379523  normal  0.343568 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0246  resolvase domain-containing protein  29.32 
 
 
179 aa  71.6  0.000000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.315323  normal 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2392  Resolvase domain  27.69 
 
 
197 aa  70.9  0.00000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000064315  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1052  Resolvase domain  31.77 
 
 
186 aa  71.6  0.00000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9833  Resolvase Protein  30.65 
 
 
210 aa  71.2  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1579  transposon Tn3 resolvase  27.98 
 
 
185 aa  70.9  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.159821  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20410  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  29.29 
 
 
194 aa  71.2  0.00000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0661103 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3170  resolvase domain-containing protein  32.3 
 
 
200 aa  70.9  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00430122 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08245  resolvase  33.78 
 
 
179 aa  70.5  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2984  putative site-specific recombinases, DNA invertase Pin  29.94 
 
 
203 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.200056  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2582  resolvase domain-containing protein  33.12 
 
 
185 aa  70.9  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6376  resolvase domain-containing protein  30.82 
 
 
206 aa  70.1  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0202  resolvase  28.86 
 
 
183 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1503  resolvase  27.37 
 
 
182 aa  69.7  0.00000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.236013  normal 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0233  resolvase  28.86 
 
 
183 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0010  resolvase  31.05 
 
 
185 aa  69.3  0.00000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0319649  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2355  Resolvase domain protein  28.36 
 
 
186 aa  69.3  0.00000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.230305  normal  0.6636 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3714  resolvase domain-containing protein  29.59 
 
 
188 aa  69.3  0.00000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.566828  n/a   
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5396  resolvase domain-containing protein  30.72 
 
 
180 aa  69.3  0.00000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.859533  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2381  Resolvase domain  27.41 
 
 
196 aa  68.9  0.00000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>