More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_2438 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_2438  Resolvase domain protein  100 
 
 
206 aa  423  1e-117  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000895592 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0216  site-specific recombinase  61.58 
 
 
208 aa  244  8e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal  0.613104 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0167  site-specific recombinase  57.5 
 
 
214 aa  231  5e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1183  resolvase domain-containing protein  45.08 
 
 
200 aa  172  2.9999999999999996e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.132915  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0049  recombinase  42.71 
 
 
220 aa  168  5e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00880033  n/a   
 
 
-
 
NC_006578  pBT9727_0065  DNA recombinase  44.1 
 
 
203 aa  167  1e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5624  resolvase domain-containing protein  45.5 
 
 
179 aa  156  2e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010715  Nther_2949  Resolvase domain  38.34 
 
 
202 aa  123  2e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.587528  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2322  DNA recombinase  39.6 
 
 
110 aa  84.7  8e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1445  Resolvase domain  31.12 
 
 
188 aa  82.8  0.000000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0090  resolvase TnpR  29.74 
 
 
183 aa  82.4  0.000000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.707126  normal  0.345515 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0687  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  27.83 
 
 
200 aa  81.6  0.000000000000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.731539  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0096  resolvase domain-containing protein  28.21 
 
 
185 aa  81.6  0.000000000000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1579  transposon Tn3 resolvase  29.9 
 
 
185 aa  79  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.159821  normal 
 
 
-
 
NC_013518  Sterm_4140  Resolvase domain protein  34.58 
 
 
217 aa  78.6  0.00000000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00204948  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2324  resolvase-like protein  43.9 
 
 
95 aa  76.6  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3862  resolvase domain-containing protein  31.94 
 
 
194 aa  77  0.0000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0506724  unclonable  0.00000235811 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6187  resolvase-like protein  30.37 
 
 
186 aa  75.9  0.0000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0984609  hitchhiker  0.0000107923 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4764  resolvase domain-containing protein  28.9 
 
 
189 aa  75.5  0.0000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2351  resolvase-like protein  29.65 
 
 
235 aa  75.1  0.0000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.329475 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0955  Resolvase domain protein  32.02 
 
 
194 aa  74.3  0.000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2362  DNA-invertase  27.69 
 
 
188 aa  73.9  0.000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0545  hypothetical protein  28.5 
 
 
186 aa  74.3  0.000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0606652 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1125  resolvase domain-containing protein  31.41 
 
 
184 aa  73.9  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.577602  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4668  resolvase domain-containing protein  27.6 
 
 
189 aa  73.2  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4775  resolvase domain-containing protein  27.6 
 
 
189 aa  73.2  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1494  resolvase-like protein  29.32 
 
 
186 aa  73.2  0.000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.493325 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1206  Resolvase domain protein  26.4 
 
 
186 aa  72.8  0.000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0011  RlgA  32.11 
 
 
186 aa  72.8  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.928686  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3135  resolvase TnpR  28.87 
 
 
217 aa  72.4  0.000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3928  resolvase domain-containing protein  30.1 
 
 
191 aa  72  0.000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.272515  hitchhiker  0.0000753359 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25710  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  32.93 
 
 
201 aa  72  0.000000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0523  resolvase-like protein  29.95 
 
 
198 aa  71.6  0.000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4489  Resolvase domain protein  28.27 
 
 
186 aa  71.6  0.000000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000146883  normal 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4352  Resolvase domain protein  28.27 
 
 
186 aa  71.6  0.000000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00813261  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1104  Resolvase domain  27.64 
 
 
196 aa  71.2  0.000000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01209  bacteriocin production protein  37.25 
 
 
198 aa  70.9  0.00000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000702686  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4137  resolvase domain-containing protein  31.98 
 
 
224 aa  71.2  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.130251  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3464  resolvase domain-containing protein  29.08 
 
 
185 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0037  transposon Tn21 resolvase  28.06 
 
 
205 aa  70.9  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.335597 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0166  Resolvase domain protein  28.27 
 
 
188 aa  71.2  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08245  resolvase  28.35 
 
 
179 aa  70.1  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0043  hypothetical protein  28.06 
 
 
188 aa  70.1  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0580  resolvase domain-containing protein  31.58 
 
 
186 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0605  resolvase domain-containing protein  31.58 
 
 
186 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.177837 
 
 
-
 
NC_010374  M446_7059  hypothetical protein  29.53 
 
 
183 aa  70.5  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0611  Resolvase domain protein  31.58 
 
 
186 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3655  Resolvase domain protein  30.93 
 
 
212 aa  69.7  0.00000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0554731  normal  0.301287 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4598  Resolvase domain protein  29.32 
 
 
188 aa  69.7  0.00000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4685  resolvase domain-containing protein  29.41 
 
 
193 aa  69.3  0.00000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1256  resolvase domain-containing protein  28.57 
 
 
185 aa  68.9  0.00000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.249423  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2680  resolvase domain-containing protein  28.57 
 
 
185 aa  68.9  0.00000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4473  serine-based site-specific recombinase activity TnpR  27.75 
 
 
186 aa  68.9  0.00000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0992302  decreased coverage  0.00348712 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4599  serine-based site-specific recombinase activity TnpR  27.75 
 
 
186 aa  68.9  0.00000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000321893  hitchhiker  0.00456228 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15430  putative resolvase, essential for transposition  27.75 
 
 
186 aa  68.9  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  7.34084e-16  unclonable  6.55355e-22 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3829  resolvase domain-containing protein  28.57 
 
 
185 aa  68.9  0.00000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3846  resolvase domain-containing protein  28.57 
 
 
185 aa  68.9  0.00000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.40246  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1914  resolvase domain-containing protein  28.57 
 
 
185 aa  68.9  0.00000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3982  resolvase domain-containing protein  31.61 
 
 
201 aa  68.9  0.00000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.364011  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0631  resolvase domain-containing protein  31.61 
 
 
201 aa  68.9  0.00000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0816  resolvase domain-containing protein  33.53 
 
 
185 aa  68.6  0.00000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2582  resolvase domain-containing protein  32.3 
 
 
185 aa  68.6  0.00000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2355  Resolvase domain protein  31.96 
 
 
186 aa  68.2  0.00000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.230305  normal  0.6636 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2033  resolvase domain-containing protein  27.55 
 
 
192 aa  68.2  0.00000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.188765  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1711  integrative genetic element Gsu5, resolvase  30.54 
 
 
190 aa  67.4  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0316952  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6405  resolvase domain-containing protein  33.53 
 
 
185 aa  67.4  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0011  resolvase, putative  28.42 
 
 
181 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0014  resolvase domain-containing protein  28.27 
 
 
184 aa  66.6  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.125158  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1645  resolvase-like protein  28.28 
 
 
213 aa  67  0.0000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.27327  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3678  Resolvase domain  29.27 
 
 
190 aa  67  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134045  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3992  resolvase domain-containing protein  29.7 
 
 
195 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.378658  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0088  resolvase domain-containing protein  25.25 
 
 
199 aa  65.9  0.0000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.223955  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4319  resolvase domain-containing protein  28.27 
 
 
186 aa  65.9  0.0000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1325  resolvase domain-containing protein  29.74 
 
 
192 aa  65.9  0.0000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0053  transposon Tn21 resolvase  28.27 
 
 
186 aa  65.9  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.509225 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6810  Resolvase domain protein  32.94 
 
 
185 aa  65.9  0.0000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.67902  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3572  Resolvase domain protein  30.77 
 
 
213 aa  65.5  0.0000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000252709  hitchhiker  0.00189094 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2381  Resolvase domain  26 
 
 
196 aa  65.9  0.0000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5519  Resolvase domain  31.12 
 
 
197 aa  65.9  0.0000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.176111  normal  0.515657 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1490  resolvase domain-containing protein  29.95 
 
 
183 aa  65.9  0.0000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.832501  hitchhiker  0.00333462 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2264  resolvase-like protein  29.73 
 
 
183 aa  65.5  0.0000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0723164  hitchhiker  0.00531394 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21550  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  26.18 
 
 
218 aa  65.1  0.0000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.850113  normal 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4244  resolvase  30.14 
 
 
203 aa  65.1  0.0000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_42  putative resolvase  28.57 
 
 
181 aa  65.1  0.0000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0684051  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1397  Resolvase domain protein  29.02 
 
 
209 aa  65.1  0.0000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.954133  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0068  resolvase  29.15 
 
 
181 aa  64.7  0.0000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0902003  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1312  resolvase, N-terminal:resolvase helix-turn-helix region  32.64 
 
 
187 aa  64.3  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.183881 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2322  resolvase domain-containing protein  27.43 
 
 
186 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5396  resolvase domain-containing protein  29.17 
 
 
180 aa  64.3  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.859533  n/a   
 
 
-
 
NC_010373  M446_7006  hypothetical protein  28.79 
 
 
183 aa  64.7  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2392  Resolvase domain  30.57 
 
 
197 aa  64.3  0.000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000064315  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0260  resolvase family site-specific recombinase  32.66 
 
 
205 aa  63.9  0.000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1082  resolvase family site-specific recombinase  32.66 
 
 
205 aa  63.9  0.000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.271311  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3523  resolvase, N-terminal:resolvase helix-turn-helix region  34.29 
 
 
184 aa  63.5  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000257012  decreased coverage  0.00040401 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0466  Resolvase domain  28.14 
 
 
205 aa  63.2  0.000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.418385  normal  0.0169839 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3680  resolvase domain-containing protein  33.99 
 
 
199 aa  63.5  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3876  resolvase domain-containing protein  33.99 
 
 
199 aa  63.5  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.3792 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4081  resolvase domain-containing protein  33.99 
 
 
199 aa  63.5  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0381075 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5190  resolvase domain-containing protein  28.65 
 
 
191 aa  62.8  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000411755  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5628  Resolvase domain  29.9 
 
 
198 aa  62.8  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.526216 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>