124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2322 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_2322  DNA recombinase  100 
 
 		 110 aa  226  8e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006578  pBT9727_0065  DNA recombinase  53.4 
 
 		 203 aa  108  3e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0049  recombinase  51.46 
 
 		 220 aa  106  1e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00880033  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1183  resolvase domain-containing protein  50.49 
 
 		 200 aa  100  5e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.132915  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5624  resolvase domain-containing protein  42.2 
 
 		 179 aa  91.3  5e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0216  site-specific recombinase  46.3 
 
 		 208 aa  90.1  9e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  0.613104 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0167  site-specific recombinase  43.36 
 
 		 214 aa  88.2  3e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2438  Resolvase domain protein  39.6 
 
 		 206 aa  84.7  3e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000895592 
 
 
-
 
NC_010715  Nther_2949  Resolvase domain  39.13 
 
 		 202 aa  80.1  0.000000000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.587528  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2033  resolvase domain-containing protein  35.96 
 
 		 192 aa  58.9  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.188765  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25950  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  39.51 
 
 		 195 aa  55.1  0.0000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2984  putative site-specific recombinases, DNA invertase Pin  37.84 
 
 		 203 aa  53.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.200056  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16170  resolvase  35.23 
 
 		 207 aa  52  0.000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.982528  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21550  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  36.25 
 
 		 218 aa  52  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.850113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4764  resolvase domain-containing protein  37.97 
 
 		 189 aa  52  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2264  resolvase-like protein  35.29 
 
 		 183 aa  51.2  0.000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0723164  hitchhiker  0.00531394 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1503  resolvase  33.75 
 
 		 182 aa  50.8  0.000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.236013  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2351  resolvase-like protein  35.37 
 
 		 235 aa  50.4  0.000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.329475 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0088  resolvase domain-containing protein  31.4 
 
 		 199 aa  50.4  0.000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.223955  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0884  Resolvase domain protein  31.25 
 
 		 187 aa  50.4  0.000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000364698  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0523  resolvase-like protein  32.95 
 
 		 198 aa  50.4  0.000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1807  resolvase domain-containing protein  33.71 
 
 		 201 aa  50.4  0.000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.261116  unclonable  0.00000000603181 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1494  resolvase-like protein  36.59 
 
 		 186 aa  49.7  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.493325 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3440  invertase/recombinase protein  31.71 
 
 		 188 aa  50.1  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.115695  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3862  resolvase domain-containing protein  36 
 
 		 194 aa  49.7  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0506724  unclonable  0.00000235811 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4386  resolvase  33.33 
 
 		 219 aa  48.9  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6187  resolvase-like protein  35.37 
 
 		 186 aa  48.5  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0984609  hitchhiker  0.0000107923 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2144  Resolvase domain protein  25.84 
 
 		 196 aa  48.1  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0618608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0536  resolvase domain-containing protein  34.67 
 
 		 203 aa  48.1  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.201567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4352  Resolvase domain protein  37.8 
 
 		 186 aa  48.1  0.00004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00813261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4489  Resolvase domain protein  37.8 
 
 		 186 aa  48.1  0.00004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000146883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4473  serine-based site-specific recombinase activity TnpR  35.37 
 
 		 186 aa  47.4  0.00007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0992302  decreased coverage  0.00348712 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4599  serine-based site-specific recombinase activity TnpR  35.37 
 
 		 186 aa  47.4  0.00007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000321893  hitchhiker  0.00456228 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15430  putative resolvase, essential for transposition  35.37 
 
 		 186 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  7.34084e-16  unclonable  6.55355e-22 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4319  resolvase domain-containing protein  35.37 
 
 		 186 aa  47  0.00008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0053  transposon Tn21 resolvase  35.37 
 
 		 186 aa  47  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.509225 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1445  Resolvase domain  35.44 
 
 		 188 aa  47  0.00009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007617  Nmul_D2813  resolvase-like protein  35.53 
 
 		 184 aa  46.6  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.493253  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1125  resolvase domain-containing protein  34.15 
 
 		 184 aa  46.6  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.577602  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4084  resolvase domain-containing protein  30.12 
 
 		 188 aa  46.6  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.236689  normal  0.0346573 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1206  Resolvase domain protein  35.37 
 
 		 186 aa  46.6  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0273  resolvase/recombinase  38.75 
 
 		 213 aa  45.4  0.0002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4598  Resolvase domain protein  33.73 
 
 		 188 aa  45.8  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0166  Resolvase domain protein  33.33 
 
 		 188 aa  45.8  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5628  Resolvase domain  39.02 
 
 		 198 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.526216 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3075  resolvase domain protein  32.14 
 
 		 191 aa  46.2  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0011  RlgA  39.19 
 
 		 186 aa  46.2  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.928686  normal  1 
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5037  resolvase domain-containing protein  30.49 
 
 		 201 aa  45.1  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.931406  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3829  resolvase domain-containing protein  33.73 
 
 		 185 aa  45.1  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3846  resolvase domain-containing protein  33.73 
 
 		 185 aa  45.1  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.40246  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1914  resolvase domain-containing protein  33.73 
 
 		 185 aa  45.1  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1256  resolvase domain-containing protein  33.73 
 
 		 185 aa  45.1  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.249423  n/a   
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4382  resolvase domain-containing protein  32.89 
 
 		 194 aa  44.7  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2362  DNA-invertase  34.21 
 
 		 188 aa  44.7  0.0004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2680  resolvase domain-containing protein  33.73 
 
 		 185 aa  45.1  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6634  resolvase domain-containing protein  31.33 
 
 		 198 aa  45.1  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000708994  hitchhiker  0.0000367715 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3124  resolvase domain-containing protein  28.41 
 
 		 194 aa  44.7  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0904767  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0037  transposon Tn21 resolvase  33.73 
 
 		 205 aa  44.7  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.335597 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0011  resolvase, putative  36.84 
 
 		 181 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013518  Sterm_4140  Resolvase domain protein  35.23 
 
 		 217 aa  44.3  0.0006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00204948  n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0090  resolvase TnpR  31.71 
 
 		 183 aa  44.3  0.0006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.707126  normal  0.345515 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2363  resolvase-like protein  34.21 
 
 		 228 aa  43.9  0.0007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.379523  normal  0.343568 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29040  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  34.12 
 
 		 197 aa  43.9  0.0007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.436309  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2100  Resolvase domain protein  39.29 
 
 		 196 aa  43.1  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000956779  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0854  invertase/recombinase like protein  32.14 
 
 		 198 aa  43.5  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.160403  normal  0.816153 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3464  resolvase domain-containing protein  32.53 
 
 		 185 aa  43.5  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0687  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  30.11 
 
 		 200 aa  43.1  0.001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.731539  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4154  resolvase domain-containing protein  35.14 
 
 		 199 aa  43.1  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4727  Site-specific recombinase DNA invertase Pin  38.6 
 
 		 337 aa  43.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6373  resolvase domain-containing protein  32.47 
 
 		 193 aa  43.1  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6403  resolvase domain-containing protein  32.47 
 
 		 193 aa  43.1  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01345  predicted site-specific recombinase  39.29 
 
 		 196 aa  42.4  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01504  predicted site-specific recombinase  39.29 
 
 		 196 aa  42.4  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.133152  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2272  Resolvase domain protein  39.29 
 
 		 196 aa  42.4  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.861059  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01357  hypothetical protein  39.29 
 
 		 196 aa  42.4  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2172  recombinase  48.72 
 
 		 214 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0678128  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0149  resolvase  27.91 
 
 		 189 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2331  resolvase-like protein  29.7 
 
 		 206 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.385659  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0235  resolvase domain-containing protein  32.43 
 
 		 187 aa  42.7  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2312  Resolvase domain  28.57 
 
 		 201 aa  42.7  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4775  resolvase domain-containing protein  32.89 
 
 		 189 aa  42.4  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4668  resolvase domain-containing protein  32.89 
 
 		 189 aa  42.4  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1754  site-specific recombinase resolvase family protein PinR  39.29 
 
 		 196 aa  42.4  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0427296  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2979  resolvase domain-containing protein  32 
 
 		 98 aa  42.7  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000276011 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01515  hypothetical protein  39.29 
 
 		 196 aa  42.4  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.088804  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2113  resolvase domain-containing protein  39.29 
 
 		 196 aa  42.4  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0120982  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4128  Resolvase domain protein  40.32 
 
 		 231 aa  42.4  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2392  Resolvase domain  34.57 
 
 		 197 aa  42.7  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000064315  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0466  Resolvase domain  35.44 
 
 		 205 aa  42.4  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.418385  normal  0.0169839 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0039  resolvase  32.89 
 
 		 181 aa  42  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0293678  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1467  resolvase-like protein  41.18 
 
 		 196 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1202  resolvase domain-containing protein  32.53 
 
 		 194 aa  42  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5396  resolvase domain-containing protein  34.21 
 
 		 180 aa  42  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.859533  n/a   
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6497  resolvase domain-containing protein  31.17 
 
 		 193 aa  42  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6450  resolvase domain-containing protein  31.17 
 
 		 193 aa  42  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1579  transposon Tn3 resolvase  36.36 
 
 		 185 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.159821  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20410  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  29.41 
 
 		 194 aa  42  0.003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0661103 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0043  hypothetical protein  31.76 
 
 		 188 aa  41.6  0.004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0167  resolvase domain-containing protein  30.59 
 
 		 196 aa  41.6  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3256  Fis family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 116 aa  41.2  0.004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0578977  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>