More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_2331 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_2331  resolvase-like protein  100 
 
 
206 aa  406  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.385659  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3075  resolvase domain protein  53.12 
 
 
191 aa  169  2e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2810  integrase  65.38 
 
 
280 aa  91.3  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0019  Resolvase domain protein  37.89 
 
 
195 aa  90.1  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4253  resolvase-like protein  40.27 
 
 
201 aa  87  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.35703  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4263  resolvase-like protein  40.27 
 
 
201 aa  87  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2896  resolvase-like protein  37.02 
 
 
206 aa  84.3  0.000000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.232346  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1467  resolvase-like protein  36.18 
 
 
196 aa  82  0.000000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2132  resolvase domain-containing protein  39.84 
 
 
198 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0356691 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1490  resolvase domain-containing protein  37.41 
 
 
183 aa  80.9  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.832501  hitchhiker  0.00333462 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0039  resolvase  32.26 
 
 
181 aa  80.9  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0293678  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3694  resolvase domain-containing protein  37.02 
 
 
206 aa  80.9  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2549  Resolvase domain protein  30.11 
 
 
194 aa  80.1  0.00000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0121219  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3007  resolvase-like protein  36.26 
 
 
204 aa  80.1  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0154323 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4042  serine-based site-specific recombinase activity  36.26 
 
 
204 aa  80.1  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.890679  normal  0.169813 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4975  serine-based site-specific recombinase activity  36.26 
 
 
204 aa  80.1  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.283487  normal  0.35895 
 
 
-
 
NC_006663  SEA0006  resolvase family site-specific recombinase  33.79 
 
 
192 aa  73.9  0.000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.105184  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1594  resolvase domain-containing protein  32.79 
 
 
189 aa  74.7  0.000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.94865  normal  0.455677 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4764  resolvase domain-containing protein  32.46 
 
 
189 aa  73.6  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3652  resolvase, N-terminal  35.47 
 
 
192 aa  72.4  0.000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000770175  normal 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2347  Resolvase domain protein  35.52 
 
 
204 aa  72.4  0.000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1099  resolvase domain-containing protein  32.42 
 
 
212 aa  72.4  0.000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1021  resolvase domain-containing protein  30.5 
 
 
230 aa  72  0.000000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0963583 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0721  resolvase domain-containing protein  43.01 
 
 
200 aa  71.6  0.000000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0556625 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0014  resolvase domain-containing protein  31.51 
 
 
184 aa  71.2  0.000000000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.125158  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9833  Resolvase Protein  35.36 
 
 
210 aa  71.2  0.000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6187  resolvase-like protein  33.52 
 
 
186 aa  71.2  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0984609  hitchhiker  0.0000107923 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1503  resolvase  34.9 
 
 
182 aa  71.2  0.00000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.236013  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0088  resolvase domain-containing protein  30.61 
 
 
199 aa  70.9  0.00000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.223955  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0486  Resolvase domain protein  34.52 
 
 
515 aa  70.5  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.325495  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1807  resolvase domain-containing protein  30.61 
 
 
201 aa  70.1  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.261116  unclonable  0.00000000603181 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4084  resolvase domain-containing protein  33.15 
 
 
188 aa  70.1  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.236689  normal  0.0346573 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0041  resolvase domain-containing protein  30.14 
 
 
184 aa  70.1  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  decreased coverage  0.0000573211 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2967  DNA-invertase hin  31.67 
 
 
188 aa  69.3  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000835062 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3135  resolvase TnpR  32.04 
 
 
217 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43160  Resolvase-like protein  33.99 
 
 
189 aa  69.3  0.00000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3045  Resolvase domain protein  33.14 
 
 
189 aa  69.3  0.00000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.436524  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2351  resolvase-like protein  29.95 
 
 
235 aa  69.3  0.00000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.329475 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2781  resolvase domain-containing protein  34.03 
 
 
190 aa  69.3  0.00000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.183587  normal  0.43479 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0536  resolvase domain-containing protein  33.33 
 
 
203 aa  69.3  0.00000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.201567  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2948  DNA-invertase hin  31.67 
 
 
187 aa  68.6  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  1.3180099999999999e-20 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4663  resolvase domain-containing protein  33.52 
 
 
197 aa  68.6  0.00000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.94015  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4379  resolvase-like protein  33.52 
 
 
197 aa  68.6  0.00000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.907706  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4555  resolvase-like protein  33.52 
 
 
197 aa  68.6  0.00000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.849085  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2913  DNA-invertase hin  31.67 
 
 
190 aa  68.6  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.504047  normal  0.0309704 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1852  Resolvase domain  33.33 
 
 
197 aa  68.6  0.00000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.064893  hitchhiker  0.000000000000388244 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4479  Resolvase domain protein  33.33 
 
 
197 aa  68.6  0.00000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000000147912 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1477  Resolvase domain  33.33 
 
 
197 aa  68.6  0.00000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.79192  unclonable  0.0000000000000150315 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4419  resolvase domain-containing protein  32.75 
 
 
196 aa  68.2  0.00000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00736052  normal  0.464308 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2084  resolvase domain-containing protein  32.75 
 
 
196 aa  68.2  0.00000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2173  resolvase domain-containing protein  32.75 
 
 
196 aa  68.2  0.00000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6307  resolvase domain-containing protein  32.14 
 
 
209 aa  68.2  0.00000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5450  resolvase domain-containing protein  37.78 
 
 
184 aa  68.2  0.00000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1562  recombinase  30.56 
 
 
188 aa  68.2  0.00000000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2746  resolvase domain-containing protein  35.62 
 
 
197 aa  68.2  0.00000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0991  resolvase domain-containing protein  31.28 
 
 
205 aa  68.2  0.00000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0378771  normal 
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2823  resolvase domain-containing protein  35.62 
 
 
197 aa  68.2  0.00000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1615  resolvase family site-specific recombinase  32.09 
 
 
197 aa  67.4  0.0000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3423  Resolvase domain protein  35.71 
 
 
185 aa  67.4  0.0000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2656  resolvase domain-containing protein  35.2 
 
 
200 aa  67.4  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.14772 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4320  hypothetical protein  35.85 
 
 
293 aa  67.8  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.264253 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3714  resolvase domain-containing protein  28.33 
 
 
188 aa  67.4  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.566828  n/a   
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5457  hypothetical protein  31.11 
 
 
194 aa  67.4  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4775  resolvase domain-containing protein  35.71 
 
 
189 aa  67.4  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_2482  TonB-dependent receptor protein  33.96 
 
 
294 aa  67.4  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4189  TonB-dependent receptor protein  33.96 
 
 
294 aa  67  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5126  Resolvase domain protein  32.42 
 
 
197 aa  66.6  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.114051 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4668  resolvase domain-containing protein  35.71 
 
 
189 aa  67.4  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1494  resolvase-like protein  31.87 
 
 
186 aa  67  0.0000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.493325 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4272  resolvase-like protein  33.8 
 
 
149 aa  67  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.299836  normal 
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5396  resolvase domain-containing protein  31.32 
 
 
180 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.859533  n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5424  Resolvase domain  31.11 
 
 
194 aa  67.4  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2668  helix-turn-helix, Fis-type  33.33 
 
 
204 aa  66.6  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00804941  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1568  helix-turn-helix, Fis-type  33.33 
 
 
204 aa  66.6  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2984  putative site-specific recombinases, DNA invertase Pin  31.52 
 
 
203 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.200056  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0052  hypothetical protein  30.89 
 
 
201 aa  65.9  0.0000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1803  resolvase domain-containing protein  34.5 
 
 
193 aa  65.9  0.0000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2489  Resolvase domain protein  31.67 
 
 
184 aa  65.5  0.0000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.243262  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5190  resolvase domain-containing protein  33.78 
 
 
191 aa  65.5  0.0000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000411755  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20410  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  34.19 
 
 
194 aa  65.5  0.0000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0661103 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5339  DNA-invertase  32.96 
 
 
192 aa  65.5  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.687343  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5399  resolvase domain-containing protein  30.17 
 
 
186 aa  65.1  0.0000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00909416  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2154  Resolvase domain protein  28.89 
 
 
185 aa  65.1  0.0000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.478214  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3683  resolvase domain-containing protein  33.89 
 
 
215 aa  65.1  0.0000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2312  Resolvase domain  32.28 
 
 
201 aa  65.1  0.0000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3748  resolvase domain-containing protein  35.4 
 
 
293 aa  64.7  0.0000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.57685  normal  0.861996 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2258  resolvase domain-containing protein  28.89 
 
 
195 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.880923  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1403  resolvase domain-containing protein  28.89 
 
 
185 aa  64.7  0.000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.749996  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1754  site-specific recombinase resolvase family protein PinR  31.82 
 
 
196 aa  64.3  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0427296  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1052  Resolvase domain  33.72 
 
 
186 aa  64.3  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0302  DNA-invertase  31.11 
 
 
184 aa  64.7  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.623719 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2144  Resolvase domain protein  31.22 
 
 
196 aa  64.7  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0618608  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1206  Resolvase domain protein  30.22 
 
 
186 aa  64.7  0.000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4319  resolvase-like protein  30.82 
 
 
206 aa  64.3  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01504  predicted site-specific recombinase  31.82 
 
 
196 aa  63.5  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.133152  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2272  Resolvase domain protein  31.82 
 
 
196 aa  63.5  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.861059  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01515  hypothetical protein  31.82 
 
 
196 aa  63.5  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.088804  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2113  resolvase domain-containing protein  31.82 
 
 
196 aa  63.5  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0120982  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2362  DNA-invertase  32.08 
 
 
188 aa  63.9  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1635  site-specific recombinase resolvase family protein PinR  31.82 
 
 
196 aa  63.9  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00540929  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>