More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0721 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_0721  resolvase domain-containing protein  100 
 
 
200 aa  404  1.0000000000000001e-112  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0556625 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2549  Resolvase domain protein  40.96 
 
 
194 aa  126  3e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0121219  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0557  resolvase-like protein  44.92 
 
 
128 aa  99.8  2e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.158765  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2967  DNA-invertase hin  33.85 
 
 
188 aa  87.4  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000835062 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2913  DNA-invertase hin  34 
 
 
190 aa  87.4  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.504047  normal  0.0309704 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2948  DNA-invertase hin  33.85 
 
 
187 aa  87  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  1.3180099999999999e-20 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4128  Resolvase domain protein  30.97 
 
 
231 aa  86.7  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0090  resolvase TnpR  32.07 
 
 
183 aa  85.9  4e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.707126  normal  0.345515 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25950  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  32.65 
 
 
195 aa  84.7  7e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2757  resolvase domain-containing protein  32.99 
 
 
188 aa  83.2  0.000000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4379  resolvase-like protein  33.33 
 
 
197 aa  82.8  0.000000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.907706  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4555  resolvase-like protein  33.33 
 
 
197 aa  82.8  0.000000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.849085  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1104  Resolvase domain  32.79 
 
 
196 aa  82.8  0.000000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1645  resolvase-like protein  37.95 
 
 
213 aa  82.4  0.000000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.27327  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3045  Resolvase domain protein  31.91 
 
 
189 aa  82.4  0.000000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.436524  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3423  Resolvase domain protein  34.85 
 
 
185 aa  82.4  0.000000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008263  CPR_A0002  resolvase  32.09 
 
 
190 aa  82  0.000000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141759  n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08245  resolvase  31.61 
 
 
179 aa  81.6  0.000000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0302  DNA-invertase  32.47 
 
 
184 aa  81.6  0.000000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.623719 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3135  resolvase TnpR  38.82 
 
 
217 aa  81.6  0.000000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5519  Resolvase domain  33.33 
 
 
197 aa  80.5  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.176111  normal  0.515657 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3652  resolvase, N-terminal  36.75 
 
 
192 aa  80.1  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000770175  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1579  transposon Tn3 resolvase  30.98 
 
 
185 aa  79  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.159821  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3231  transposon Tn2501 resolvase  30.93 
 
 
191 aa  79  0.00000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3031  DNA-invertase  34.57 
 
 
197 aa  78.6  0.00000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00130363 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6417  resolvase domain-containing protein  32.8 
 
 
196 aa  78.2  0.00000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2381  Resolvase domain  32.07 
 
 
196 aa  78.2  0.00000000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4383  resolvase  33.86 
 
 
193 aa  78.2  0.00000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5792  resolvase TnpR  33.68 
 
 
212 aa  78.2  0.00000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.923438  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2489  Resolvase domain protein  31.44 
 
 
184 aa  78.2  0.00000000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.243262  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0006  resolvase family site-specific recombinase  30.39 
 
 
192 aa  77.4  0.0000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.105184  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1494  resolvase-like protein  33.16 
 
 
186 aa  77.8  0.0000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.493325 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4663  resolvase domain-containing protein  35.06 
 
 
197 aa  77.8  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.94015  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5628  Resolvase domain  34.74 
 
 
198 aa  77.4  0.0000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.526216 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2494  resolvase domain-containing protein  32.45 
 
 
191 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0105  resolvase, N-terminal:resolvase helix-turn-helix region  30.57 
 
 
192 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007617  Nmul_D2813  resolvase-like protein  30.89 
 
 
184 aa  77  0.0000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.493253  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0466  resolvase  32.8 
 
 
193 aa  77  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.736746  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1594  resolvase domain-containing protein  30.21 
 
 
189 aa  77  0.0000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.94865  normal  0.455677 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5190  resolvase domain-containing protein  30.2 
 
 
191 aa  76.3  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000411755  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2781  resolvase domain-containing protein  31.09 
 
 
190 aa  76.3  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.183587  normal  0.43479 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1445  Resolvase domain  31.61 
 
 
188 aa  76.3  0.0000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2351  resolvase-like protein  31.41 
 
 
235 aa  75.9  0.0000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.329475 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4473  serine-based site-specific recombinase activity TnpR  32.64 
 
 
186 aa  75.9  0.0000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0992302  decreased coverage  0.00348712 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4599  serine-based site-specific recombinase activity TnpR  32.64 
 
 
186 aa  75.9  0.0000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000321893  hitchhiker  0.00456228 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15430  putative resolvase, essential for transposition  32.64 
 
 
186 aa  75.9  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  7.34084e-16  unclonable  6.55355e-22 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1762  resolvase-like protein  30.21 
 
 
192 aa  75.5  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2374  resolvase domain-containing protein  30.21 
 
 
192 aa  75.5  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2258  resolvase domain-containing protein  30 
 
 
195 aa  75.5  0.0000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.880923  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1803  resolvase domain-containing protein  34.39 
 
 
193 aa  75.1  0.0000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0268  resolvase domain-containing protein  32.45 
 
 
181 aa  75.1  0.0000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.268273  normal 
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0024  cpp27  31.41 
 
 
204 aa  74.7  0.0000000000008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.586795  n/a   
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6307  resolvase domain-containing protein  33.51 
 
 
209 aa  74.7  0.0000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0011  resolvase, putative  30.81 
 
 
181 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1490  resolvase domain-containing protein  36.77 
 
 
183 aa  74.3  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.832501  hitchhiker  0.00333462 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01345  predicted site-specific recombinase  28.06 
 
 
196 aa  73.6  0.000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01504  predicted site-specific recombinase  28.06 
 
 
196 aa  73.6  0.000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.133152  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2272  Resolvase domain protein  28.06 
 
 
196 aa  73.6  0.000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.861059  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1807  resolvase domain-containing protein  33.68 
 
 
201 aa  73.6  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.261116  unclonable  0.00000000603181 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1206  Resolvase domain protein  32.64 
 
 
186 aa  73.6  0.000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1284  transposon Tn2501 resolvase  33.99 
 
 
191 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.1264  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0747  resolvase domain-containing protein  32.45 
 
 
181 aa  73.6  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2113  resolvase domain-containing protein  28.06 
 
 
196 aa  73.6  0.000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0120982  normal 
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a003  site-specific recombinase/resolvase  30.22 
 
 
200 aa  73.6  0.000000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.0000421132  n/a   
 
 
-
 
NC_008264  CPR_B0006  resolvase  28.88 
 
 
189 aa  73.6  0.000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00548662  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01357  hypothetical protein  28.06 
 
 
196 aa  73.6  0.000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4319  resolvase-like protein  30.5 
 
 
206 aa  73.2  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004307  resolvase N-terminal domain protein  30.53 
 
 
190 aa  73.9  0.000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.179008  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01515  hypothetical protein  28.06 
 
 
196 aa  73.6  0.000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.088804  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0039  resolvase  36.36 
 
 
181 aa  73.2  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0293678  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2003  transposon Tn2501 resolvase  29.47 
 
 
222 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00181715  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1635  site-specific recombinase resolvase family protein PinR  28.06 
 
 
196 aa  73.2  0.000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00540929  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3410  Resolvase domain protein  29.84 
 
 
206 aa  72.4  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.260918 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43160  Resolvase-like protein  32.9 
 
 
189 aa  72.4  0.000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3862  resolvase domain-containing protein  34.55 
 
 
194 aa  72.4  0.000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0506724  unclonable  0.00000235811 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3694  resolvase domain-containing protein  31.25 
 
 
206 aa  72.4  0.000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3982  resolvase domain-containing protein  31.05 
 
 
201 aa  72.4  0.000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.364011  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0631  resolvase domain-containing protein  31.05 
 
 
201 aa  72.4  0.000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5396  resolvase domain-containing protein  34.64 
 
 
180 aa  72  0.000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.859533  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1006  Resolvase domain protein  32.46 
 
 
189 aa  72.4  0.000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2100  Resolvase domain protein  28.06 
 
 
196 aa  72  0.000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000956779  n/a   
 
 
-
 
NC_010715  Nther_2949  Resolvase domain  27.18 
 
 
202 aa  71.2  0.000000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.587528  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2823  resolvase domain-containing protein  29.7 
 
 
197 aa  70.9  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2746  resolvase domain-containing protein  29.7 
 
 
197 aa  70.9  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21550  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  31.35 
 
 
218 aa  70.9  0.00000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.850113  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0041  resolvase domain-containing protein  34.21 
 
 
184 aa  70.9  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  decreased coverage  0.0000573211 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29040  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  34.21 
 
 
197 aa  70.5  0.00000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.436309  normal 
 
 
-
 
NC_010374  M446_7059  hypothetical protein  33.51 
 
 
183 aa  70.9  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0149  resolvase  35.1 
 
 
189 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2084  resolvase domain-containing protein  30 
 
 
196 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3007  resolvase-like protein  31.63 
 
 
204 aa  70.5  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0154323 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4042  serine-based site-specific recombinase activity  31.63 
 
 
204 aa  70.5  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.890679  normal  0.169813 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4975  serine-based site-specific recombinase activity  31.63 
 
 
204 aa  70.5  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.283487  normal  0.35895 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2173  resolvase domain-containing protein  30 
 
 
196 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3464  resolvase domain-containing protein  30.05 
 
 
185 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3714  resolvase domain-containing protein  30.48 
 
 
188 aa  71.2  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.566828  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4419  resolvase domain-containing protein  30 
 
 
196 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00736052  normal  0.464308 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0095  resolvase domain-containing protein  32.47 
 
 
189 aa  70.9  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.386301 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2132  resolvase domain-containing protein  30.21 
 
 
198 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0356691 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2327  Resolvase domain  28.5 
 
 
217 aa  70.1  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>