More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_2549 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_2549  Resolvase domain protein  100 
 
 		 194 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0121219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0721  resolvase domain-containing protein  40.96 
 
 		 200 aa  126  3e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0556625 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0557  resolvase-like protein  44.44 
 
 		 128 aa  107  2e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.158765  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3075  resolvase domain protein  28.72 
 
 		 191 aa  91.3  7e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5792  resolvase TnpR  33.16 
 
 		 212 aa  90.5  1e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.923438  normal  1 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0090  resolvase TnpR  30.16 
 
 		 183 aa  88.2  7e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.707126  normal  0.345515 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1490  resolvase domain-containing protein  32.28 
 
 		 183 aa  87  1e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.832501  hitchhiker  0.00333462 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0014  resolvase domain-containing protein  33.33 
 
 		 184 aa  86.3  3e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.125158  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3135  resolvase TnpR  37.91 
 
 		 217 aa  86.3  3e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1104  Resolvase domain  31.22 
 
 		 196 aa  85.1  6e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3423  Resolvase domain protein  31.02 
 
 		 185 aa  84  0.000000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0096  resolvase domain-containing protein  31.02 
 
 		 185 aa  84.3  0.000000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3652  resolvase, N-terminal  33.7 
 
 		 192 aa  83.2  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000770175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1579  transposon Tn3 resolvase  29.1 
 
 		 185 aa  83.2  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.159821  normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2381  Resolvase domain  30.16 
 
 		 196 aa  81.3  0.000000000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008264  CPR_B0006  resolvase  32.81 
 
 		 189 aa  79.3  0.00000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00548662  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0041  resolvase domain-containing protein  32.28 
 
 		 184 aa  79.3  0.00000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.0000573211 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1807  resolvase domain-containing protein  32.81 
 
 		 201 aa  77.4  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.261116  unclonable  0.00000000603181 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1645  resolvase-like protein  34.46 
 
 		 213 aa  77.8  0.0000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.27327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008263  CPR_A0002  resolvase  30.21 
 
 		 190 aa  77.8  0.0000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141759  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1021  resolvase domain-containing protein  35.4 
 
 		 230 aa  77.8  0.0000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0963583 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4663  resolvase domain-containing protein  29.57 
 
 		 197 aa  76.6  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.94015  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2331  resolvase-like protein  30.11 
 
 		 206 aa  76.3  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.385659  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4379  resolvase-like protein  29.73 
 
 		 197 aa  74.7  0.0000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.907706  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4555  resolvase-like protein  29.73 
 
 		 197 aa  74.7  0.0000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.849085  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0011  resolvase, putative  28.19 
 
 		 181 aa  74.3  0.0000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0545  hypothetical protein  27.81 
 
 		 186 aa  73.9  0.000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0606652 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0088  resolvase domain-containing protein  32.29 
 
 		 199 aa  74.3  0.000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.223955  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1099  resolvase domain-containing protein  27.96 
 
 		 212 aa  73.6  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04260  hypothetical protein  35.03 
 
 		 197 aa  71.6  0.000000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0149  resolvase  27.51 
 
 		 189 aa  71.2  0.000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20410  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  31.09 
 
 		 194 aa  70.5  0.00000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0661103 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0854  invertase/recombinase like protein  31.01 
 
 		 198 aa  70.5  0.00000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.160403  normal  0.816153 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2144  Resolvase domain protein  28.88 
 
 		 196 aa  70.9  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0618608  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0019  Resolvase domain protein  28.49 
 
 		 195 aa  71.2  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2392  Resolvase domain  28.42 
 
 		 197 aa  70.5  0.00000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000064315  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4244  resolvase  30.21 
 
 		 203 aa  70.5  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4794  resolvase domain-containing protein  27.55 
 
 		 193 aa  70.5  0.00000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5190  resolvase domain-containing protein  30.53 
 
 		 191 aa  70.1  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000411755  n/a   
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5396  resolvase domain-containing protein  29.57 
 
 		 180 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.859533  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0039  resolvase  28.88 
 
 		 181 aa  69.7  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0293678  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2172  recombinase  30.81 
 
 		 214 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0678128  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1397  invertase/recombinase like protein  31.21 
 
 		 176 aa  69.7  0.00000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.777573 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1543  resolvase domain-containing protein  34.42 
 
 		 213 aa  69.3  0.00000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0184299  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1803  resolvase domain-containing protein  27.13 
 
 		 193 aa  69.7  0.00000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4319  resolvase-like protein  29.47 
 
 		 206 aa  68.9  0.00000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4731  Resolvase domain protein  28.4 
 
 		 187 aa  68.6  0.00000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1202  resolvase domain-containing protein  31.33 
 
 		 194 aa  68.6  0.00000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0167  resolvase domain-containing protein  30.57 
 
 		 196 aa  68.2  0.00000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9833  Resolvase Protein  27.6 
 
 		 210 aa  68.2  0.00000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3440  invertase/recombinase protein  27.37 
 
 		 188 aa  67.8  0.00000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.115695  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0095  resolvase domain-containing protein  29.47 
 
 		 189 aa  67.4  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.386301 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2494  resolvase domain-containing protein  25.41 
 
 		 191 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0466  resolvase  31.05 
 
 		 193 aa  66.6  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.736746  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2154  Resolvase domain protein  31.72 
 
 		 185 aa  66.6  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.478214  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1403  resolvase domain-containing protein  31.72 
 
 		 185 aa  66.6  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.749996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1963  resolvase domain-containing protein  31.79 
 
 		 251 aa  66.6  0.0000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0600134  normal  1 
 
 
-
 
NC_007617  Nmul_D2813  resolvase-like protein  29.73 
 
 		 184 aa  66.2  0.0000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.493253  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1967  resolvase domain-containing protein  32.03 
 
 		 252 aa  66.2  0.0000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29040  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  27.32 
 
 		 197 aa  65.5  0.0000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.436309  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2550  Resolvase domain  30.48 
 
 		 196 aa  65.5  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.819685  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0235  resolvase domain-containing protein  28.11 
 
 		 187 aa  65.5  0.0000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0876  resolvase domain-containing protein  27.55 
 
 		 251 aa  65.1  0.0000000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0740279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0010  resolvase  31.18 
 
 		 185 aa  65.1  0.0000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0319649  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1467  resolvase-like protein  30.46 
 
 		 196 aa  65.1  0.0000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2003  transposon Tn2501 resolvase  26.6 
 
 		 222 aa  65.1  0.0000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00181715  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1562  recombinase  30.85 
 
 		 188 aa  65.1  0.0000000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0019  ISSod9, DNA-invertase  30.85 
 
 		 185 aa  64.7  0.0000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0170  ISSod9, DNA-invertase  30.85 
 
 		 185 aa  64.7  0.0000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.579928  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4383  resolvase  30.53 
 
 		 193 aa  64.7  0.0000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0216  transposon resolvase  30.26 
 
 		 199 aa  64.3  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.159168 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1762  resolvase-like protein  25.81 
 
 		 192 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2374  resolvase domain-containing protein  25.81 
 
 		 192 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004307  resolvase N-terminal domain protein  30.1 
 
 		 190 aa  64.3  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.179008  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43160  Resolvase-like protein  30.95 
 
 		 189 aa  63.2  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5126  Resolvase domain protein  26.32 
 
 		 197 aa  63.2  0.000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.114051 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2258  resolvase domain-containing protein  26.84 
 
 		 195 aa  62.8  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.880923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0222  transposon resolvase  30.26 
 
 		 199 aa  63.2  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000952158 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0797  resolvase domain-containing protein  29.8 
 
 		 251 aa  62.8  0.000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000013388 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4128  Resolvase domain protein  31.33 
 
 		 231 aa  62.8  0.000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4668  resolvase domain-containing protein  32.47 
 
 		 189 aa  62.4  0.000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1138  resolvase-like protein  30.85 
 
 		 207 aa  62.4  0.000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00747364  normal  0.0234159 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4775  resolvase domain-containing protein  32.47 
 
 		 189 aa  62.4  0.000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3714  resolvase domain-containing protein  30.11 
 
 		 188 aa  62.4  0.000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.566828  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6376  resolvase domain-containing protein  28.34 
 
 		 206 aa  62.4  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2427  resolvase domain-containing protein  24.86 
 
 		 193 aa  62  0.000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0929457  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0955  Resolvase domain protein  28.72 
 
 		 194 aa  62  0.000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5431  Resolvase domain protein  29.03 
 
 		 185 aa  62  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.318584  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2668  helix-turn-helix, Fis-type  23.04 
 
 		 204 aa  62  0.000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00804941  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1284  transposon Tn2501 resolvase  27.66 
 
 		 191 aa  61.6  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.1264  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1568  helix-turn-helix, Fis-type  23.04 
 
 		 204 aa  62  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0024  cpp27  31.21 
 
 		 204 aa  61.6  0.000000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.586795  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4223  resolvase domain-containing protein  26.84 
 
 		 194 aa  61.6  0.000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.150601  normal  1 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0204  transposon resolvase  27.6 
 
 		 191 aa  61.2  0.000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000159954 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4154  resolvase domain-containing protein  28.11 
 
 		 199 aa  61.2  0.000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3694  resolvase domain-containing protein  27.63 
 
 		 206 aa  61.2  0.000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5450  resolvase domain-containing protein  28.26 
 
 		 184 aa  60.8  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4419  resolvase domain-containing protein  26.98 
 
 		 196 aa  60.1  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00736052  normal  0.464308 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2948  DNA-invertase hin  28.19 
 
 		 187 aa  60.1  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.3180099999999999e-20 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2913  DNA-invertase hin  28.19 
 
 		 190 aa  59.7  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.504047  normal  0.0309704 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>