More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_0557 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007955  Mbur_0557  resolvase-like protein  100 
 
 		 128 aa  263  4e-70  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.158765  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2549  Resolvase domain protein  44.44 
 
 		 194 aa  107  8.000000000000001e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0121219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0721  resolvase domain-containing protein  44.92 
 
 		 200 aa  99.8  1e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0556625 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0159  hypothetical protein  97.37 
 
 		 81 aa  79  0.00000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1021  resolvase domain-containing protein  33.33 
 
 		 230 aa  72.4  0.000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0963583 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1803  resolvase domain-containing protein  38.54 
 
 		 193 aa  70.9  0.000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4128  Resolvase domain protein  40 
 
 		 231 aa  70.9  0.000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4244  resolvase  38.05 
 
 		 203 aa  70.1  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1807  resolvase domain-containing protein  38.94 
 
 		 201 aa  68.2  0.00000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.261116  unclonable  0.00000000603181 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0088  resolvase domain-containing protein  38.94 
 
 		 199 aa  67.4  0.00000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.223955  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3652  resolvase, N-terminal  40.62 
 
 		 192 aa  67  0.00000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000770175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2427  resolvase domain-containing protein  37.5 
 
 		 193 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0929457  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43160  Resolvase-like protein  37.5 
 
 		 189 aa  65.5  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4383  resolvase  33.61 
 
 		 193 aa  65.1  0.0000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2494  resolvase domain-containing protein  37.5 
 
 		 191 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1762  resolvase-like protein  35.42 
 
 		 192 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2374  resolvase domain-containing protein  35.42 
 
 		 192 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0105  resolvase, N-terminal:resolvase helix-turn-helix region  37.5 
 
 		 192 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1645  resolvase-like protein  36.46 
 
 		 213 aa  63.9  0.0000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.27327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2781  resolvase domain-containing protein  40.57 
 
 		 190 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.183587  normal  0.43479 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0466  resolvase  33.61 
 
 		 193 aa  63.5  0.0000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.736746  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0041  resolvase domain-containing protein  36.84 
 
 		 184 aa  63.5  0.0000000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.0000573211 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3135  resolvase TnpR  37.23 
 
 		 217 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0095  resolvase domain-containing protein  35.71 
 
 		 189 aa  63.2  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.386301 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4154  resolvase domain-containing protein  38.78 
 
 		 199 aa  63.5  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0409  resolvase domain-containing protein  38.78 
 
 		 186 aa  63.2  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00000318958  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1490  resolvase domain-containing protein  35.09 
 
 		 183 aa  62.4  0.000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.832501  hitchhiker  0.00333462 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3440  invertase/recombinase protein  34.38 
 
 		 188 aa  62  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.115695  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3231  transposon Tn2501 resolvase  35.42 
 
 		 191 aa  62  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1818  Resolvase domain protein  32.5 
 
 		 184 aa  61.6  0.000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.601257  n/a   
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4794  resolvase domain-containing protein  39.13 
 
 		 193 aa  61.6  0.000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0010  resolvase  33.61 
 
 		 185 aa  61.6  0.000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0319649  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1594  resolvase domain-containing protein  38.54 
 
 		 189 aa  61.6  0.000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.94865  normal  0.455677 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20261  hypothetical protein  32.99 
 
 		 211 aa  61.2  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.528712 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1202  resolvase domain-containing protein  33.33 
 
 		 194 aa  60.8  0.000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0536  resolvase domain-containing protein  30.77 
 
 		 203 aa  60.8  0.000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.201567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0014  resolvase domain-containing protein  35.09 
 
 		 184 aa  60.8  0.000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.125158  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3660  resolvase domain-containing protein  37.11 
 
 		 202 aa  60.5  0.000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1284  transposon Tn2501 resolvase  36.46 
 
 		 191 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.1264  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4419  resolvase domain-containing protein  37.5 
 
 		 196 aa  60.1  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00736052  normal  0.464308 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0279  recombinase  37.08 
 
 		 248 aa  60.1  0.00000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000482548  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2173  resolvase domain-containing protein  37.5 
 
 		 196 aa  60.1  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2084  resolvase domain-containing protein  37.5 
 
 		 196 aa  60.1  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004307  resolvase N-terminal domain protein  37.38 
 
 		 190 aa  59.7  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.179008  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5792  resolvase TnpR  36 
 
 		 212 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.923438  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6748  resolvase domain-containing protein  37.5 
 
 		 201 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.167425 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4835  Resolvase domain protein  34.19 
 
 		 201 aa  58.5  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.291279 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6376  resolvase domain-containing protein  38.54 
 
 		 206 aa  58.5  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1562  recombinase  31.93 
 
 		 188 aa  58.9  0.00000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2489  Resolvase domain protein  31.09 
 
 		 184 aa  58.2  0.00000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.243262  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2154  Resolvase domain protein  31.93 
 
 		 185 aa  58.2  0.00000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.478214  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1403  resolvase domain-containing protein  31.93 
 
 		 185 aa  57.8  0.00000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.749996  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3031  DNA-invertase  30.25 
 
 		 197 aa  57.4  0.00000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130363 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0876  resolvase domain-containing protein  33.6 
 
 		 251 aa  57  0.00000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0740279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1099  resolvase domain-containing protein  29.79 
 
 		 212 aa  57  0.00000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3423  Resolvase domain protein  35.87 
 
 		 185 aa  56.2  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1967  resolvase domain-containing protein  32.8 
 
 		 252 aa  56.2  0.0000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2757  resolvase domain-containing protein  31.93 
 
 		 188 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0438  putative resolvase  35.11 
 
 		 318 aa  56.6  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0302  DNA-invertase  29.41 
 
 		 184 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.623719 
 
 
-
 
NC_007617  Nmul_D2813  resolvase-like protein  34.38 
 
 		 184 aa  56.2  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.493253  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20410  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  37.62 
 
 		 194 aa  56.6  0.0000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0661103 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1218  putative invertase  34.69 
 
 		 183 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25950  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  34.29 
 
 		 195 aa  57  0.0000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3474  resolvase domain-containing protein  31.09 
 
 		 188 aa  56.2  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3714  resolvase domain-containing protein  31.93 
 
 		 188 aa  56.6  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.566828  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28731  hypothetical protein  31.96 
 
 		 211 aa  56.2  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0011  resolvase, putative  37.36 
 
 		 181 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0955  Resolvase domain protein  32.65 
 
 		 194 aa  55.5  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0090  resolvase TnpR  37.36 
 
 		 183 aa  55.5  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.707126  normal  0.345515 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5190  resolvase domain-containing protein  37.76 
 
 		 191 aa  55.8  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000411755  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4223  resolvase domain-containing protein  34.38 
 
 		 194 aa  55.1  0.0000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.150601  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1579  transposon Tn3 resolvase  36.26 
 
 		 185 aa  55.1  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.159821  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4123  resolvase domain-containing protein  30.25 
 
 		 185 aa  55.5  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0694671 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2003  transposon Tn2501 resolvase  31.37 
 
 		 222 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00181715  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0149  resolvase  36.73 
 
 		 189 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2967  DNA-invertase hin  31.09 
 
 		 188 aa  54.3  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000835062 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2312  Resolvase domain  35.58 
 
 		 201 aa  54.7  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2913  DNA-invertase hin  31.09 
 
 		 190 aa  54.3  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.504047  normal  0.0309704 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04260  hypothetical protein  36.26 
 
 		 197 aa  54.3  0.0000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6417  resolvase domain-containing protein  34.38 
 
 		 196 aa  54.3  0.0000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1963  resolvase domain-containing protein  33.07 
 
 		 251 aa  53.9  0.0000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0600134  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2948  DNA-invertase hin  31.09 
 
 		 187 aa  54.3  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.3180099999999999e-20 
 
 
-
 
NC_009341  Mflv_5602  resolvase domain-containing protein  33.7 
 
 		 213 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0143673  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0235  resolvase domain-containing protein  34.69 
 
 		 187 aa  54.3  0.0000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6610  resolvase domain-containing protein  33.33 
 
 		 192 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.874577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0471  resolvase  30.43 
 
 		 197 aa  53.9  0.0000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0797  resolvase domain-containing protein  33.33 
 
 		 251 aa  53.9  0.0000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000013388 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3553  resolvase domain-containing protein  35.34 
 
 		 181 aa  53.9  0.0000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.467372  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5628  Resolvase domain  32.29 
 
 		 198 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.526216 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5298  DNA-invertase hin  31.03 
 
 		 186 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5122  resolvase domain-containing protein  35.71 
 
 		 290 aa  53.1  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29040  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  33.68 
 
 		 197 aa  52.8  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.436309  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6782  resolvase domain-containing protein  34.69 
 
 		 184 aa  52.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.504828  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5431  Resolvase domain protein  30.25 
 
 		 185 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.318584  normal  1 
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5436  Resolvase domain  34.69 
 
 		 193 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4081  resolvase domain-containing protein  29.17 
 
 		 199 aa  53.1  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0381075 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0273  resolvase/recombinase  39.13 
 
 		 213 aa  53.1  0.000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3680  resolvase domain-containing protein  29.17 
 
 		 199 aa  53.1  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2245  resolvase domain-containing protein  31.62 
 
 		 183 aa  53.5  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.0071186  normal  0.011182 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>