More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BOV_0279 on replicon NC_009505
Organism: Brucella ovis ATCC 25840



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009505  BOV_0279  recombinase  100 
 
 
248 aa  511  1e-144  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000482548  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6448  Resolvase domain protein  68.42 
 
 
211 aa  272  5.000000000000001e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011889  Mnod_7752  Resolvase domain protein  69.38 
 
 
214 aa  267  1e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5372  Resolvase domain  72 
 
 
210 aa  266  2e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.925185 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2441  putative recombinase, transposition resolvase, TnpR  36.73 
 
 
199 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.273719 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3315  resolvase, N-terminal:resolvase helix-turn-helix region  36.27 
 
 
200 aa  107  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0043  hypothetical protein  33.33 
 
 
188 aa  98.6  8e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2003  transposon Tn2501 resolvase  32.57 
 
 
222 aa  97.1  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00181715  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1762  resolvase-like protein  35.64 
 
 
192 aa  97.4  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2374  resolvase domain-containing protein  35.64 
 
 
192 aa  97.4  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1206  Resolvase domain protein  34.74 
 
 
186 aa  94.4  2e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3231  transposon Tn2501 resolvase  36.04 
 
 
191 aa  93.6  3e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4473  serine-based site-specific recombinase activity TnpR  34.21 
 
 
186 aa  93.2  3e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0992302  decreased coverage  0.00348712 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4599  serine-based site-specific recombinase activity TnpR  34.21 
 
 
186 aa  93.2  3e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000321893  hitchhiker  0.00456228 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15430  putative resolvase, essential for transposition  34.21 
 
 
186 aa  93.2  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  7.34084e-16  unclonable  6.55355e-22 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1494  resolvase-like protein  33.68 
 
 
186 aa  91.3  1e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.493325 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1803  resolvase domain-containing protein  32.29 
 
 
193 aa  91.3  1e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2680  resolvase domain-containing protein  34.74 
 
 
185 aa  91.3  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3829  resolvase domain-containing protein  34.74 
 
 
185 aa  91.3  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3846  resolvase domain-containing protein  34.74 
 
 
185 aa  91.3  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.40246  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1914  resolvase domain-containing protein  34.74 
 
 
185 aa  91.3  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1256  resolvase domain-containing protein  34.74 
 
 
185 aa  91.3  1e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.249423  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2427  resolvase domain-containing protein  33.16 
 
 
193 aa  89.4  5e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0929457  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0105  resolvase, N-terminal:resolvase helix-turn-helix region  33.67 
 
 
192 aa  89  6e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6187  resolvase-like protein  33.66 
 
 
186 aa  89.4  6e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0984609  hitchhiker  0.0000107923 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3464  resolvase domain-containing protein  34.21 
 
 
185 aa  89  6e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2351  resolvase-like protein  34.21 
 
 
235 aa  88.6  8e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.329475 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1445  Resolvase domain  31.25 
 
 
188 aa  88.6  9e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4489  Resolvase domain protein  32.49 
 
 
186 aa  88.2  1e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000146883  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0037  transposon Tn21 resolvase  32.68 
 
 
205 aa  87.8  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.335597 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4352  Resolvase domain protein  32.49 
 
 
186 aa  88.2  1e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00813261  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2494  resolvase domain-containing protein  33.33 
 
 
191 aa  87.4  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1284  transposon Tn2501 resolvase  33.5 
 
 
191 aa  87.4  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.1264  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0053  transposon Tn21 resolvase  33.16 
 
 
186 aa  87  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.509225 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4319  resolvase domain-containing protein  33.16 
 
 
186 aa  87  3e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2033  resolvase domain-containing protein  31.34 
 
 
192 aa  86.3  4e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.188765  n/a   
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0011  RlgA  35.42 
 
 
186 aa  85.1  9e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.928686  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2100  Resolvase domain protein  30.73 
 
 
196 aa  84.3  0.000000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000956779  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2084  resolvase domain-containing protein  32.29 
 
 
196 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2173  resolvase domain-containing protein  32.29 
 
 
196 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4419  resolvase domain-containing protein  32.29 
 
 
196 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00736052  normal  0.464308 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3474  resolvase domain-containing protein  31.58 
 
 
188 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3135  resolvase TnpR  30.09 
 
 
217 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1754  site-specific recombinase resolvase family protein PinR  30.21 
 
 
196 aa  84  0.000000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0427296  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1403  resolvase domain-containing protein  32.81 
 
 
185 aa  84  0.000000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.749996  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2154  Resolvase domain protein  32.81 
 
 
185 aa  83.6  0.000000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.478214  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1125  resolvase domain-containing protein  33.68 
 
 
184 aa  83.2  0.000000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.577602  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3112  Resolvase domain protein  33 
 
 
184 aa  83.6  0.000000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01345  predicted site-specific recombinase  30.21 
 
 
196 aa  82.8  0.000000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01504  predicted site-specific recombinase  30.21 
 
 
196 aa  82.8  0.000000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.133152  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2272  Resolvase domain protein  30.21 
 
 
196 aa  82.8  0.000000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.861059  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4764  resolvase domain-containing protein  32.45 
 
 
189 aa  82.8  0.000000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01515  hypothetical protein  30.21 
 
 
196 aa  82.8  0.000000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.088804  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01357  hypothetical protein  30.21 
 
 
196 aa  82.8  0.000000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2113  resolvase domain-containing protein  30.21 
 
 
196 aa  82.8  0.000000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0120982  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0268  resolvase domain-containing protein  35.86 
 
 
181 aa  82.8  0.000000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.268273  normal 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3982  resolvase domain-containing protein  31.05 
 
 
201 aa  82.8  0.000000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.364011  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0631  resolvase domain-containing protein  31.05 
 
 
201 aa  82.8  0.000000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2132  resolvase domain-containing protein  29.74 
 
 
198 aa  82  0.000000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0356691 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0580  resolvase domain-containing protein  34.9 
 
 
186 aa  82  0.000000000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0605  resolvase domain-containing protein  34.9 
 
 
186 aa  82  0.000000000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.177837 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0611  Resolvase domain protein  34.9 
 
 
186 aa  82  0.000000000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1635  site-specific recombinase resolvase family protein PinR  29.69 
 
 
196 aa  81.3  0.00000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00540929  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0010  resolvase  31.77 
 
 
185 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0319649  n/a   
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5396  resolvase domain-containing protein  31.58 
 
 
180 aa  80.1  0.00000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.859533  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1562  recombinase  32.29 
 
 
188 aa  80.1  0.00000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2322  resolvase domain-containing protein  31.05 
 
 
186 aa  80.1  0.00000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0088  resolvase domain-containing protein  28.95 
 
 
199 aa  80.1  0.00000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.223955  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3652  resolvase, N-terminal  31.82 
 
 
192 aa  79.7  0.00000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000770175  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3862  resolvase domain-containing protein  32.65 
 
 
194 aa  79.7  0.00000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0506724  unclonable  0.00000235811 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1807  resolvase domain-containing protein  29.84 
 
 
201 aa  79.3  0.00000000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.261116  unclonable  0.00000000603181 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2757  resolvase domain-containing protein  33.89 
 
 
188 aa  79.7  0.00000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0536  resolvase domain-containing protein  32.5 
 
 
203 aa  79  0.00000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.201567  normal 
 
 
-
 
NC_010374  M446_7059  hypothetical protein  32.83 
 
 
183 aa  79  0.00000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010373  M446_7006  hypothetical protein  33.33 
 
 
183 aa  79  0.00000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3031  DNA-invertase  32.78 
 
 
197 aa  79  0.00000000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00130363 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5628  Resolvase domain  33.33 
 
 
198 aa  78.6  0.00000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.526216 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4386  resolvase  33.66 
 
 
219 aa  78.6  0.00000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4663  resolvase domain-containing protein  32.49 
 
 
197 aa  78.6  0.00000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.94015  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1325  resolvase domain-containing protein  32.82 
 
 
192 aa  78.6  0.00000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0260  resolvase family site-specific recombinase  33.67 
 
 
205 aa  78.2  0.0000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1082  resolvase family site-specific recombinase  33.67 
 
 
205 aa  78.2  0.0000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.271311  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4223  resolvase domain-containing protein  31.77 
 
 
194 aa  78.2  0.0000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.150601  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0747  resolvase domain-containing protein  33.84 
 
 
181 aa  77.8  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4379  resolvase-like protein  32.99 
 
 
197 aa  78.2  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.907706  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4555  resolvase-like protein  32.99 
 
 
197 aa  78.2  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.849085  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1594  resolvase domain-containing protein  33.5 
 
 
189 aa  78.2  0.0000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.94865  normal  0.455677 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1711  integrative genetic element Gsu5, resolvase  33.67 
 
 
190 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0316952  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2362  DNA-invertase  32.98 
 
 
188 aa  77.4  0.0000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6417  resolvase domain-containing protein  32.65 
 
 
196 aa  77.4  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3124  resolvase domain-containing protein  30.5 
 
 
194 aa  77  0.0000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0904767  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0166  Resolvase domain protein  32.63 
 
 
188 aa  77  0.0000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3170  resolvase domain-containing protein  30.41 
 
 
200 aa  76.3  0.0000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00430122 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6748  resolvase domain-containing protein  33.52 
 
 
201 aa  75.9  0.0000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.167425 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4598  Resolvase domain protein  32.29 
 
 
188 aa  75.5  0.0000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0302  DNA-invertase  32.78 
 
 
184 aa  75.5  0.0000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.623719 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1326  resolvase domain-containing protein  31.63 
 
 
180 aa  75.1  0.0000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5792  resolvase TnpR  32.08 
 
 
212 aa  75.1  0.0000000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.923438  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2489  Resolvase domain protein  31.67 
 
 
184 aa  74.7  0.000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.243262  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3928  resolvase domain-containing protein  30.85 
 
 
191 aa  74.7  0.000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.272515  hitchhiker  0.0000753359 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>