More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_1543 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_1543  resolvase domain-containing protein  100 
 
 		 213 aa  436  9.999999999999999e-123  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0184299  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3135  resolvase TnpR  36.49 
 
 		 217 aa  95.9  4e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0438  putative resolvase  42.57 
 
 		 318 aa  95.9  4e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3652  resolvase, N-terminal  36.67 
 
 		 192 aa  95.5  6e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000770175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1594  resolvase domain-containing protein  35.23 
 
 		 189 aa  93.6  2e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.94865  normal  0.455677 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1803  resolvase domain-containing protein  36.42 
 
 		 193 aa  92  5e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1132  Resolvase domain  33.14 
 
 		 184 aa  90.9  1e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3678  Resolvase domain  34.46 
 
 		 190 aa  89.7  3e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134045  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004307  resolvase N-terminal domain protein  38 
 
 		 190 aa  89.4  3e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.179008  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1006  Resolvase domain protein  35.42 
 
 		 189 aa  89.4  4e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0260  resolvase family site-specific recombinase  35.42 
 
 		 205 aa  89  5e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1082  resolvase family site-specific recombinase  35.42 
 
 		 205 aa  89  5e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.271311  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4775  resolvase domain-containing protein  36.55 
 
 		 189 aa  87.4  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4668  resolvase domain-containing protein  36.55 
 
 		 189 aa  87.4  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1711  integrative genetic element Gsu5, resolvase  30.46 
 
 		 190 aa  85.5  6e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0316952  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2781  resolvase domain-containing protein  37.33 
 
 		 190 aa  85.1  8e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.183587  normal  0.43479 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2312  Resolvase domain  37.58 
 
 		 201 aa  84.7  9e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3423  Resolvase domain protein  33.71 
 
 		 185 aa  84.3  0.000000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2355  Resolvase domain protein  32.68 
 
 		 186 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.230305  normal  0.6636 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2582  resolvase domain-containing protein  29.65 
 
 		 185 aa  84.3  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4223  resolvase domain-containing protein  34.21 
 
 		 194 aa  83.2  0.000000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.150601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3694  resolvase domain-containing protein  31.58 
 
 		 206 aa  83.6  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1579  transposon Tn3 resolvase  30.99 
 
 		 185 aa  82  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.159821  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43160  Resolvase-like protein  35.86 
 
 		 189 aa  82  0.000000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3670  resolvase domain-containing protein  31.15 
 
 		 185 aa  82  0.000000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4419  resolvase domain-containing protein  31.07 
 
 		 196 aa  81.6  0.000000000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00736052  normal  0.464308 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2173  resolvase domain-containing protein  31.07 
 
 		 196 aa  81.6  0.000000000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2084  resolvase domain-containing protein  31.07 
 
 		 196 aa  81.6  0.000000000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5298  DNA-invertase hin  35.37 
 
 		 186 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5792  resolvase TnpR  32.65 
 
 		 212 aa  80.5  0.00000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.923438  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003898  resolvase putative  36.88 
 
 		 202 aa  80.5  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1754  site-specific recombinase resolvase family protein PinR  31.07 
 
 		 196 aa  79.7  0.00000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0427296  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29040  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  33.77 
 
 		 197 aa  79.3  0.00000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.436309  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2132  resolvase domain-containing protein  35.14 
 
 		 198 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0356691 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01345  predicted site-specific recombinase  31.07 
 
 		 196 aa  78.6  0.00000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01504  predicted site-specific recombinase  31.07 
 
 		 196 aa  78.6  0.00000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.133152  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2100  Resolvase domain protein  33.78 
 
 		 196 aa  78.6  0.00000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000956779  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2272  Resolvase domain protein  31.07 
 
 		 196 aa  78.6  0.00000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.861059  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01357  hypothetical protein  31.07 
 
 		 196 aa  78.6  0.00000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2113  resolvase domain-containing protein  31.07 
 
 		 196 aa  78.6  0.00000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0120982  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01515  hypothetical protein  31.07 
 
 		 196 aa  78.6  0.00000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.088804  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1635  site-specific recombinase resolvase family protein PinR  33.78 
 
 		 196 aa  78.6  0.00000000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00540929  n/a   
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2239  resolvase domain-containing protein  30.82 
 
 		 187 aa  77.8  0.0000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3440  invertase/recombinase protein  30 
 
 		 188 aa  77.4  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.115695  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2757  resolvase domain-containing protein  32.19 
 
 		 188 aa  77.4  0.0000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1104  Resolvase domain  32.24 
 
 		 196 aa  77  0.0000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010504  Mrad2831_6517  resolvase domain-containing protein  30.26 
 
 		 185 aa  77.4  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1807  resolvase domain-containing protein  34.01 
 
 		 201 aa  76.6  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.261116  unclonable  0.00000000603181 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1762  resolvase-like protein  33.33 
 
 		 192 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2374  resolvase domain-containing protein  33.33 
 
 		 192 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0938  site-specific recombinase  35 
 
 		 154 aa  76.6  0.0000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2489  Resolvase domain protein  33.56 
 
 		 184 aa  76.3  0.0000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.243262  n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0090  resolvase TnpR  33.56 
 
 		 183 aa  76.3  0.0000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.707126  normal  0.345515 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2494  resolvase domain-containing protein  33.33 
 
 		 191 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0302  DNA-invertase  33.56 
 
 		 184 aa  76.3  0.0000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.623719 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9833  Resolvase Protein  32.56 
 
 		 210 aa  76.6  0.0000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0167  resolvase domain-containing protein  32.55 
 
 		 196 aa  76.6  0.0000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3231  transposon Tn2501 resolvase  31.95 
 
 		 191 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0088  resolvase domain-containing protein  34.01 
 
 		 199 aa  75.9  0.0000000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.223955  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4379  resolvase-like protein  35.57 
 
 		 197 aa  75.5  0.0000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.907706  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4555  resolvase-like protein  35.57 
 
 		 197 aa  75.5  0.0000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.849085  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2347  Resolvase domain protein  30.41 
 
 		 204 aa  75.5  0.0000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0466  Resolvase domain  34.44 
 
 		 205 aa  75.5  0.0000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.418385  normal  0.0169839 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0011  resolvase, putative  34.44 
 
 		 181 aa  75.5  0.0000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2668  helix-turn-helix, Fis-type  33.33 
 
 		 204 aa  75.5  0.0000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00804941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1568  helix-turn-helix, Fis-type  33.33 
 
 		 204 aa  75.5  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2003  transposon Tn2501 resolvase  34.01 
 
 		 222 aa  75.1  0.0000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00181715  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1284  transposon Tn2501 resolvase  32.65 
 
 		 191 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.1264  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5628  Resolvase domain  28.99 
 
 		 198 aa  74.3  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.526216 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4537  Resolvase domain protein  32.21 
 
 		 198 aa  73.9  0.000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.41321 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2095  Resolvase domain protein  31.17 
 
 		 203 aa  74.3  0.000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2144  Resolvase domain protein  30.6 
 
 		 196 aa  73.6  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0618608  normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2381  Resolvase domain  32.21 
 
 		 196 aa  73.6  0.000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3007  resolvase-like protein  30.99 
 
 		 204 aa  73.6  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0154323 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4042  serine-based site-specific recombinase activity  30.99 
 
 		 204 aa  73.6  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.890679  normal  0.169813 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4975  serine-based site-specific recombinase activity  30.99 
 
 		 204 aa  73.6  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.283487  normal  0.35895 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2427  resolvase domain-containing protein  33.33 
 
 		 193 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0929457  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4459  resolvase  31.51 
 
 		 190 aa  73.6  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4290  resolvase  31.51 
 
 		 190 aa  73.6  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4190  resolvase  31.51 
 
 		 190 aa  73.6  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3031  DNA-invertase  32.88 
 
 		 197 aa  73.9  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130363 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0512  resolvase domain-containing protein  26.52 
 
 		 299 aa  73.2  0.000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4794  resolvase domain-containing protein  35.25 
 
 		 193 aa  72.8  0.000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A23  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  33.81 
 
 		 187 aa  72.8  0.000000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0105  resolvase, N-terminal:resolvase helix-turn-helix region  32.19 
 
 		 192 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2258  resolvase domain-containing protein  35.17 
 
 		 195 aa  72.4  0.000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.880923  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4228  resolvase family site-specific recombinase  30.34 
 
 		 187 aa  72.4  0.000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.623835  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2362  DNA-invertase  36.19 
 
 		 188 aa  72.4  0.000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0545  hypothetical protein  34.87 
 
 		 186 aa  72  0.000000000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0606652 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4663  resolvase domain-containing protein  33.78 
 
 		 197 aa  72  0.000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.94015  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4091  Resolvase domain  27.45 
 
 		 186 aa  72  0.000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3474  resolvase domain-containing protein  32.39 
 
 		 188 aa  71.6  0.000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6748  resolvase domain-containing protein  31.76 
 
 		 201 aa  71.6  0.000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.167425 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2027  resolvase domain-containing protein  31.65 
 
 		 185 aa  71.6  0.000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6417  resolvase domain-containing protein  29.59 
 
 		 196 aa  70.9  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3992  resolvase domain-containing protein  34.56 
 
 		 195 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.378658  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3847  resolvase-like protein  32.19 
 
 		 191 aa  71.2  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.388128  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0039  resolvase  30.9 
 
 		 181 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0293678  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1424  Resolvase domain protein  32.9 
 
 		 215 aa  70.5  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00141617  n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D08  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  30.91 
 
 		 193 aa  70.5  0.00000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.942713  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>