More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_3847 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_3847  resolvase-like protein  100 
 
 		 191 aa  388  1e-107  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.388128  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2245  resolvase domain-containing protein  47.19 
 
 		 183 aa  161  6e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.0071186  normal  0.011182 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5450  resolvase domain-containing protein  48.88 
 
 		 184 aa  159  3e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3553  resolvase domain-containing protein  50 
 
 		 181 aa  157  6e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.467372  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1615  resolvase family site-specific recombinase  45.65 
 
 		 197 aa  149  2e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5399  resolvase domain-containing protein  41.44 
 
 		 186 aa  141  5e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00909416  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3338  resolvase domain-containing protein  46.41 
 
 		 186 aa  134  9.999999999999999e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4084  resolvase domain-containing protein  42.86 
 
 		 188 aa  132  1.9999999999999998e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.236689  normal  0.0346573 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2144  Resolvase domain protein  41.05 
 
 		 196 aa  130  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0618608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1090  resolvase domain-containing protein  43.79 
 
 		 159 aa  128  5.0000000000000004e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4319  resolvase-like protein  40.68 
 
 		 206 aa  127  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0268  resolvase domain-containing protein  43.65 
 
 		 181 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.268273  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1006  Resolvase domain protein  41.14 
 
 		 189 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2550  Resolvase domain  43.01 
 
 		 196 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.819685  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1562  recombinase  40 
 
 		 188 aa  125  5e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0088  resolvase domain-containing protein  42.55 
 
 		 199 aa  123  1e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.223955  n/a   
 
 
-
 
NC_008264  CPR_B0006  resolvase  40 
 
 		 189 aa  122  4e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00548662  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1807  resolvase domain-containing protein  41.84 
 
 		 201 aa  121  6e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.261116  unclonable  0.00000000603181 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1490  resolvase domain-containing protein  40.67 
 
 		 183 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.832501  hitchhiker  0.00333462 
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D08  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  38.89 
 
 		 193 aa  119  1.9999999999999998e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.942713  n/a   
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5396  resolvase domain-containing protein  36.46 
 
 		 180 aa  118  3.9999999999999996e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.859533  n/a   
 
 
-
 
NC_008263  CPR_A0002  resolvase  38.38 
 
 		 190 aa  118  3.9999999999999996e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141759  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1503  resolvase  43.72 
 
 		 182 aa  118  3.9999999999999996e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.236013  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3124  resolvase domain-containing protein  36.08 
 
 		 194 aa  118  3.9999999999999996e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0904767  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2154  Resolvase domain protein  39.33 
 
 		 185 aa  118  3.9999999999999996e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.478214  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0039  resolvase  36.26 
 
 		 181 aa  118  6e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0293678  n/a   
 
 
-
 
NC_007617  Nmul_D2813  resolvase-like protein  39.13 
 
 		 184 aa  117  7e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.493253  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1403  resolvase domain-containing protein  38.76 
 
 		 185 aa  117  7e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.749996  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1711  integrative genetic element Gsu5, resolvase  38.67 
 
 		 190 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0316952  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0010  resolvase  38.76 
 
 		 185 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0319649  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2147  Resolvase domain protein  43.98 
 
 		 191 aa  115  3e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0747  resolvase domain-containing protein  41.44 
 
 		 181 aa  115  3e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4249  resolvase domain-containing protein  43.98 
 
 		 191 aa  115  3e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.251845 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20410  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  37.37 
 
 		 194 aa  115  3.9999999999999997e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0661103 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1052  Resolvase domain  38.38 
 
 		 186 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4796  resolvase domain-containing protein  49.26 
 
 		 310 aa  115  5e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.271999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0014  resolvase domain-containing protein  34.59 
 
 		 184 aa  114  6e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.125158  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3474  resolvase domain-containing protein  37.64 
 
 		 188 aa  114  6e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0019  ISSod9, DNA-invertase  38.89 
 
 		 185 aa  114  6.9999999999999995e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0170  ISSod9, DNA-invertase  38.89 
 
 		 185 aa  114  6.9999999999999995e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.579928  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4154  resolvase domain-containing protein  38.92 
 
 		 199 aa  114  6.9999999999999995e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2984  putative site-specific recombinases, DNA invertase Pin  38.8 
 
 		 203 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.200056  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0041  resolvase domain-containing protein  37.42 
 
 		 184 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.0000573211 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2172  recombinase  40.21 
 
 		 214 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0678128  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3714  resolvase domain-containing protein  37.08 
 
 		 188 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.566828  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5431  Resolvase domain protein  37.22 
 
 		 185 aa  113  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.318584  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0466  Resolvase domain  40.22 
 
 		 205 aa  112  3e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.418385  normal  0.0169839 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1326  resolvase domain-containing protein  39.56 
 
 		 180 aa  112  3e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4123  resolvase domain-containing protein  37.22 
 
 		 185 aa  112  3e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0694671 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0466  resolvase  36.22 
 
 		 193 aa  112  4.0000000000000004e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.736746  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0409  resolvase domain-containing protein  43.42 
 
 		 186 aa  112  4.0000000000000004e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00000318958  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0204  transposon resolvase  35.08 
 
 		 191 aa  111  5e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000159954 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1132  Resolvase domain  44.93 
 
 		 184 aa  110  9e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3748  resolvase domain-containing protein  47.79 
 
 		 293 aa  110  9e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.57685  normal  0.861996 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3853  resolvase domain-containing protein  47.06 
 
 		 326 aa  110  1.0000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.363521  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0235  resolvase domain-containing protein  36.07 
 
 		 187 aa  110  1.0000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0222  transposon resolvase  35.08 
 
 		 199 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000952158 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2362  DNA-invertase  36.51 
 
 		 188 aa  110  2.0000000000000002e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2757  resolvase domain-containing protein  33.69 
 
 		 188 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2096  resolvase domain-containing protein  37.43 
 
 		 190 aa  109  2.0000000000000002e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0211835 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4105  resolvase domain-containing protein  47.06 
 
 		 293 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.571135  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4383  resolvase  36.72 
 
 		 193 aa  108  3e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3670  resolvase domain-containing protein  40 
 
 		 185 aa  109  3e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4386  resolvase  37.57 
 
 		 219 aa  108  4.0000000000000004e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3914  resolvase domain-containing protein  42.7 
 
 		 293 aa  108  5e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.789856  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2396  resolvase domain-containing protein  47.14 
 
 		 163 aa  108  5e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.718289  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2489  Resolvase domain protein  35.96 
 
 		 184 aa  108  6e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.243262  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4026  resolvase domain-containing protein  46.32 
 
 		 298 aa  107  7.000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.884346  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0216  transposon resolvase  34.25 
 
 		 199 aa  107  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.159168 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4320  hypothetical protein  46.32 
 
 		 293 aa  107  8.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.264253 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2095  Resolvase domain protein  39.69 
 
 		 203 aa  107  9.000000000000001e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5280  resolvase domain-containing protein  48.23 
 
 		 305 aa  107  9.000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5093  resolvase domain-containing protein  39.89 
 
 		 201 aa  107  1e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.993134 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0302  DNA-invertase  35.96 
 
 		 184 aa  107  1e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.623719 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0090  resolvase TnpR  34.81 
 
 		 183 aa  107  1e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.707126  normal  0.345515 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0536  resolvase domain-containing protein  39.34 
 
 		 203 aa  107  1e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.201567  normal  1 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6417  resolvase domain-containing protein  45.19 
 
 		 196 aa  107  1e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_2482  TonB-dependent receptor protein  46.32 
 
 		 294 aa  106  2e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5628  Resolvase domain  39.44 
 
 		 198 aa  106  2e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.526216 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3501  resolvase domain-containing protein  46.32 
 
 		 324 aa  106  2e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.654072  n/a   
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A23  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  39.72 
 
 		 187 aa  106  2e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5459  resolvase domain-containing protein  37.91 
 
 		 190 aa  105  3e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.358499  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5519  Resolvase domain  44.44 
 
 		 197 aa  105  4e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.176111  normal  0.515657 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4189  TonB-dependent receptor protein  45.59 
 
 		 294 aa  105  4e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4685  resolvase domain-containing protein  41.1 
 
 		 193 aa  105  4e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0006  resolvase family site-specific recombinase  33.16 
 
 		 192 aa  104  7e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.105184  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2312  Resolvase domain  33.51 
 
 		 201 aa  104  8e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2582  resolvase domain-containing protein  36.81 
 
 		 185 aa  104  8e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4991  resolvase domain-containing protein  39.13 
 
 		 189 aa  104  9e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01209  bacteriocin production protein  34.38 
 
 		 198 aa  103  1e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000702686  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0718  resolvase domain-containing protein  40.44 
 
 		 197 aa  103  1e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.784479 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3678  Resolvase domain  36.61 
 
 		 190 aa  103  1e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134045  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3862  resolvase domain-containing protein  40.25 
 
 		 194 aa  104  1e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0506724  unclonable  0.00000235811 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3045  Resolvase domain protein  35.39 
 
 		 189 aa  103  2e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.436524  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4885  resolvase domain-containing protein  36.11 
 
 		 187 aa  103  2e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1202  resolvase domain-containing protein  35.68 
 
 		 194 aa  102  2e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3031  DNA-invertase  33.71 
 
 		 197 aa  102  2e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130363 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0149  resolvase  34.04 
 
 		 189 aa  102  3e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1579  transposon Tn3 resolvase  37.02 
 
 		 185 aa  102  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.159821  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2399  resolvase domain-containing protein  37.91 
 
 		 197 aa  102  4e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.211423  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>