More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_4272 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_4272  resolvase-like protein  100 
 
 
149 aa  301  2.0000000000000002e-81  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.299836  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1503  resolvase  41.96 
 
 
182 aa  105  2e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.236013  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4253  resolvase-like protein  39.6 
 
 
201 aa  104  3e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.35703  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4263  resolvase-like protein  39.6 
 
 
201 aa  104  3e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1467  resolvase-like protein  41.1 
 
 
196 aa  99.8  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2258  resolvase domain-containing protein  36.11 
 
 
195 aa  99  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.880923  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0019  Resolvase domain protein  38 
 
 
195 aa  97.8  4e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0536  resolvase domain-containing protein  38.41 
 
 
203 aa  97.4  6e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.201567  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1562  recombinase  42.28 
 
 
188 aa  96.7  1e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4386  resolvase  35.76 
 
 
219 aa  96.7  1e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2312  Resolvase domain  37.76 
 
 
201 aa  95.1  3e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0108  hypothetical protein  45.37 
 
 
309 aa  94.7  3e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4084  resolvase domain-containing protein  42.86 
 
 
188 aa  95.1  3e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.236689  normal  0.0346573 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5190  resolvase domain-containing protein  36.73 
 
 
191 aa  94.7  4e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000411755  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4249  resolvase domain-containing protein  39.72 
 
 
191 aa  94.4  5e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.251845 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2147  Resolvase domain protein  39.72 
 
 
191 aa  94.4  5e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2154  Resolvase domain protein  40.65 
 
 
185 aa  93.6  7e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.478214  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0010  resolvase  39.84 
 
 
185 aa  92  2e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0319649  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1099  resolvase domain-containing protein  37.93 
 
 
212 aa  92.4  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0466  resolvase  34.97 
 
 
193 aa  92  2e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.736746  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1403  resolvase domain-containing protein  37.76 
 
 
185 aa  92.8  2e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.749996  normal 
 
 
-
 
NC_007617  Nmul_D2813  resolvase-like protein  46.59 
 
 
184 aa  91.7  3e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.493253  n/a   
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6307  resolvase domain-containing protein  47.71 
 
 
209 aa  91.3  4e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2757  resolvase domain-containing protein  37.09 
 
 
188 aa  91.7  4e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4123  resolvase domain-containing protein  38.46 
 
 
185 aa  91.3  5e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0694671 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4685  resolvase domain-containing protein  43.56 
 
 
193 aa  90.9  5e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3714  resolvase domain-containing protein  38.21 
 
 
188 aa  90.9  6e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.566828  n/a   
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5457  hypothetical protein  37.06 
 
 
194 aa  90.5  7e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2702  resolvase domain-containing protein  37.91 
 
 
307 aa  90.5  7e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.264305  normal 
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5424  Resolvase domain  37.06 
 
 
194 aa  90.5  7e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2944  resolvase domain-containing protein  37.91 
 
 
307 aa  90.5  7e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.857733  normal 
 
 
-
 
NC_009660  Krad_4707  resolvase domain-containing protein  40.69 
 
 
190 aa  90.5  7e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1852  Resolvase domain  44.14 
 
 
197 aa  90.1  8e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.064893  hitchhiker  0.000000000000388244 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4479  Resolvase domain protein  44.14 
 
 
197 aa  90.1  8e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000000147912 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2984  putative site-specific recombinases, DNA invertase Pin  40 
 
 
203 aa  90.1  8e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.200056  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1477  Resolvase domain  44.14 
 
 
197 aa  90.1  8e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.79192  unclonable  0.0000000000000150315 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4383  resolvase  34.27 
 
 
193 aa  90.1  8e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5339  DNA-invertase  44.14 
 
 
192 aa  90.1  8e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.687343  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0019  ISSod9, DNA-invertase  39.84 
 
 
185 aa  90.1  9e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0170  ISSod9, DNA-invertase  39.84 
 
 
185 aa  90.1  9e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.579928  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1397  invertase/recombinase like protein  41.59 
 
 
176 aa  90.1  9e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.777573 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2489  Resolvase domain protein  36.42 
 
 
184 aa  89.4  1e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.243262  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5431  Resolvase domain protein  39.02 
 
 
185 aa  90.1  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.318584  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2111  Resolvase domain protein  44.14 
 
 
191 aa  89.4  2e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.813305  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3440  invertase/recombinase protein  36.11 
 
 
188 aa  89  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.115695  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3031  DNA-invertase  36.05 
 
 
197 aa  88.6  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00130363 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6748  resolvase domain-containing protein  42.16 
 
 
201 aa  88.2  3e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.167425 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0052  hypothetical protein  40.74 
 
 
201 aa  88.6  3e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2392  Resolvase domain  41.28 
 
 
197 aa  88.2  3e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000064315  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0068  resolvase  32.17 
 
 
181 aa  87.8  4e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0902003  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0854  invertase/recombinase like protein  41.28 
 
 
198 aa  88.2  4e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.160403  normal  0.816153 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0095  resolvase domain-containing protein  36.99 
 
 
189 aa  87.8  4e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.386301 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0202  resolvase  32.87 
 
 
183 aa  87.8  5e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0233  resolvase  32.87 
 
 
183 aa  87.8  5e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2172  recombinase  36.81 
 
 
214 aa  87.4  6e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0678128  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4154  resolvase domain-containing protein  43.14 
 
 
199 aa  87.4  6e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2362  DNA-invertase  40.57 
 
 
188 aa  87  7e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0409  resolvase domain-containing protein  43.14 
 
 
186 aa  87  7e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00000318958  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4835  Resolvase domain protein  43.3 
 
 
201 aa  87  8e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.291279 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5093  resolvase domain-containing protein  37.09 
 
 
201 aa  86.3  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.993134 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3474  resolvase domain-containing protein  37.4 
 
 
188 aa  86.7  1e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2967  DNA-invertase hin  36.36 
 
 
188 aa  85.5  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000835062 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2948  DNA-invertase hin  36.36 
 
 
187 aa  85.5  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  1.3180099999999999e-20 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4128  Resolvase domain protein  39.25 
 
 
231 aa  85.5  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2913  DNA-invertase hin  36.36 
 
 
190 aa  85.5  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.504047  normal  0.0309704 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3045  Resolvase domain protein  43.14 
 
 
189 aa  85.5  2e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.436524  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5459  resolvase domain-containing protein  40.59 
 
 
190 aa  85.9  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.358499  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2550  Resolvase domain  39.34 
 
 
196 aa  85.5  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.819685  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0302  DNA-invertase  35.1 
 
 
184 aa  84.7  4e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.623719 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2144  Resolvase domain protein  36.36 
 
 
196 aa  84.3  5e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0618608  normal 
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4991  resolvase domain-containing protein  37.5 
 
 
189 aa  84  6e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1052  Resolvase domain  40.59 
 
 
186 aa  84.3  6e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6608  resolvase domain-containing protein  36.64 
 
 
189 aa  84  6e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.525053  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1006  Resolvase domain protein  35.17 
 
 
189 aa  83.6  8e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006663  SEA0006  resolvase family site-specific recombinase  34.48 
 
 
192 aa  83.6  9e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.105184  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1104  resolvase domain-containing protein  40.15 
 
 
219 aa  82.8  0.000000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3606  resolvase domain-containing protein  40.15 
 
 
219 aa  82.8  0.000000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  normal  0.996271 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1202  resolvase domain-containing protein  36.3 
 
 
194 aa  83.2  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3497  resolvase domain-containing protein  40.15 
 
 
219 aa  82.8  0.000000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.503079  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3694  resolvase domain-containing protein  37.01 
 
 
206 aa  82.8  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4459  resolvase  35.95 
 
 
190 aa  83.2  0.000000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4290  resolvase  35.95 
 
 
190 aa  83.2  0.000000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4190  resolvase  35.95 
 
 
190 aa  83.2  0.000000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3570  resolvase domain-containing protein  40.15 
 
 
197 aa  83.6  0.000000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6634  resolvase domain-containing protein  37.33 
 
 
198 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000708994  hitchhiker  0.0000367715 
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5037  resolvase domain-containing protein  33.55 
 
 
201 aa  82.4  0.000000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.931406  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0235  resolvase domain-containing protein  40.2 
 
 
187 aa  82.4  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5126  Resolvase domain protein  39.16 
 
 
197 aa  82.8  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.114051 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29040  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  34.46 
 
 
197 aa  82.4  0.000000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.436309  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1711  integrative genetic element Gsu5, resolvase  35.21 
 
 
190 aa  82  0.000000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0316952  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1209  putative resolvase  35.43 
 
 
176 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3007  resolvase-like protein  34.25 
 
 
204 aa  81.6  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0154323 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4042  serine-based site-specific recombinase activity  34.25 
 
 
204 aa  81.6  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.890679  normal  0.169813 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4975  serine-based site-specific recombinase activity  34.25 
 
 
204 aa  81.6  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.283487  normal  0.35895 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0167  resolvase domain-containing protein  34 
 
 
196 aa  82  0.000000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0076  resolvase domain-containing protein  39.09 
 
 
205 aa  81.3  0.000000000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1093  Resolvase domain  41.28 
 
 
196 aa  81.3  0.000000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.531001  normal 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3914  resolvase domain-containing protein  43.52 
 
 
293 aa  80.9  0.000000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.789856  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5280  resolvase domain-containing protein  44.54 
 
 
305 aa  80.5  0.000000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2582  resolvase domain-containing protein  36.17 
 
 
185 aa  80.5  0.000000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>