248 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_5624 on replicon NC_010180
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010180  BcerKBAB4_5624  resolvase domain-containing protein  100 
 
 		 179 aa  368  1e-101  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0167  site-specific recombinase  74.29 
 
 		 214 aa  308  2e-83  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0216  site-specific recombinase  55.39 
 
 		 208 aa  224  6e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  0.613104 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2438  Resolvase domain protein  45.5 
 
 		 206 aa  156  1e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000895592 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1183  resolvase domain-containing protein  40.59 
 
 		 200 aa  143  2e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.132915  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0049  recombinase  35.15 
 
 		 220 aa  123  1e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00880033  n/a   
 
 
-
 
NC_006578  pBT9727_0065  DNA recombinase  33.66 
 
 		 203 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010715  Nther_2949  Resolvase domain  33.5 
 
 		 202 aa  106  2e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.587528  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2322  DNA recombinase  42.2 
 
 		 110 aa  91.3  7e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1445  Resolvase domain  29.59 
 
 		 188 aa  69.7  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1807  resolvase domain-containing protein  25.89 
 
 		 201 aa  69.3  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.261116  unclonable  0.00000000603181 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0053  transposon Tn21 resolvase  35.86 
 
 		 186 aa  68.2  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.509225 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4319  resolvase domain-containing protein  35.86 
 
 		 186 aa  68.2  0.00000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0011  resolvase, putative  31.68 
 
 		 181 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0043  hypothetical protein  30.41 
 
 		 188 aa  67  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0167  resolvase domain-containing protein  29.02 
 
 		 196 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4764  resolvase domain-containing protein  33.78 
 
 		 189 aa  66.6  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3982  resolvase domain-containing protein  29.38 
 
 		 201 aa  66.6  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.364011  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0631  resolvase domain-containing protein  29.38 
 
 		 201 aa  66.6  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0233  resolvase  30.85 
 
 		 183 aa  65.9  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0202  resolvase  30.85 
 
 		 183 aa  65.9  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0068  resolvase  28.49 
 
 		 181 aa  65.1  0.0000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0902003  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0166  Resolvase domain protein  35.17 
 
 		 188 aa  64.7  0.0000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0088  resolvase domain-containing protein  24.37 
 
 		 199 aa  64.7  0.0000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.223955  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3928  resolvase domain-containing protein  33.54 
 
 		 191 aa  64.7  0.0000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.272515  hitchhiker  0.0000753359 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0037  transposon Tn21 resolvase  28.21 
 
 		 205 aa  64.7  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.335597 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4489  Resolvase domain protein  29.38 
 
 		 186 aa  64.7  0.0000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000146883  normal  1 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4352  Resolvase domain protein  29.38 
 
 		 186 aa  64.7  0.0000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00813261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0041  resolvase domain-containing protein  28.86 
 
 		 184 aa  63.9  0.000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.0000573211 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2351  resolvase-like protein  35.42 
 
 		 235 aa  63.9  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.329475 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1490  resolvase domain-containing protein  27.89 
 
 		 183 aa  63.9  0.000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.832501  hitchhiker  0.00333462 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2033  resolvase domain-containing protein  29.9 
 
 		 192 aa  63.5  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.188765  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1811  Resolvase domain protein  34.55 
 
 		 183 aa  63.5  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0297206  hitchhiker  0.00833685 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1579  transposon Tn3 resolvase  28.87 
 
 		 185 aa  62.8  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.159821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6187  resolvase-like protein  29.38 
 
 		 186 aa  63.2  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0984609  hitchhiker  0.0000107923 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0014  resolvase domain-containing protein  28.86 
 
 		 184 aa  63.2  0.000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.125158  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2322  resolvase domain-containing protein  28.35 
 
 		 186 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5396  resolvase domain-containing protein  30.67 
 
 		 180 aa  62.4  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.859533  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2757  resolvase domain-containing protein  32.34 
 
 		 188 aa  62  0.000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1494  resolvase-like protein  32.88 
 
 		 186 aa  62  0.000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.493325 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1125  resolvase domain-containing protein  32.41 
 
 		 184 aa  62.4  0.000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.577602  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0854  invertase/recombinase like protein  27.89 
 
 		 198 aa  61.6  0.000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.160403  normal  0.816153 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0523  resolvase-like protein  26 
 
 		 198 aa  61.2  0.000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3464  resolvase domain-containing protein  27.69 
 
 		 185 aa  61.2  0.000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3829  resolvase domain-containing protein  27.18 
 
 		 185 aa  60.8  0.000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3846  resolvase domain-containing protein  27.18 
 
 		 185 aa  60.8  0.000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.40246  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1914  resolvase domain-containing protein  27.18 
 
 		 185 aa  60.8  0.000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2680  resolvase domain-containing protein  27.18 
 
 		 185 aa  60.8  0.000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1256  resolvase domain-containing protein  27.18 
 
 		 185 aa  60.8  0.000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.249423  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4598  Resolvase domain protein  33.1 
 
 		 188 aa  60.8  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2355  Resolvase domain protein  30.92 
 
 		 186 aa  60.5  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.230305  normal  0.6636 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1206  Resolvase domain protein  31.72 
 
 		 186 aa  60.1  0.00000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4473  serine-based site-specific recombinase activity TnpR  31.72 
 
 		 186 aa  60.8  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0992302  decreased coverage  0.00348712 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4599  serine-based site-specific recombinase activity TnpR  31.72 
 
 		 186 aa  60.8  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000321893  hitchhiker  0.00456228 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1645  resolvase-like protein  27.86 
 
 		 213 aa  60.5  0.00000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.27327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15430  putative resolvase, essential for transposition  31.72 
 
 		 186 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  7.34084e-16  unclonable  6.55355e-22 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0955  Resolvase domain protein  28.65 
 
 		 194 aa  59.7  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0090  resolvase TnpR  31.94 
 
 		 183 aa  59.7  0.00000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.707126  normal  0.345515 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1325  resolvase domain-containing protein  29.29 
 
 		 192 aa  59.3  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4084  resolvase domain-containing protein  26.53 
 
 		 188 aa  58.9  0.00000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.236689  normal  0.0346573 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0149  resolvase  30.87 
 
 		 189 aa  58.5  0.00000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1711  integrative genetic element Gsu5, resolvase  28.37 
 
 		 190 aa  58.2  0.00000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0316952  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3031  DNA-invertase  31.21 
 
 		 197 aa  58.2  0.00000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130363 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3124  resolvase domain-containing protein  31.25 
 
 		 194 aa  58.2  0.00000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0904767  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0545  hypothetical protein  27.51 
 
 		 186 aa  57.8  0.00000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0606652 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2489  Resolvase domain protein  32.19 
 
 		 184 aa  57.4  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.243262  n/a   
 
 
-
 
NC_008263  CPR_A0002  resolvase  30.14 
 
 		 190 aa  57  0.0000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141759  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1503  resolvase  28.12 
 
 		 182 aa  57.4  0.0000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.236013  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0096  resolvase domain-containing protein  29.53 
 
 		 185 aa  56.6  0.0000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08245  resolvase  32.41 
 
 		 179 aa  56.6  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5450  resolvase domain-containing protein  31.76 
 
 		 184 aa  56.2  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0884  Resolvase domain protein  30.43 
 
 		 187 aa  56.6  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000364698  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2362  DNA-invertase  27.13 
 
 		 188 aa  56.2  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2392  Resolvase domain  25.79 
 
 		 197 aa  56.2  0.0000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000064315  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0302  DNA-invertase  31.51 
 
 		 184 aa  56.6  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.623719 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3170  resolvase domain-containing protein  34.25 
 
 		 200 aa  56.2  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00430122 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21550  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  26.06 
 
 		 218 aa  56.2  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.850113  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1132  Resolvase domain  29.53 
 
 		 184 aa  55.5  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2582  resolvase domain-containing protein  26.4 
 
 		 185 aa  55.5  0.0000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0687  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  28.57 
 
 		 200 aa  55.1  0.0000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.731539  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2324  resolvase-like protein  43.55 
 
 		 95 aa  55.1  0.0000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1397  invertase/recombinase like protein  28.75 
 
 		 176 aa  54.7  0.0000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.777573 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2702  resolvase domain-containing protein  25.79 
 
 		 307 aa  55.1  0.0000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.264305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2944  resolvase domain-containing protein  25.79 
 
 		 307 aa  55.1  0.0000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.857733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2312  Resolvase domain  27.92 
 
 		 201 aa  54.7  0.0000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2967  DNA-invertase hin  31.36 
 
 		 188 aa  54.7  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000835062 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2948  DNA-invertase hin  31.36 
 
 		 187 aa  54.3  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.3180099999999999e-20 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0039  resolvase  28.97 
 
 		 181 aa  54.3  0.0000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0293678  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2913  DNA-invertase hin  31.36 
 
 		 190 aa  54.3  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.504047  normal  0.0309704 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2363  resolvase-like protein  25.76 
 
 		 228 aa  54.3  0.0000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.379523  normal  0.343568 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20410  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  25.89 
 
 		 194 aa  53.9  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0661103 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1104  Resolvase domain  31.25 
 
 		 196 aa  53.9  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4668  resolvase domain-containing protein  25.77 
 
 		 189 aa  53.9  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0204  transposon resolvase  28.79 
 
 		 191 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000159954 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3562  resolvase domain-containing protein  30.56 
 
 		 208 aa  53.9  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4775  resolvase domain-containing protein  25.77 
 
 		 189 aa  53.9  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0105  resolvase, N-terminal:resolvase helix-turn-helix region  29.89 
 
 		 192 aa  53.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1052  Resolvase domain  28.5 
 
 		 186 aa  53.5  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0216  transposon resolvase  28.28 
 
 		 199 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.159168 
 
 
-
 
NC_008264  CPR_B0006  resolvase  28.08 
 
 		 189 aa  53.5  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00548662  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>