More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2324 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_2324  resolvase-like protein  100 
 
 		 95 aa  194  4.0000000000000005e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0049  recombinase  57.47 
 
 		 220 aa  102  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00880033  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1183  resolvase domain-containing protein  55.17 
 
 		 200 aa  100  5e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.132915  n/a   
 
 
-
 
NC_006578  pBT9727_0065  DNA recombinase  51.72 
 
 		 203 aa  94.7  4e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0167  site-specific recombinase  43.68 
 
 		 214 aa  83.6  9e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0216  site-specific recombinase  47.62 
 
 		 208 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  0.613104 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2438  Resolvase domain protein  43.9 
 
 		 206 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000895592 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1312  resolvase, N-terminal:resolvase helix-turn-helix region  51.39 
 
 		 187 aa  69.7  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.183881 
 
 
-
 
NC_010715  Nther_2949  Resolvase domain  46.43 
 
 		 202 aa  69.3  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.587528  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3523  resolvase, N-terminal:resolvase helix-turn-helix region  50 
 
 		 184 aa  68.9  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000257012  decreased coverage  0.00040401 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0105  resolvase, N-terminal:resolvase helix-turn-helix region  37.11 
 
 		 192 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4244  resolvase  47.22 
 
 		 203 aa  69.3  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6376  resolvase domain-containing protein  40 
 
 		 206 aa  67.8  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1397  invertase/recombinase like protein  45.57 
 
 		 176 aa  67.4  0.00000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.777573 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1284  transposon Tn2501 resolvase  36.08 
 
 		 191 aa  66.6  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.1264  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0854  invertase/recombinase like protein  45 
 
 		 198 aa  67  0.00000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.160403  normal  0.816153 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0991  resolvase domain-containing protein  42.22 
 
 		 205 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0378771  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1093  Resolvase domain  36.26 
 
 		 196 aa  65.5  0.0000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.531001  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3231  transposon Tn2501 resolvase  36.08 
 
 		 191 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2392  Resolvase domain  36.26 
 
 		 197 aa  65.1  0.0000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000064315  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0884  Resolvase domain protein  41.86 
 
 		 187 aa  65.1  0.0000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000364698  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1762  resolvase-like protein  35.05 
 
 		 192 aa  65.1  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2427  resolvase domain-containing protein  36.08 
 
 		 193 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0929457  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2374  resolvase domain-containing protein  35.05 
 
 		 192 aa  65.1  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2494  resolvase domain-containing protein  35.05 
 
 		 191 aa  63.5  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0011  resolvase, putative  37.97 
 
 		 181 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013518  Sterm_4140  Resolvase domain protein  39.77 
 
 		 217 aa  63.2  0.000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00204948  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1125  resolvase domain-containing protein  44.29 
 
 		 184 aa  63.2  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.577602  n/a   
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4489  Resolvase domain protein  44.29 
 
 		 186 aa  62.4  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000146883  normal  1 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4352  Resolvase domain protein  44.29 
 
 		 186 aa  62.4  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00813261  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2003  transposon Tn2501 resolvase  34.02 
 
 		 222 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00181715  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2351  resolvase-like protein  42.86 
 
 		 235 aa  62.4  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.329475 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0053  transposon Tn21 resolvase  45.71 
 
 		 186 aa  62.4  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.509225 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4319  resolvase domain-containing protein  45.71 
 
 		 186 aa  62.4  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43160  Resolvase-like protein  35.42 
 
 		 189 aa  62  0.000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3662  Resolvase domain protein  38.75 
 
 		 188 aa  62  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0438  putative resolvase  39.18 
 
 		 318 aa  61.6  0.000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4764  resolvase domain-containing protein  42.86 
 
 		 189 aa  61.2  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0096  resolvase domain-containing protein  37.97 
 
 		 185 aa  60.8  0.000000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2033  resolvase domain-containing protein  41.43 
 
 		 192 aa  60.8  0.000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.188765  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0166  Resolvase domain protein  45.71 
 
 		 188 aa  60.5  0.000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6187  resolvase-like protein  41.43 
 
 		 186 aa  60.5  0.000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0984609  hitchhiker  0.0000107923 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4598  Resolvase domain protein  45.71 
 
 		 188 aa  60.1  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3928  resolvase domain-containing protein  44.44 
 
 		 191 aa  60.1  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.272515  hitchhiker  0.0000753359 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0631  resolvase domain-containing protein  41.43 
 
 		 201 aa  60.1  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3982  resolvase domain-containing protein  41.43 
 
 		 201 aa  60.1  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.364011  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2322  resolvase domain-containing protein  42.86 
 
 		 186 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1256  resolvase domain-containing protein  42.86 
 
 		 185 aa  59.3  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.249423  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2680  resolvase domain-containing protein  42.86 
 
 		 185 aa  59.3  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0021  resolvase-like protein  45.71 
 
 		 189 aa  59.3  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04260  hypothetical protein  43.01 
 
 		 197 aa  58.9  0.00000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0233  resolvase  31.87 
 
 		 183 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4473  serine-based site-specific recombinase activity TnpR  42.86 
 
 		 186 aa  59.3  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0992302  decreased coverage  0.00348712 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4599  serine-based site-specific recombinase activity TnpR  42.86 
 
 		 186 aa  59.3  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000321893  hitchhiker  0.00456228 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3464  resolvase domain-containing protein  42.86 
 
 		 185 aa  59.3  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15430  putative resolvase, essential for transposition  42.86 
 
 		 186 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  7.34084e-16  unclonable  6.55355e-22 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0202  resolvase  31.87 
 
 		 183 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3829  resolvase domain-containing protein  42.86 
 
 		 185 aa  59.3  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3846  resolvase domain-containing protein  42.86 
 
 		 185 aa  59.3  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.40246  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1914  resolvase domain-containing protein  42.86 
 
 		 185 aa  59.3  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2132  resolvase domain-containing protein  32.99 
 
 		 198 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0356691 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4379  resolvase-like protein  30.93 
 
 		 197 aa  58.5  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.907706  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4555  resolvase-like protein  30.93 
 
 		 197 aa  58.5  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.849085  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003898  resolvase putative  36.46 
 
 		 202 aa  58.5  0.00000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1206  Resolvase domain protein  42.86 
 
 		 186 aa  58.5  0.00000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4419  resolvase domain-containing protein  34.02 
 
 		 196 aa  58.2  0.00000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00736052  normal  0.464308 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3440  invertase/recombinase protein  41.57 
 
 		 188 aa  58.2  0.00000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.115695  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2084  resolvase domain-containing protein  34.02 
 
 		 196 aa  58.2  0.00000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2173  resolvase domain-containing protein  34.02 
 
 		 196 aa  58.2  0.00000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1325  resolvase domain-containing protein  42.47 
 
 		 192 aa  58.2  0.00000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0037  transposon Tn21 resolvase  40 
 
 		 205 aa  58.2  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.335597 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4668  resolvase domain-containing protein  35.96 
 
 		 189 aa  57.8  0.00000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0014  resolvase domain-containing protein  38.16 
 
 		 184 aa  57.8  0.00000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.125158  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4775  resolvase domain-containing protein  35.96 
 
 		 189 aa  57.8  0.00000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2362  DNA-invertase  35.56 
 
 		 188 aa  57.4  0.00000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2170  DNA invertase  41.46 
 
 		 281 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0593579  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1803  resolvase domain-containing protein  35.05 
 
 		 193 aa  57  0.00000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4663  resolvase domain-containing protein  31.96 
 
 		 197 aa  57  0.00000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.94015  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00855  hypothetical protein  42.86 
 
 		 93 aa  57  0.00000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00849  putative DNA-invertase  42.86 
 
 		 91 aa  57  0.00000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D15  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  37.78 
 
 		 184 aa  57  0.00000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0043  hypothetical protein  34.07 
 
 		 188 aa  56.6  0.0000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0068  resolvase  37.66 
 
 		 181 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0902003  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2258  resolvase domain-containing protein  35.56 
 
 		 195 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.880923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1494  resolvase-like protein  41.43 
 
 		 186 aa  57  0.0000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.493325 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2757  resolvase domain-containing protein  40.91 
 
 		 188 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3660  resolvase domain-containing protein  38.2 
 
 		 202 aa  56.2  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4835  Resolvase domain protein  40 
 
 		 201 aa  56.6  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.291279 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6610  resolvase domain-containing protein  48.05 
 
 		 192 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.874577  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2489  Resolvase domain protein  37.5 
 
 		 184 aa  55.5  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.243262  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3862  resolvase domain-containing protein  37.78 
 
 		 194 aa  56.2  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0506724  unclonable  0.00000235811 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1579  transposon Tn3 resolvase  35.44 
 
 		 185 aa  55.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.159821  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3170  resolvase domain-containing protein  34.09 
 
 		 200 aa  55.5  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00430122 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0041  resolvase domain-containing protein  38.16 
 
 		 184 aa  55.8  0.0000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.0000573211 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1807  resolvase domain-containing protein  33.71 
 
 		 201 aa  55.8  0.0000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.261116  unclonable  0.00000000603181 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21550  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  40.91 
 
 		 218 aa  55.5  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.850113  normal  1 
 
 
-
 
NC_008264  CPR_B0006  resolvase  40 
 
 		 189 aa  55.8  0.0000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00548662  n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D08  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  31.82 
 
 		 193 aa  56.2  0.0000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.942713  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4383  resolvase  44 
 
 		 193 aa  55.5  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3031  DNA-invertase  37.5 
 
 		 197 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130363 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>