More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene pBT9727_0065 on replicon NC_006578
Organism: Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006578  pBT9727_0065  DNA recombinase  100 
 
 
203 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0049  recombinase  71 
 
 
220 aa  298  4e-80  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00880033  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1183  resolvase domain-containing protein  61.81 
 
 
200 aa  254  4e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.132915  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0216  site-specific recombinase  48.04 
 
 
208 aa  175  5e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal  0.613104 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2438  Resolvase domain protein  44.1 
 
 
206 aa  167  1e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000895592 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0167  site-specific recombinase  43.69 
 
 
214 aa  166  2e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010715  Nther_2949  Resolvase domain  36.18 
 
 
202 aa  137  1e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.587528  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5624  resolvase domain-containing protein  33.66 
 
 
179 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2322  DNA recombinase  53.4 
 
 
110 aa  108  6e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2324  resolvase-like protein  51.72 
 
 
95 aa  94.7  8e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1445  Resolvase domain  34.15 
 
 
188 aa  93.2  2e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3928  resolvase domain-containing protein  35.23 
 
 
191 aa  91.3  8e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.272515  hitchhiker  0.0000753359 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1125  resolvase domain-containing protein  33.68 
 
 
184 aa  89.4  3e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.577602  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1494  resolvase-like protein  36.05 
 
 
186 aa  88.6  6e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.493325 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4352  Resolvase domain protein  34.32 
 
 
186 aa  87.8  1e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00813261  normal 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4598  Resolvase domain protein  36.53 
 
 
188 aa  87  1e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4489  Resolvase domain protein  34.32 
 
 
186 aa  87.8  1e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000146883  normal 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6187  resolvase-like protein  35.54 
 
 
186 aa  87  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0984609  hitchhiker  0.0000107923 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3982  resolvase domain-containing protein  32.81 
 
 
201 aa  86.7  2e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.364011  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0631  resolvase domain-containing protein  32.81 
 
 
201 aa  86.7  2e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1206  Resolvase domain protein  35.19 
 
 
186 aa  86.3  3e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2322  resolvase domain-containing protein  32.82 
 
 
186 aa  86.3  3e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2033  resolvase domain-containing protein  33.97 
 
 
192 aa  85.5  5e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.188765  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1256  resolvase domain-containing protein  34.29 
 
 
185 aa  85.5  5e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.249423  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0687  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  37.75 
 
 
200 aa  85.1  6e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.731539  n/a   
 
 
-
 
NC_013518  Sterm_4140  Resolvase domain protein  33.96 
 
 
217 aa  85.1  7e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00204948  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3829  resolvase domain-containing protein  34.29 
 
 
185 aa  84.7  9e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3846  resolvase domain-containing protein  34.29 
 
 
185 aa  84.7  9e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.40246  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1914  resolvase domain-containing protein  34.29 
 
 
185 aa  84.7  9e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2680  resolvase domain-containing protein  34.29 
 
 
185 aa  84.7  9e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0166  Resolvase domain protein  34.34 
 
 
188 aa  84  0.000000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0053  transposon Tn21 resolvase  36.59 
 
 
186 aa  83.6  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.509225 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2351  resolvase-like protein  34.18 
 
 
235 aa  83.2  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.329475 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4473  serine-based site-specific recombinase activity TnpR  34.57 
 
 
186 aa  83.2  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0992302  decreased coverage  0.00348712 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4599  serine-based site-specific recombinase activity TnpR  34.57 
 
 
186 aa  83.2  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000321893  hitchhiker  0.00456228 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15430  putative resolvase, essential for transposition  34.57 
 
 
186 aa  83.2  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  7.34084e-16  unclonable  6.55355e-22 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4319  resolvase domain-containing protein  36.59 
 
 
186 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0037  transposon Tn21 resolvase  32.94 
 
 
205 aa  82.4  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.335597 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3464  resolvase domain-containing protein  34.42 
 
 
185 aa  82.4  0.000000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0014  resolvase domain-containing protein  32.8 
 
 
184 aa  81.3  0.000000000000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.125158  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0216  transposon resolvase  31.47 
 
 
199 aa  80.9  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.159168 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0043  hypothetical protein  37.97 
 
 
188 aa  80.1  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0204  transposon resolvase  31.68 
 
 
191 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000159954 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3523  resolvase, N-terminal:resolvase helix-turn-helix region  38.73 
 
 
184 aa  79.3  0.00000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000257012  decreased coverage  0.00040401 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4764  resolvase domain-containing protein  32.52 
 
 
189 aa  78.6  0.00000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0011  resolvase, putative  35.76 
 
 
181 aa  78.6  0.00000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1807  resolvase domain-containing protein  28.5 
 
 
201 aa  77.8  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.261116  unclonable  0.00000000603181 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1312  resolvase, N-terminal:resolvase helix-turn-helix region  38.24 
 
 
187 aa  77.8  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.183881 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2803  putative resolvase  35.44 
 
 
188 aa  76.6  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.545302  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0884  Resolvase domain protein  31.06 
 
 
187 aa  77  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000364698  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0088  resolvase domain-containing protein  28.5 
 
 
199 aa  76.3  0.0000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.223955  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0041  resolvase domain-containing protein  31.09 
 
 
184 aa  75.9  0.0000000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  decreased coverage  0.0000573211 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1735  putative resolvase  34.81 
 
 
188 aa  75.9  0.0000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0222  transposon resolvase  31.19 
 
 
199 aa  75.5  0.0000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000952158 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3135  resolvase TnpR  34.73 
 
 
217 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2154  Resolvase domain protein  34.36 
 
 
185 aa  73.9  0.000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.478214  n/a   
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5037  resolvase domain-containing protein  28.12 
 
 
201 aa  74.3  0.000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.931406  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4154  resolvase domain-containing protein  32.43 
 
 
199 aa  74.3  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0409  resolvase domain-containing protein  31.58 
 
 
186 aa  73.9  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00000318958  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3170  resolvase domain-containing protein  31.65 
 
 
200 aa  73.6  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00430122 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1403  resolvase domain-containing protein  35.76 
 
 
185 aa  73.6  0.000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.749996  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0167  resolvase domain-containing protein  31.61 
 
 
196 aa  72.8  0.000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4084  resolvase domain-containing protein  29.53 
 
 
188 aa  72.4  0.000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.236689  normal  0.0346573 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0090  resolvase TnpR  29.38 
 
 
183 aa  72  0.000000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.707126  normal  0.345515 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1052  Resolvase domain  29.63 
 
 
186 aa  72  0.000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0235  resolvase domain-containing protein  31.22 
 
 
187 aa  71.6  0.000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4685  resolvase domain-containing protein  29.23 
 
 
193 aa  71.6  0.000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6417  resolvase domain-containing protein  35.4 
 
 
196 aa  70.9  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25710  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  25.37 
 
 
201 aa  70.9  0.00000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2489  Resolvase domain protein  31.95 
 
 
184 aa  70.5  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.243262  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0545  hypothetical protein  27.64 
 
 
186 aa  70.1  0.00000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0606652 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21550  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  29.26 
 
 
218 aa  70.1  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.850113  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0302  DNA-invertase  31.95 
 
 
184 aa  69.7  0.00000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.623719 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1645  resolvase-like protein  29.85 
 
 
213 aa  69.3  0.00000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.27327  normal 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0010  resolvase  33.74 
 
 
185 aa  68.9  0.00000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0319649  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4137  resolvase domain-containing protein  33.33 
 
 
224 aa  68.6  0.00000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.130251  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4228  resolvase family site-specific recombinase  35.53 
 
 
187 aa  68.2  0.00000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.623835  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5519  Resolvase domain  33.33 
 
 
197 aa  68.2  0.00000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.176111  normal  0.515657 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1503  resolvase  30.41 
 
 
182 aa  68.2  0.00000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.236013  normal 
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5396  resolvase domain-containing protein  28.72 
 
 
180 aa  68.2  0.00000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.859533  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0052  hypothetical protein  31.94 
 
 
201 aa  67.4  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D08  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  33.99 
 
 
193 aa  67.8  0.0000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.942713  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0233  resolvase  26.06 
 
 
183 aa  67  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2362  DNA-invertase  25.13 
 
 
188 aa  67  0.0000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08245  resolvase  30.22 
 
 
179 aa  66.6  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0955  Resolvase domain protein  27.55 
 
 
194 aa  67  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2264  resolvase-like protein  33.59 
 
 
183 aa  67  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0723164  hitchhiker  0.00531394 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0202  resolvase  26.06 
 
 
183 aa  67  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0096  resolvase domain-containing protein  27.32 
 
 
185 aa  66.6  0.0000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1490  resolvase domain-containing protein  27.89 
 
 
183 aa  66.2  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.832501  hitchhiker  0.00333462 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1104  Resolvase domain  30.87 
 
 
196 aa  66.2  0.0000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0105  resolvase, N-terminal:resolvase helix-turn-helix region  30.22 
 
 
192 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4459  resolvase  33.14 
 
 
190 aa  65.9  0.0000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4290  resolvase  33.14 
 
 
190 aa  65.9  0.0000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4190  resolvase  33.14 
 
 
190 aa  65.9  0.0000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43160  Resolvase-like protein  32.53 
 
 
189 aa  65.9  0.0000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004307  resolvase N-terminal domain protein  31.82 
 
 
190 aa  65.9  0.0000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.179008  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3662  Resolvase domain protein  28.72 
 
 
188 aa  65.5  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2582  resolvase domain-containing protein  32.91 
 
 
185 aa  65.5  0.0000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6376  resolvase domain-containing protein  29.59 
 
 
206 aa  65.5  0.0000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>