More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_001518 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013457  VEA_001518  resolvase  100 
 
 		 204 aa  419  1e-116  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000153211  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1801  resolvase domain-containing protein  62.42 
 
 		 228 aa  212  2.9999999999999995e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.118365 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2180  resolvase domain-containing protein  54.55 
 
 		 212 aa  202  3e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.52939  n/a   
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4386  resolvase domain-containing protein  55.05 
 
 		 209 aa  202  3e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4460  Resolvase domain protein  54.55 
 
 		 209 aa  200  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4455  resolvase domain-containing protein  54.04 
 
 		 203 aa  200  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4562  resolvase domain-containing protein  54.55 
 
 		 209 aa  200  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.338072  normal  1 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4355  Resolvase domain protein  54.55 
 
 		 200 aa  200  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0298  resolvase, putative  48.85 
 
 		 205 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4408  resolvase domain-containing protein  43.65 
 
 		 202 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000545957  normal  0.0701498 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4666  resolvase domain-containing protein  43.65 
 
 		 202 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000148612  normal  0.936039 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4343  Resolvase domain protein  43.65 
 
 		 202 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000112202  normal  1 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0021  resolvase, putative  50 
 
 		 221 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00853796  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0024  resolvase, putative  49.42 
 
 		 206 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000663819  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4533  resolvase domain-containing protein  41.9 
 
 		 214 aa  161  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_03  resolvase  44.79 
 
 		 209 aa  160  9e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0123  putative resolvase  41.5 
 
 		 206 aa  159  2e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  6.922970000000001e-26 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01413  resolvase, putative  43.15 
 
 		 207 aa  157  8e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0873  Resolvase domain protein  43.94 
 
 		 206 aa  157  1e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4266  resolvase domain-containing protein  40.69 
 
 		 231 aa  157  1e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000000000120246  unclonable  5.20349e-19 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4161  Resolvase domain  45.08 
 
 		 206 aa  156  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0054  resolvase domain-containing protein  42.93 
 
 		 213 aa  156  3e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_44  putative resolvase  42.86 
 
 		 211 aa  155  3e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0377389  n/a   
 
 
-
 
NC_009516  PsycPRwf_2397  resolvase domain-containing protein  44.32 
 
 		 210 aa  155  4e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4402  resolvase domain-containing protein  42.86 
 
 		 213 aa  155  5.0000000000000005e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3590  resolvase domain protein  44.44 
 
 		 208 aa  152  4e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000308956 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1306  resolvase domain-containing protein  45.77 
 
 		 205 aa  149  3e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.92579  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4246  Resolvase domain protein  46.15 
 
 		 205 aa  149  4e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3278  resolvase domain-containing protein  45.77 
 
 		 208 aa  148  4e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.312644  n/a   
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0078  TnpR  42.64 
 
 		 220 aa  146  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.569126 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0571  resolvase domain-containing protein  46.58 
 
 		 210 aa  146  2.0000000000000003e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2559  resolvase-like protein  41.12 
 
 		 222 aa  145  5e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.22678 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0077  resolvase family site-specific recombinase  40.44 
 
 		 211 aa  138  6e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.349046  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0950  resolvase domain-containing protein  39.8 
 
 		 207 aa  134  7.000000000000001e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6887  resolvase domain-containing protein  42.42 
 
 		 210 aa  131  7.999999999999999e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3979  resolvase domain-containing protein  46.91 
 
 		 208 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2477  resolvase-like protein  38.61 
 
 		 198 aa  123  2e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.131622  normal  0.782919 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0719  resolvase domain-containing protein  37.13 
 
 		 197 aa  114  8.999999999999998e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000179161 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3355  resolvase domain-containing protein  35.32 
 
 		 301 aa  112  5e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0978291  normal  0.274195 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0094  resolvase  38.95 
 
 		 245 aa  108  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.86084  normal  1 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6519  resolvase  35.11 
 
 		 283 aa  108  6e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0037  resolvase  38.37 
 
 		 245 aa  106  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.489197  normal  0.472165 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1355  resolvase-like protein  36.92 
 
 		 190 aa  103  2e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.141663 
 
 
-
 
NC_008263  CPR_A0002  resolvase  30.24 
 
 		 190 aa  85.5  5e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141759  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0466  Resolvase domain  31.31 
 
 		 205 aa  79  0.00000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.418385  normal  0.0169839 
 
 
-
 
NC_010715  Nther_2949  Resolvase domain  26.9 
 
 		 202 aa  78.6  0.00000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.587528  n/a   
 
 
-
 
NC_008264  CPR_B0006  resolvase  29.7 
 
 		 189 aa  78.2  0.00000000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00548662  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0222  transposon resolvase  27.72 
 
 		 199 aa  76.3  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000952158 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3124  resolvase domain-containing protein  28.3 
 
 		 194 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0904767  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0204  transposon resolvase  26.6 
 
 		 191 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000159954 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3670  resolvase domain-containing protein  31.25 
 
 		 185 aa  72.8  0.000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0216  transposon resolvase  25.5 
 
 		 199 aa  71.6  0.000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.159168 
 
 
-
 
NC_013518  Sterm_4140  Resolvase domain protein  28.16 
 
 		 217 aa  71.6  0.000000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00204948  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20410  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  28.5 
 
 		 194 aa  71.6  0.000000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0661103 
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2479  hypothetical protein  41.51 
 
 		 138 aa  71.2  0.00000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.802993 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0026  resolvase family site-specific recombinase  44.9 
 
 		 102 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  decreased coverage  0.000122476  n/a   
 
 
-
 
NC_010504  Mrad2831_6517  resolvase domain-containing protein  29.21 
 
 		 185 aa  70.5  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1711  integrative genetic element Gsu5, resolvase  26.9 
 
 		 190 aa  69.3  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0316952  n/a   
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a031  site-specific recombinase/resolvase  30.19 
 
 		 211 aa  69.3  0.00000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0141681  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1326  resolvase domain-containing protein  27.67 
 
 		 180 aa  68.6  0.00000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1006  Resolvase domain protein  29.45 
 
 		 189 aa  68.6  0.00000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4091  Resolvase domain  26.87 
 
 		 186 aa  68.6  0.00000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0260  resolvase family site-specific recombinase  28.29 
 
 		 205 aa  68.6  0.00000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1082  resolvase family site-specific recombinase  28.29 
 
 		 205 aa  68.6  0.00000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.271311  n/a   
 
 
-
 
NC_010373  M446_7006  hypothetical protein  30.49 
 
 		 183 aa  68.6  0.00000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2173  resolvase domain-containing protein  30.69 
 
 		 196 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2084  resolvase domain-containing protein  30.69 
 
 		 196 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0086  resolvase family site-specific recombinase  29.34 
 
 		 196 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.464664  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0088  resolvase domain-containing protein  27.94 
 
 		 199 aa  67.8  0.0000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.223955  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3477  resolvase domain-containing protein  29.34 
 
 		 196 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4419  resolvase domain-containing protein  30.69 
 
 		 196 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00736052  normal  0.464308 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1807  resolvase domain-containing protein  27.86 
 
 		 201 aa  67.4  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.261116  unclonable  0.00000000603181 
 
 
-
 
NC_010374  M446_7059  hypothetical protein  28.57 
 
 		 183 aa  66.6  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2019  resolvase family site-specific recombinase  46.99 
 
 		 91 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3652  resolvase, N-terminal  30.3 
 
 		 192 aa  66.6  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000770175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6187  resolvase-like protein  25.63 
 
 		 186 aa  67.4  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0984609  hitchhiker  0.0000107923 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1490  resolvase domain-containing protein  28.08 
 
 		 183 aa  67.4  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.832501  hitchhiker  0.00333462 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3112  Resolvase domain protein  30.69 
 
 		 184 aa  66.2  0.0000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3007  resolvase-like protein  27.32 
 
 		 204 aa  66.2  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0154323 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4042  serine-based site-specific recombinase activity  27.32 
 
 		 204 aa  66.2  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.890679  normal  0.169813 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4975  serine-based site-specific recombinase activity  27.32 
 
 		 204 aa  66.2  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.283487  normal  0.35895 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4560  resolvase domain-containing protein  28.74 
 
 		 192 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0068  resolvase  23.38 
 
 		 181 aa  65.9  0.0000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0902003  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1992  resolvase domain-containing protein  28.74 
 
 		 206 aa  65.9  0.0000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0189  resolvase domain-containing protein  28.74 
 
 		 206 aa  65.9  0.0000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1594  resolvase domain-containing protein  29.15 
 
 		 189 aa  65.9  0.0000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.94865  normal  0.455677 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0202  resolvase  25.87 
 
 		 183 aa  65.1  0.0000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0233  resolvase  25.87 
 
 		 183 aa  65.1  0.0000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2095  Resolvase domain protein  29.41 
 
 		 203 aa  65.1  0.0000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1494  resolvase-like protein  24.87 
 
 		 186 aa  64.7  0.0000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.493325 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0014  resolvase domain-containing protein  26.92 
 
 		 184 aa  64.7  0.0000000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.125158  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2027  resolvase domain-containing protein  29.06 
 
 		 185 aa  64.3  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0816  resolvase domain-containing protein  30.14 
 
 		 185 aa  64.7  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4473  serine-based site-specific recombinase activity TnpR  24.37 
 
 		 186 aa  64.3  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0992302  decreased coverage  0.00348712 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4599  serine-based site-specific recombinase activity TnpR  24.37 
 
 		 186 aa  64.3  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000321893  hitchhiker  0.00456228 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1762  resolvase-like protein  31.31 
 
 		 192 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15430  putative resolvase, essential for transposition  24.37 
 
 		 186 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  7.34084e-16  unclonable  6.55355e-22 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3928  resolvase domain-containing protein  25.24 
 
 		 191 aa  63.9  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.272515  hitchhiker  0.0000753359 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2374  resolvase domain-containing protein  31.31 
 
 		 192 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6388  resolvase domain-containing protein  24.88 
 
 		 191 aa  63.9  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>