More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_4386 on replicon NC_009661
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009661  Shew185_4386  resolvase domain-containing protein  100 
 
 		 209 aa  431  1e-120  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4562  resolvase domain-containing protein  99.04 
 
 		 209 aa  427  1e-119  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.338072  normal  1 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4460  Resolvase domain protein  96.17 
 
 		 209 aa  420  1e-117  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4355  Resolvase domain protein  98.5 
 
 		 200 aa  408  1e-113  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2180  resolvase domain-containing protein  96.52 
 
 		 212 aa  400  1e-111  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.52939  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4455  resolvase domain-containing protein  94.55 
 
 		 203 aa  402  1e-111  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0026  resolvase family site-specific recombinase  97.06 
 
 		 102 aa  206  2e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  decreased coverage  0.000122476  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001518  resolvase  55.05 
 
 		 204 aa  202  3e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000153211  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1801  resolvase domain-containing protein  51.71 
 
 		 228 aa  192  3e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.118365 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0571  resolvase domain-containing protein  50.25 
 
 		 210 aa  189  2e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4533  resolvase domain-containing protein  46.86 
 
 		 214 aa  186  2e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4161  Resolvase domain  45.96 
 
 		 206 aa  184  6e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0078  TnpR  47.98 
 
 		 220 aa  183  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.569126 
 
 
-
 
NC_009516  PsycPRwf_2397  resolvase domain-containing protein  46.77 
 
 		 210 aa  182  3e-45  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4666  resolvase domain-containing protein  46.23 
 
 		 202 aa  178  4.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000148612  normal  0.936039 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4408  resolvase domain-containing protein  46.23 
 
 		 202 aa  178  4.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000545957  normal  0.0701498 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4343  Resolvase domain protein  46.23 
 
 		 202 aa  178  4.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000112202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1306  resolvase domain-containing protein  48.22 
 
 		 205 aa  175  3e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.92579  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4246  Resolvase domain protein  47.76 
 
 		 205 aa  175  5e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0298  resolvase, putative  47.45 
 
 		 205 aa  174  6e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2019  resolvase family site-specific recombinase  96.51 
 
 		 91 aa  172  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3278  resolvase domain-containing protein  47.21 
 
 		 208 aa  173  1.9999999999999998e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.312644  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6887  resolvase domain-containing protein  48 
 
 		 210 aa  171  5.999999999999999e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0021  resolvase, putative  47.47 
 
 		 221 aa  166  2e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00853796  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0024  resolvase, putative  46.97 
 
 		 206 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000663819  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3979  resolvase domain-containing protein  48.76 
 
 		 208 aa  164  5.9999999999999996e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0950  resolvase domain-containing protein  46.86 
 
 		 207 aa  163  2.0000000000000002e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2559  resolvase-like protein  43.87 
 
 		 222 aa  160  1e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.22678 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4402  resolvase domain-containing protein  45.71 
 
 		 213 aa  158  6e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_03  resolvase  44.77 
 
 		 209 aa  155  5.0000000000000005e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_44  putative resolvase  44.19 
 
 		 211 aa  153  2e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0377389  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3590  resolvase domain protein  43.3 
 
 		 208 aa  151  7e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000308956 
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0054  resolvase domain-containing protein  44.57 
 
 		 213 aa  151  8.999999999999999e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0077  resolvase family site-specific recombinase  43.07 
 
 		 211 aa  150  1e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.349046  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0123  putative resolvase  42.03 
 
 		 206 aa  149  4e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  6.922970000000001e-26 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01413  resolvase, putative  40.3 
 
 		 207 aa  148  5e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0873  Resolvase domain protein  41.54 
 
 		 206 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4266  resolvase domain-containing protein  38.94 
 
 		 231 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000000000120246  unclonable  5.20349e-19 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3355  resolvase domain-containing protein  36.55 
 
 		 301 aa  122  3e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0978291  normal  0.274195 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6519  resolvase  38.14 
 
 		 283 aa  121  7e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0719  resolvase domain-containing protein  40.34 
 
 		 197 aa  115  3.9999999999999997e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000179161 
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2477  resolvase-like protein  40.12 
 
 		 198 aa  114  1.0000000000000001e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.131622  normal  0.782919 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0037  resolvase  35.53 
 
 		 245 aa  113  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.489197  normal  0.472165 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0094  resolvase  35.53 
 
 		 245 aa  113  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.86084  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1355  resolvase-like protein  39.76 
 
 		 190 aa  105  4e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.141663 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0246  resolvase domain-containing protein  30.89 
 
 		 179 aa  75.5  0.0000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.315323  normal  1 
 
 
-
 
NC_010715  Nther_2949  Resolvase domain  28.16 
 
 		 202 aa  70.5  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.587528  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3678  Resolvase domain  27.45 
 
 		 190 aa  64.7  0.0000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134045  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0019  Resolvase domain protein  28.95 
 
 		 195 aa  63.9  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08245  resolvase  26.7 
 
 		 179 aa  64.3  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01209  bacteriocin production protein  28.65 
 
 		 198 aa  63.2  0.000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000702686  n/a   
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2479  hypothetical protein  32.21 
 
 		 138 aa  62.4  0.000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.802993 
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_42  putative resolvase  28.5 
 
 		 181 aa  62  0.000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0684051  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4084  resolvase domain-containing protein  28.35 
 
 		 188 aa  61.6  0.000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.236689  normal  0.0346573 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5450  resolvase domain-containing protein  27.86 
 
 		 184 aa  61.2  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0260  resolvase family site-specific recombinase  29.9 
 
 		 205 aa  60.5  0.00000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1082  resolvase family site-specific recombinase  29.9 
 
 		 205 aa  60.5  0.00000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.271311  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1445  Resolvase domain  27.55 
 
 		 188 aa  60.1  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006578  pBT9727_0065  DNA recombinase  26.88 
 
 		 203 aa  59.3  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1326  resolvase domain-containing protein  25.77 
 
 		 180 aa  59.3  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1183  resolvase domain-containing protein  28.93 
 
 		 200 aa  58.9  0.00000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.132915  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1006  Resolvase domain protein  26.5 
 
 		 189 aa  58.9  0.00000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0466  Resolvase domain  27.67 
 
 		 205 aa  58.5  0.00000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.418385  normal  0.0169839 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0049  recombinase  24.86 
 
 		 220 aa  58.2  0.00000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00880033  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0172  resolvase family site-specific recombinase  27.88 
 
 		 208 aa  57.8  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1284  transposon Tn2501 resolvase  30.15 
 
 		 191 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.1264  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6810  Resolvase domain protein  27.27 
 
 		 185 aa  57  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.67902  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3410  Resolvase domain protein  28.08 
 
 		 206 aa  57  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.260918 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0011  resolvase, putative  28.06 
 
 		 181 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0816  resolvase domain-containing protein  26.77 
 
 		 185 aa  56.2  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3847  resolvase-like protein  27.18 
 
 		 191 aa  56.2  0.0000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.388128  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2355  Resolvase domain protein  29.09 
 
 		 186 aa  55.8  0.0000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.230305  normal  0.6636 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6405  resolvase domain-containing protein  27.27 
 
 		 185 aa  55.8  0.0000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6187  resolvase-like protein  28.21 
 
 		 186 aa  55.8  0.0000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0984609  hitchhiker  0.0000107923 
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0011  RlgA  26.4 
 
 		 186 aa  55.5  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.928686  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1494  resolvase-like protein  28.21 
 
 		 186 aa  55.1  0.0000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.493325 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0086  resolvase family site-specific recombinase  26.74 
 
 		 196 aa  54.7  0.0000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.464664  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2362  DNA-invertase  27.86 
 
 		 188 aa  55.1  0.0000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1325  resolvase domain-containing protein  27.27 
 
 		 192 aa  54.7  0.0000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2509  putative res  61.54 
 
 		 41 aa  54.7  0.000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.963906 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0222  transposon resolvase  24.62 
 
 		 199 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000952158 
 
 
-
 
NC_010374  M446_7059  hypothetical protein  27.37 
 
 		 183 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1811  Resolvase domain protein  26.8 
 
 		 183 aa  54.3  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0297206  hitchhiker  0.00833685 
 
 
-
 
NC_013518  Sterm_4140  Resolvase domain protein  27.78 
 
 		 217 aa  53.9  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00204948  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1467  resolvase-like protein  26.32 
 
 		 196 aa  53.9  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1741  Resolvase domain  28.31 
 
 		 228 aa  53.5  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2173  resolvase domain-containing protein  29.53 
 
 		 196 aa  53.9  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0204  transposon resolvase  24.12 
 
 		 191 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000159954 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4319  resolvase domain-containing protein  27.22 
 
 		 186 aa  53.9  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3670  resolvase domain-containing protein  28.22 
 
 		 185 aa  53.5  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2582  resolvase domain-containing protein  26.67 
 
 		 185 aa  53.9  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4419  resolvase domain-containing protein  29.53 
 
 		 196 aa  53.9  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00736052  normal  0.464308 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0053  transposon Tn21 resolvase  27.22 
 
 		 186 aa  53.9  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.509225 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2084  resolvase domain-containing protein  29.53 
 
 		 196 aa  53.9  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0523  resolvase-like protein  30.12 
 
 		 198 aa  53.1  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0155  resolvase x  25.46 
 
 		 193 aa  52.8  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2095  Resolvase domain protein  29.19 
 
 		 203 aa  53.1  0.000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3477  resolvase domain-containing protein  27.01 
 
 		 196 aa  53.1  0.000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1807  resolvase domain-containing protein  26.24 
 
 		 201 aa  52.8  0.000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.261116  unclonable  0.00000000603181 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0088  resolvase domain-containing protein  26.87 
 
 		 199 aa  52.8  0.000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.223955  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>