More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_6887 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_6887  resolvase domain-containing protein  100 
 
 		 210 aa  417  1e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3278  resolvase domain-containing protein  63.46 
 
 		 208 aa  254  5e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.312644  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1306  resolvase domain-containing protein  65 
 
 		 205 aa  253  1.0000000000000001e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.92579  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4533  resolvase domain-containing protein  63.94 
 
 		 214 aa  250  9.000000000000001e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4161  Resolvase domain  61.19 
 
 		 206 aa  240  9e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009516  PsycPRwf_2397  resolvase domain-containing protein  53.08 
 
 		 210 aa  229  3e-59  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4408  resolvase domain-containing protein  55.67 
 
 		 202 aa  223  1e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000545957  normal  0.0701498 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4343  Resolvase domain protein  55.67 
 
 		 202 aa  223  1e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000112202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4666  resolvase domain-containing protein  55.67 
 
 		 202 aa  223  1e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000148612  normal  0.936039 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4246  Resolvase domain protein  54.95 
 
 		 205 aa  218  7e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0078  TnpR  51.21 
 
 		 220 aa  212  3.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.569126 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0571  resolvase domain-containing protein  51.98 
 
 		 210 aa  211  4.9999999999999996e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0950  resolvase domain-containing protein  50.97 
 
 		 207 aa  199  1.9999999999999998e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0123  putative resolvase  49.75 
 
 		 206 aa  197  7e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  6.922970000000001e-26 
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_44  putative resolvase  49.05 
 
 		 211 aa  197  1.0000000000000001e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0377389  n/a   
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_03  resolvase  55.43 
 
 		 209 aa  195  3e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0298  resolvase, putative  52.26 
 
 		 205 aa  195  5.000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3979  resolvase domain-containing protein  50.25 
 
 		 208 aa  193  2e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4266  resolvase domain-containing protein  53.06 
 
 		 231 aa  192  2e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000000000120246  unclonable  5.20349e-19 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2180  resolvase domain-containing protein  49 
 
 		 212 aa  192  2e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.52939  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4455  resolvase domain-containing protein  48 
 
 		 203 aa  191  8e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0077  resolvase family site-specific recombinase  45.5 
 
 		 211 aa  188  5e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.349046  n/a   
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4562  resolvase domain-containing protein  48.5 
 
 		 209 aa  188  5e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.338072  normal  1 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4460  Resolvase domain protein  48 
 
 		 209 aa  188  5e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4355  Resolvase domain protein  48 
 
 		 200 aa  187  1e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4386  resolvase domain-containing protein  48 
 
 		 209 aa  186  2e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0024  resolvase, putative  50.25 
 
 		 206 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000663819  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0021  resolvase, putative  49.75 
 
 		 221 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00853796  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0873  Resolvase domain protein  45.59 
 
 		 206 aa  174  8e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0054  resolvase domain-containing protein  41.98 
 
 		 213 aa  173  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01413  resolvase, putative  42.36 
 
 		 207 aa  171  7.999999999999999e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3590  resolvase domain protein  45.05 
 
 		 208 aa  170  1e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000308956 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4402  resolvase domain-containing protein  43.35 
 
 		 213 aa  170  2e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001518  resolvase  42.42 
 
 		 204 aa  144  1e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000153211  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1801  resolvase domain-containing protein  40.5 
 
 		 228 aa  135  5e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.118365 
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2477  resolvase-like protein  39.51 
 
 		 198 aa  134  8e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.131622  normal  0.782919 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0719  resolvase domain-containing protein  37.81 
 
 		 197 aa  124  8.000000000000001e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000179161 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2559  resolvase-like protein  39.19 
 
 		 222 aa  124  8.000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.22678 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1355  resolvase-like protein  37.24 
 
 		 190 aa  119  3e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.141663 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3355  resolvase domain-containing protein  37.13 
 
 		 301 aa  113  2.0000000000000002e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0978291  normal  0.274195 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0094  resolvase  36.36 
 
 		 245 aa  109  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.86084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0037  resolvase  37.02 
 
 		 245 aa  109  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.489197  normal  0.472165 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6519  resolvase  35.68 
 
 		 283 aa  106  3e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2479  hypothetical protein  39.62 
 
 		 138 aa  95.1  6e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.802993 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1811  Resolvase domain protein  29.29 
 
 		 183 aa  73.2  0.000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0297206  hitchhiker  0.00833685 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5792  resolvase TnpR  30.24 
 
 		 212 aa  70.9  0.00000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.923438  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0026  resolvase family site-specific recombinase  40.66 
 
 		 102 aa  69.3  0.00000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  decreased coverage  0.000122476  n/a   
 
 
-
 
NC_010715  Nther_2949  Resolvase domain  29.63 
 
 		 202 aa  68.2  0.00000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.587528  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2019  resolvase family site-specific recombinase  43.21 
 
 		 91 aa  68.2  0.00000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0260  resolvase family site-specific recombinase  31.68 
 
 		 205 aa  67.4  0.0000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1082  resolvase family site-specific recombinase  31.68 
 
 		 205 aa  67.4  0.0000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.271311  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3670  resolvase domain-containing protein  30.77 
 
 		 185 aa  67.8  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20410  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  31.28 
 
 		 194 aa  65.9  0.0000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0661103 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08245  resolvase  28.35 
 
 		 179 aa  65.1  0.0000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3678  Resolvase domain  30.58 
 
 		 190 aa  63.2  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134045  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3170  resolvase domain-containing protein  31.48 
 
 		 200 aa  62.8  0.000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00430122 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1711  integrative genetic element Gsu5, resolvase  31.79 
 
 		 190 aa  62.4  0.000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0316952  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3423  Resolvase domain protein  28.22 
 
 		 185 aa  61.2  0.000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010504  Mrad2831_6517  resolvase domain-containing protein  30.14 
 
 		 185 aa  60.8  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0088  resolvase domain-containing protein  25.37 
 
 		 199 aa  60.5  0.00000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.223955  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1006  Resolvase domain protein  27.18 
 
 		 189 aa  60.5  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01209  bacteriocin production protein  25.89 
 
 		 198 aa  60.8  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000702686  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0053  transposon Tn21 resolvase  28.5 
 
 		 186 aa  59.7  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.509225 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4319  resolvase domain-containing protein  28.5 
 
 		 186 aa  59.7  0.00000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3124  resolvase domain-containing protein  27.54 
 
 		 194 aa  59.3  0.00000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0904767  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1206  Resolvase domain protein  27.98 
 
 		 186 aa  58.9  0.00000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1467  resolvase-like protein  31.22 
 
 		 196 aa  58.5  0.00000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0037  transposon Tn21 resolvase  28.14 
 
 		 205 aa  58.5  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.335597 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1445  Resolvase domain  28.43 
 
 		 188 aa  57.8  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0204  transposon resolvase  26.53 
 
 		 191 aa  57.4  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000159954 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3652  resolvase, N-terminal  32.37 
 
 		 192 aa  57.8  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000770175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2355  Resolvase domain protein  27.8 
 
 		 186 aa  57.8  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.230305  normal  0.6636 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1494  resolvase-like protein  29.69 
 
 		 186 aa  57.8  0.0000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.493325 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0222  transposon resolvase  27.04 
 
 		 199 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000952158 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004307  resolvase N-terminal domain protein  29.23 
 
 		 190 aa  57.8  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.179008  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1325  resolvase domain-containing protein  26.73 
 
 		 192 aa  58.2  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3135  resolvase TnpR  26.73 
 
 		 217 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1807  resolvase domain-containing protein  24.88 
 
 		 201 aa  57.4  0.0000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.261116  unclonable  0.00000000603181 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0167  site-specific recombinase  26.86 
 
 		 214 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010374  M446_7059  hypothetical protein  28.43 
 
 		 183 aa  56.2  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0039  resolvase  24.75 
 
 		 181 aa  56.2  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0293678  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4473  serine-based site-specific recombinase activity TnpR  27.98 
 
 		 186 aa  56.2  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0992302  decreased coverage  0.00348712 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4599  serine-based site-specific recombinase activity TnpR  27.98 
 
 		 186 aa  56.2  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000321893  hitchhiker  0.00456228 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15430  putative resolvase, essential for transposition  27.98 
 
 		 186 aa  56.2  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  7.34084e-16  unclonable  6.55355e-22 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0246  resolvase domain-containing protein  26.8 
 
 		 179 aa  56.2  0.0000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.315323  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003898  resolvase putative  28.64 
 
 		 202 aa  55.5  0.0000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6405  resolvase domain-containing protein  29.8 
 
 		 185 aa  55.1  0.0000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0019  Resolvase domain protein  30.69 
 
 		 195 aa  55.1  0.0000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3112  Resolvase domain protein  31.48 
 
 		 184 aa  55.1  0.0000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0687  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  29.11 
 
 		 200 aa  54.7  0.0000009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.731539  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0802  resolvase, N-terminal  29.67 
 
 		 229 aa  54.7  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000162467  unclonable  0.000000072068 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2499  resolvase, N-terminal  29.67 
 
 		 229 aa  54.3  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.994531 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2322  resolvase domain-containing protein  28.57 
 
 		 186 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3464  resolvase domain-containing protein  25.13 
 
 		 185 aa  54.3  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0108  hypothetical protein  29.56 
 
 		 309 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0466  Resolvase domain  29.84 
 
 		 205 aa  53.9  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.418385  normal  0.0169839 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1594  resolvase domain-containing protein  28 
 
 		 189 aa  53.5  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.94865  normal  0.455677 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0216  transposon resolvase  26.53 
 
 		 199 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.159168 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1256  resolvase domain-containing protein  26.63 
 
 		 185 aa  53.5  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.249423  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4223  resolvase domain-containing protein  29.03 
 
 		 194 aa  53.5  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.150601  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>