More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_B0078 on replicon NC_011204
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011204  SeD_B0078  TnpR  100 
 
 		 220 aa  453  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.569126 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3278  resolvase domain-containing protein  58.46 
 
 		 208 aa  224  9e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.312644  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1306  resolvase domain-containing protein  57.95 
 
 		 205 aa  221  9e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.92579  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4246  Resolvase domain protein  51.5 
 
 		 205 aa  217  8.999999999999998e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4161  Resolvase domain  51.52 
 
 		 206 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4408  resolvase domain-containing protein  51 
 
 		 202 aa  202  2e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000545957  normal  0.0701498 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4666  resolvase domain-containing protein  51 
 
 		 202 aa  202  2e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000148612  normal  0.936039 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4343  Resolvase domain protein  51 
 
 		 202 aa  202  2e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000112202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009516  PsycPRwf_2397  resolvase domain-containing protein  48.5 
 
 		 210 aa  199  1.9999999999999998e-50  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6887  resolvase domain-containing protein  51.21 
 
 		 210 aa  197  7e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4533  resolvase domain-containing protein  49.51 
 
 		 214 aa  196  3e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0571  resolvase domain-containing protein  46 
 
 		 210 aa  193  2e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_44  putative resolvase  46.04 
 
 		 211 aa  191  1e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0377389  n/a   
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_03  resolvase  46.27 
 
 		 209 aa  190  1e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0298  resolvase, putative  47.72 
 
 		 205 aa  190  2e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3979  resolvase domain-containing protein  47.72 
 
 		 208 aa  187  1e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4386  resolvase domain-containing protein  47.98 
 
 		 209 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4402  resolvase domain-containing protein  50.85 
 
 		 213 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4355  Resolvase domain protein  47.98 
 
 		 200 aa  182  3e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4562  resolvase domain-containing protein  47.5 
 
 		 209 aa  182  4.0000000000000006e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.338072  normal  1 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4460  Resolvase domain protein  47.47 
 
 		 209 aa  182  5.0000000000000004e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0024  resolvase, putative  46.7 
 
 		 206 aa  180  1e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000663819  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0054  resolvase domain-containing protein  50.28 
 
 		 213 aa  180  2e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0021  resolvase, putative  46.19 
 
 		 221 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00853796  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4455  resolvase domain-containing protein  45.69 
 
 		 203 aa  179  4e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01413  resolvase, putative  44.62 
 
 		 207 aa  177  8e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2180  resolvase domain-containing protein  46.19 
 
 		 212 aa  177  1e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.52939  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4266  resolvase domain-containing protein  43.96 
 
 		 231 aa  176  3e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000000000120246  unclonable  5.20349e-19 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0077  resolvase family site-specific recombinase  46.55 
 
 		 211 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.349046  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0873  Resolvase domain protein  43.88 
 
 		 206 aa  171  9e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0123  putative resolvase  42.13 
 
 		 206 aa  164  1.0000000000000001e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  6.922970000000001e-26 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3590  resolvase domain protein  42.71 
 
 		 208 aa  160  1e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000308956 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0950  resolvase domain-containing protein  42.36 
 
 		 207 aa  154  9e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2559  resolvase-like protein  42.47 
 
 		 222 aa  154  1e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.22678 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0719  resolvase domain-containing protein  42.16 
 
 		 197 aa  149  2e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000179161 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001518  resolvase  42.64 
 
 		 204 aa  146  2.0000000000000003e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000153211  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1355  resolvase-like protein  41.29 
 
 		 190 aa  143  3e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.141663 
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2477  resolvase-like protein  40.78 
 
 		 198 aa  138  4.999999999999999e-32  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.131622  normal  0.782919 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1801  resolvase domain-containing protein  40 
 
 		 228 aa  138  6e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.118365 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6519  resolvase  34.16 
 
 		 283 aa  119  4.9999999999999996e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3355  resolvase domain-containing protein  37.04 
 
 		 301 aa  115  6e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0978291  normal  0.274195 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0037  resolvase  34.83 
 
 		 245 aa  109  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.489197  normal  0.472165 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0094  resolvase  34.33 
 
 		 245 aa  106  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.86084  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0026  resolvase family site-specific recombinase  46.39 
 
 		 102 aa  87.8  1e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  decreased coverage  0.000122476  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2019  resolvase family site-specific recombinase  50.63 
 
 		 91 aa  86.7  3e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1811  Resolvase domain protein  31.31 
 
 		 183 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0297206  hitchhiker  0.00833685 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0043  hypothetical protein  30.81 
 
 		 188 aa  79.3  0.00000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1807  resolvase domain-containing protein  27.5 
 
 		 201 aa  77.8  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.261116  unclonable  0.00000000603181 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0039  resolvase  30.53 
 
 		 181 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0293678  n/a   
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2479  hypothetical protein  35.71 
 
 		 138 aa  76.6  0.0000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.802993 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0088  resolvase domain-containing protein  27 
 
 		 199 aa  75.1  0.0000000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.223955  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0260  resolvase family site-specific recombinase  28.77 
 
 		 205 aa  73.6  0.000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1082  resolvase family site-specific recombinase  28.77 
 
 		 205 aa  73.6  0.000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.271311  n/a   
 
 
-
 
NC_010504  Mrad2831_6517  resolvase domain-containing protein  28.71 
 
 		 185 aa  73.6  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4091  Resolvase domain  28.35 
 
 		 186 aa  73.2  0.000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0466  Resolvase domain  31.98 
 
 		 205 aa  73.2  0.000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.418385  normal  0.0169839 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3670  resolvase domain-containing protein  29.38 
 
 		 185 aa  72.4  0.000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1006  Resolvase domain protein  26.8 
 
 		 189 aa  72  0.000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0204  transposon resolvase  28.79 
 
 		 191 aa  71.6  0.000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000159954 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0222  transposon resolvase  29.29 
 
 		 199 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000952158 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4253  resolvase-like protein  26.9 
 
 		 201 aa  71.2  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.35703  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4263  resolvase-like protein  26.9 
 
 		 201 aa  71.2  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4084  resolvase domain-containing protein  27.92 
 
 		 188 aa  70.5  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.236689  normal  0.0346573 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2680  resolvase domain-containing protein  28.06 
 
 		 185 aa  69.7  0.00000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3829  resolvase domain-containing protein  28.06 
 
 		 185 aa  69.7  0.00000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3846  resolvase domain-containing protein  28.06 
 
 		 185 aa  69.7  0.00000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.40246  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1914  resolvase domain-containing protein  28.06 
 
 		 185 aa  69.7  0.00000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1256  resolvase domain-containing protein  28.06 
 
 		 185 aa  69.7  0.00000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.249423  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20410  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  27.69 
 
 		 194 aa  69.3  0.00000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0661103 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0687  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  29 
 
 		 200 aa  68.9  0.00000000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.731539  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0019  Resolvase domain protein  34.39 
 
 		 195 aa  68.6  0.00000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4473  serine-based site-specific recombinase activity TnpR  27.04 
 
 		 186 aa  68.6  0.00000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0992302  decreased coverage  0.00348712 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4599  serine-based site-specific recombinase activity TnpR  27.04 
 
 		 186 aa  68.6  0.00000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000321893  hitchhiker  0.00456228 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15430  putative resolvase, essential for transposition  27.04 
 
 		 186 aa  68.6  0.00000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  7.34084e-16  unclonable  6.55355e-22 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0216  transposon resolvase  28.22 
 
 		 199 aa  68.2  0.00000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.159168 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2033  resolvase domain-containing protein  28.28 
 
 		 192 aa  68.2  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.188765  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1711  integrative genetic element Gsu5, resolvase  25.5 
 
 		 190 aa  68.2  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0316952  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4668  resolvase domain-containing protein  28.14 
 
 		 189 aa  67.8  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4775  resolvase domain-containing protein  28.14 
 
 		 189 aa  67.8  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1494  resolvase-like protein  27.04 
 
 		 186 aa  68.2  0.0000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.493325 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0037  transposon Tn21 resolvase  27.27 
 
 		 205 aa  67  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.335597 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2582  resolvase domain-containing protein  28.25 
 
 		 185 aa  67  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6388  resolvase domain-containing protein  26.53 
 
 		 191 aa  67.4  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3464  resolvase domain-containing protein  27.27 
 
 		 185 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1445  Resolvase domain  28.06 
 
 		 188 aa  66.2  0.0000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1125  resolvase domain-containing protein  27.55 
 
 		 184 aa  65.9  0.0000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.577602  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3678  Resolvase domain  25.91 
 
 		 190 aa  65.9  0.0000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134045  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3170  resolvase domain-containing protein  26.5 
 
 		 200 aa  65.5  0.0000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00430122 
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5396  resolvase domain-containing protein  28.42 
 
 		 180 aa  65.1  0.0000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.859533  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2351  resolvase-like protein  27.78 
 
 		 235 aa  64.7  0.0000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.329475 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01209  bacteriocin production protein  27.09 
 
 		 198 aa  65.1  0.0000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000702686  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1206  Resolvase domain protein  26.53 
 
 		 186 aa  64.7  0.000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0816  resolvase domain-containing protein  31 
 
 		 185 aa  64.7  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2179  resolvase domain-containing protein  26.15 
 
 		 188 aa  63.9  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0190993  hitchhiker  0.0022624 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3124  resolvase domain-containing protein  25.84 
 
 		 194 aa  63.9  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0904767  n/a   
 
 
-
 
NC_010374  M446_7059  hypothetical protein  32.5 
 
 		 183 aa  63.5  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6810  Resolvase domain protein  31 
 
 		 185 aa  63.5  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.67902  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4154  resolvase domain-containing protein  26.77 
 
 		 199 aa  63.9  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2946  resolvase domain-containing protein  26.15 
 
 		 188 aa  63.9  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0986415  normal  0.227448 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3928  resolvase domain-containing protein  28.72 
 
 		 191 aa  63.9  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.272515  hitchhiker  0.0000753359 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>