More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_4266 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_4266  resolvase domain-containing protein  100 
 
 		 231 aa  471  1e-132  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000000000120246  unclonable  5.20349e-19 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0298  resolvase, putative  54.15 
 
 		 205 aa  214  8e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0123  putative resolvase  52.71 
 
 		 206 aa  211  7e-54  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  6.922970000000001e-26 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4343  Resolvase domain protein  52.68 
 
 		 202 aa  210  1e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000112202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4666  resolvase domain-containing protein  52.68 
 
 		 202 aa  210  1e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000148612  normal  0.936039 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4408  resolvase domain-containing protein  52.68 
 
 		 202 aa  210  1e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000545957  normal  0.0701498 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01413  resolvase, putative  52.2 
 
 		 207 aa  209  3e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4533  resolvase domain-containing protein  52.29 
 
 		 214 aa  205  4e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_03  resolvase  51.9 
 
 		 209 aa  203  2e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3278  resolvase domain-containing protein  57.56 
 
 		 208 aa  199  1.9999999999999998e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.312644  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0077  resolvase family site-specific recombinase  50.96 
 
 		 211 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.349046  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1306  resolvase domain-containing protein  57.56 
 
 		 205 aa  199  3.9999999999999996e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.92579  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4161  Resolvase domain  52.43 
 
 		 206 aa  198  7.999999999999999e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_44  putative resolvase  51.46 
 
 		 211 aa  196  2.0000000000000003e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0377389  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0571  resolvase domain-containing protein  49.76 
 
 		 210 aa  193  2e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009516  PsycPRwf_2397  resolvase domain-containing protein  47.64 
 
 		 210 aa  192  3e-48  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0021  resolvase, putative  47.55 
 
 		 221 aa  189  4e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00853796  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0024  resolvase, putative  47.06 
 
 		 206 aa  188  7e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000663819  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4246  Resolvase domain protein  51.02 
 
 		 205 aa  187  8e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4402  resolvase domain-containing protein  46.01 
 
 		 213 aa  185  5e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0054  resolvase domain-containing protein  45.97 
 
 		 213 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0078  TnpR  43.96 
 
 		 220 aa  176  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.569126 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6887  resolvase domain-containing protein  53.06 
 
 		 210 aa  175  5e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0950  resolvase domain-containing protein  47.14 
 
 		 207 aa  170  1e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0873  Resolvase domain protein  44.88 
 
 		 206 aa  168  6e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3979  resolvase domain-containing protein  49.49 
 
 		 208 aa  167  1e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3590  resolvase domain protein  43.63 
 
 		 208 aa  157  1e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000308956 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001518  resolvase  40.69 
 
 		 204 aa  157  2e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000153211  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1801  resolvase domain-containing protein  44.98 
 
 		 228 aa  155  4e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.118365 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2559  resolvase-like protein  40.38 
 
 		 222 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.22678 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4460  Resolvase domain protein  39.9 
 
 		 209 aa  142  3e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4562  resolvase domain-containing protein  39.42 
 
 		 209 aa  142  4e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.338072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2180  resolvase domain-containing protein  39.9 
 
 		 212 aa  142  6e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.52939  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4455  resolvase domain-containing protein  40.38 
 
 		 203 aa  142  6e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4386  resolvase domain-containing protein  38.94 
 
 		 209 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4355  Resolvase domain protein  39.32 
 
 		 200 aa  139  3e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2477  resolvase-like protein  41.26 
 
 		 198 aa  136  3.0000000000000003e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.131622  normal  0.782919 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0719  resolvase domain-containing protein  40.78 
 
 		 197 aa  131  7.999999999999999e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000179161 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1355  resolvase-like protein  39 
 
 		 190 aa  118  7e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.141663 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0037  resolvase  36.59 
 
 		 245 aa  115  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.489197  normal  0.472165 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0094  resolvase  35.96 
 
 		 245 aa  115  7.999999999999999e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.86084  normal  1 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6519  resolvase  37.68 
 
 		 283 aa  112  6e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3355  resolvase domain-containing protein  37.07 
 
 		 301 aa  110  2.0000000000000002e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0978291  normal  0.274195 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3124  resolvase domain-containing protein  33.33 
 
 		 194 aa  87  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0904767  n/a   
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2479  hypothetical protein  36.72 
 
 		 138 aa  85.5  7e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.802993 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1711  integrative genetic element Gsu5, resolvase  32.09 
 
 		 190 aa  83.6  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0316952  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1811  Resolvase domain protein  29.35 
 
 		 183 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0297206  hitchhiker  0.00833685 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0039  resolvase  29.9 
 
 		 181 aa  75.5  0.0000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0293678  n/a   
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5396  resolvase domain-containing protein  29.76 
 
 		 180 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.859533  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1326  resolvase domain-containing protein  33.17 
 
 		 180 aa  74.7  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0466  Resolvase domain  35.29 
 
 		 205 aa  74.7  0.000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.418385  normal  0.0169839 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1006  Resolvase domain protein  29.56 
 
 		 189 aa  73.2  0.000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1594  resolvase domain-containing protein  28.78 
 
 		 189 aa  72.4  0.000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.94865  normal  0.455677 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4379  resolvase-like protein  29.76 
 
 		 197 aa  71.6  0.000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.907706  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4555  resolvase-like protein  29.76 
 
 		 197 aa  71.6  0.000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.849085  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2179  resolvase domain-containing protein  30.2 
 
 		 188 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0190993  hitchhiker  0.0022624 
 
 
-
 
NC_010715  Nther_2949  Resolvase domain  27.36 
 
 		 202 aa  71.2  0.00000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.587528  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2946  resolvase domain-containing protein  30.2 
 
 		 188 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0986415  normal  0.227448 
 
 
-
 
NC_010374  M446_7059  hypothetical protein  33.67 
 
 		 183 aa  70.9  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3670  resolvase domain-containing protein  29.33 
 
 		 185 aa  70.9  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0019  Resolvase domain protein  32.34 
 
 		 195 aa  70.1  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2173  resolvase domain-containing protein  28.77 
 
 		 196 aa  68.9  0.00000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4419  resolvase domain-containing protein  28.77 
 
 		 196 aa  68.9  0.00000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00736052  normal  0.464308 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2084  resolvase domain-containing protein  28.77 
 
 		 196 aa  68.9  0.00000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0088  resolvase domain-containing protein  26.79 
 
 		 199 aa  68.6  0.00000000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.223955  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0260  resolvase family site-specific recombinase  30.5 
 
 		 205 aa  67.8  0.0000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1082  resolvase family site-specific recombinase  30.5 
 
 		 205 aa  67.8  0.0000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.271311  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1807  resolvase domain-containing protein  26.67 
 
 		 201 aa  68.2  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.261116  unclonable  0.00000000603181 
 
 
-
 
NC_008263  CPR_A0002  resolvase  25.24 
 
 		 190 aa  67.4  0.0000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141759  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4663  resolvase domain-containing protein  29.76 
 
 		 197 aa  67  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.94015  n/a   
 
 
-
 
NC_010373  M446_7006  hypothetical protein  32.84 
 
 		 183 aa  66.6  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5792  resolvase TnpR  29.76 
 
 		 212 aa  66.6  0.0000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.923438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1762  resolvase-like protein  29.61 
 
 		 192 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2374  resolvase domain-containing protein  29.61 
 
 		 192 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3678  Resolvase domain  29.33 
 
 		 190 aa  65.5  0.0000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134045  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0105  resolvase, N-terminal:resolvase helix-turn-helix region  29.27 
 
 		 192 aa  65.1  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010504  Mrad2831_6517  resolvase domain-containing protein  29.9 
 
 		 185 aa  64.7  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2582  resolvase domain-containing protein  29.95 
 
 		 185 aa  64.7  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3112  Resolvase domain protein  31.22 
 
 		 184 aa  63.9  0.000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20410  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  29.58 
 
 		 194 aa  64.3  0.000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0661103 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3423  Resolvase domain protein  28.5 
 
 		 185 aa  63.5  0.000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43160  Resolvase-like protein  33.53 
 
 		 189 aa  63.5  0.000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2427  resolvase domain-containing protein  28.43 
 
 		 193 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0929457  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0246  resolvase domain-containing protein  29.65 
 
 		 179 aa  63.2  0.000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.315323  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3231  transposon Tn2501 resolvase  29.61 
 
 		 191 aa  62  0.000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2781  resolvase domain-containing protein  27.32 
 
 		 190 aa  61.6  0.000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.183587  normal  0.43479 
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0011  RlgA  30.56 
 
 		 186 aa  61.2  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.928686  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2003  transposon Tn2501 resolvase  27.45 
 
 		 222 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00181715  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3992  resolvase domain-containing protein  29.19 
 
 		 195 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.378658  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0204  transposon resolvase  24.14 
 
 		 191 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000159954 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0605  resolvase domain-containing protein  28.97 
 
 		 186 aa  61.6  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.177837 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0687  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  29.38 
 
 		 200 aa  61.6  0.00000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.731539  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0611  Resolvase domain protein  28.97 
 
 		 186 aa  61.6  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6810  Resolvase domain protein  32.35 
 
 		 185 aa  61.2  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.67902  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2027  resolvase domain-containing protein  33.14 
 
 		 185 aa  61.6  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0580  resolvase domain-containing protein  28.97 
 
 		 186 aa  61.6  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004307  resolvase N-terminal domain protein  30.14 
 
 		 190 aa  60.8  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.179008  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1132  Resolvase domain  28.85 
 
 		 184 aa  60.5  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002227  resolvase  30.6 
 
 		 128 aa  60.5  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2494  resolvase domain-containing protein  29.27 
 
 		 191 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>