202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_4402 on replicon NC_009036
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009036  Sbal_4402  resolvase domain-containing protein  100 
 
 		 213 aa  438  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0054  resolvase domain-containing protein  92.96 
 
 		 213 aa  409  1e-113  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0077  resolvase family site-specific recombinase  50.25 
 
 		 211 aa  199  1.9999999999999998e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.349046  n/a   
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_44  putative resolvase  46.23 
 
 		 211 aa  196  2.0000000000000003e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0377389  n/a   
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_03  resolvase  45.93 
 
 		 209 aa  192  4e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4246  Resolvase domain protein  53.71 
 
 		 205 aa  187  7e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4266  resolvase domain-containing protein  46.01 
 
 		 231 aa  185  4e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000000000120246  unclonable  5.20349e-19 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0571  resolvase domain-containing protein  52 
 
 		 210 aa  184  8e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0298  resolvase, putative  49.02 
 
 		 205 aa  183  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01413  resolvase, putative  48.04 
 
 		 207 aa  184  1.0000000000000001e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0078  TnpR  50.85 
 
 		 220 aa  182  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.569126 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0123  putative resolvase  45.32 
 
 		 206 aa  180  2e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  6.922970000000001e-26 
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0024  resolvase, putative  47.09 
 
 		 206 aa  176  2e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000663819  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0021  resolvase, putative  47.09 
 
 		 221 aa  176  2e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00853796  n/a   
 
 
-
 
NC_009516  PsycPRwf_2397  resolvase domain-containing protein  50 
 
 		 210 aa  174  9.999999999999999e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4161  Resolvase domain  45.81 
 
 		 206 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3278  resolvase domain-containing protein  47.06 
 
 		 208 aa  172  3.9999999999999995e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.312644  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1306  resolvase domain-containing protein  46.57 
 
 		 205 aa  171  1e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.92579  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3979  resolvase domain-containing protein  52.57 
 
 		 208 aa  169  2e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0873  Resolvase domain protein  48.57 
 
 		 206 aa  168  5e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4533  resolvase domain-containing protein  43.6 
 
 		 214 aa  165  4e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4460  Resolvase domain protein  46.86 
 
 		 209 aa  161  8.000000000000001e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6887  resolvase domain-containing protein  43.35 
 
 		 210 aa  159  2e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4455  resolvase domain-containing protein  46.29 
 
 		 203 aa  160  2e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4562  resolvase domain-containing protein  46.29 
 
 		 209 aa  159  3e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.338072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4666  resolvase domain-containing protein  45.71 
 
 		 202 aa  159  3e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000148612  normal  0.936039 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4343  Resolvase domain protein  45.71 
 
 		 202 aa  159  3e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000112202  normal  1 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4355  Resolvase domain protein  46.29 
 
 		 200 aa  159  3e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4408  resolvase domain-containing protein  45.71 
 
 		 202 aa  159  3e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000545957  normal  0.0701498 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0950  resolvase domain-containing protein  49.14 
 
 		 207 aa  158  5e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4386  resolvase domain-containing protein  45.71 
 
 		 209 aa  158  6e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001518  resolvase  42.86 
 
 		 204 aa  155  6e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000153211  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3590  resolvase domain protein  46.29 
 
 		 208 aa  154  1e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000308956 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2180  resolvase domain-containing protein  45.88 
 
 		 212 aa  154  1e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.52939  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2559  resolvase-like protein  40.95 
 
 		 222 aa  144  9e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.22678 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1801  resolvase domain-containing protein  41.46 
 
 		 228 aa  144  1e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.118365 
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2477  resolvase-like protein  39.9 
 
 		 198 aa  131  9e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.131622  normal  0.782919 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0719  resolvase domain-containing protein  38.92 
 
 		 197 aa  127  1.0000000000000001e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000179161 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1355  resolvase-like protein  38.58 
 
 		 190 aa  125  6e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.141663 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0094  resolvase  37.44 
 
 		 245 aa  120  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.86084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0037  resolvase  37.44 
 
 		 245 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.489197  normal  0.472165 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3355  resolvase domain-containing protein  36.45 
 
 		 301 aa  112  4.0000000000000004e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0978291  normal  0.274195 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6519  resolvase  34.3 
 
 		 283 aa  105  3e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2479  hypothetical protein  32.09 
 
 		 138 aa  72.8  0.000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.802993 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20410  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  28 
 
 		 194 aa  66.6  0.0000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0661103 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0039  resolvase  29.69 
 
 		 181 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0293678  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3124  resolvase domain-containing protein  26.73 
 
 		 194 aa  63.2  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0904767  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0222  transposon resolvase  29 
 
 		 199 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000952158 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0204  transposon resolvase  27.5 
 
 		 191 aa  59.7  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000159954 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1711  integrative genetic element Gsu5, resolvase  24.07 
 
 		 190 aa  59.7  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0316952  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2019  resolvase family site-specific recombinase  48.15 
 
 		 91 aa  58.9  0.00000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0216  transposon resolvase  28.22 
 
 		 199 aa  58.5  0.00000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.159168 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0026  resolvase family site-specific recombinase  48.15 
 
 		 102 aa  57.8  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  decreased coverage  0.000122476  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1445  Resolvase domain  25.93 
 
 		 188 aa  58.2  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0088  resolvase domain-containing protein  27.92 
 
 		 199 aa  57.4  0.0000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.223955  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1807  resolvase domain-containing protein  27.78 
 
 		 201 aa  57.4  0.0000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.261116  unclonable  0.00000000603181 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0068  resolvase  25.85 
 
 		 181 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0902003  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0233  resolvase  27.94 
 
 		 183 aa  55.8  0.0000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1132  Resolvase domain  26.95 
 
 		 184 aa  55.5  0.0000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1967  resolvase domain-containing protein  29.05 
 
 		 252 aa  55.8  0.0000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0202  resolvase  27.94 
 
 		 183 aa  55.8  0.0000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3464  resolvase domain-containing protein  26.34 
 
 		 185 aa  55.1  0.0000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3670  resolvase domain-containing protein  27.22 
 
 		 185 aa  55.1  0.0000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1006  Resolvase domain protein  26.35 
 
 		 189 aa  54.7  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008263  CPR_A0002  resolvase  24.88 
 
 		 190 aa  54.3  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141759  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3829  resolvase domain-containing protein  25.93 
 
 		 185 aa  53.9  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3846  resolvase domain-containing protein  25.93 
 
 		 185 aa  53.9  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.40246  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1914  resolvase domain-containing protein  25.93 
 
 		 185 aa  53.9  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2582  resolvase domain-containing protein  24.55 
 
 		 185 aa  53.5  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1256  resolvase domain-containing protein  25.93 
 
 		 185 aa  53.9  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.249423  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2680  resolvase domain-containing protein  25.93 
 
 		 185 aa  53.9  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0206  transposon resolvase  28.4 
 
 		 169 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000314886 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1326  resolvase domain-containing protein  28 
 
 		 180 aa  52.8  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3847  resolvase-like protein  29.76 
 
 		 191 aa  52.8  0.000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.388128  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0037  transposon Tn21 resolvase  25.93 
 
 		 205 aa  52.4  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.335597 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1811  Resolvase domain protein  24.5 
 
 		 183 aa  52  0.000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0297206  hitchhiker  0.00833685 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6448  Resolvase domain protein  29.61 
 
 		 211 aa  51.6  0.000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0041  resolvase domain-containing protein  26.9 
 
 		 184 aa  51.6  0.000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.0000573211 
 
 
-
 
NC_004310  BR0260  resolvase family site-specific recombinase  25.98 
 
 		 205 aa  51.2  0.00001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1082  resolvase family site-specific recombinase  25.98 
 
 		 205 aa  51.2  0.00001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.271311  n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0043  hypothetical protein  26.4 
 
 		 188 aa  51.2  0.00001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008264  CPR_B0006  resolvase  25 
 
 		 189 aa  51.2  0.00001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00548662  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5553  resolvase domain protein  34.26 
 
 		 515 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.919369999999999e-21 
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2509  putative res  63.16 
 
 		 41 aa  50.1  0.00002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.963906 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0592  Resolvase domain protein  31.07 
 
 		 462 aa  50.4  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0466  Resolvase domain  26.54 
 
 		 205 aa  50.4  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.418385  normal  0.0169839 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6187  resolvase-like protein  24.69 
 
 		 186 aa  49.7  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0984609  hitchhiker  0.0000107923 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0797  resolvase domain-containing protein  28.29 
 
 		 251 aa  50.1  0.00003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000013388 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0246  resolvase domain-containing protein  28.07 
 
 		 179 aa  50.1  0.00003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.315323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4419  resolvase domain-containing protein  28.49 
 
 		 196 aa  49.7  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00736052  normal  0.464308 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2084  resolvase domain-containing protein  28.49 
 
 		 196 aa  49.7  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2173  resolvase domain-containing protein  28.49 
 
 		 196 aa  49.7  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0053  transposon Tn21 resolvase  24.69 
 
 		 186 aa  49.7  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.509225 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1494  resolvase-like protein  27.78 
 
 		 186 aa  49.3  0.00004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.493325 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4319  resolvase domain-containing protein  24.69 
 
 		 186 aa  49.7  0.00004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0014  resolvase domain-containing protein  24.87 
 
 		 184 aa  49.7  0.00004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.125158  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4473  serine-based site-specific recombinase activity TnpR  27.78 
 
 		 186 aa  48.9  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0992302  decreased coverage  0.00348712 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4599  serine-based site-specific recombinase activity TnpR  27.78 
 
 		 186 aa  48.9  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000321893  hitchhiker  0.00456228 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15430  putative resolvase, essential for transposition  27.78 
 
 		 186 aa  48.9  0.00005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  7.34084e-16  unclonable  6.55355e-22 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0687  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  27.1 
 
 		 200 aa  48.9  0.00005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.731539  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>