50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_2019 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009052  Sbal_2019  resolvase family site-specific recombinase  100 
 
 		 91 aa  186  1e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0026  resolvase family site-specific recombinase  98.84 
 
 		 102 aa  175  1e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  decreased coverage  0.000122476  n/a   
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4460  Resolvase domain protein  97.67 
 
 		 209 aa  174  3e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4562  resolvase domain-containing protein  98.82 
 
 		 209 aa  174  4e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.338072  normal  1 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4355  Resolvase domain protein  97.65 
 
 		 200 aa  172  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4386  resolvase domain-containing protein  96.51 
 
 		 209 aa  172  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4455  resolvase domain-containing protein  96.51 
 
 		 203 aa  172  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2180  resolvase domain-containing protein  94.05 
 
 		 212 aa  162  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.52939  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0571  resolvase domain-containing protein  54.22 
 
 		 210 aa  91.3  5e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0078  TnpR  50.63 
 
 		 220 aa  86.7  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.569126 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4666  resolvase domain-containing protein  53.16 
 
 		 202 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000148612  normal  0.936039 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4343  Resolvase domain protein  53.16 
 
 		 202 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000112202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4408  resolvase domain-containing protein  53.16 
 
 		 202 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000545957  normal  0.0701498 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4246  Resolvase domain protein  49.4 
 
 		 205 aa  79  0.00000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009516  PsycPRwf_2397  resolvase domain-containing protein  44.44 
 
 		 210 aa  76.3  0.0000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1801  resolvase domain-containing protein  52.94 
 
 		 228 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.118365 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4161  Resolvase domain  46.75 
 
 		 206 aa  72.4  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0873  Resolvase domain protein  40.91 
 
 		 206 aa  68.6  0.00000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001518  resolvase  46.99 
 
 		 204 aa  66.6  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000153211  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3590  resolvase domain protein  42.86 
 
 		 208 aa  65.5  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000308956 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3979  resolvase domain-containing protein  50.6 
 
 		 208 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0021  resolvase, putative  48.68 
 
 		 221 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00853796  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0024  resolvase, putative  47.37 
 
 		 206 aa  65.1  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000663819  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0950  resolvase domain-containing protein  45.24 
 
 		 207 aa  64.3  0.0000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0298  resolvase, putative  43.24 
 
 		 205 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4533  resolvase domain-containing protein  40.91 
 
 		 214 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0077  resolvase family site-specific recombinase  45.56 
 
 		 211 aa  62  0.000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.349046  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6519  resolvase  41.46 
 
 		 283 aa  61.2  0.000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0123  putative resolvase  42.86 
 
 		 206 aa  61.2  0.000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  6.922970000000001e-26 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3355  resolvase domain-containing protein  42.68 
 
 		 301 aa  60.8  0.000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0978291  normal  0.274195 
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_44  putative resolvase  39.02 
 
 		 211 aa  60.1  0.00000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0377389  n/a   
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_03  resolvase  37.21 
 
 		 209 aa  59.3  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4402  resolvase domain-containing protein  48.15 
 
 		 213 aa  58.9  0.00000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2559  resolvase-like protein  39.56 
 
 		 222 aa  55.5  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.22678 
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0054  resolvase domain-containing protein  46.3 
 
 		 213 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0094  resolvase  39.02 
 
 		 245 aa  53.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.86084  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6887  resolvase domain-containing protein  43.21 
 
 		 210 aa  52.8  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0037  resolvase  39.02 
 
 		 245 aa  53.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.489197  normal  0.472165 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3278  resolvase domain-containing protein  39.29 
 
 		 208 aa  52  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.312644  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1306  resolvase domain-containing protein  40.48 
 
 		 205 aa  51.6  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.92579  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4266  resolvase domain-containing protein  36.9 
 
 		 231 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000000000120246  unclonable  5.20349e-19 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0246  resolvase domain-containing protein  42.11 
 
 		 179 aa  49.3  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.315323  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002227  resolvase  34.57 
 
 		 128 aa  47  0.00008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01413  resolvase, putative  31.33 
 
 		 207 aa  45.8  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0466  Resolvase domain  30.59 
 
 		 205 aa  42.7  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.418385  normal  0.0169839 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2095  Resolvase domain protein  47.5 
 
 		 203 aa  41.6  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6388  resolvase domain-containing protein  31.58 
 
 		 191 aa  41.2  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0260  resolvase family site-specific recombinase  35.44 
 
 		 205 aa  40.8  0.007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1082  resolvase family site-specific recombinase  35.44 
 
 		 205 aa  40.8  0.007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.271311  n/a   
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_42  putative resolvase  38.46 
 
 		 181 aa  40  0.01  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0684051  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>