252 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_3963 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_3963  recombinase  100 
 
 		 493 aa  1030    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.636106  normal  0.385317 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1250  resolvase  39.75 
 
 		 524 aa  338  9.999999999999999e-92  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0231  resolvase domain-containing protein  27.09 
 
 		 519 aa  176  6e-43  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.829739  normal  0.106092 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0320  resolvase domain-containing protein  27.8 
 
 		 531 aa  126  7e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.140685  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3000  resolvase domain protein  26.1 
 
 		 549 aa  126  1e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0216  resolvase domain-containing protein  24.94 
 
 		 517 aa  119  9.999999999999999e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0910  recombinase  26.68 
 
 		 743 aa  119  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0155  resolvase domain-containing protein  28.81 
 
 		 510 aa  116  1.0000000000000001e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0303  resolvase domain-containing protein  24.51 
 
 		 548 aa  114  3e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.637835  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1552  resolvase domain-containing protein  26.27 
 
 		 554 aa  114  3e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.914203  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0063  resolvase domain-containing protein  26.27 
 
 		 542 aa  114  4.0000000000000004e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0592  Resolvase domain protein  28.21 
 
 		 462 aa  114  5e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0051  site-specific recombinase  28.98 
 
 		 513 aa  114  6e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.169299  hitchhiker  0.000782563 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1430  Resolvase domain protein  26.9 
 
 		 607 aa  108  3e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3523  resolvase domain protein  26.25 
 
 		 568 aa  107  4e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.876485  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2572  resolvase domain protein  25.87 
 
 		 539 aa  105  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2827  Resolvase domain protein  23.26 
 
 		 509 aa  104  3e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.952038 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4205  resolvase domain protein  25.06 
 
 		 525 aa  102  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2057  Resolvase domain protein  25.14 
 
 		 582 aa  101  4e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0536001  normal  0.0182288 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3805  resolvase-like protein  26.88 
 
 		 526 aa  95.5  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.296715  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0737  resolvase  24.54 
 
 		 542 aa  95.1  3e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0547783  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0698  recombinase  29.41 
 
 		 506 aa  94.4  4e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000998497  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0463  Resolvase domain protein  29.07 
 
 		 475 aa  93.6  8e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0983248  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3989  recombinase  22.33 
 
 		 613 aa  92.8  1e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_215  resolvase domain protein, PinR type  25.65 
 
 		 563 aa  91.7  3e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2499  cassette chromosome recombinase B  26.12 
 
 		 542 aa  88.6  2e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0049  resolvase domain-containing protein  25.79 
 
 		 449 aa  88.6  3e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0050  resolvase domain-containing protein  25.79 
 
 		 449 aa  88.6  3e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6320  resolvase domain protein  29.36 
 
 		 553 aa  87.8  4e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0048  resolvase domain-containing protein  26.12 
 
 		 542 aa  87.8  4e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0049  resolvase domain-containing protein  26.12 
 
 		 542 aa  87.8  4e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1983  resolvase domain-containing protein  24.79 
 
 		 546 aa  87  7e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0800721  normal  0.49542 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2777  recombinase  24.53 
 
 		 441 aa  87  7e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0248  resolvase domain-containing protein  25.54 
 
 		 524 aa  87  7e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.0000541084  hitchhiker  0.00459613 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2498  cassette chromosome recombinase A  25.52 
 
 		 449 aa  85.5  0.000000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1037  resolvase domain-containing protein  24.53 
 
 		 504 aa  85.5  0.000000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00127199  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2975  resolvase domain-containing protein  24.68 
 
 		 516 aa  85.1  0.000000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.539501  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5360  resolvase domain protein  23.31 
 
 		 546 aa  84.7  0.000000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000247289  hitchhiker  0.00000000017806 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5553  resolvase domain protein  22.68 
 
 		 515 aa  84.7  0.000000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.919369999999999e-21 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2926  resolvase domain-containing protein  24.59 
 
 		 441 aa  83.6  0.000000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.855729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1795  resolvase domain protein  29.08 
 
 		 558 aa  83.6  0.000000000000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1297  resolvase domain-containing protein  22.73 
 
 		 555 aa  83.2  0.000000000000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.023509  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1292  ssrA integrase  22.28 
 
 		 550 aa  83.2  0.00000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00290655  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0795  Recombinase  24.05 
 
 		 496 aa  81.6  0.00000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.682484  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0097  resolvase domain-containing protein  36.14 
 
 		 211 aa  81.6  0.00000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.371309  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5598  DNA recombinase, putative  23.36 
 
 		 522 aa  81.3  0.00000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.318471  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5133  Resolvase domain  25.25 
 
 		 539 aa  81.3  0.00000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.880179 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1684  resolvase-like protein  24.04 
 
 		 665 aa  80.5  0.00000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.560816 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1561  resolvase-like protein  25.86 
 
 		 546 aa  79.7  0.0000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.571827 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3976  resolvase domain-containing protein  22.51 
 
 		 415 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0001  recombinase  25.87 
 
 		 539 aa  76.6  0.0000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3078  Resolvase domain protein  23.66 
 
 		 482 aa  76.3  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.244166  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1282  ssrA integrase  22.26 
 
 		 558 aa  75.9  0.000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000313732  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1943  resolvase  22.87 
 
 		 443 aa  75.1  0.000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0594  Resolvase domain protein  26.71 
 
 		 525 aa  74.7  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2949  site-specific recombinase  23.44 
 
 		 479 aa  74.3  0.000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00000000764647  unclonable  0.00000628307 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3150  Resolvase domain protein  24.12 
 
 		 532 aa  74.7  0.000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.617817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2971  resolvase domain-containing protein  26.84 
 
 		 474 aa  73.9  0.000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0952966  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0397  resolvase domain-containing protein  23.76 
 
 		 494 aa  73.6  0.000000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2997  resolvase domain-containing protein  25.97 
 
 		 444 aa  73.6  0.000000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3904  Resolvase domain protein  24.68 
 
 		 460 aa  73.2  0.000000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3998  resolvase domain-containing protein  24.23 
 
 		 521 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3138  resolvase  25.51 
 
 		 561 aa  72.8  0.00000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.741085  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2617  resolvase domain-containing protein  22.25 
 
 		 445 aa  73.2  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0540166  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2668  resolvase domain-containing protein  22.44 
 
 		 445 aa  72.8  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2857  resolvase domain-containing protein  23.86 
 
 		 445 aa  72.8  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.564499  normal  0.264008 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4193  Resolvase domain  25.61 
 
 		 555 aa  71.2  0.00000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.384127 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1563  resolvase domain-containing protein  26.67 
 
 		 540 aa  70.5  0.00000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.681987  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0859  Resolvase domain  25.17 
 
 		 544 aa  69.7  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.367879  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0102  resolvase domain-containing protein  21.26 
 
 		 537 aa  68.6  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218605 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0568  recombinase  23.29 
 
 		 547 aa  68.9  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.816013  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2081  recombinase  25.29 
 
 		 441 aa  68.9  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0665131 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1935  site-specific recombinase  22.78 
 
 		 528 aa  66.6  0.0000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1738  Resolvase domain  28.69 
 
 		 505 aa  66.2  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0204025 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0896  site-specific recombinase  23.76 
 
 		 527 aa  66.6  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1942  Resolvase domain protein  22.51 
 
 		 561 aa  66.6  0.000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2797  Resolvase domain protein  22.68 
 
 		 525 aa  66.2  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.501781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2219  recombinase  22.59 
 
 		 541 aa  66.2  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.543065  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2420  site-specific recombinase  23.97 
 
 		 479 aa  66.6  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.450706 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3247  putative site-specific integrase protein  23.12 
 
 		 462 aa  65.9  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.964648 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2591  Resolvase domain protein  23.14 
 
 		 490 aa  65.1  0.000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0023015  hitchhiker  0.000000886482 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1368  recombinase  25.16 
 
 		 453 aa  65.5  0.000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.118986  normal  0.794966 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1486  resolvase domain-containing protein  22.17 
 
 		 485 aa  64.7  0.000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0898  resolvase domain-containing protein  21.07 
 
 		 586 aa  64.7  0.000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3776  recombinase  23.29 
 
 		 528 aa  64.7  0.000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.902088  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7341  Resolvase domain protein  26.55 
 
 		 295 aa  63.5  0.000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7321  putative resolvase  21.88 
 
 		 518 aa  63.9  0.000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.988127  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0845  Resolvase domain protein  29.36 
 
 		 252 aa  63.9  0.000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000678199  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1741  Resolvase domain  26.94 
 
 		 228 aa  62.8  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1227  resolvase domain-containing protein  23.81 
 
 		 441 aa  63.2  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.254859 
 
 
-
 
NC_002978  WD0634  prophage LambdaW5, site-specific recombinase resolvase family protein  23.79 
 
 		 489 aa  62.4  0.00000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0891  putative site-specific integrase/recombinase protein  21.55 
 
 		 460 aa  62.4  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2351  resolvase-like protein  30.4 
 
 		 235 aa  62  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.329475 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1155  recombinase  22.96 
 
 		 343 aa  62  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5555  integrase  27.11 
 
 		 272 aa  62.4  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.14894e-26 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0796  recombinase  28.29 
 
 		 421 aa  62  0.00000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0974  Resolvase domain protein  25.16 
 
 		 513 aa  61.6  0.00000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2087  recombinase  20.11 
 
 		 447 aa  61.6  0.00000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0591459 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5572  recombinase  28.12 
 
 		 479 aa  61.2  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0686025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5975  recombinase  28.12 
 
 		 479 aa  61.2  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>