83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_2443 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_2443  DNA binding domain protein, excisionase family  100 
 
 
193 aa  386  1e-106  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.453884  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0895  DNA binding domain protein, excisionase family  91.24 
 
 
192 aa  353  5.999999999999999e-97  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2393  DNA binding domain protein, excisionase family  96.37 
 
 
191 aa  353  8.999999999999999e-97  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0911  DNA binding domain protein, excisionase family  91.24 
 
 
192 aa  351  4e-96  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  unclonable  0.00000302589  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2574  DNA binding domain protein, excisionase family  91.71 
 
 
194 aa  351  4e-96  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.235149  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2645  DNA binding domain protein, excisionase family  89.69 
 
 
192 aa  346  9e-95  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2048  Resolvase domain protein  88.66 
 
 
193 aa  341  5e-93  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0322526  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2150  DNA binding domain protein, excisionase family  88.14 
 
 
195 aa  337  4e-92  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1118  Resolvase domain protein  47.5 
 
 
229 aa  166  2e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000220769  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0744  Resolvase domain protein  48 
 
 
229 aa  163  1.0000000000000001e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000000124642  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0272  Resolvase domain protein  47 
 
 
229 aa  162  4.0000000000000004e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000593088  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1111  DNA binding domain-containing protein  45.7 
 
 
215 aa  155  3e-37  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.385151  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2716  DNA binding domain protein, excisionase family  44.33 
 
 
213 aa  154  5.0000000000000005e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.00788025  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1513  DNA binding domain protein, excisionase family  44.33 
 
 
213 aa  154  5.0000000000000005e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1710  resolvase domain-containing protein  42.78 
 
 
222 aa  151  7e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0122  DNA binding domain protein, excisionase family  43.59 
 
 
216 aa  142  3e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0131  DNA binding domain protein, excisionase family  43.59 
 
 
216 aa  142  3e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000948008  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0522  DNA binding domain protein, excisionase family  42.11 
 
 
244 aa  140  9e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0170413  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1070  resolvase domain-containing protein  43.68 
 
 
197 aa  137  7e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.709621  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0390  DNA binding domain protein, excisionase family  42.56 
 
 
216 aa  137  7e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0112175  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0484  DNA binding domain protein, excisionase family  42.56 
 
 
216 aa  137  1e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.114276  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1190  DNA binding domain protein, excisionase family  42.05 
 
 
216 aa  137  1e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0236  Resolvase domain protein  46.03 
 
 
195 aa  135  5e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000223632  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1304  transposon resolvase  39.23 
 
 
209 aa  134  6.0000000000000005e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0311544  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0818  DNA binding domain protein, excisionase family  41.54 
 
 
216 aa  134  9.999999999999999e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0947  Resolvase domain protein  44.44 
 
 
195 aa  132  3e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000151254  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1270  Resolvase domain protein  40.76 
 
 
195 aa  132  3e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0785  Resolvase domain protein  42.93 
 
 
202 aa  131  5e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00525149  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0754  Resolvase domain protein  39.49 
 
 
207 aa  129  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1808  DNA binding domain protein, excisionase family  37 
 
 
219 aa  127  7.000000000000001e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1449  Resolvase domain protein  43.85 
 
 
207 aa  127  8.000000000000001e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0392946  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1911  DNA binding domain-containing protein  41.15 
 
 
216 aa  127  1.0000000000000001e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0941  resolvase domain-containing protein  36.56 
 
 
208 aa  124  6e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0143335  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1174  DNA binding domain protein, excisionase family  37.5 
 
 
219 aa  123  1e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.122691  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1717  regulatory protein MerR  40.93 
 
 
201 aa  123  1e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.212526  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3324  resolvase domain-containing protein  39.8 
 
 
197 aa  120  9.999999999999999e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.296266  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1564  hypothetical protein  38.74 
 
 
215 aa  115  3e-25  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.20655  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0658  hypothetical protein  38.74 
 
 
215 aa  115  3e-25  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1913  Resolvase domain protein  35.23 
 
 
208 aa  110  1.0000000000000001e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0948  site-specific integrase/resolvase  43.8 
 
 
209 aa  109  3e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.531266  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3893  DNA binding domain protein, excisionase family  32.8 
 
 
203 aa  107  7.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3943  DNA binding domain protein, excisionase family  32.8 
 
 
203 aa  107  7.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000130893  normal  0.0337021 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2194  Resolvase domain protein  34.2 
 
 
208 aa  105  4e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.72008  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1219  DNA binding domain protein, excisionase family  33.33 
 
 
201 aa  105  4e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2781  Resolvase domain protein  37.43 
 
 
222 aa  102  4e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.912906 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0851  regulatory protein MerR  36.87 
 
 
222 aa  102  4e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1241  Resolvase domain protein  36.36 
 
 
222 aa  101  9e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0456632  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3670  DNA binding domain-containing protein  36.87 
 
 
201 aa  100  1e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.635315  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0751  Resolvase domain protein  36.9 
 
 
209 aa  100  1e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0842  resolvase domain-containing protein  36.98 
 
 
196 aa  99  4e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.419  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0465  resolvase-like protein  37.08 
 
 
219 aa  95.9  3e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.123984  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2935  Resolvase domain protein  33.85 
 
 
206 aa  94.4  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1000  Resolvase domain protein  33.85 
 
 
206 aa  94.4  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0589477 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2513  Resolvase domain protein  37.57 
 
 
195 aa  92  5e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1105  transposon resolvase  33.52 
 
 
196 aa  87.4  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.600674  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1220  DNA binding domain protein, excisionase family  30.15 
 
 
201 aa  85.5  5e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12805  resolvase  37.78 
 
 
193 aa  80.9  0.00000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00189559  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10939  resolvase  38.13 
 
 
193 aa  80.9  0.00000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2683  resolvase-like protein  32.22 
 
 
190 aa  79.7  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.300522  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5676  resolvase domain-containing protein  32.2 
 
 
190 aa  78.2  0.00000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0684  resolvase domain-containing protein  32.2 
 
 
190 aa  78.2  0.00000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.245344 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1224  putative site-specific integrase-resolvase  34.72 
 
 
197 aa  76.6  0.0000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.997311  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3431  resolvase-like protein  32.2 
 
 
197 aa  75.9  0.0000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1033  transposon resolvase  35.62 
 
 
204 aa  75.1  0.0000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.412274  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12994  resolvase  30.11 
 
 
194 aa  74.3  0.000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000478883  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10616  resolvase  36.92 
 
 
202 aa  72.4  0.000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000496522  normal  0.221326 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2000  DNA binding domain protein, excisionase family  28.28 
 
 
212 aa  71.2  0.000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.27976  normal  0.357405 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1614  resolvase domain-containing protein  30.18 
 
 
182 aa  67.4  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00182311  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13862  resolvase  32.33 
 
 
203 aa  62.4  0.000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2002  regulatory protein, MerR  35.61 
 
 
148 aa  61.6  0.000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5986  resolvase domain-containing protein  33.61 
 
 
162 aa  59.3  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00224994  normal  0.0280728 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2776  putative resolvase  35.96 
 
 
116 aa  57  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.481265  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1891  transposase OrfA  40.98 
 
 
74 aa  53.9  0.000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2258  resolvase domain-containing protein  40.98 
 
 
74 aa  53.1  0.000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.216039  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12900  resolvase  34.92 
 
 
295 aa  48.5  0.00007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0601752  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2288  site-specific integrase-resolvase-like protein  37.68 
 
 
69 aa  48.1  0.00009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1088  resolvase domain-containing protein  28.47 
 
 
227 aa  45.4  0.0005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1548  molybdenum-pterin binding protein  33.33 
 
 
137 aa  45.1  0.0007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.207471  normal  0.138773 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0196  putative site-specific integrase-resolvase, degenerate  39.34 
 
 
63 aa  44.7  0.0008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000193839  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2714  putative cassette chromosome recombinase resolvase, CcrB like  28.26 
 
 
641 aa  44.3  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0173703  normal  0.344103 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1424  Resolvase domain protein  25.53 
 
 
215 aa  42.7  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00141617  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3461  regulatory protein, MerR  33.33 
 
 
128 aa  42  0.006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1960  site-specific integrase-resolvase-like  30.14 
 
 
147 aa  41.6  0.007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.4652  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>