86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_10939 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_10939  resolvase  100 
 
 		 193 aa  383  1e-106  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2513  Resolvase domain protein  56.41 
 
 		 195 aa  218  3.9999999999999997e-56  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12805  resolvase  60.67 
 
 		 193 aa  211  5.999999999999999e-54  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00189559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10616  resolvase  61.02 
 
 		 202 aa  208  3e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000496522  normal  0.221326 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2683  resolvase-like protein  62.15 
 
 		 190 aa  207  1e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.300522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13862  resolvase  60.11 
 
 		 203 aa  203  1e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12994  resolvase  56.08 
 
 		 194 aa  201  7e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000478883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3431  resolvase-like protein  58.48 
 
 		 197 aa  197  7.999999999999999e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0684  resolvase domain-containing protein  61.4 
 
 		 190 aa  197  9e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.245344 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5676  resolvase domain-containing protein  61.4 
 
 		 190 aa  197  9e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1105  transposon resolvase  51.63 
 
 		 196 aa  181  4.0000000000000006e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.600674  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1614  resolvase domain-containing protein  57.76 
 
 		 182 aa  175  4e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00182311  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1224  putative site-specific integrase-resolvase  47.18 
 
 		 197 aa  164  5.9999999999999996e-40  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.997311  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5986  resolvase domain-containing protein  58.74 
 
 		 162 aa  157  1e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00224994  normal  0.0280728 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12900  resolvase  52.91 
 
 		 295 aa  152  2e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0601752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1425  putative resolvase  55.83 
 
 		 126 aa  123  1e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2776  putative resolvase  61.05 
 
 		 116 aa  115  5e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.481265  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1033  transposon resolvase  34.97 
 
 		 204 aa  106  2e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.412274  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1111  DNA binding domain-containing protein  33.15 
 
 		 215 aa  105  6e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.385151  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2716  DNA binding domain protein, excisionase family  31.49 
 
 		 213 aa  103  2e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.00788025  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1513  DNA binding domain protein, excisionase family  31.49 
 
 		 213 aa  103  2e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1241  Resolvase domain protein  39.39 
 
 		 222 aa  97.4  1e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0456632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2935  Resolvase domain protein  32.5 
 
 		 206 aa  95.1  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1000  Resolvase domain protein  32.5 
 
 		 206 aa  95.1  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0589477 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2781  Resolvase domain protein  37.88 
 
 		 222 aa  93.2  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.912906 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0751  Resolvase domain protein  37.88 
 
 		 209 aa  92.8  3e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1710  resolvase domain-containing protein  30.3 
 
 		 222 aa  91.7  6e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0851  regulatory protein MerR  37.12 
 
 		 222 aa  90.9  1e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0522  DNA binding domain protein, excisionase family  35.23 
 
 		 244 aa  90.5  1e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0170413  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1564  hypothetical protein  32.98 
 
 		 215 aa  90.1  2e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.20655  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0272  Resolvase domain protein  35.35 
 
 		 229 aa  90.1  2e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000593088  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0658  hypothetical protein  32.98 
 
 		 215 aa  90.1  2e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2645  DNA binding domain protein, excisionase family  38.69 
 
 		 192 aa  90.1  2e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1118  Resolvase domain protein  35.35 
 
 		 229 aa  89.7  2e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000220769  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0895  DNA binding domain protein, excisionase family  38.69 
 
 		 192 aa  89.4  3e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1913  Resolvase domain protein  30.92 
 
 		 208 aa  89.4  3e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0948  site-specific integrase/resolvase  36.3 
 
 		 209 aa  89  4e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.531266  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0744  Resolvase domain protein  35.86 
 
 		 229 aa  87.4  1e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000000124642  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0818  DNA binding domain protein, excisionase family  34.2 
 
 		 216 aa  87  2e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1190  DNA binding domain protein, excisionase family  33.51 
 
 		 216 aa  86.7  2e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2194  Resolvase domain protein  30.29 
 
 		 208 aa  87  2e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.72008  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0484  DNA binding domain protein, excisionase family  33.68 
 
 		 216 aa  86.7  2e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.114276  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0390  DNA binding domain protein, excisionase family  32.99 
 
 		 216 aa  86.7  2e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0112175  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0131  DNA binding domain protein, excisionase family  32.99 
 
 		 216 aa  86.3  2e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000948008  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0122  DNA binding domain protein, excisionase family  32.99 
 
 		 216 aa  86.3  2e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3324  resolvase domain-containing protein  35.17 
 
 		 197 aa  86.7  2e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.296266  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0465  resolvase-like protein  30.05 
 
 		 219 aa  86.3  3e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.123984  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2150  DNA binding domain protein, excisionase family  36.5 
 
 		 195 aa  85.5  4e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0911  DNA binding domain protein, excisionase family  37.23 
 
 		 192 aa  84  0.000000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  unclonable  0.00000302589  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2048  Resolvase domain protein  36.96 
 
 		 193 aa  84  0.000000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0322526  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0754  Resolvase domain protein  28.37 
 
 		 207 aa  84  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0941  resolvase domain-containing protein  27.03 
 
 		 208 aa  82.8  0.000000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0143335  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2574  DNA binding domain protein, excisionase family  36.69 
 
 		 194 aa  82  0.000000000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.235149  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0236  Resolvase domain protein  31.28 
 
 		 195 aa  81.6  0.000000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000223632  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2443  DNA binding domain protein, excisionase family  38.13 
 
 		 193 aa  81.3  0.000000000000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.453884  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3670  DNA binding domain-containing protein  30.26 
 
 		 201 aa  80.9  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.635315  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0947  Resolvase domain protein  37.12 
 
 		 195 aa  80.5  0.00000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000151254  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1911  DNA binding domain-containing protein  30.65 
 
 		 216 aa  78.2  0.00000000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1070  resolvase domain-containing protein  28.5 
 
 		 197 aa  78.2  0.00000000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.709621  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2000  DNA binding domain protein, excisionase family  32.64 
 
 		 212 aa  77.4  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.27976  normal  0.357405 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1808  DNA binding domain protein, excisionase family  33.16 
 
 		 219 aa  77  0.0000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0785  Resolvase domain protein  34.85 
 
 		 202 aa  77  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00525149  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1449  Resolvase domain protein  36.84 
 
 		 207 aa  77  0.0000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0392946  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1174  DNA binding domain protein, excisionase family  32.85 
 
 		 219 aa  76.6  0.0000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.122691  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1219  DNA binding domain protein, excisionase family  28.57 
 
 		 201 aa  74.3  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2393  DNA binding domain protein, excisionase family  38.69 
 
 		 191 aa  74.3  0.0000000000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1426  site-specific integrase-resolvase-like protein  59.09 
 
 		 81 aa  71.6  0.000000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.765769  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1270  Resolvase domain protein  25.79 
 
 		 195 aa  71.2  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1960  site-specific integrase-resolvase-like  53.12 
 
 		 147 aa  69.3  0.00000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.4652  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3893  DNA binding domain protein, excisionase family  26.09 
 
 		 203 aa  68.9  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3943  DNA binding domain protein, excisionase family  26.09 
 
 		 203 aa  68.9  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000130893  normal  0.0337021 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1304  transposon resolvase  26.15 
 
 		 209 aa  68.6  0.00000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0311544  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2002  regulatory protein, MerR  31.25 
 
 		 148 aa  61.6  0.000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1717  regulatory protein MerR  24.74 
 
 		 201 aa  61.6  0.000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.212526  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0842  resolvase domain-containing protein  28.57 
 
 		 196 aa  57.8  0.00000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3278  resolvase domain-containing protein  32.52 
 
 		 208 aa  54.7  0.0000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.312644  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2921  transposase, IS605 OrfB  64.1 
 
 		 249 aa  51.2  0.000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0840725 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1306  resolvase domain-containing protein  30.08 
 
 		 205 aa  49.7  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.92579  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4533  resolvase domain-containing protein  31.97 
 
 		 214 aa  45.8  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4506  hypothetical protein  47.06 
 
 		 132 aa  45.1  0.0006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4161  Resolvase domain  27.63 
 
 		 206 aa  44.3  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1891  transposase OrfA  34.43 
 
 		 74 aa  44.3  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0298  resolvase, putative  34.38 
 
 		 205 aa  43.5  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0464  regulatory protein MerR  29.17 
 
 		 100 aa  43.5  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.169334 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1220  DNA binding domain protein, excisionase family  20.77 
 
 		 201 aa  43.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6887  resolvase domain-containing protein  31.15 
 
 		 210 aa  42.4  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>