More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2921 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2921  transposase, IS605 OrfB  100 
 
 		 249 aa  503  1e-141  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0840725 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3430  transposase  98.43 
 
 		 442 aa  377  1e-104  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2681  transposase  97.38 
 
 		 261 aa  374  1e-103  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.452621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5677  IS605 family transposase OrfB  82.72 
 
 		 442 aa  314  8e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0685  IS605 family transposase OrfB  85.64 
 
 		 442 aa  314  9e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.289129 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3267  transposase, IS605 OrfB  78.53 
 
 		 356 aa  298  4e-80  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.244566 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2775  transposase, IS605 OrfB  78.01 
 
 		 356 aa  297  1e-79  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.525112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5114  IS605 family transposase OrfB  78.86 
 
 		 461 aa  284  1.0000000000000001e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.279407  normal  0.776114 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1966  transposase, IS605 OrfB  65.05 
 
 		 267 aa  249  3e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1615  IS891/IS1136/IS1341 family transposase  62.91 
 
 		 420 aa  243  1.9999999999999999e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00623083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2297  transposase IS605 OrfB  82.03 
 
 		 192 aa  221  7e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.294637  normal  0.708384 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2200  transposase IS605 OrfB  79.7 
 
 		 134 aa  215  5e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.118819 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3275  transposase  60 
 
 		 405 aa  174  9.999999999999999e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.151083  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3537  transposase, IS605 OrfB family  49.67 
 
 		 393 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0103085 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4920  transposase, IS607 family  49.67 
 
 		 393 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.287144 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2141  transposase, IS605 OrfB family  53.96 
 
 		 363 aa  161  9e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.954173 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2003  IS605 family transposase OrfB  50 
 
 		 409 aa  157  1e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2514  transposase, IS605 OrfB family  51.7 
 
 		 383 aa  153  2e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.969916  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1223  transposase  53.85 
 
 		 440 aa  151  1e-35  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3325  IS605 family transposase OrfB  45.11 
 
 		 399 aa  151  1e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.156682  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1819  transposase, IS605 OrfB family  52.45 
 
 		 410 aa  146  3e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.538618 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5487  IS605 family transposase OrfB  53.38 
 
 		 293 aa  145  5e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.643829  normal  0.289527 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1343  transposase, IS607 family  46.43 
 
 		 393 aa  142  5e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4909  transposase, IS605 OrfB family  51.85 
 
 		 410 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.646541 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1594  transposase  38.76 
 
 		 393 aa  137  1e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0111  transposase, IS605 OrfB family  48.95 
 
 		 410 aa  137  2e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.976081  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5594  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  47.14 
 
 		 381 aa  136  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0815398  normal  0.455176 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0703  transposase, IS605 OrfB  48.57 
 
 		 368 aa  135  4e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0442  transposase  42.24 
 
 		 384 aa  134  9.999999999999999e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000469255  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1554  IS605 family transposase OrfB  50.72 
 
 		 377 aa  133  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.596284 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1017  transposase IS605 OrfB family  52.9 
 
 		 406 aa  134  1.9999999999999998e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.347453  hitchhiker  0.000143802 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1180  transposase, IS605 OrfB family  45.62 
 
 		 399 aa  133  3e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0545445  normal  0.213807 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1914  transposase, IS605 OrfB family  45.62 
 
 		 399 aa  133  3e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.70549 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3044  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  48.57 
 
 		 376 aa  133  3e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.396348  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2895  transposase, IS605 OrfB family  44.83 
 
 		 405 aa  132  5e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.56532  normal  0.682802 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5745  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  47.37 
 
 		 381 aa  132  5e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0857845  normal  0.0649876 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1924  transposase, IS605 OrfB family  48.25 
 
 		 405 aa  132  6e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.304571 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7865  IS605 family transposase OrfB  46.62 
 
 		 381 aa  131  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4039  IS605 family transposase OrfB  47.1 
 
 		 377 aa  131  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0972683 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1563  transposase OrfB  46.36 
 
 		 398 aa  130  2.0000000000000002e-29  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.522288  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0659  transposase OrfB  46.36 
 
 		 398 aa  130  2.0000000000000002e-29  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1829  IS891/IS1136/IS1341 transposase  40.72 
 
 		 403 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2272  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  43.75 
 
 		 391 aa  130  2.0000000000000002e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.641277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2165  IS605 family transposase OrfB  49.28 
 
 		 377 aa  130  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.896467  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1520  transposase  46.94 
 
 		 393 aa  129  3e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1784  IS605 family transposase OrfB  48.55 
 
 		 375 aa  130  3e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.125878  normal  0.304536 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0071  IS891/IS1136/IS1341 transposase  46.43 
 
 		 395 aa  129  5.0000000000000004e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.681722 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12899  transposase  42.79 
 
 		 460 aa  128  7.000000000000001e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0267522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4506  hypothetical protein  77.01 
 
 		 132 aa  128  8.000000000000001e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1391  transposase, IS605 OrfB family  41.83 
 
 		 403 aa  128  9.000000000000001e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000173221  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2243  transposase, IS605 OrfB family  46.41 
 
 		 424 aa  128  9.000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.504985  normal  0.252097 
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2259  IS605 family transposase OrfB  45.7 
 
 		 398 aa  127  1.0000000000000001e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.495382  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3202  transposase, IS605 OrfB family  41.62 
 
 		 390 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.860584  normal  0.719364 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1376  transposase, IS605 OrfB family  42.14 
 
 		 391 aa  126  3e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.158654  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0401  transposase  45.32 
 
 		 402 aa  126  4.0000000000000003e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1425  IS605 family transposase OrfB  40 
 
 		 435 aa  124  1e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1346  transposase, IS605 OrfB family  42.03 
 
 		 391 aa  124  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4226  IS605 family transposase OrfB  42.75 
 
 		 408 aa  124  2e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4201  transposase, IS605 OrfB family  39.31 
 
 		 403 aa  123  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1266  IS605 family transposase OrfB  42.94 
 
 		 292 aa  124  2e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1309  transposase  44.68 
 
 		 427 aa  124  2e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.231489  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2543  transposase  44.68 
 
 		 390 aa  124  2e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1565  ISCpe2, transposase orfB  38.89 
 
 		 384 aa  122  4e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2846  transposase, IS605 OrfB family  44.29 
 
 		 369 aa  122  4e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3000  transposase, IS605 OrfB family  44.29 
 
 		 369 aa  122  4e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000628392  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0190  transposase, IS605 OrfB family  44.29 
 
 		 369 aa  122  4e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2039  transposase, IS605 OrfB family  44.29 
 
 		 369 aa  122  4e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2178  transposase, IS605 OrfB family  44.29 
 
 		 369 aa  122  4e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0889  ISCpe2, transposase orfB  38.89 
 
 		 384 aa  123  4e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.688854  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1098  transposase, IS605 OrfB family  38.2 
 
 		 403 aa  122  5e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4435  transposase, IS605 OrfB family  38.2 
 
 		 403 aa  122  5e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1127  transposase, IS605 OrfB family  38.2 
 
 		 403 aa  122  5e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.319632 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4240  transposase, IS605 OrfB family  38.2 
 
 		 403 aa  122  5e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142269 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3168  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  45.65 
 
 		 381 aa  122  5e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0245  ISCpe2, transposase orfB  38.89 
 
 		 384 aa  122  5e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0772  ISCpe2, transposase orfB  38.89 
 
 		 383 aa  122  6e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0168  ISCpe2, transposase orfB  38.89 
 
 		 384 aa  122  7e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0723  ISCpe2, transposase orfB  38.26 
 
 		 384 aa  121  9e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1031  ISCpe2, transposase orfB  38.89 
 
 		 384 aa  121  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0491139  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0989  ISCpe2, transposase orfB  38.89 
 
 		 384 aa  121  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1583  ISCpe2, transposase orfB  38.89 
 
 		 384 aa  121  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0166589  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3220  transposase, IS605 OrfB family  44.2 
 
 		 404 aa  121  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0126  ISCpe2, transposase orfB  38.89 
 
 		 384 aa  121  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2900  transposase, IS605 OrfB family  44.2 
 
 		 404 aa  121  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.355417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0472  ISCpe2, transposase orfB  38.89 
 
 		 384 aa  121  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0547  ISCpe2, transposase orfB  38.89 
 
 		 384 aa  121  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0626  ISCpe2, transposase orfB  38.89 
 
 		 384 aa  121  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.202409  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2965  transposase, IS605 OrfB family  41.3 
 
 		 405 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0711  ISCpe2, transposase orfB  38.19 
 
 		 384 aa  120  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.489014  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2689  transposase, IS605 OrfB family  44.2 
 
 		 373 aa  119  3e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.104678  normal  0.242406 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0348  IS605 family transposase OrfB  36.41 
 
 		 362 aa  120  3e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0991817  normal  0.583483 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3471  IS605 family transposase  38 
 
 		 370 aa  120  3e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0155497  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3700  transposase, IS605 family  38 
 
 		 370 aa  120  3e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000048938 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12804  transposase  45 
 
 		 459 aa  120  3e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00653678  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0499  transposase  45.14 
 
 		 450 aa  120  3e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1505  transposase  45.14 
 
 		 392 aa  120  3e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.606196  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2768  transposase  48.09 
 
 		 392 aa  120  3e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000132039  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3745  IS605 family transposase  38 
 
 		 370 aa  120  3e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0235026  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2218  transposase  43.26 
 
 		 392 aa  119  3.9999999999999996e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12993  transposase  44.44 
 
 		 459 aa  119  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000000929698  normal  0.662784 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>