84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_2645 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_2645  DNA binding domain protein, excisionase family  100 
 
 
192 aa  384  1e-106  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0895  DNA binding domain protein, excisionase family  98.44 
 
 
192 aa  379  1e-104  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0911  DNA binding domain protein, excisionase family  95.31 
 
 
192 aa  371  1e-102  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  unclonable  0.00000302589  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2150  DNA binding domain protein, excisionase family  94.79 
 
 
195 aa  364  1e-100  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2574  DNA binding domain protein, excisionase family  92.75 
 
 
194 aa  362  2e-99  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.235149  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2048  Resolvase domain protein  93.26 
 
 
193 aa  358  3e-98  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0322526  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2443  DNA binding domain protein, excisionase family  89.69 
 
 
193 aa  346  9e-95  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.453884  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2393  DNA binding domain protein, excisionase family  88.54 
 
 
191 aa  328  2e-89  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1118  Resolvase domain protein  47.45 
 
 
229 aa  168  5e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000220769  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0272  Resolvase domain protein  47.45 
 
 
229 aa  167  8e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000593088  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0744  Resolvase domain protein  47.96 
 
 
229 aa  164  6.9999999999999995e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000000124642  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1513  DNA binding domain protein, excisionase family  44.33 
 
 
213 aa  163  1.0000000000000001e-39  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2716  DNA binding domain protein, excisionase family  44.33 
 
 
213 aa  163  1.0000000000000001e-39  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.00788025  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1111  DNA binding domain-containing protein  43.84 
 
 
215 aa  163  1.0000000000000001e-39  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.385151  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1710  resolvase domain-containing protein  44.33 
 
 
222 aa  155  4e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0484  DNA binding domain protein, excisionase family  44.62 
 
 
216 aa  149  3e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.114276  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0122  DNA binding domain protein, excisionase family  45.64 
 
 
216 aa  148  4e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0131  DNA binding domain protein, excisionase family  45.64 
 
 
216 aa  148  4e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000948008  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0522  DNA binding domain protein, excisionase family  44.1 
 
 
244 aa  147  8e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0170413  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0390  DNA binding domain protein, excisionase family  44.62 
 
 
216 aa  147  9e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0112175  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1190  DNA binding domain protein, excisionase family  44.62 
 
 
216 aa  146  2.0000000000000003e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0818  DNA binding domain protein, excisionase family  44.1 
 
 
216 aa  144  7.0000000000000006e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1070  resolvase domain-containing protein  45.51 
 
 
197 aa  142  3e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.709621  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0236  Resolvase domain protein  46.03 
 
 
195 aa  141  5e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000223632  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0947  Resolvase domain protein  44.44 
 
 
195 aa  139  3e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000151254  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0785  Resolvase domain protein  43.35 
 
 
202 aa  136  2e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00525149  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1304  transposon resolvase  40.88 
 
 
209 aa  135  4e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0311544  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1449  Resolvase domain protein  43.85 
 
 
207 aa  135  4e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0392946  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1808  DNA binding domain protein, excisionase family  41 
 
 
219 aa  133  9.999999999999999e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1911  DNA binding domain-containing protein  43.07 
 
 
216 aa  131  6e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1270  Resolvase domain protein  39.13 
 
 
195 aa  128  5.0000000000000004e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0754  Resolvase domain protein  38.27 
 
 
207 aa  128  5.0000000000000004e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1174  DNA binding domain protein, excisionase family  39.5 
 
 
219 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.122691  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1717  regulatory protein MerR  44.32 
 
 
201 aa  125  3e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.212526  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0941  resolvase domain-containing protein  35.48 
 
 
208 aa  125  5e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0143335  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3324  resolvase domain-containing protein  39.8 
 
 
197 aa  122  2e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.296266  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1913  Resolvase domain protein  38.34 
 
 
208 aa  118  4.9999999999999996e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0658  hypothetical protein  38.14 
 
 
215 aa  117  7.999999999999999e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1564  hypothetical protein  38.14 
 
 
215 aa  117  7.999999999999999e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.20655  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2194  Resolvase domain protein  37.82 
 
 
208 aa  113  1.0000000000000001e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.72008  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0948  site-specific integrase/resolvase  43.26 
 
 
209 aa  112  5e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.531266  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3943  DNA binding domain protein, excisionase family  32.99 
 
 
203 aa  111  6e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000130893  normal  0.0337021 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3893  DNA binding domain protein, excisionase family  32.99 
 
 
203 aa  111  6e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0842  resolvase domain-containing protein  38.61 
 
 
196 aa  109  3e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.419  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1219  DNA binding domain protein, excisionase family  33.84 
 
 
201 aa  108  5e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3670  DNA binding domain-containing protein  36.87 
 
 
201 aa  103  2e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.635315  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0851  regulatory protein MerR  35.38 
 
 
222 aa  103  2e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2781  Resolvase domain protein  35.9 
 
 
222 aa  103  2e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.912906 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1241  Resolvase domain protein  36.08 
 
 
222 aa  102  3e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0456632  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0465  resolvase-like protein  35.6 
 
 
219 aa  102  4e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.123984  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0751  Resolvase domain protein  35.9 
 
 
209 aa  102  5e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2513  Resolvase domain protein  36.9 
 
 
195 aa  99.8  2e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1105  transposon resolvase  34.27 
 
 
196 aa  98.2  7e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.600674  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2935  Resolvase domain protein  33.85 
 
 
206 aa  96.7  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1000  Resolvase domain protein  33.85 
 
 
206 aa  96.7  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0589477 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12805  resolvase  41.35 
 
 
193 aa  95.1  5e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00189559  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2683  resolvase-like protein  34.83 
 
 
190 aa  93.2  2e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.300522  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0684  resolvase domain-containing protein  34.29 
 
 
190 aa  91.7  6e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.245344 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5676  resolvase domain-containing protein  34.29 
 
 
190 aa  91.7  6e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1220  DNA binding domain protein, excisionase family  29.29 
 
 
201 aa  90.1  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10939  resolvase  38.69 
 
 
193 aa  89.7  2e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3431  resolvase-like protein  33.71 
 
 
197 aa  87.4  1e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12994  resolvase  32.18 
 
 
194 aa  87.4  1e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000478883  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1224  putative site-specific integrase-resolvase  34.51 
 
 
197 aa  87.4  1e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.997311  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10616  resolvase  40.62 
 
 
202 aa  86.7  2e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000496522  normal  0.221326 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1033  transposon resolvase  35.21 
 
 
204 aa  84.3  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.412274  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1614  resolvase domain-containing protein  31.14 
 
 
182 aa  79.3  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00182311  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13862  resolvase  34.88 
 
 
203 aa  75.9  0.0000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2000  DNA binding domain protein, excisionase family  28.72 
 
 
212 aa  72  0.000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.27976  normal  0.357405 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5986  resolvase domain-containing protein  36.67 
 
 
162 aa  70.9  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00224994  normal  0.0280728 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2002  regulatory protein, MerR  36.03 
 
 
148 aa  68.9  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2776  putative resolvase  39.77 
 
 
116 aa  63.5  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.481265  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12900  resolvase  37.8 
 
 
295 aa  63.2  0.000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0601752  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1191  Resolvase domain protein  24 
 
 
205 aa  60.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1218  resolvase domain protein  24 
 
 
205 aa  58.9  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1891  transposase OrfA  41.54 
 
 
74 aa  52  0.000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2258  resolvase domain-containing protein  42.62 
 
 
74 aa  50.4  0.00001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.216039  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0196  putative site-specific integrase-resolvase, degenerate  37.7 
 
 
63 aa  45.8  0.0004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000193839  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3461  regulatory protein, MerR  34.62 
 
 
128 aa  45.1  0.0006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1426  site-specific integrase-resolvase-like protein  33.33 
 
 
81 aa  44.7  0.0008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.765769  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1548  molybdenum-pterin binding protein  35.42 
 
 
137 aa  44.3  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.207471  normal  0.138773 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2288  site-specific integrase-resolvase-like protein  35.82 
 
 
69 aa  43.9  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0071  hypothetical protein  40 
 
 
326 aa  41.2  0.009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00119952  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0545  hypothetical protein  33.71 
 
 
186 aa  41.2  0.01  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0606652 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>