43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3366 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_3366  DNA binding domain protein, excisionase family  100 
 
 
71 aa  142  1e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1504  DNA binding domain protein, excisionase family  50 
 
 
77 aa  75.5  0.0000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0579  hypothetical protein  34.29 
 
 
79 aa  51.6  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0276  excisionase family DNA binding domain-containing protein  34.29 
 
 
73 aa  51.2  0.000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.42155  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6709  DNA binding domain protein, excisionase family  32.79 
 
 
72 aa  48.9  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4926  merR family DNA-binding response regulator  42.31 
 
 
192 aa  48.1  0.00004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2699  excisionase/Xis, DNA-binding  39.58 
 
 
67 aa  48.1  0.00004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5016  DNA binding domain protein, excisionase family  39.58 
 
 
64 aa  47.8  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0258  DNA binding domain-containing protein  39.58 
 
 
74 aa  47.8  0.00005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.453374  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4424  DNA binding domain protein, excisionase family  36.54 
 
 
68 aa  47.4  0.00007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4511  DNA binding domain-containing protein  32.39 
 
 
88 aa  47  0.00009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.812065  hitchhiker  0.00570166 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4091  DNA binding domain-containing protein  35.85 
 
 
90 aa  46.6  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.446784 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1619  DNA-binding response regulator  37.25 
 
 
185 aa  46.2  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.208637  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1042  DNA binding domain protein, excisionase family  47.62 
 
 
82 aa  46.6  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0931  DNA binding domain protein, excisionase family  34.55 
 
 
68 aa  46.6  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0819  DNA binding domain-containing protein, excisionase family  37.5 
 
 
65 aa  45.8  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0693  DNA binding domain protein, excisionase family  38 
 
 
79 aa  45.1  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0633565  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3943  DNA binding domain protein, excisionase family  32.81 
 
 
203 aa  44.3  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000130893  normal  0.0337021 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3893  DNA binding domain protein, excisionase family  32.81 
 
 
203 aa  44.3  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0301  DNA binding domain protein, excisionase family  34.69 
 
 
67 aa  43.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0161  DNA binding domain-containing protein  38.3 
 
 
69 aa  43.5  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.177228  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4676  DNA binding domain protein, excisionase family  43.59 
 
 
80 aa  43.5  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.272297  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0170  DNA binding domain-containing protein  38.3 
 
 
69 aa  43.5  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.996607  hitchhiker  0.0018108 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2068  DNA binding domain-containing protein  36.17 
 
 
69 aa  42.4  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03000  DNA-binding protein, excisionase family  32 
 
 
69 aa  42.7  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.17033  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0733  response regulator receiver protein  44.68 
 
 
215 aa  42.4  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8997  hypothetical protein  34.69 
 
 
67 aa  42.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.944138  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0294  DNA binding domain protein, excisionase family  34.69 
 
 
67 aa  42  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4391  DNA binding domain protein, excisionase family  36.17 
 
 
67 aa  42  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3348  excisionase family DNA binding domain-containing protein  34.69 
 
 
67 aa  42  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.401166 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2751  excisionase/Xis, DNA-binding  36.17 
 
 
67 aa  42  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0704152  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2000  DNA binding domain protein, excisionase family  34 
 
 
212 aa  41.6  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.27976  normal  0.357405 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2905  DNA binding domain protein, excisionase family  34.62 
 
 
71 aa  42  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.616527  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7205  DNA binding domain-containing protein  36.17 
 
 
68 aa  41.6  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0300475  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0099  excisionase/Xis, DNA-binding  36.17 
 
 
68 aa  41.6  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.51311 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5979  DNA binding domain-containing protein, excisionase family  35.42 
 
 
75 aa  41.2  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.553184 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3086  DNA binding domain protein, excisionase family  29.31 
 
 
69 aa  41.2  0.005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08990  DNA-binding protein, excisionase family  36.36 
 
 
72 aa  40.8  0.006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.269526  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3670  DNA binding domain-containing protein  36.17 
 
 
201 aa  40.8  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.635315  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1220  DNA binding domain protein, excisionase family  38.3 
 
 
201 aa  40.8  0.007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1219  DNA binding domain protein, excisionase family  34.04 
 
 
201 aa  40.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6401  DNA binding domain protein, excisionase family  41.67 
 
 
279 aa  40.4  0.009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.566174  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2349  DNA binding domain protein, excisionase family  31.91 
 
 
79 aa  40.4  0.009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>