23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_2705 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_2705  DNA binding domain protein, excisionase family  100 
 
 		 75 aa  154  4e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0720  DNA binding domain-containing protein  45.1 
 
 		 129 aa  49.3  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.60238  normal  0.0504983 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4598  DNA binding domain protein, excisionase family  45.28 
 
 		 76 aa  47  0.00009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0230  DNA binding domain-containing protein  41.18 
 
 		 59 aa  46.2  0.0001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.016519 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2614  phage transcriptional regulator, AlpA  42.31 
 
 		 75 aa  44.3  0.0005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.317776 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0957  excision promoter, Xis  35.94 
 
 		 69 aa  44.3  0.0006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.392434  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0842  resolvase domain-containing protein  33.33 
 
 		 196 aa  44.3  0.0006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1829  DNA binding domain-containing protein  35.59 
 
 		 109 aa  43.9  0.0007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3757  excisionase/Xis, DNA-binding  42 
 
 		 58 aa  43.9  0.0008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0156  DNA binding domain-containing protein  40.35 
 
 		 70 aa  43.5  0.0009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000704193 
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2158  DNA binding domain protein, excisionase family  44.9 
 
 		 206 aa  43.1  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1790  DNA binding domain-containing protein  37.74 
 
 		 155 aa  43.5  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2705  excisionase/Xis, DNA-binding  35.48 
 
 		 77 aa  42  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.34571  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0343  DNA binding domain protein, excisionase family  38.78 
 
 		 66 aa  41.6  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0484  DNA binding domain-containing protein  37.93 
 
 		 67 aa  42  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.111356  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0279  DNA binding domain-containing protein  34.85 
 
 		 89 aa  41.6  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.908043  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0399  DNA binding domain protein  42.55 
 
 		 70 aa  41.2  0.005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.687205 
 
 
-
 
NC_013596  Sros_9401  hypothetical protein  39.66 
 
 		 74 aa  41.2  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0933  DNA binding domain protein  38.18 
 
 		 73 aa  40.8  0.006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5016  DNA binding domain protein, excisionase family  34.43 
 
 		 64 aa  40.8  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2421  DNA binding domain-containing protein  46.67 
 
 		 137 aa  40.4  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00439934  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1809  excisionase/Xis, DNA-binding  46.67 
 
 		 137 aa  40.4  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.202545  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2677  DNA binding domain protein, excisionase family  35.59 
 
 		 248 aa  40.4  0.008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000367572  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>