More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET0076 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET0076  resolvase domain-containing protein  100 
 
 		 205 aa  427  1e-119  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0254  resolvase domain-containing protein  50.93 
 
 		 211 aa  208  5e-53  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0277  resolvase domain-containing protein  50.93 
 
 		 211 aa  208  5e-53  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0887  resolvase domain-containing protein  50.93 
 
 		 211 aa  208  5e-53  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0073  resolvase domain-containing protein  50.93 
 
 		 211 aa  208  5e-53  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5360  resolvase domain protein  37.97 
 
 		 546 aa  104  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000247289  hitchhiker  0.00000000017806 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1298  resolvase domain-containing protein  33.54 
 
 		 205 aa  102  4e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0238352  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1138  resolvase-like protein  37.11 
 
 		 207 aa  100  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00747364  normal  0.0234159 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1293  DNA invertase/resolvase  32.91 
 
 		 194 aa  98.6  6e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00017233  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4253  resolvase-like protein  37.35 
 
 		 201 aa  96.3  3e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.35703  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4263  resolvase-like protein  37.35 
 
 		 201 aa  96.3  3e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3998  resolvase domain-containing protein  36.48 
 
 		 521 aa  95.9  4e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4154  resolvase domain-containing protein  41.72 
 
 		 199 aa  95.5  5e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0235  resolvase domain-containing protein  40.94 
 
 		 187 aa  95.5  5e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0409  resolvase domain-containing protein  41.72 
 
 		 186 aa  95.1  7e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00000318958  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2896  resolvase-like protein  35.5 
 
 		 206 aa  94.7  8e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.232346  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1397  invertase/recombinase like protein  38.51 
 
 		 176 aa  94.4  1e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.777573 
 
 
-
 
NC_007617  Nmul_D2813  resolvase-like protein  40.88 
 
 		 184 aa  94  1e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.493253  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2668  helix-turn-helix, Fis-type  40.94 
 
 		 204 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00804941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1568  helix-turn-helix, Fis-type  40.94 
 
 		 204 aa  93.6  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0854  invertase/recombinase like protein  38.51 
 
 		 198 aa  92.8  3e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.160403  normal  0.816153 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2362  DNA-invertase  37.27 
 
 		 188 aa  93.2  3e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0592  Resolvase domain protein  34.42 
 
 		 462 aa  92.8  3e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2944  resolvase domain-containing protein  40.65 
 
 		 307 aa  92.4  4e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.857733  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2702  resolvase domain-containing protein  40.65 
 
 		 307 aa  92.4  4e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.264305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4386  resolvase  38.1 
 
 		 219 aa  90.9  1e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5126  Resolvase domain protein  36.7 
 
 		 197 aa  90.1  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.114051 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2757  resolvase domain-containing protein  41.18 
 
 		 188 aa  89.4  4e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0019  ISSod9, DNA-invertase  40.82 
 
 		 185 aa  88.6  5e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0170  ISSod9, DNA-invertase  40.82 
 
 		 185 aa  88.6  5e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.579928  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6748  resolvase domain-containing protein  34.21 
 
 		 201 aa  89  5e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.167425 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5431  Resolvase domain protein  38.51 
 
 		 185 aa  88.2  8e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.318584  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3031  DNA-invertase  41.18 
 
 		 197 aa  88.2  8e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130363 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0348  Resolvase domain protein  40.15 
 
 		 209 aa  87.4  1e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2392  Resolvase domain  35.47 
 
 		 197 aa  87.4  1e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000064315  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2147  Resolvase domain protein  36.18 
 
 		 191 aa  86.7  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4249  resolvase domain-containing protein  36.18 
 
 		 191 aa  86.7  2e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.251845 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0991  resolvase domain-containing protein  36.36 
 
 		 205 aa  86.3  3e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0378771  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3045  Resolvase domain protein  39.22 
 
 		 189 aa  86.7  3e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.436524  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4685  resolvase domain-containing protein  39.35 
 
 		 193 aa  85.9  4e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0052  hypothetical protein  32.32 
 
 		 201 aa  85.5  4e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6634  resolvase domain-containing protein  36.77 
 
 		 198 aa  85.9  4e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000708994  hitchhiker  0.0000367715 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0466  resolvase  38.1 
 
 		 193 aa  85.9  4e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.736746  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3683  resolvase domain-containing protein  39.74 
 
 		 215 aa  85.9  4e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2489  Resolvase domain protein  39.87 
 
 		 184 aa  85.5  5e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.243262  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25950  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  34.25 
 
 		 195 aa  85.5  5e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1403  resolvase domain-containing protein  38.93 
 
 		 185 aa  85.1  7e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.749996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1099  resolvase domain-containing protein  35.85 
 
 		 212 aa  85.1  7e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2154  Resolvase domain protein  39.86 
 
 		 185 aa  85.1  7e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.478214  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3474  resolvase domain-containing protein  37.58 
 
 		 188 aa  84.7  8e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1562  recombinase  39.62 
 
 		 188 aa  84.7  9e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0302  DNA-invertase  39.87 
 
 		 184 aa  84.7  9e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.623719 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3694  resolvase domain-containing protein  38.51 
 
 		 206 aa  84  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1202  resolvase domain-containing protein  36.94 
 
 		 194 aa  84.3  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5424  Resolvase domain  36.24 
 
 		 194 aa  83.6  0.000000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5457  hypothetical protein  36.24 
 
 		 194 aa  83.6  0.000000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1283  DNA invertase/resolvase  28.22 
 
 		 200 aa  83.6  0.000000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000215115  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4383  resolvase  37.58 
 
 		 193 aa  83.2  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4320  hypothetical protein  34.13 
 
 		 293 aa  83.6  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.264253 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3714  resolvase domain-containing protein  38.61 
 
 		 188 aa  83.2  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.566828  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2396  resolvase domain-containing protein  39.46 
 
 		 163 aa  82.8  0.000000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.718289  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0486  Resolvase domain protein  34.19 
 
 		 515 aa  82.4  0.000000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.325495  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2332  resolvase domain-containing protein  33.55 
 
 		 227 aa  82.4  0.000000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0095  resolvase domain-containing protein  35.67 
 
 		 189 aa  82.4  0.000000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.386301 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0167  resolvase domain-containing protein  33.94 
 
 		 196 aa  82.4  0.000000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2312  Resolvase domain  36 
 
 		 201 aa  82.4  0.000000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3440  invertase/recombinase protein  37.01 
 
 		 188 aa  82  0.000000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.115695  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6608  resolvase domain-containing protein  37.97 
 
 		 189 aa  81.6  0.000000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.525053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0068  resolvase  33.16 
 
 		 181 aa  81.6  0.000000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0902003  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0010  resolvase  38.51 
 
 		 185 aa  81.3  0.000000000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0319649  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5190  resolvase domain-containing protein  32.67 
 
 		 191 aa  81.3  0.000000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000411755  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0233  resolvase  34.15 
 
 		 183 aa  81.3  0.000000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0202  resolvase  34.15 
 
 		 183 aa  81.3  0.000000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0108  hypothetical protein  35.67 
 
 		 309 aa  81.3  0.000000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4272  resolvase-like protein  39.09 
 
 		 149 aa  81.3  0.000000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.299836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4123  resolvase domain-containing protein  37.84 
 
 		 185 aa  81.3  0.000000000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0694671 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2347  Resolvase domain protein  36.24 
 
 		 204 aa  80.9  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3007  resolvase-like protein  36.24 
 
 		 204 aa  80.9  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0154323 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4042  serine-based site-specific recombinase activity  36.24 
 
 		 204 aa  80.9  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.890679  normal  0.169813 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4975  serine-based site-specific recombinase activity  36.24 
 
 		 204 aa  80.9  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.283487  normal  0.35895 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0585  resolvase-like protein  39.39 
 
 		 189 aa  80.5  0.00000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.698292  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1645  resolvase-like protein  36.05 
 
 		 213 aa  80.1  0.00000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.27327  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0463  Resolvase domain protein  32.91 
 
 		 475 aa  79.3  0.00000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0983248  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9833  Resolvase Protein  37.58 
 
 		 210 aa  79  0.00000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1503  resolvase  38.04 
 
 		 182 aa  78.6  0.00000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.236013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2971  resolvase domain-containing protein  32.41 
 
 		 474 aa  78.2  0.00000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0952966  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4835  Resolvase domain protein  38.85 
 
 		 201 aa  78.2  0.00000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.291279 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2172  recombinase  31.66 
 
 		 214 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0678128  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1093  Resolvase domain  36.3 
 
 		 196 aa  77.8  0.0000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.531001  normal  1 
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4382  resolvase domain-containing protein  28.14 
 
 		 194 aa  77.8  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3570  resolvase domain-containing protein  37.12 
 
 		 197 aa  76.6  0.0000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3501  resolvase domain-containing protein  36.99 
 
 		 324 aa  77  0.0000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.654072  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4357  resolvase-like protein  37.66 
 
 		 309 aa  76.6  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5037  resolvase domain-containing protein  37.18 
 
 		 201 aa  77.4  0.0000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.931406  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5704  resolvase domain-containing protein  35 
 
 		 283 aa  77  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3594  resolvase domain-containing protein  41.22 
 
 		 197 aa  76.3  0.0000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.260682  hitchhiker  0.00636554 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4084  resolvase domain-containing protein  33.76 
 
 		 188 aa  76.3  0.0000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.236689  normal  0.0346573 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3748  resolvase domain-containing protein  34.13 
 
 		 293 aa  76.3  0.0000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.57685  normal  0.861996 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1052  Resolvase domain  35.29 
 
 		 186 aa  75.9  0.0000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03270  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  33.55 
 
 		 426 aa  75.9  0.0000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.99262 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>