176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2057 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_2057  Resolvase domain protein  100 
 
 		 582 aa  1192    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0536001  normal  0.0182288 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1430  Resolvase domain protein  45.58 
 
 		 607 aa  457  1e-127  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0910  recombinase  36.1 
 
 		 743 aa  327  3e-88  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1250  resolvase  25.64 
 
 		 524 aa  138  3.0000000000000003e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4182  resolvase domain-containing protein  28.31 
 
 		 579 aa  118  3e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.86871  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1942  Resolvase domain protein  27.51 
 
 		 561 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3138  resolvase  26.16 
 
 		 561 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.741085  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4193  Resolvase domain  28.19 
 
 		 555 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.384127 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0568  recombinase  27.13 
 
 		 547 aa  113  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.816013  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2851  resolvase domain-containing protein  26.87 
 
 		 565 aa  112  2.0000000000000002e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.437901 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0430  putative resolvase  27.73 
 
 		 540 aa  109  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0212047  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1552  resolvase domain-containing protein  24.46 
 
 		 554 aa  106  1e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.914203  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0063  resolvase domain-containing protein  24.56 
 
 		 542 aa  105  2e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1292  ssrA integrase  29.21 
 
 		 550 aa  105  2e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00290655  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1297  resolvase domain-containing protein  29.21 
 
 		 555 aa  105  2e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.023509  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3384  resolvase domain-containing protein  26.79 
 
 		 590 aa  104  4e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0980736 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3109  resolvase  34.45 
 
 		 377 aa  103  7e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3963  recombinase  25.14 
 
 		 493 aa  101  5e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.636106  normal  0.385317 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2827  Resolvase domain protein  26.53 
 
 		 509 aa  99.4  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.952038 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0277  resolvase domain-containing protein  27.39 
 
 		 551 aa  99.4  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.738521  normal  0.0325045 
 
 
-
 
NC_002936  DET0155  resolvase domain-containing protein  23.25 
 
 		 510 aa  98.6  3e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7321  putative resolvase  28.35 
 
 		 518 aa  98.2  4e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.988127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0102  resolvase domain-containing protein  28.03 
 
 		 537 aa  97.1  9e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218605 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4205  resolvase domain protein  24.71 
 
 		 525 aa  92.8  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3805  resolvase-like protein  25.6 
 
 		 526 aa  92  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.296715  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0594  Resolvase domain protein  24.05 
 
 		 525 aa  91.7  4e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0303  resolvase domain-containing protein  24.84 
 
 		 548 aa  90.9  7e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.637835  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1282  ssrA integrase  27.09 
 
 		 558 aa  89.7  1e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000313732  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0706  Resolvase domain protein  26.46 
 
 		 534 aa  89  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.995743 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0770  Resolvase domain protein  26.01 
 
 		 537 aa  89  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.872914  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1216  Resolvase domain protein  26.15 
 
 		 534 aa  89  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.766992  hitchhiker  0.00144818 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3523  resolvase domain protein  24.14 
 
 		 568 aa  88.6  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.876485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2975  resolvase domain-containing protein  26.3 
 
 		 516 aa  87.8  5e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.539501  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1034  Resolvase domain protein  25.41 
 
 		 534 aa  87  8e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2572  resolvase domain protein  24.84 
 
 		 539 aa  86.7  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0817  Resolvase domain protein  25.93 
 
 		 534 aa  86.3  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0231  resolvase domain-containing protein  21.88 
 
 		 519 aa  86.7  0.000000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.829739  normal  0.106092 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0248  resolvase domain-containing protein  25.26 
 
 		 524 aa  86.7  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.0000541084  hitchhiker  0.00459613 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0320  resolvase domain-containing protein  24.11 
 
 		 531 aa  86.3  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.140685  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0628  Resolvase domain protein  26.15 
 
 		 534 aa  85.1  0.000000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2617  resolvase domain-containing protein  25.39 
 
 		 445 aa  85.1  0.000000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0540166  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0958  Resolvase domain protein  26.29 
 
 		 537 aa  84.7  0.000000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.560129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0216  resolvase domain-containing protein  24.12 
 
 		 517 aa  84.3  0.000000000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0894  Resolvase domain protein  26.37 
 
 		 534 aa  84.3  0.000000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_215  resolvase domain protein, PinR type  22.59 
 
 		 563 aa  84  0.000000000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0592  Resolvase domain protein  22.67 
 
 		 462 aa  82.4  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3989  recombinase  24.79 
 
 		 613 aa  81.3  0.00000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2857  resolvase domain-containing protein  24.78 
 
 		 445 aa  80.5  0.00000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.564499  normal  0.264008 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0051  site-specific recombinase  22.11 
 
 		 513 aa  80.5  0.00000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.169299  hitchhiker  0.000782563 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2438  Resolvase domain protein  23.76 
 
 		 526 aa  80.5  0.00000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2777  recombinase  24.2 
 
 		 441 aa  79.7  0.0000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0397  resolvase domain-containing protein  23.59 
 
 		 494 aa  80.1  0.0000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0001  recombinase  21.6 
 
 		 539 aa  79  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2499  cassette chromosome recombinase B  22.92 
 
 		 542 aa  78.6  0.0000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2087  recombinase  22.89 
 
 		 447 aa  78.6  0.0000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0591459 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0048  resolvase domain-containing protein  22.92 
 
 		 542 aa  78.6  0.0000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0049  resolvase domain-containing protein  22.92 
 
 		 542 aa  78.6  0.0000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0886  resolvase domain-containing protein  24.74 
 
 		 511 aa  77.8  0.0000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5553  resolvase domain protein  22.31 
 
 		 515 aa  77.4  0.0000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.919369999999999e-21 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2926  resolvase domain-containing protein  24.73 
 
 		 441 aa  77.4  0.0000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.855729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1935  site-specific recombinase  21.73 
 
 		 528 aa  77  0.0000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3776  recombinase  22.18 
 
 		 528 aa  77  0.0000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.902088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1561  resolvase-like protein  24.68 
 
 		 546 aa  77  0.000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.571827 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2440  Resolvase domain protein  23.79 
 
 		 539 aa  77  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0428  resolvase domain-containing protein  24.25 
 
 		 522 aa  76.3  0.000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.0000177151  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0737  resolvase  26.88 
 
 		 542 aa  75.1  0.000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0547783  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1486  resolvase domain-containing protein  23.48 
 
 		 485 aa  73.6  0.000000000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3904  Resolvase domain protein  25.79 
 
 		 460 aa  72  0.00000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7140  recombinase  44.16 
 
 		 108 aa  71.6  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0190883  normal  0.28367 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0172  recombinase  24.72 
 
 		 545 aa  71.2  0.00000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0859  Resolvase domain  24.05 
 
 		 544 aa  71.6  0.00000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.367879  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0796  recombinase  23.16 
 
 		 421 aa  71.2  0.00000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0698  recombinase  26.06 
 
 		 506 aa  69.3  0.0000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000998497  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2668  resolvase domain-containing protein  24.04 
 
 		 445 aa  69.3  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2122  Resolvase domain protein  20.85 
 
 		 547 aa  69.3  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00614032  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1943  resolvase  24.43 
 
 		 443 aa  68.2  0.0000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3976  resolvase domain-containing protein  23.82 
 
 		 415 aa  68.2  0.0000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3998  resolvase domain-containing protein  24.36 
 
 		 521 aa  68.2  0.0000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5598  DNA recombinase, putative  24.08 
 
 		 522 aa  68.2  0.0000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.318471  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3000  resolvase domain protein  22.04 
 
 		 549 aa  67.4  0.0000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1526  Resolvase domain protein  25.26 
 
 		 552 aa  67.4  0.0000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00555834  hitchhiker  0.00000415828 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0898  resolvase domain-containing protein  20.88 
 
 		 586 aa  64.7  0.000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0693  resolvase domain protein  22.37 
 
 		 606 aa  64.7  0.000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.298225  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1776  resolvase domain protein  22.37 
 
 		 606 aa  64.7  0.000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0417  DNA recombinase, putative  22.51 
 
 		 520 aa  64.3  0.000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0896  site-specific recombinase  24.08 
 
 		 527 aa  63.9  0.000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1795  resolvase domain protein  22.74 
 
 		 558 aa  64.3  0.000000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2971  resolvase domain-containing protein  24.55 
 
 		 474 aa  63.9  0.000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0952966  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1609  recombinase  22.82 
 
 		 522 aa  63.2  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000418639  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1037  resolvase domain-containing protein  24.47 
 
 		 504 aa  63.5  0.00000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00127199  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2797  Resolvase domain protein  23.9 
 
 		 525 aa  62.4  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.501781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0876  TnpX site-specific recombinase family protein  22.41 
 
 		 550 aa  62.4  0.00000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1684  resolvase-like protein  23.78 
 
 		 665 aa  62  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.560816 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2420  site-specific recombinase  20.31 
 
 		 479 aa  61.6  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.450706 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2714  putative cassette chromosome recombinase resolvase, CcrB like  23.43 
 
 		 641 aa  61.6  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0173703  normal  0.344103 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2762  cellulose binding, type IV  23.02 
 
 		 449 aa  61.2  0.00000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000724406 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5360  resolvase domain protein  23.32 
 
 		 546 aa  60.8  0.00000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000247289  hitchhiker  0.00000000017806 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0097  resolvase domain-containing protein  26.57 
 
 		 211 aa  60.8  0.00000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.371309  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5572  recombinase  25.79 
 
 		 479 aa  60.5  0.00000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0686025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5975  recombinase  25.79 
 
 		 479 aa  60.5  0.00000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>