170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2949 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_2949  site-specific recombinase  100 
 
 		 479 aa  988    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00000000764647  unclonable  0.00000628307 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3000  resolvase domain protein  28.14 
 
 		 549 aa  162  1e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6320  resolvase domain protein  27.31 
 
 		 553 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3523  resolvase domain protein  24.95 
 
 		 568 aa  113  8.000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.876485  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0051  site-specific recombinase  27.05 
 
 		 513 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.169299  hitchhiker  0.000782563 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4205  resolvase domain protein  25.06 
 
 		 525 aa  111  3e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2975  resolvase domain-containing protein  23.06 
 
 		 516 aa  109  8.000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.539501  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2572  resolvase domain protein  24.83 
 
 		 539 aa  106  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0592  Resolvase domain protein  28.29 
 
 		 462 aa  101  2e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2668  resolvase domain-containing protein  25.24 
 
 		 445 aa  97.4  4e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2857  resolvase domain-containing protein  25.88 
 
 		 445 aa  94.4  4e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.564499  normal  0.264008 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2617  resolvase domain-containing protein  25.24 
 
 		 445 aa  92.8  1e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0540166  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2797  Resolvase domain protein  20.37 
 
 		 525 aa  90.1  7e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.501781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2087  recombinase  24.38 
 
 		 447 aa  89.4  1e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0591459 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2866  Resolvase domain protein  19.62 
 
 		 525 aa  83.2  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.376058  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1935  site-specific recombinase  25.77 
 
 		 528 aa  80.9  0.00000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3776  recombinase  25.77 
 
 		 528 aa  81.3  0.00000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.902088  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5553  resolvase domain protein  23.76 
 
 		 515 aa  80.9  0.00000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.919369999999999e-21 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0706  Resolvase domain protein  27.84 
 
 		 534 aa  80.9  0.00000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.995743 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0770  Resolvase domain protein  26 
 
 		 537 aa  80.1  0.00000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.872914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3998  resolvase domain-containing protein  24.46 
 
 		 521 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3247  putative site-specific integrase protein  24.65 
 
 		 462 aa  78.6  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.964648 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0894  Resolvase domain protein  22.55 
 
 		 534 aa  79  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3171  putative site-specific integrase/resolvase protein  24.31 
 
 		 462 aa  78.2  0.0000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0817  Resolvase domain protein  25.6 
 
 		 534 aa  78.2  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2729  Resolvase domain protein  25.87 
 
 		 535 aa  77.8  0.0000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0958  Resolvase domain protein  27.32 
 
 		 537 aa  77.4  0.0000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.560129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0628  Resolvase domain protein  26.8 
 
 		 534 aa  77.4  0.0000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1216  Resolvase domain protein  26.29 
 
 		 534 aa  76.6  0.0000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.766992  hitchhiker  0.00144818 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1034  Resolvase domain protein  24.8 
 
 		 534 aa  77  0.0000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2438  Resolvase domain protein  26.18 
 
 		 526 aa  76.6  0.0000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1155  recombinase  27.23 
 
 		 343 aa  75.9  0.000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0594  Resolvase domain protein  26.32 
 
 		 525 aa  76.3  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5598  DNA recombinase, putative  23.3 
 
 		 522 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.318471  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0320  resolvase domain-containing protein  22.44 
 
 		 531 aa  75.5  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.140685  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3963  recombinase  23.44 
 
 		 493 aa  74.3  0.000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.636106  normal  0.385317 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1449  resolvase-like protein  25.74 
 
 		 522 aa  73.9  0.000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2081  recombinase  26.56 
 
 		 441 aa  74.3  0.000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0665131 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2762  cellulose binding, type IV  23.35 
 
 		 449 aa  72.8  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000724406 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0796  resolvase-like protein  24.71 
 
 		 506 aa  72.8  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.196824  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2777  recombinase  23.28 
 
 		 441 aa  73.2  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2926  resolvase domain-containing protein  22.69 
 
 		 441 aa  73.2  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.855729  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0891  putative site-specific integrase/recombinase protein  24.48 
 
 		 460 aa  72  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0886  resolvase domain-containing protein  23.04 
 
 		 511 aa  71.6  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1943  resolvase  24.56 
 
 		 443 aa  71.2  0.00000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5360  resolvase domain protein  24.09 
 
 		 546 aa  71.2  0.00000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000247289  hitchhiker  0.00000000017806 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0430  resolvase domain-containing protein  28.25 
 
 		 522 aa  71.2  0.00000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0901787  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1250  resolvase  24.06 
 
 		 524 aa  70.5  0.00000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2634  prophage LambdaMc01, site-specific recombinase resolvase family protein  24.17 
 
 		 459 aa  70.1  0.00000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2971  resolvase domain-containing protein  22.62 
 
 		 474 aa  70.1  0.00000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0952966  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0896  site-specific recombinase  24.8 
 
 		 527 aa  69.7  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3976  resolvase domain-containing protein  24.26 
 
 		 415 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0231  resolvase domain-containing protein  24.44 
 
 		 519 aa  68.6  0.0000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.829739  normal  0.106092 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2336  resolvase  27.38 
 
 		 532 aa  68.2  0.0000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.930487 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1524  Resolvase domain protein  24.19 
 
 		 543 aa  68.6  0.0000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000240403  hitchhiker  0.00200455 
 
 
-
 
NC_002978  WD0634  prophage LambdaW5, site-specific recombinase resolvase family protein  23.79 
 
 		 489 aa  67.8  0.0000000004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2827  Resolvase domain protein  19.44 
 
 		 509 aa  67.8  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.952038 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3232  Resolvase domain protein  25.6 
 
 		 474 aa  67.8  0.0000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2499  cassette chromosome recombinase B  23.41 
 
 		 542 aa  67  0.0000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1671  recombinase  29.38 
 
 		 522 aa  67.4  0.0000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1951  resolvase  24.81 
 
 		 445 aa  66.2  0.000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.666917  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3078  Resolvase domain protein  23.47 
 
 		 482 aa  66.2  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.244166  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3989  recombinase  22.78 
 
 		 613 aa  66.2  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0048  resolvase domain-containing protein  23.41 
 
 		 542 aa  66.6  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0049  resolvase domain-containing protein  23.41 
 
 		 542 aa  66.6  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1227  resolvase domain-containing protein  20.22 
 
 		 441 aa  65.5  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.254859 
 
 
-
 
NC_002936  DET1067  phage integrase family site specific recombinase  27.68 
 
 		 518 aa  64.7  0.000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.194572  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1526  Resolvase domain protein  25.11 
 
 		 552 aa  64.7  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00555834  hitchhiker  0.00000415828 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7341  Resolvase domain protein  23.42 
 
 		 295 aa  64.3  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0419  DNA recombinase, putative  27.68 
 
 		 523 aa  63.9  0.000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1522  resolvase domain-containing protein  26.63 
 
 		 568 aa  63.5  0.000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.40814  normal  0.455873 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2814  Resolvase domain protein  25.56 
 
 		 523 aa  63.2  0.000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.652656  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2432  resolvase domain-containing protein  22.22 
 
 		 281 aa  63.2  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0183379  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1274  resolvase domain-containing protein  30.34 
 
 		 523 aa  62  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.135333  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0698  recombinase  22.22 
 
 		 506 aa  62  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000998497  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1795  resolvase domain protein  20.39 
 
 		 558 aa  61.6  0.00000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0627  site-specific recombinase  22.51 
 
 		 516 aa  61.6  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1612  resolvase domain-containing protein  29.21 
 
 		 523 aa  61.6  0.00000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0288  prophage LambdaW1, site-specific recombinase resolvase family protein  24.5 
 
 		 500 aa  61.2  0.00000004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0551  site-specific recombinase  23.12 
 
 		 516 aa  61.2  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000944856 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1561  resolvase-like protein  23.32 
 
 		 546 aa  60.8  0.00000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.571827 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1282  Resolvase domain protein  19.71 
 
 		 485 aa  60.8  0.00000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5555  integrase  25.41 
 
 		 272 aa  60.8  0.00000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.14894e-26 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0796  recombinase  29.19 
 
 		 421 aa  60.5  0.00000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0486  Resolvase domain protein  23 
 
 		 515 aa  59.7  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.325495  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0172  recombinase  23.79 
 
 		 545 aa  59.3  0.0000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0913  resolvase domain-containing protein  26.85 
 
 		 554 aa  59.3  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.955385  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2966  Resolvase domain protein  21.86 
 
 		 524 aa  59.7  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1125  recombinase  27.8 
 
 		 322 aa  58.9  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0324535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1609  recombinase  22.82 
 
 		 522 aa  58.5  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000418639  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0430  Resolvase domain protein  22.71 
 
 		 535 aa  59.3  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2731  Resolvase domain protein  22.95 
 
 		 526 aa  58.5  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1608  putative resolvase  25.68 
 
 		 502 aa  58.2  0.0000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0440  Resolvase domain protein  27.16 
 
 		 552 aa  58.2  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000141398  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1037  resolvase domain-containing protein  22.61 
 
 		 504 aa  57.4  0.0000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00127199  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1145  recombinase  30.71 
 
 		 549 aa  57.4  0.0000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1983  resolvase domain-containing protein  20.27 
 
 		 546 aa  57.4  0.0000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0800721  normal  0.49542 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0737  resolvase  20.17 
 
 		 542 aa  57  0.0000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0547783  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1691  resolvase domain-containing protein  25.48 
 
 		 491 aa  57  0.0000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0333311  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1700  recombinase  29.61 
 
 		 442 aa  56.6  0.0000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000219867  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>