25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_0881 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_0881  resolvase family site-specific recombinase  100 
 
 		 219 aa  429  1e-119  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00811311  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1216  Resolvase domain protein  96.8 
 
 		 534 aa  386  1e-106  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.766992  hitchhiker  0.00144818 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0894  Resolvase domain protein  95.89 
 
 		 534 aa  377  1e-104  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0706  Resolvase domain protein  94.98 
 
 		 534 aa  374  1e-103  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.995743 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0958  Resolvase domain protein  95.83 
 
 		 537 aa  370  1e-102  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.560129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0817  Resolvase domain protein  94.93 
 
 		 534 aa  370  1e-102  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0628  Resolvase domain protein  94.52 
 
 		 534 aa  368  1e-101  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0770  Resolvase domain protein  94.91 
 
 		 537 aa  368  1e-101  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.872914  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1034  Resolvase domain protein  93.61 
 
 		 534 aa  364  1e-100  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0620  hypothetical protein  89.62 
 
 		 220 aa  278  4e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.761062 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0764  hypothetical protein  89.62 
 
 		 220 aa  278  4e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0953  hypothetical protein  97.5 
 
 		 112 aa  106  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0594  Resolvase domain protein  33.33 
 
 		 525 aa  96.3  3e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0952  hypothetical protein  80.36 
 
 		 56 aa  90.5  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2797  Resolvase domain protein  30.3 
 
 		 525 aa  66.6  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.501781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0886  resolvase domain-containing protein  26.7 
 
 		 511 aa  65.1  0.0000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2866  Resolvase domain protein  31.82 
 
 		 525 aa  62.4  0.000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.376058  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1227  resolvase domain-containing protein  40.38 
 
 		 441 aa  47  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.254859 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3776  recombinase  26.74 
 
 		 528 aa  47.4  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.902088  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1942  Resolvase domain protein  26.8 
 
 		 561 aa  45.8  0.0005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0891  putative site-specific integrase/recombinase protein  43.06 
 
 		 460 aa  45.8  0.0006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1935  site-specific recombinase  25.67 
 
 		 528 aa  45.4  0.0007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0630  resolvase  33.75 
 
 		 247 aa  42.4  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3998  resolvase domain-containing protein  21.78 
 
 		 521 aa  42  0.006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5553  resolvase domain protein  20.3 
 
 		 515 aa  42  0.008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.919369999999999e-21 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>