64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_0630 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_0630  resolvase  100 
 
 		 247 aa  505  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4193  Resolvase domain  61.13 
 
 		 555 aa  298  5e-80  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.384127 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3138  resolvase  55.24 
 
 		 561 aa  278  4e-74  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.741085  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1942  Resolvase domain protein  51.22 
 
 		 561 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0568  recombinase  47.37 
 
 		 547 aa  224  7e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.816013  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7321  putative resolvase  46.56 
 
 		 518 aa  220  9.999999999999999e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.988127  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4182  resolvase domain-containing protein  43.53 
 
 		 579 aa  170  2e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.86871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2851  resolvase domain-containing protein  42.52 
 
 		 565 aa  170  2e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.437901 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0277  resolvase domain-containing protein  40 
 
 		 551 aa  164  1.0000000000000001e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.738521  normal  0.0325045 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3384  resolvase domain-containing protein  38.34 
 
 		 590 aa  161  1e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0980736 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0430  putative resolvase  38.8 
 
 		 540 aa  154  1e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0212047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0102  resolvase domain-containing protein  33.6 
 
 		 537 aa  131  1.0000000000000001e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218605 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0303  resolvase domain-containing protein  25.23 
 
 		 548 aa  83.6  0.000000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.637835  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0096  hypothetical protein  26.46 
 
 		 261 aa  83.6  0.000000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0063  resolvase domain-containing protein  23.15 
 
 		 542 aa  79  0.00000000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1552  resolvase domain-containing protein  23.15 
 
 		 554 aa  79  0.00000000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.914203  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3120  recombinase  41.51 
 
 		 173 aa  78.6  0.00000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.964732  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1983  resolvase domain-containing protein  30.58 
 
 		 546 aa  69.3  0.00000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0800721  normal  0.49542 
 
 
-
 
NC_002936  DET0155  resolvase domain-containing protein  22.07 
 
 		 510 aa  68.2  0.0000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_215  resolvase domain protein, PinR type  23.96 
 
 		 563 aa  67.8  0.0000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0216  resolvase domain-containing protein  21.23 
 
 		 517 aa  60.5  0.00000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0706  Resolvase domain protein  34.21 
 
 		 534 aa  58.5  0.00000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.995743 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0817  Resolvase domain protein  33.33 
 
 		 534 aa  57.8  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0628  Resolvase domain protein  33.33 
 
 		 534 aa  57.4  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1216  Resolvase domain protein  33.33 
 
 		 534 aa  57.4  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.766992  hitchhiker  0.00144818 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0894  Resolvase domain protein  33.33 
 
 		 534 aa  57  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0698  recombinase  24.62 
 
 		 506 aa  57  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000998497  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5598  DNA recombinase, putative  21.05 
 
 		 522 aa  57  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.318471  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0770  Resolvase domain protein  32.46 
 
 		 537 aa  56.2  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.872914  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1034  Resolvase domain protein  33.33 
 
 		 534 aa  55.8  0.0000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0958  Resolvase domain protein  33.33 
 
 		 537 aa  54.7  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.560129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0795  Recombinase  24.26 
 
 		 496 aa  53.9  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.682484  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1563  resolvase domain-containing protein  26.11 
 
 		 540 aa  52.4  0.000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.681987  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1227  resolvase domain-containing protein  28.83 
 
 		 441 aa  52  0.000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.254859 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2606  resolvase family site-specific recombinase  25 
 
 		 534 aa  52  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0594  Resolvase domain protein  37.5 
 
 		 525 aa  51.2  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2827  Resolvase domain protein  25.5 
 
 		 509 aa  50.8  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.952038 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3989  recombinase  28.29 
 
 		 613 aa  50.4  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2857  resolvase domain-containing protein  33.33 
 
 		 445 aa  50.4  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.564499  normal  0.264008 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2668  resolvase domain-containing protein  33.33 
 
 		 445 aa  49.7  0.00004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5360  resolvase domain protein  26.61 
 
 		 546 aa  49.7  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000247289  hitchhiker  0.00000000017806 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3976  resolvase domain-containing protein  23.08 
 
 		 415 aa  48.9  0.00008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2617  resolvase domain-containing protein  30.67 
 
 		 445 aa  48.1  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0540166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5028  hypothetical protein  57.14 
 
 		 185 aa  47.4  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.284216  normal  0.520699 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0913  resolvase domain-containing protein  21.46 
 
 		 554 aa  47  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.955385  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0049  resolvase domain-containing protein  20.79 
 
 		 542 aa  46.2  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2499  cassette chromosome recombinase B  20.79 
 
 		 542 aa  46.6  0.0004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0440  Resolvase domain protein  24.19 
 
 		 552 aa  46.2  0.0004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000141398  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0048  resolvase domain-containing protein  20.79 
 
 		 542 aa  46.2  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0886  resolvase domain-containing protein  24.23 
 
 		 511 aa  46.2  0.0005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0248  resolvase domain-containing protein  28.49 
 
 		 524 aa  45.4  0.0007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.0000541084  hitchhiker  0.00459613 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2777  recombinase  29.37 
 
 		 441 aa  45.1  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0849  cassette chromosome recombinase B  25.24 
 
 		 484 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000173859 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2219  recombinase  28.97 
 
 		 558 aa  44.3  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.338837  normal  0.810308 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2797  Resolvase domain protein  26.44 
 
 		 525 aa  44.3  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.501781  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5553  resolvase domain protein  21.95 
 
 		 515 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.919369999999999e-21 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3864  recombinase  27.03 
 
 		 537 aa  43.5  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.802308  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2926  resolvase domain-containing protein  28.57 
 
 		 441 aa  43.1  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.855729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2219  recombinase  27.34 
 
 		 541 aa  42.7  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.543065  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0845  DNA recombinase, putative  24.76 
 
 		 484 aa  42.7  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0881  resolvase family site-specific recombinase  33.75 
 
 		 219 aa  42.7  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00811311  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2774  hypothetical protein  26.29 
 
 		 644 aa  42.7  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1486  resolvase domain-containing protein  26.42 
 
 		 485 aa  42.4  0.007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2336  recombinase  29.75 
 
 		 532 aa  42.4  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.430525  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>