12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_0953 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_0953  hypothetical protein  100 
 
 
112 aa  207  4e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0817  Resolvase domain protein  97.5 
 
 
534 aa  110  6e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1216  Resolvase domain protein  95 
 
 
534 aa  110  6e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.766992  hitchhiker  0.00144818 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0706  Resolvase domain protein  97.5 
 
 
534 aa  108  3e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.995743 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0620  hypothetical protein  97.5 
 
 
220 aa  107  7.000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.761062 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0764  hypothetical protein  97.5 
 
 
220 aa  107  7.000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0881  resolvase family site-specific recombinase  97.5 
 
 
219 aa  105  1e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00811311  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1034  Resolvase domain protein  96.25 
 
 
534 aa  106  1e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0958  Resolvase domain protein  96.25 
 
 
537 aa  105  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.560129  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0628  Resolvase domain protein  95 
 
 
534 aa  104  5e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0770  Resolvase domain protein  92.5 
 
 
537 aa  100  5e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.872914  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0894  Resolvase domain protein  92.5 
 
 
534 aa  100  7e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>