19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_2215 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_2215  DNA recombinase, putative  100 
 
 
192 aa  385  1e-106  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1612  resolvase domain-containing protein  95.14 
 
 
523 aa  360  8e-99  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1274  resolvase domain-containing protein  92.97 
 
 
523 aa  350  1e-95  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.135333  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0419  DNA recombinase, putative  58.92 
 
 
523 aa  225  2e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1671  recombinase  57.84 
 
 
522 aa  223  1e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2814  Resolvase domain protein  55.68 
 
 
523 aa  217  8.999999999999998e-56  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.652656  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0430  resolvase domain-containing protein  56.22 
 
 
522 aa  213  9.999999999999999e-55  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0901787  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1067  phage integrase family site specific recombinase  45.7 
 
 
518 aa  171  3.9999999999999995e-42  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.194572  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1491  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  34.62 
 
 
506 aa  107  8.000000000000001e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1526  Resolvase domain protein  33.16 
 
 
552 aa  103  2e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00555834  hitchhiker  0.00000415828 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2729  Resolvase domain protein  34.54 
 
 
535 aa  102  3e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2440  Resolvase domain protein  34.01 
 
 
539 aa  88.2  7e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1525  Recombinase  24.47 
 
 
299 aa  50.1  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000398733  hitchhiker  0.000531049 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0417  DNA recombinase, putative  24.74 
 
 
520 aa  47  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1527  Resolvase domain protein  41.18 
 
 
431 aa  43.5  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00144014  hitchhiker  0.00000000612209 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1272  resolvase domain-containing protein  21.55 
 
 
519 aa  41.2  0.008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000672315  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1609  recombinase  22.05 
 
 
522 aa  41.6  0.008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000418639  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0693  resolvase domain protein  26.15 
 
 
606 aa  41.2  0.01  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.298225  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1776  resolvase domain protein  26.15 
 
 
606 aa  41.2  0.01  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>