More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_7041 on replicon NC_010373
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010373  M446_7041  hypothetical protein  100 
 
 		 224 aa  461  1e-129  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.414192 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2432  resolvase domain-containing protein  34.88 
 
 		 281 aa  98.2  9e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0183379  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5555  integrase  29.65 
 
 		 272 aa  87.4  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.14894e-26 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7341  Resolvase domain protein  35.18 
 
 		 295 aa  86.3  4e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29040  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  31.65 
 
 		 197 aa  83.2  0.000000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.436309  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0463  Resolvase domain protein  32.55 
 
 		 475 aa  83.2  0.000000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0983248  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1803  resolvase domain-containing protein  37.76 
 
 		 193 aa  82  0.000000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3776  recombinase  34.97 
 
 		 528 aa  80.1  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.902088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0991  resolvase domain-containing protein  40.82 
 
 		 205 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0378771  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4228  resolvase family site-specific recombinase  34.81 
 
 		 187 aa  79.7  0.00000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.623835  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1935  site-specific recombinase  34.97 
 
 		 528 aa  80.1  0.00000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3007  resolvase-like protein  36.77 
 
 		 204 aa  79.3  0.00000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0154323 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4042  serine-based site-specific recombinase activity  36.77 
 
 		 204 aa  79.3  0.00000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.890679  normal  0.169813 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4975  serine-based site-specific recombinase activity  36.77 
 
 		 204 aa  79.3  0.00000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.283487  normal  0.35895 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2144  Resolvase domain protein  36.67 
 
 		 196 aa  79  0.00000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0618608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1543  resolvase domain-containing protein  30.65 
 
 		 213 aa  79  0.00000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0184299  normal  1 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1795  resolvase domain protein  29.88 
 
 		 558 aa  78.6  0.00000000000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5298  DNA-invertase hin  32 
 
 		 186 aa  77  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003898  resolvase putative  31.63 
 
 		 202 aa  75.9  0.0000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9833  Resolvase Protein  36.88 
 
 		 210 aa  76.3  0.0000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5553  resolvase domain protein  32.21 
 
 		 515 aa  75.9  0.0000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.919369999999999e-21 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5126  Resolvase domain protein  37.11 
 
 		 197 aa  74.3  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.114051 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3423  Resolvase domain protein  31.85 
 
 		 185 aa  74.7  0.000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0896  site-specific recombinase  32.74 
 
 		 527 aa  74.7  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3231  transposon Tn2501 resolvase  34.19 
 
 		 191 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2347  Resolvase domain protein  35.48 
 
 		 204 aa  74.7  0.000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3652  resolvase, N-terminal  29.56 
 
 		 192 aa  73.6  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000770175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1684  resolvase-like protein  34.78 
 
 		 665 aa  73.6  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.560816 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1983  resolvase domain-containing protein  33.33 
 
 		 546 aa  73.9  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0800721  normal  0.49542 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5792  resolvase TnpR  31.85 
 
 		 212 aa  73.6  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.923438  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25950  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  32.47 
 
 		 195 aa  73.2  0.000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4128  Resolvase domain protein  31.37 
 
 		 231 aa  73.2  0.000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2668  helix-turn-helix, Fis-type  37.41 
 
 		 204 aa  73.2  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00804941  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20410  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  34.07 
 
 		 194 aa  73.2  0.000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0661103 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6748  resolvase domain-containing protein  34.39 
 
 		 201 aa  73.6  0.000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.167425 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1568  helix-turn-helix, Fis-type  37.41 
 
 		 204 aa  73.2  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1132  Resolvase domain  34.04 
 
 		 184 aa  72.8  0.000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3649  resolvase domain-containing protein  33.84 
 
 		 380 aa  72.8  0.000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.340945 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0466  Resolvase domain  35.33 
 
 		 205 aa  72.4  0.000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.418385  normal  0.0169839 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1284  transposon Tn2501 resolvase  32.9 
 
 		 191 aa  72.4  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.1264  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2757  resolvase domain-containing protein  37.25 
 
 		 188 aa  70.9  0.00000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4459  resolvase  36.36 
 
 		 190 aa  71.2  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4290  resolvase  36.36 
 
 		 190 aa  71.2  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4190  resolvase  36.36 
 
 		 190 aa  71.2  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1424  Resolvase domain protein  34.11 
 
 		 215 aa  70.9  0.00000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00141617  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3683  resolvase domain-containing protein  38.78 
 
 		 215 aa  71.2  0.00000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0068  resolvase  35.06 
 
 		 181 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0902003  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4081  resolvase domain-containing protein  42.31 
 
 		 199 aa  70.5  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0381075 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0854  invertase/recombinase like protein  34.42 
 
 		 198 aa  70.9  0.00000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.160403  normal  0.816153 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1449  resolvase-like protein  32.9 
 
 		 522 aa  70.5  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3680  resolvase domain-containing protein  42.31 
 
 		 199 aa  70.5  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2392  Resolvase domain  35.06 
 
 		 197 aa  70.9  0.00000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000064315  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3876  resolvase domain-containing protein  42.31 
 
 		 199 aa  70.5  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.3792 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2312  Resolvase domain  31.71 
 
 		 201 aa  69.7  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0955  Resolvase domain protein  37.16 
 
 		 194 aa  69.7  0.00000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1762  resolvase-like protein  32.26 
 
 		 192 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3594  resolvase domain-containing protein  36.09 
 
 		 197 aa  70.1  0.00000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.260682  hitchhiker  0.00636554 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2374  resolvase domain-containing protein  32.26 
 
 		 192 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2258  resolvase domain-containing protein  35.03 
 
 		 195 aa  70.1  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.880923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2355  Resolvase domain protein  35.29 
 
 		 186 aa  69.7  0.00000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.230305  normal  0.6636 
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A23  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  33.8 
 
 		 187 aa  69.7  0.00000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2399  resolvase domain-containing protein  36.09 
 
 		 197 aa  69.3  0.00000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.211423  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3031  DNA-invertase  36.6 
 
 		 197 aa  69.3  0.00000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130363 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2762  cellulose binding, type IV  34.13 
 
 		 449 aa  69.3  0.00000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000724406 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1522  resolvase domain-containing protein  32.9 
 
 		 568 aa  68.9  0.00000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.40814  normal  0.455873 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2494  resolvase domain-containing protein  31.61 
 
 		 191 aa  68.9  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1397  invertase/recombinase like protein  34.19 
 
 		 176 aa  68.9  0.00000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.777573 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4663  resolvase domain-containing protein  31.87 
 
 		 197 aa  68.9  0.00000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.94015  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0019  Resolvase domain protein  34.5 
 
 		 195 aa  68.9  0.00000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0381  resolvase domain-containing protein  46.67 
 
 		 147 aa  68.9  0.00000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0368407  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1202  resolvase domain-containing protein  37.25 
 
 		 194 aa  68.9  0.00000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2096  resolvase domain-containing protein  35.53 
 
 		 190 aa  68.6  0.00000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0211835 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2984  putative site-specific recombinases, DNA invertase Pin  32.13 
 
 		 203 aa  68.6  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.200056  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1561  resolvase-like protein  34.27 
 
 		 546 aa  68.6  0.00000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.571827 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2132  resolvase domain-containing protein  31.13 
 
 		 198 aa  68.6  0.00000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0356691 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0486  Resolvase domain protein  30.81 
 
 		 515 aa  68.6  0.00000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.325495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0105  resolvase, N-terminal:resolvase helix-turn-helix region  32.9 
 
 		 192 aa  68.2  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0817  Resolvase domain protein  33.77 
 
 		 534 aa  67.8  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0958  Resolvase domain protein  33.77 
 
 		 537 aa  67.8  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.560129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1992  resolvase domain-containing protein  32.39 
 
 		 206 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0859  Resolvase domain  28.16 
 
 		 544 aa  67.8  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.367879  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0189  resolvase domain-containing protein  32.39 
 
 		 206 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3662  Resolvase domain protein  30.38 
 
 		 188 aa  67.8  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2617  resolvase domain-containing protein  30.91 
 
 		 445 aa  67.8  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0540166  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2857  resolvase domain-containing protein  30.91 
 
 		 445 aa  67.8  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.564499  normal  0.264008 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4137  resolvase domain-containing protein  35.06 
 
 		 224 aa  67.4  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.130251  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2550  Resolvase domain  37.33 
 
 		 196 aa  67  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.819685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1486  resolvase domain-containing protein  27.7 
 
 		 485 aa  67  0.0000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2948  DNA-invertase hin  35.03 
 
 		 187 aa  67.4  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.3180099999999999e-20 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43160  Resolvase-like protein  30.97 
 
 		 189 aa  67  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2967  DNA-invertase hin  35.03 
 
 		 188 aa  67.4  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000835062 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3232  Resolvase domain protein  36.61 
 
 		 474 aa  67  0.0000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0592  Resolvase domain protein  30.41 
 
 		 462 aa  67  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0048  resolvase domain-containing protein  28.92 
 
 		 542 aa  67  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2913  DNA-invertase hin  35.03 
 
 		 190 aa  67  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.504047  normal  0.0309704 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3477  resolvase domain-containing protein  33.71 
 
 		 196 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3992  resolvase domain-containing protein  34.62 
 
 		 195 aa  67  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.378658  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2084  resolvase domain-containing protein  28.22 
 
 		 196 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0108  hypothetical protein  34.62 
 
 		 309 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2173  resolvase domain-containing protein  28.22 
 
 		 196 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>