More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_A0025 on replicon NC_007411
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007411  Ava_A0025  resolvase  100 
 
 
511 aa  1061    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.712822  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4459  resolvase  39.69 
 
 
190 aa  88.6  2e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4290  resolvase  39.69 
 
 
190 aa  88.6  2e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4190  resolvase  39.69 
 
 
190 aa  88.6  2e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2971  resolvase domain-containing protein  29 
 
 
474 aa  87.8  4e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0952966  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0086  resolvase family site-specific recombinase  38.17 
 
 
196 aa  87.4  5e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.464664  n/a   
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4560  resolvase domain-containing protein  38.17 
 
 
192 aa  87.4  5e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0189  resolvase domain-containing protein  38.17 
 
 
206 aa  87.8  5e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1992  resolvase domain-containing protein  38.17 
 
 
206 aa  87.8  5e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3477  resolvase domain-containing protein  38.17 
 
 
196 aa  87.4  6e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4386  resolvase  34.15 
 
 
219 aa  85.5  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4668  resolvase domain-containing protein  35.61 
 
 
189 aa  85.9  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4775  resolvase domain-containing protein  35.61 
 
 
189 aa  85.9  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0260  resolvase family site-specific recombinase  38.64 
 
 
205 aa  85.1  0.000000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1082  resolvase family site-specific recombinase  38.64 
 
 
205 aa  85.1  0.000000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.271311  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1490  resolvase domain-containing protein  34.04 
 
 
183 aa  85.1  0.000000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.832501  hitchhiker  0.00333462 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2095  Resolvase domain protein  39.1 
 
 
203 aa  85.1  0.000000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0886  resolvase domain-containing protein  22.11 
 
 
511 aa  85.1  0.000000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0041  resolvase domain-containing protein  33.33 
 
 
184 aa  83.2  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  decreased coverage  0.0000573211 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0014  resolvase domain-containing protein  32.62 
 
 
184 aa  82.4  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.125158  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2702  resolvase domain-containing protein  38.17 
 
 
307 aa  82  0.00000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.264305  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2944  resolvase domain-containing protein  38.17 
 
 
307 aa  82  0.00000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.857733  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0108  hypothetical protein  38.93 
 
 
309 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0409  resolvase domain-containing protein  36.96 
 
 
186 aa  82  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00000318958  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1282  Resolvase domain protein  23.71 
 
 
485 aa  81.6  0.00000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4091  Resolvase domain  36.84 
 
 
186 aa  81.6  0.00000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3670  resolvase domain-containing protein  34.85 
 
 
185 aa  81.3  0.00000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4137  resolvase domain-containing protein  37.4 
 
 
224 aa  80.9  0.00000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.130251  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2984  putative site-specific recombinases, DNA invertase Pin  35.77 
 
 
203 aa  80.9  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.200056  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1467  site-specific recombinase, putative  23.64 
 
 
551 aa  80.9  0.00000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00705906  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2258  resolvase domain-containing protein  35.43 
 
 
195 aa  80.9  0.00000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.880923  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2582  resolvase domain-containing protein  34.09 
 
 
185 aa  80.9  0.00000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5280  resolvase domain-containing protein  38.06 
 
 
305 aa  80.5  0.00000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4154  resolvase domain-containing protein  36.23 
 
 
199 aa  80.5  0.00000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3501  resolvase domain-containing protein  36.3 
 
 
324 aa  80.1  0.00000000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.654072  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1202  resolvase domain-containing protein  35.46 
 
 
194 aa  80.1  0.00000000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2096  resolvase domain-containing protein  33.82 
 
 
190 aa  79.7  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0211835 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1052  Resolvase domain  34.29 
 
 
186 aa  80.1  0.0000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007411  Ava_A0024  hypothetical protein  67.21 
 
 
63 aa  79.7  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.408387  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1006  Resolvase domain protein  35.61 
 
 
189 aa  80.1  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0466  resolvase  34.78 
 
 
193 aa  79.7  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.736746  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3678  Resolvase domain  36.36 
 
 
190 aa  79  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134045  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0167  resolvase domain-containing protein  34.59 
 
 
196 aa  79  0.0000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01209  bacteriocin production protein  35.48 
 
 
198 aa  79.3  0.0000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000702686  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4320  hypothetical protein  36.69 
 
 
293 aa  78.6  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.264253 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3914  resolvase domain-containing protein  37.12 
 
 
293 aa  79.3  0.0000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.789856  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0845  DNA recombinase, putative  22.66 
 
 
484 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3853  resolvase domain-containing protein  37.12 
 
 
326 aa  78.2  0.0000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.363521  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1807  resolvase domain-containing protein  31.43 
 
 
201 aa  78.2  0.0000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.261116  unclonable  0.00000000603181 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1326  resolvase domain-containing protein  37.04 
 
 
180 aa  78.6  0.0000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4357  resolvase-like protein  36.36 
 
 
309 aa  78.2  0.0000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6748  resolvase domain-containing protein  35.34 
 
 
201 aa  78.6  0.0000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.167425 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2154  Resolvase domain protein  34.59 
 
 
185 aa  78.2  0.0000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.478214  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4835  Resolvase domain protein  36.64 
 
 
201 aa  78.6  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.291279 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1132  Resolvase domain  34.09 
 
 
184 aa  77.8  0.0000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0849  cassette chromosome recombinase B  21.93 
 
 
484 aa  77.8  0.0000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000173859 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2392  Resolvase domain  37.33 
 
 
197 aa  77.8  0.0000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000064315  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0274  resolvase domain-containing protein  30.36 
 
 
580 aa  78.2  0.0000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4105  resolvase domain-containing protein  37.12 
 
 
293 aa  77.8  0.0000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.571135  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1403  resolvase domain-containing protein  34.59 
 
 
185 aa  78.2  0.0000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.749996  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0095  resolvase domain-containing protein  35.97 
 
 
189 aa  77.8  0.0000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.386301 
 
 
-
 
NC_009660  Krad_4707  resolvase domain-containing protein  35.56 
 
 
190 aa  77.4  0.0000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2757  resolvase domain-containing protein  35.34 
 
 
188 aa  77.4  0.0000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1093  Resolvase domain  37.78 
 
 
196 aa  77.4  0.0000000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.531001  normal 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0202  resolvase  31.43 
 
 
183 aa  77  0.0000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0854  invertase/recombinase like protein  35.81 
 
 
198 aa  77  0.0000000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.160403  normal  0.816153 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0010  resolvase  33.83 
 
 
185 aa  77  0.0000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0319649  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0233  resolvase  31.43 
 
 
183 aa  77  0.0000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4123  resolvase domain-containing protein  34.59 
 
 
185 aa  77  0.0000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0694671 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1711  integrative genetic element Gsu5, resolvase  33.33 
 
 
190 aa  77  0.0000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0316952  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1935  site-specific recombinase  21.33 
 
 
528 aa  77  0.0000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2668  resolvase domain-containing protein  24.24 
 
 
445 aa  77  0.0000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6307  resolvase domain-containing protein  32.06 
 
 
209 aa  76.6  0.0000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1155  recombinase  31.03 
 
 
343 aa  76.6  0.0000000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3776  recombinase  21.69 
 
 
528 aa  76.6  0.0000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.902088  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0088  resolvase domain-containing protein  30.71 
 
 
199 aa  76.3  0.000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.223955  n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_2482  TonB-dependent receptor protein  36.69 
 
 
294 aa  76.6  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4189  TonB-dependent receptor protein  36.69 
 
 
294 aa  76.3  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5332  Resolvase domain protein  34.38 
 
 
184 aa  76.6  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0348  Resolvase domain protein  34.38 
 
 
209 aa  76.3  0.000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2147  Resolvase domain protein  36.36 
 
 
191 aa  76.3  0.000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2617  resolvase domain-containing protein  24.69 
 
 
445 aa  75.9  0.000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0540166  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1562  recombinase  33.83 
 
 
188 aa  76.3  0.000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4026  resolvase domain-containing protein  37.12 
 
 
298 aa  76.3  0.000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.884346  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4249  resolvase domain-containing protein  36.36 
 
 
191 aa  76.3  0.000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.251845 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2144  Resolvase domain protein  35.07 
 
 
196 aa  75.9  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0618608  normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9004  DNA invertase  34.85 
 
 
313 aa  74.7  0.000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2312  Resolvase domain  37.59 
 
 
201 aa  75.1  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5190  resolvase domain-containing protein  35.29 
 
 
191 aa  75.1  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000411755  n/a   
 
 
-
 
NC_010504  Mrad2831_6517  resolvase domain-containing protein  34.59 
 
 
185 aa  75.1  0.000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4084  resolvase domain-containing protein  32.61 
 
 
188 aa  75.1  0.000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.236689  normal  0.0346573 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3031  DNA-invertase  34.06 
 
 
197 aa  75.1  0.000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00130363 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2857  resolvase domain-containing protein  25.07 
 
 
445 aa  74.7  0.000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.564499  normal  0.264008 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5431  Resolvase domain protein  32.61 
 
 
185 aa  74.7  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.318584  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2027  resolvase domain-containing protein  36.57 
 
 
185 aa  74.7  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2239  resolvase domain-containing protein  34.59 
 
 
187 aa  74.7  0.000000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A23  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  35.92 
 
 
187 aa  74.7  0.000000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3714  resolvase domain-containing protein  34.51 
 
 
188 aa  74.3  0.000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.566828  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2489  Resolvase domain protein  32.86 
 
 
184 aa  74.3  0.000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.243262  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0302  DNA-invertase  33.57 
 
 
184 aa  74.3  0.000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.623719 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>